Search TFs
or Genes
Construction
and Validation
Optimal
Promoter Size
Download Citation and
Contact

NKX3-1 target genes for motif:
NKX3-1_homeodomain_full_monomeric_9_1

The NKX3-1_homeodomain_full_monomeric_9_1 motif was discovered for NKX3-1 and was found in the SELEX repository.

NKX3-1 motif sequence logo


NKX3-1 motif positions


 

NKX3-1 target gene list


Download all NKX3-1 TF binding sites
GeneEntrez# of SitesStrandChromosomePromoter LocationTSS
CLDN1 9076 2 chr3 - 190039735-190045235 190040235
CLDN6 9074 1 chr16 - 3067688-3073188 3068188
DOCK10 55619 1 chr2 - 225906830-225912330 225907330
TIPRL 261726 1 chr1 + 168143170-168148670 168148170
LPP 4026 1 chr3 + 187866662-187872162 187871662
PSD3 23362 1 chr8 - 18870696-18876196 18871196
ARPC2 10109 1 chr2 + 219076873-219082619 219082119
PLS3 5358 1 chrX + 114790176-114795676 114795176
GALM 130589 1 chr2 + 38888051-38893551 38893051
IL1RAP 3556 1 chr3 + 190226839-190232339 190231839
CPSF4 10898 1 chr7 + 99031562-99037062 99036562
ZNF540 163255 1 chr19 + 38037272-38042772 38042272
LDB1 8861 1 chr10 - 103874223-103885210 103874723
JARID2 3720 1 chr6 + 15241205-15249585 15249085
PCOLCE2 26577 1 chr3 - 142607545-142613045 142608045
KRT8 3856 1 chr12 - 53343150-53348650 53343650
NUDT16L1 84309 1 chr16 + 4738693-4744193 4743693
KRT5 3852 1 chr12 - 52913743-52919243 52914243
AP1M1 8907 1 chr19 + 16303664-16309164 16308664
SLC2A6 11182 1 chr9 - 136343776-136349276 136344276
GPER 2852 1 chr7 + 1121442-1128222 1127722
DOCK2 1794 1 chr5 + 169059250-169064750 169064250
UNC5B 219699 1 chr10 + 72967291-72972791 72972291
RPL27 6155 1 chr17 + 41145445-41150945 41150445
TNF 7124 1 chr6 + 31538343-31543843 31543343
TNNC2 7125 1 chr20 - 44455453-44460953 44455953
PRMT3 10196 1 chr11 + 20404075-20409575 20409075
DHX58 79132 1 chr17 - 40264251-40269751 40264751
DCTN4 51164 2 chr5 - 150137582-150143657 150138082
TTI1 9675 1 chr20 - 36661333-36666833 36661833
SLC2A12 154091 1 chr6 - 134373289-134378789 134373789
PGLYRP3 114771 2 chr1 - 153282694-153288194 153283194
ITFG1 81533 1 chr16 - 47494515-47500015 47495015
PITPNA 5306 1 chr17 - 1465610-1471110 1466110
LRRC1 55227 1 chr6 + 53654777-53660277 53659777
LIN9 286826 1 chr1 - 226496704-226502449 226497204
DHX15 1665 1 chr4 - 24585684-24591184 24586184
FNDC4 64838 1 chr2 - 27717626-27723126 27718126
ACTR3C 653857 1 chr7 - 150020258-150025758 150020758
HDAC11 79885 1 chr3 + 13516714-13522343 13521843
HLTF 6596 1 chr3 - 148803841-148809341 148804341
ITGA7 3679 1 chr12 - 56101186-56111089 56101686
MYO10 4651 1 chr5 - 16935885-16941385 16936385
MYO9B 4650 1 chr19 + 17181590-17187090 17186590
GPM6B 2824 1 chrX - 13956331-13961831 13956831
ITGA2 3673 1 chr5 + 52280155-52285655 52285155
ABRA 137735 1 chr8 - 107781972-107787472 107782472
MAPK6 5597 1 chr15 + 52306410-52311910 52311410
RBM44 375316 1 chr2 + 238702387-238707887 238707387
WDR59 79726 1 chr16 - 75018517-75024017 75019017
EHD4 30844 1 chr15 - 42264255-42269755 42264755
HIST1H1A 3024 1 chr6 - 26017540-26023040 26018040
FAM82B 51115 1 chr8 - 87520509-87526009 87521009
PELI2 57161 1 chr14 + 56580092-56585592 56585092
ZNF692 55657 1 chr1 - 249152625-249158315 249153125
NARG2 79664 1 chr15 - 60770859-60776359 60771359
DCLRE1C 64421 2 chr10 - 14995594-15001094 14996094
ANKRD45 339416 1 chr1 - 173638501-173644001 173639001
MEIS2 4212 1 chr15 - 37390062-37398500 37390562
FAM135A 57579 1 chr6 + 71118106-71123606 71123106
MDH2 4191 1 chr7 + 75672392-75677892 75677392
C17orf103 256302 1 chr17 - 21156078-21161578 21156578
TESPA1 9840 1 chr12 - 55375122-55383530 55375622
MPV17 4358 1 chr2 - 27545469-27550969 27545969
ZEB1 6935 1 chr10 + 31603100-31610563 31610063
MFAP3L 9848 1 chr4 - 170946929-170952429 170947429
CHST10 9486 1 chr2 - 101033630-101039130 101034130
NID1 4811 1 chr1 - 236227981-236233481 236228481
PAQR6 79957 1 chr1 - 156217408-156222908 156217908
EGFL6 25975 1 chrX + 13582693-13588193 13587693
TIPARP 25976 1 chr3 + 156387204-156394952 156394452
DUSP1 1843 1 chr5 - 172197703-172203203 172198203
DUSP5 1847 1 chr10 + 112252624-112258124 112257624
SLC22A8 9376 1 chr11 - 62782817-62788317 62783317
SLAMF1 6504 1 chr1 - 160616581-160622081 160617081
UTP3 57050 1 chr4 + 71549195-71554695 71554195
SETD1B 23067 1 chr12 + 122237637-122243137 122242637
FAM227B 196951 1 chr15 - 49912618-49918118 49913118
HINT1 3094 1 chr5 - 130500541-130506041 130501041
PTCD1 26024 1 chr7 - 99035962-99041462 99036462
RGS14 10636 1 chr5 + 176779843-176785343 176784843
LRCH1 23143 1 chr13 + 47122295-47127795 47127295
PDPN 10630 1 chr1 + 13905251-13912466 13911966
POLR3E 55718 1 chr16 + 22303695-22309195 22308695
NSA2 10412 1 chr5 + 74057815-74063315 74062815
C7orf45 136263 1 chr7 + 129842703-129848203 129847703
APLP2 334 1 chr11 + 129934715-129940962 129940462
BCOR 54880 1 chrX - 40036082-40041582 40036582
TEX10 54881 1 chr9 - 103114353-103120259 103114853
TM2D2 83877 1 chr8 - 38853541-38859041 38854041
HIST1H2BM 8342 1 chr6 + 27777821-27783321 27782821
HIST1H2BL 8340 1 chr6 - 27775209-27780709 27775709
~ 8347 1 chr6 - 26123632-26129132 26124132
HIST1H2BH 8345 1 chr6 + 26246878-26252378 26251878
MRPS16 51021 1 chr10 - 75011951-75017451 75012451
LRRC61 65999 1 chr7 + 150015295-150020795 150020295
PARPBP 55010 1 chr12 + 102508955-102514455 102513955
TTC4 7268 1 chr1 + 55176494-55181994 55181494
HAUS8 93323 1 chr19 - 17185843-17191343 17186343
VCAM1 7412 1 chr1 + 101180195-101185695 101185195
ZDHHC17 23390 1 chr12 + 77152853-77158353 77157853
OLFML2B 25903 1 chr1 - 161993144-161998644 161993644
RPL23 9349 1 chr17 - 37009553-37015053 37010053
DARS2 55157 1 chr1 + 173788796-173794296 173793796
~ 8357 1 chr6 + 27772841-27778341 27777841
CCDC122 160857 1 chr13 - 44453326-44458826 44453826
RNF111 54778 1 chr15 + 59274864-59280844 59280344
ZNRF2 223082 1 chr7 + 30318922-30324422 30323922
FGGY 55277 1 chr1 + 59757624-59763124 59762624
KDM2B 84678 1 chr12 - 122017864-122023920 122018364
MRPL15 29088 1 chr8 + 55042780-55048280 55047780
ANKRD13C 81573 1 chr1 - 70819917-70825417 70820417
NFATC3 4775 1 chr16 + 68114268-68119768 68119268
ACVR2B 93 1 chr3 + 38490789-38496289 38495789
ABCG1 9619 1 chr21 + 43614798-43620421 43619921
SLC37A4 2542 1 chr11 - 118899778-118906616 118900278
ACTR2 10097 1 chr2 + 65449828-65455328 65454828
PGAM1 5223 1 chr10 + 99181026-99186526 99186026
LTV1 84946 1 chr6 + 144159507-144165007 144164507
SFRP2 6423 1 chr4 - 154709728-154715228 154710228
KIAA0907 22889 1 chr1 - 155903688-155909188 155904188
PIGV 55650 1 chr1 + 27109453-27115178 27114678
EIF4ENIF1 56478 1 chr22 - 31885047-31890874 31885547
PTPRF 5792 1 chr1 + 43991546-43997046 43996546
YIPF4 84272 1 chr2 + 32497957-32503457 32502957
KCNH5 27133 1 chr14 - 63568084-63573584 63568584
PURB 5814 1 chr7 - 44924460-44929960 44924960
TNFRSF12A 51330 1 chr16 + 3065312-3070812 3070312
COQ5 84274 1 chr12 - 120966464-120971964 120966964
SNX10 29887 1 chr7 + 26326514-26332014 26331514
INPPL1 3636 1 chr11 + 71930881-71936381 71935881
AVPR2 554 1 chrX + 153165528-153171028 153170528
METTL22 79091 1 chr16 + 8710526-8716026 8715526
LRAT 9227 1 chr4 + 155660162-155665662 155665162
TAT 6898 1 chr16 - 71610498-71615998 71610998
KLF2 10365 1 chr19 + 16430650-16436150 16435650
ZBTB4 57659 2 chr17 - 7382444-7392568 7382944
SFMBT2 57713 1 chr10 - 7450803-7458448 7451303
SEMA4G 57715 1 chr10 + 102727285-102732785 102732285
PLN 5350 1 chr6 + 118864441-118869941 118869441
FLRT2 23768 1 chr14 + 85991487-85996987 85996487
TIAL1 7073 1 chr10 - 121356041-121361541 121356541
RASGRF2 5924 1 chr5 + 80251507-80257007 80256507
STYXL1 51657 1 chr7 - 75676821-75682321 75677321
ZNF664 144348 1 chr12 + 124452761-124458261 124457761
EHD1 10938 1 chr11 - 64645691-64651191 64646191
C7orf23 79161 1 chr7 - 86848531-86854031 86849031
BCAS3 54828 1 chr17 + 58750171-58755671 58755171
TRAPPC3 27095 1 chr1 - 36621154-36626654 36621654
GABARAPL1 23710 1 chr12 + 10360488-10365988 10365488
TLR9 54106 1 chr3 - 52259679-52265179 52260179
MPEG1 219972 1 chr11 - 58979994-58985494 58980494
FN3KRP 79672 1 chr17 + 80669581-80675081 80674581
ACBD7 414149 1 chr10 - 15130275-15135775 15130775
SENP8 123228 1 chr15 + 72401598-72411130 72410630
COL3A1 1281 1 chr2 + 189834098-189839598 189839098
NUDT5 11164 1 chr10 - 12237643-12243143 12238143
RAD9B 144715 1 chr12 + 110935004-110940504 110940004
METTL9 51108 1 chr16 + 21605855-21611355 21610855
FAM57B 83723 1 chr16 - 30041686-30047186 30042186
GIT2 9815 1 chr12 - 110433694-110439194 110434194
PALLD 23022 1 chr4 + 169413216-169418716 169418216
INHBE 83729 1 chr12 + 57844095-57849595 57849095
CYP3A4 1576 1 chr7 - 99381311-99386811 99381811
FZD2 2535 1 chr17 + 42629811-42635311 42634811
MYPN 84665 1 chr10 + 69860873-69869689 69869189
CENPL 91687 1 chr1 - 173792770-173798777 173793270
C4orf3 401152 1 chr4 - 120221468-120230600 120221968
PLEKHG5 57449 1 chr1 - 6579621-6585121 6580121
PPIG 9360 1 chr2 + 170435849-170441349 170440849
RNF44 22838 1 chr5 - 175963921-175969421 175964421
LAT 27040 1 chr16 + 28991146-28996886 28996386
TMSB10 9168 1 chr2 + 85127762-85133262 85132762
TRPS1 7227 1 chr8 - 116680728-116686228 116681228
ZMYND8 23613 1 chr20 - 45984974-45990474 45985474
TFG 10342 1 chr3 + 100423133-100428885 100428385
EBAG9 9166 1 chr8 + 110546928-110552809 110552309
SHKBP1 92799 1 chr19 + 41077756-41083256 41082756
FAM100A 124402 1 chr16 - 4664427-4669927 4664927
COBLL1 22837 1 chr2 - 165697428-165702928 165697928
TCTN2 79867 1 chr12 + 124150659-124156159 124155659
KIF5A 3798 1 chr12 + 57938846-57944346 57943846
PROS1 5627 1 chr3 - 93692434-93697934 93692934
FAM46C 54855 2 chr1 + 118143603-118149103 118148603
DSTN 11034 1 chr20 + 17545598-17551098 17550598
KBTBD2 25948 1 chr7 - 32930968-32936468 32931468
ZNF138 7697 1 chr7 + 64249765-64255265 64254765
F2RL1 2150 1 chr5 + 76109832-76115332 76114832
PPFIBP1 8496 1 chr12 + 27672044-27677544 27677044
EVL 51466 1 chr14 + 100526750-100532250 100531750
CPT2 1376 1 chr1 + 53657100-53662600 53662100
CR1L 1379 1 chr1 + 207813457-207818957 207818457
RRM2 6241 1 chr2 + 10257694-10263362 10262862
CTTN 2017 1 chr11 + 70239611-70245111 70244611
PVRL3 25945 1 chr3 + 110785605-110791514 110791014
EMP1 2012 1 chr12 + 13344601-13350101 13349601
LEMD2 221496 1 chr6 - 33754219-33761906 33754719
MAP3K6 9064 1 chr1 - 27692837-27698337 27693337
ADAM32 203102 1 chr8 + 38960049-38965549 38965049
NLRP10 338322 1 chr11 - 7984559-7990059 7985059
THUMPD1 55623 1 chr16 - 20752699-20758199 20753199
RGS19 10287 1 chr20 - 62710345-62716324 62710845
MRPS30 10884 1 chr5 + 44804026-44809526 44809026
LCE2A 353139 1 chr1 + 152665839-152671339 152670839
HIST1H2AJ 8331 1 chr6 - 27782018-27787518 27782518
LPIN2 9663 2 chr18 - 3011445-3016945 3011945
HIST1H2AC 8334 1 chr6 + 26119372-26124872 26124372
LRP4 4038 1 chr11 - 46939673-46945173 46940173
CDC123 8872 1 chr10 + 12232960-12238460 12237960
ARHGEF7 8874 1 chr13 + 111762623-111768123 111767623
TSHR 7253 1 chr14 + 81416868-81422368 81421868
HPD 3242 1 chr12 - 122326017-122331517 122326517
MAP4 4134 1 chr3 - 48130269-48135769 48130769
TMEM212 389177 1 chr3 + 171556138-171561638 171561138
PSMB4 5692 1 chr1 + 151367040-151372540 151372040
CAMK2N1 55450 1 chr1 - 20812228-20817728 20812728
CCDC7 221016 1 chr10 + 32730040-32735540 32735040
CAPN1 823 1 chr11 + 64943685-64949803 64949303
CAPG 822 1 chr2 - 85637320-85646197 85637820
NEDD9 4739 1 chr6 - 11382081-11387581 11382581
LAMB4 22798 1 chr7 - 107770301-107775801 107770801
MEAF6 64769 1 chr1 - 37979920-37985420 37980420
XIRP1 165904 1 chr3 - 39233577-39239085 39234077
PLD3 23646 1 chr19 + 40849331-40854831 40854331
CTBS 1486 1 chr1 - 85039663-85045163 85040163
INIP 58493 1 chr9 - 115479887-115485387 115480387
EMR3 84658 1 chr19 - 14785230-14790730 14785730
ARID2 196528 2 chr12 + 46118619-46124119 46123619
OVOL2 58495 1 chr20 - 18038021-18043521 18038521
SULT1E1 6783 1 chr4 - 70725370-70730870 70725870
HSPA13 6782 1 chr21 - 15755009-15760509 15755509
FAT1 2195 1 chr4 - 187644487-187649987 187644987
PHKB 5257 1 chr16 + 47490209-47495709 47495209
SP1 6667 1 chr12 + 53768978-53774927 53774427
TCEA3 6920 1 chr1 - 23750761-23756261 23751261
USP40 55230 1 chr2 - 234473736-234479236 234474236
SLC24A4 123041 1 chr14 + 92783924-92790651 92790151
HCST 10870 1 chr19 + 36388381-36393881 36393381
REL 5966 2 chr2 + 61103751-61109251 61108751
C11orf45 219833 1 chr11 - 128775092-128780964 128775592
GGNBP2 79893 1 chr17 + 34895736-34901236 34900736
THNSL1 79896 1 chr10 + 25300507-25306007 25305507
BARD1 580 1 chr2 - 215673928-215679428 215674428
ADAM9 8754 1 chr8 + 38849504-38855004 38854504
DTWD1 56986 1 chr15 + 49908225-49913725 49913225
GPR137C 283554 1 chr14 + 53014865-53020365 53019865
DCN 1634 1 chr12 - 91571829-91581806 91572329
DNAJB4 11080 1 chr1 + 78465635-78471135 78470635
ATP6V1E2 90423 1 chr2 - 46746596-46752096 46747096
HIST1H2AH 85235 2 chr6 + 27109860-27115360 27114860
NCOA7 135112 1 chr6 + 126097306-126102806 126102306
HIST1H2BK 85236 2 chr6 - 27114137-27119637 27114637
GIGYF1 64599 1 chr7 - 100286370-100291870 100286870
CCDC92 80212 1 chr12 - 124456663-124462163 124457163
THUMPD2 80745 1 chr2 - 40005916-40011416 40006416
YTHDC1 91746 1 chr4 - 69215324-69220824 69215824
IRX3 79191 1 chr16 - 54319878-54325378 54320378
SENP1 29843 1 chr12 - 48499275-48505091 48499775
URI1 8725 1 chr19 + 30409550-30419550 0
CDH3 1001 1 chr16 + 68673150-68678650 68678150
VEPH1 79674 1 chr3 - 157216945-157226415 157217445
FAM89A 375061 1 chr1 - 231175495-231180995 231175995
ENC1 8507 1 chr5 - 73936749-73942249 73937249
ARRDC3 57561 1 chr5 - 90678649-90684149 90679149
TCEANC 170082 1 chrX + 13666306-13671806 13671306
RASSF3 283349 1 chr12 + 64999292-65004792 65004292
P2RY6 5031 1 chr11 + 72970569-72981438 72980938
HIST3H3 8290 1 chr1 - 228612526-228618026 228613026
~ 100533183 1 chr12 + 124452761-124458261 124457761
PPRC1 23082 1 chr10 + 103887786-103893286 103892786
TRIM35 23087 1 chr8 - 27168334-27173834 27168834
SLC6A11 6538 1 chr3 + 10852916-10858416 10857916
RAB24 53917 1 chr5 - 176730244-176735744 176730744
LSM6 11157 1 chr4 + 147091834-147097334 147096834
CARS2 79587 1 chr13 - 111357980-111363480 111358480
SPTSSA 171546 1 chr14 - 34930968-34936468 34931468
TBC1D25 4943 1 chrX + 48393074-48398574 48398074
S100B 6285 1 chr21 - 48024535-48030035 48025035
CTNND2 1501 1 chr5 - 11903610-11909110 11904110
BMP4 652 1 chr14 - 54420770-54428554 54421270
C19orf47 126526 1 chr19 - 40853816-40859434 40854316
C16orf70 80262 1 chr16 + 67138914-67144414 67143914
MBD3 53615 1 chr19 - 1592152-1597652 1592652
TIFAB 497189 1 chr5 - 134787589-134793089 134788089
NLK 51701 1 chr17 + 26364687-26370187 26369687
EPB41L4B 54566 1 chr9 - 112082521-112088021 112083021
ZNF470 388566 1 chr19 + 57073889-57079389 57078889
KBTBD13 390594 1 chr15 + 65364153-65369653 65369153
SAT2 112483 1 chr17 - 7530694-7536194 7531194
DNAJC9 23234 1 chr10 - 75006525-75012025 75007025
PDE7B 27115 1 chr6 + 136167833-136173333 136172833
FOXP4 116113 1 chr6 + 41509163-41514663 41514163
AANAT 15 1 chr17 + 74444432-74449932 74449432
SELPLG 6404 1 chr12 - 109025354-109032670 109025854
RUNX2 860 1 chr6 + 45291053-45296553 45296053
PSMD9 5715 1 chr12 + 122321636-122327136 122326636
LACC1 144811 1 chr13 + 44448419-44454468 44453968
PPP1R3F 89801 1 chrX + 49121305-49126805 49126305
STIM2 57620 1 chr4 + 26857312-26862812 26862312
EPHX3 79852 1 chr19 - 15342731-15348858 15343231
HDHD2 84064 1 chr18 - 44676371-44681871 44676871
ULK4 54986 1 chr3 - 42003160-42008660 42003660
TRAPPC4 51399 1 chr11 + 118884240-118889740 118889240
CLDN23 137075 1 chr8 + 8554665-8560165 8559665
FAM219A 203259 1 chr9 - 34458068-34463568 34458568
SMCHD1 23347 1 chr18 + 2650885-2656385 2655885
PFKM 5213 1 chr12 + 48494655-48500155 48499655
SH3BGRL2 83699 2 chr6 + 80335999-80341499 80340999
CCT2 10576 1 chr12 + 69974207-69979961 69979461
NPC2 10577 1 chr14 - 74959584-74965084 74960084
SLC7A7 9056 1 chr14 - 23284607-23294020 23285107
UBE2E1 7324 2 chr3 + 23842383-23852433 23851933
RAB23 51715 1 chr6 - 57085757-57092078 57086257
BTBD17 388419 1 chr17 - 72357458-72362958 72357958
HOXD8 3234 1 chr2 + 176989421-176994967 176994467
OPRL1 4987 1 chr20 + 62706470-62716868 62716368
LMO2 4005 1 chr11 - 33913336-33918836 33913836
LHB 3972 1 chr19 - 49519847-49525347 49520347
HS3ST3A1 9955 1 chr17 - 13504744-13510244 13505244
SOWAHC 65124 1 chr2 + 110366910-110372410 110371910
THAP9 79725 1 chr4 + 83816836-83822336 83821836
GPX4 2879 1 chr19 + 1098935-1105148 1104648
TSHZ3 57616 1 chr19 - 31839690-31845190 31840190
CSRNP1 64651 1 chr3 - 39194602-39200102 39195102
TLR5 7100 1 chr1 - 223316124-223321624 223316624
NR2E1 7101 1 chr6 + 108482214-108487714 108487214
ADAM17 6868 1 chr2 - 9695417-9700917 9695917
HIPK1 204851 1 chr1 + 114466995-114472495 114471995
HCLS1 3059 1 chr3 - 121379291-121384791 121379791
GTF3A 2971 1 chr13 + 27993680-27999180 27998680
YEATS2 55689 1 chr3 + 183410605-183416105 183415605
GUCY1A2 2977 1 chr11 - 106888671-106894171 106889171
PHLPP1 23239 1 chr18 + 60377671-60383171 60382671
DENND1A 57706 1 chr9 - 126691917-126697417 126692417
FN1 2335 1 chr2 - 216300291-216305791 216300791
PLXNB1 5364 1 chr3 - 48470372-48476460 48470872
PON3 5446 1 chr7 - 95025187-95030687 95025687
RPL11 6135 1 chr1 + 24013268-24018768 24018268
ASB4 51666 1 chr7 + 95110212-95115712 95115212
SLC24A2 25769 1 chr9 - 19786517-19792017 19787017
NCR1 9437 1 chr19 + 55412507-55418007 55417507
ING4 51147 1 chr12 - 6771808-6777308 6772308
RNF165 494470 1 chr18 + 43909186-43914686 43914186
MLLT3 4300 1 chr9 - 20622014-20627514 20622514
NDFIP1 80762 1 chr5 + 141483323-141488823 141488323
PDGFC 56034 1 chr4 - 157892046-157897546 157892546
FAT4 79633 1 chr4 + 126232566-126238066 126237566
JAK3 3718 1 chr19 - 17958341-17963841 17958841
CNN2 1265 1 chr19 + 1021297-1026797 1026297
MSN 4478 1 chrX + 64882510-64888010 64887510
MSANTD3 91283 1 chr9 + 103184494-103192295 103191795
PQLC1 80148 1 chr18 - 77711153-77716653 77711653
FUS 2521 2 chr16 + 31186430-31191930 31191430
FAM53A 152877 1 chr4 - 1685218-1690988 1685718
DCAF8 50717 1 chr1 - 160231850-160237350 160232350
PARVG 64098 1 chr22 + 44563835-44569335 44568835
SLC35G6 643664 2 chr17 + 7379720-7385220 7384720
INTS1 26173 1 chr7 - 1543518-1549018 1544018
AMACR 23600 1 chr5 - 34007720-34013220 34008220
PTGES3 10728 1 chr12 - 57081578-57087078 57082078
SDPR 8436 1 chr2 - 192711506-192717006 192712006
MKRN2 23609 1 chr3 + 12593512-12599012 12598512
TMCC3 57458 1 chr12 - 95043824-95049324 95044324
GATAD2B 57459 1 chr1 - 153894951-153900451 153895451
RBM17 84991 1 chr10 + 6125948-6131808 6131308
SFTPD 6441 1 chr10 - 81708361-81713861 81708861
ZNF708 7562 1 chr19 - 21511712-21517212 21512212
OTOGL 283310 1 chr12 + 80598232-80603732 80603232
VSNL1 7447 1 chr2 + 17716806-17722306 17721806
MFSD6 54842 1 chr2 + 191268080-191273580 191273080
GINM1 116254 1 chr6 + 149882527-149888027 149887527
CBLL1 79872 1 chr7 + 107379278-107384778 107384278
C5orf20 140947 1 chr5 - 134782538-134788038 134783038
HIST2H2BF 440689 1 chr1 - 149783428-149788928 149783928
SEPT10 151011 1 chr2 - 110371283-110376783 110371783
CREBBP 1387 1 chr16 - 3929621-3935121 3930121
GREM2 64388 1 chr1 - 240774962-240780462 240775462
GCAT 23464 1 chr22 + 38198911-38204411 38203911
FAM222B 55731 1 chr17 - 27169341-27174841 27169841
DNAJA3 9093 1 chr16 + 4470805-4476305 4475805
PLEKHG7 440107 1 chr12 + 93125264-93130764 93130264
DYRK2 8445 1 chr12 + 68037511-68043011 68042511
HIST1H2AM 8329 1 chr6 + 27770976-27776476 27775976
KIF13B 23303 1 chr8 - 29120110-29125610 29120610
VPS29 51699 1 chr12 - 110939416-110944916 110939916
MGA 23269 1 chr15 + 41947609-41953109 41952609
SUPT7L 9913 1 chr2 - 27885949-27891449 27886449
ARNT2 9915 1 chr15 + 80691691-80697191 80696691
MYO6 4646 1 chr6 + 76453908-76459408 76458908
MAN1A1 4121 1 chr6 - 119670431-119675931 119670931
NAE1 8883 1 chr16 - 66864379-66869879 66864879
VLDLR 7436 1 chr9 + 2616792-2622292 2621792
~ 8968 1 chr6 - 26250335-26255835 26250835
EZR 7430 1 chr6 - 159238840-159245456 159239340
AQP9 366 1 chr15 + 58425407-58430907 58430407
PSMA3 5684 1 chr14 + 58706522-58712022 58711522
TMIGD1 388364 2 chr17 - 28660565-28666065 28661065
SMURF2 64750 1 chr17 - 62657886-62663386 62658386
C16orf46 123775 1 chr16 - 81110372-81115872 81110872
DCTN2 10540 1 chr12 - 57940614-57946114 57941114
FOS 2353 1 chr14 + 75740480-75745980 75745480
RHOB 388 1 chr2 + 20641834-20647334 20646834
ISCA2 122961 1 chr14 + 74955422-74960922 74960422
CDAN1 146059 1 chr15 - 43028917-43034417 43029417
TGFBRAP1 9392 1 chr2 - 105945648-105951148 105946148
NQO1 1728 1 chr16 - 69760033-69765533 69760533
GCN1L1 10985 1 chr12 - 120632013-120637513 120632513
CTHRC1 115908 1 chr8 + 104378742-104385160 104384660
FGF18 8817 1 chr5 + 170841666-170847166 170846666
KCNMB3 27094 2 chr3 - 178984338-178989838 178984838
GIMAP8 155038 1 chr7 + 150142961-150148461 150147961
PRIMA1 145270 1 chr14 - 94254266-94259766 94254766
TMEM9B 56674 1 chr11 - 8985489-8990989 8985989
NUPL2 11097 1 chr7 + 23216445-23221945 23221445
OSGIN1 29948 1 chr16 + 83981826-83987326 83986826
PNMA3 29944 1 chrX + 152219765-152225265 152224765
C15orf53 400359 1 chr15 + 38983798-38989298 38988798
FOXC1 2296 1 chr6 + 1605680-1611180 1610680
ZNF41 7592 1 chrX - 47341845-47347345 47342345
ACTB 60 1 chr7 - 5569732-5575232 5570232
ROCK1 6093 1 chr18 - 18691312-18696812 18691812
RNF130 55819 1 chr5 - 179498609-179504109 179499109
~ 653604 1 chr1 - 149784736-149790236 149785236
PTOV1 53635 1 chr19 + 50349415-50354915 50354415
POLR2A 5430 1 chr17 + 7382697-7388197 7387697
THOC2 57187 1 chrX - 122866404-122871904 122866904
TP53BP2 7159 1 chr1 - 224033174-224038674 224033674
GABRE 2564 1 chrX - 151142651-151148151 151143151
PAPLN 89932 1 chr14 + 73699204-73704704 73704204
LRRN4 164312 1 chr20 - 6034226-6039726 6034726
TBC1D22A 25771 1 chr22 + 47153517-47159017 47158517
AGPAT6 137964 1 chr8 + 41430706-41436206 41435706
SLC17A9 63910 1 chr20 + 61578998-61584498 61583998
CXCL17 284340 1 chr19 - 42946636-42952136 42947136
TULP3 7289 1 chr12 + 2995032-3000532 3000032
TWIST1 7291 1 chr7 - 19156795-19162295 19157295
CLTA 1211 1 chr9 + 36185852-36191352 36190852
SRRM2 23524 1 chr16 + 2797329-2802829 2802329
C1QTNF3 114899 1 chr5 - 34042871-34048371 34043371
C1orf95 375057 1 chr1 + 226731500-226737000 226736500
GPR151 134391 1 chr5 - 145895176-145900676 145895676
CCNG1 900 1 chr5 + 162859576-162865076 162864576
ATG2A 23130 1 chr11 - 64684222-64689722 64684722
OIT3 170392 1 chr10 + 74648338-74653838 74653338
SP9 100131390 1 chr2 + 175194820-175200320 175199820
~ 9865 1 chr7 - 28997529-29003029 28998029
AP2B1 163 1 chr17 + 33909281-33914781 33914281
HHLA3 11147 1 chr1 + 70815492-70820992 70820492
IFT74 80173 1 chr9 + 26942036-26947809 26947309
ITGB1 3688 1 chr10 - 33246322-33252293 33246822
MTIF2 4528 1 chr2 - 55495815-55501384 55496315
CLINT1 9685 1 chr5 - 157285683-157291183 157286183
SAG 6295 1 chr2 + 234211308-234216808 234216308
NNMT 4837 1 chr11 + 114161534-114167034 114166534
DAAM1 23002 1 chr14 + 59650380-59655880 59655380
PAFAH1B1 5048 1 chr17 + 2491922-2497422 2496922
C12orf23 90488 1 chr12 + 107344543-107350043 107349543
CTSL1 1514 1 chr9 + 90335973-90341473 90340973
FTL 2512 1 chr19 + 49463565-49469065 49468565
CTSH 1512 1 chr15 - 79236920-79242420 79237420
RFT1 91869 1 chr3 - 53163970-53169470 53164470
GLI1 2735 1 chr12 + 57848917-57854433 57853933
CD40LG 959 1 chrX + 135725335-135730835 135730335
KREMEN2 79412 1 chr16 + 3009216-3014716 3014216
SLC25A15 10166 1 chr13 + 41358546-41364046 41363546
OR2F2 135948 1 chr7 + 143627325-143632825 143632325
PIK3CA 5290 1 chr3 + 178861310-178866810 178866310
GBE1 2632 1 chr3 - 81810450-81815950 81810950
RAD9A 5883 1 chr11 + 67154422-67161275 67160775
PLCL2 23228 1 chr3 + 16921451-16926951 16926451
NFKBID 84807 1 chr19 - 36391052-36396552 36391552
SSBP2 23635 1 chr5 - 81046572-81052072 81047072
KANK1 23189 1 chr9 + 465293-470793 470293
CHIC2 26511 1 chr4 - 54930315-54935815 54930815
BHLHE41 79365 1 chr12 - 26277503-26283003 26278003
RAB13 5872 2 chr1 - 153957342-153963853 153957842
~ 100130880 1 chr7 + 137633093-137638593 137638093
FAM124B 79843 1 chr2 - 225266211-225271711 225266711
CCRL1 51554 1 chr3 + 132311093-132319480 132318980
SLC4A1AP 22950 1 chr2 + 27881337-27886837 27886337
GRIN2B 2904 1 chr12 - 14132522-14138022 14133022
EPB41L1 2036 1 chr20 + 34674425-34681131 34680631
DHH 50846 1 chr12 - 49488102-49493602 49488602
SLC7A5 8140 1 chr16 - 87902600-87908100 87903100
C1orf61 10485 1 chr1 - 156398684-156404184 156399184
TLR8 51311 1 chrX + 12919738-12925238 12924738
~ 100144595 1 chr2 + 155308950-155318950 0
C16orf90 646174 1 chr16 - 3544921-3550421 3545421
NR2F2 7026 1 chr15 + 96864156-96874610 96874110
NFKBIE 4794 1 chr6 - 44233025-44238525 44233525
MNAT1 4331 1 chr14 + 61196458-61201958 61201458
DOK2 9046 1 chr8 - 21770705-21776205 21771205
UBE3A 7337 1 chr15 - 25683675-25689175 25684175
PYGM 5837 2 chr11 - 64527687-64533187 64528187
TMEM189 7335 1 chr20 - 48729235-48737496 48729735
LRTOMT 220074 1 chr11 + 71786376-71791876 71791376
ALDH18A1 5832 1 chr10 - 97416067-97421567 97416567
UBE2W 55284 1 chr8 - 74790645-74796145 74791145
HOXC8 3224 1 chr12 + 54397889-54403389 54402889
RGS2 5997 1 chr1 + 192773168-192778668 192778168
MED13 9969 1 chr17 - 60142143-60147643 60142643
CACNA1G 8913 1 chr17 + 48633428-48638928 48638428
BCL10 8915 1 chr1 - 85742087-85747587 85742587
ABHD5 51099 1 chr3 + 43727374-43732874 43732374
KIAA0182 23199 1 chr16 + 85640028-85647423 85646923
AQP2 359 1 chr12 + 50339523-50345023 50344523
ALDH2 217 1 chr12 + 112199690-112205190 112204690
FAM133B 257415 1 chr7 - 92219206-92224706 92219706
CA2 760 1 chr8 + 86371130-86376630 86376130
ARHGAP27 201176 1 chr17 - 43509782-43515282 43510282
TMF1 7110 1 chr3 - 69100984-69106484 69101484
CTTNBP2NL 55917 1 chr1 + 112933799-112939299 112938799
PLEKHO1 51177 1 chr1 + 150117169-150122669 150122169
THBS2 7058 1 chr6 - 169653637-169659137 169654137
ZNF839 55778 1 chr14 + 102778713-102786587 102786087
TGIF1 7050 1 chr18 + 3407071-3412571 3412071
NUP37 79023 1 chr12 - 102511861-102517361 102512361
MMGT1 93380 1 chrX - 135055634-135061134 135056134
UTP14A 10813 1 chrX + 129035096-129040596 129040096
PRELID1 27166 1 chr5 + 176725762-176731262 176730762
TIMM8A 1678 1 chrX - 100603208-100608957 100603708
AMY2B 280 1 chr1 + 104092321-104102321 0
KDM6B 23135 1 chr17 + 7738234-7743734 7743234
PNRC1 10957 1 chr6 + 89785428-89790928 89790428
IGF2 3481 1 chr11 - 2170333-2175833 2170833
IGF1R 3480 1 chr15 + 99187760-99193260 99192760
LRIG3 121227 1 chr12 - 59312827-59319319 59313327
MN1 4330 1 chr22 - 28196986-28202486 28197486
BRAF 673 1 chr7 - 140624064-140629564 140624564
MYO9A 4649 1 chr15 - 72409940-72415440 72410440
CYP3A7 1551 1 chr7 - 99332319-99337819 99332819
H1F0 3005 1 chr22 + 38196113-38201613 38201113
RUFY1 80230 1 chr5 + 178972561-178978061 178977561
ANKRD35 148741 1 chr1 + 145544208-145549708 145549208
RIT1 6016 1 chr1 - 155880206-155886193 155880706
MYO1E 4643 1 chr15 - 59664571-59670071 59665071
HAS2 3037 1 chr8 - 122653130-122658630 122653630
HADHA 3030 1 chr2 - 26467094-26472594 26467594
HADHB 3032 1 chr2 + 26462615-26468115 26467615
B4GALT4 8702 1 chr3 - 118959252-118964752 118959752
DIP2B 57609 1 chr12 + 50893767-50899267 50898767
B3GALT2 8707 1 chr1 - 193155243-193160743 193155743
IFT172 26160 1 chr2 - 27712071-27717571 27712571
C2orf62 375307 1 chr2 + 219216578-219222078 219221578
TMEFF2 23671 1 chr2 - 193059144-193064644 193059644
SH3BP4 23677 1 chr2 + 235855627-235861127 235860627
GNAI1 2770 1 chr7 + 79759139-79765570 79765070
RAB19 401409 1 chr7 + 140098842-140104342 140103842
GJD3 125111 1 chr17 - 38520445-38525945 38520945
MAB21L1 4081 1 chr13 - 36050332-36055832 36050832
EPM2AIP1 9852 1 chr3 - 37034295-37039795 37034795
TBCC 6903 1 chr6 - 42713384-42718884 42713884
FARP2 9855 1 chr2 + 242290663-242296163 242295663
C19orf55 148137 1 chr19 + 36244043-36249543 36249043
KLRK1 22914 1 chr12 - 10542153-10547653 10542653
ADD1 118 1 chr4 + 2840583-2846083 2845583
VSIG10L 147645 1 chr19 - 51844878-51850378 51845378
NFYA 4800 1 chr6 + 41035706-41041206 41040706
FAM104B 90736 1 chrX - 55187035-55192628 55187535
HSPB6 126393 1 chr19 - 36247430-36252930 36247930
PRKACA 5566 1 chr19 - 14224492-14233559 14224992
KIAA0922 23240 1 chr4 + 154382497-154387997 154387497
HPS6 79803 1 chr10 + 103820123-103825623 103825123
SLC2A1 6513 1 chr1 - 43424347-43429847 43424847
HP1BP3 50809 1 chr1 - 21112681-21118181 21113181
SH3BP5 9467 1 chr3 - 15382401-15387901 15382901
DUSP10 11221 1 chr1 - 221910302-221920516 221910802
CRKL 1399 1 chr22 + 21266713-21272213 21271713
SATB1 6304 1 chr3 - 18479765-18485265 18480265
TMEM63A 9725 1 chr1 - 226069920-226075420 226070420
SEMA3E 9723 1 chr7 - 83277979-83283479 83278479
BIRC2 329 2 chr11 + 102212912-102218604 102218104
SECISBP2L 9728 1 chr15 - 49338260-49343760 49338760
RC3H2 54542 1 chr9 - 125667062-125672562 125667562
~ 8359 1 chr6 + 26016906-26022406 26021906
RALGPS1 9649 1 chr9 + 129672052-129677552 129677052
RASL11B 65997 1 chr4 + 53723494-53728994 53728494
KAZN 23254 1 chr1 + 14920212-14925712 14925212
HIST1H3J 8350 1 chr6 + 26015717-26021217 26020717
EDEM2 55741 1 chr20 - 33734661-33740161 33735161
BCMO1 53630 1 chr16 + 81267295-81272795 81272295
~ 8353 1 chr6 + 26220382-26225882 26225382
~ 100861540 1 chr7 - 99332319-99337819 99332819
PCSK1 5122 1 chr5 - 95767363-95773985 95767863
GORAB 92344 1 chr1 + 170496262-170501762 170501262
TTK 7272 1 chr6 + 80709321-80714821 80714321
DNAI1 27019 1 chr9 + 34453810-34459310 34458810
SKA1 220134 1 chr18 + 47896391-47901891 47901391
GMNN 51053 1 chr6 + 24770158-24776140 24775640
SRSF3 6428 1 chr6 + 36557089-36562589 36562089
SRSF4 6429 1 chr1 - 29508137-29513637 29508637
MLH1 4292 1 chr3 + 37029840-37035767 37035267
ADCK5 203054 1 chr8 + 145592730-145598230 145597730
NSFL1C 55968 1 chr20 - 1447837-1453337 1448337
CDHR2 54825 1 chr5 + 175964511-175970011 175969511
C7orf29 113763 1 chr7 + 150021937-150027437 150026937
C4orf36 132989 1 chr4 - 87813075-87818575 87813575
TMEM178A 130733 1 chr2 + 39887637-39893534 39893034
SUV39H1 6839 1 chrX + 48550130-48555630 48555130
FAM196B 100131897 1 chr5 - 169407244-169412744 169407744
PLCB4 5332 1 chr20 + 9044700-9050200 9049700
RPL37 6167 1 chr5 - 40834887-40840387 40835387
CNKSR1 10256 1 chr1 + 26498980-26504480 26503980
ECI1 1632 1 chr16 - 2301102-2306602 2301602
TET2 54790 1 chr4 + 106062031-106068341 106067841
TMEM242 729515 1 chr6 - 157744753-157750253 157745253
NUDCD1 84955 1 chr8 - 110341662-110351350 110342162
BUD13 84811 1 chr11 - 116643214-116648714 116643714
RGS7BP 401190 1 chr5 + 63796773-63802273 63801773
PODN 127435 1 chr1 + 53522723-53528384 53527884
GFM2 84340 1 chr5 - 74062542-74068042 74063042
NRP2 8828 1 chr2 + 206542223-206547723 206547223
FBXW4 6468 1 chr10 - 103454243-103459743 103454743
C16orf3 750 1 chr16 - 90095809-90101309 90096309
SFN 2810 1 chr1 + 27184632-27190132 27189632
PRDM14 63978 1 chr8 - 70983062-70988562 70983562
FADD 8772 1 chr11 + 70044268-70049768 70049268
CCDC81 60494 1 chr11 + 86080777-86086277 86085777
KCNN1 3780 1 chr19 + 18057110-18062610 18062110
B2M 567 1 chr15 + 44998684-45004184 45003684
ATP6V1C2 245973 1 chr2 + 10856774-10862274 10861774
UPK3B 80761 1 chr7 + 76134744-76140244 76139744
PTK2B 2185 1 chr8 + 27163998-27169498 27168998
PPP1R14D 54866 1 chr15 - 41120407-41125907 41120907
MYBL2 4605 1 chr20 + 42290708-42296208 42295708
RPRD1B 58490 1 chr20 + 36656947-36662447 36661947
SERPINF2 5345 1 chr17 + 1641129-1646819 1646319
GGT5 2687 1 chr22 - 24640610-24646110 24641110
CDK6 1021 1 chr7 - 92462731-92470941 92463231
ZFHX4 79776 1 chr8 + 77588514-77594014 77593514
CDKN2A 1029 1 chr9 - 21993990-21999490 21994490
GATA5 140628 1 chr20 - 61050526-61056026 61051026
RNF144B 255488 1 chr6 + 18382580-18388080 18387580
GNMT 27232 1 chr6 + 42923499-42928999 42928499
SHFM1 7979 1 chr7 - 96338703-96344203 96339203
MUC15 143662 1 chr11 - 26593315-26598815 26593815
SHBG 6462 1 chr17 + 7528452-7533952 7533452
PPP1CA 5499 1 chr11 - 67168876-67174376 67169376
SIPA1 6494 1 chr11 + 65400577-65408091 65407591
MYO1G 64005 1 chr7 - 45018204-45023704 45018704
MMD 23531 1 chr17 - 53498841-53504341 53499341
CKMT2 1160 1 chr5 + 80524138-80529638 80529138
TXNDC16 57544 1 chr14 - 53018801-53024301 53019301
DCTN6 10671 1 chr8 + 30008812-30014312 30013812
MGAT1 4245 2 chr5 - 180236317-180242137 180236817
RPL13 6137 1 chr16 + 89622064-89627618 89627118
CPA5 93979 1 chr7 + 129979629-129985129 129984629
KCNIP2 30819 1 chr10 - 103599111-103608677 103599611
TMEM151B 441151 1 chr6 + 44233479-44238979 44238479
C13orf35 400165 1 chr13 + 113296357-113306357 0
FUT8 2530 1 chr14 + 65872309-65882309 0
RNF10 9921 1 chr12 + 120967131-120972631 120972131
C19orf6 91304 1 chr19 - 1020641-1026141 1021141
NUMA1 4926 1 chr11 - 71791073-71796573 71791573
NANOG 79923 1 chr12 + 7936994-7942494 7941994
KIDINS220 57498 1 chr2 - 8977255-8982755 8977755
CD38 952 2 chr4 + 15774930-15780430 15779930
PAQR4 124222 1 chr16 + 3014341-3019841 3019341
FOXN3 1112 1 chr14 - 90084994-90090494 90085494
XPO7 23039 1 chr8 + 21772179-21777679 21777179
MED4 29079 1 chr13 - 48668777-48674277 48669277
KDM4B 23030 1 chr19 + 4964123-4969623 4969123
PDIA4 9601 1 chr7 - 148725282-148730782 148725782
NFE2L3 9603 1 chr7 + 26186846-26192346 26191846
XPO6 23214 1 chr16 - 28222739-28228239 28223239
UBE4A 9354 1 chr11 + 118225295-118230795 118230295
C5orf30 90355 1 chr5 + 102589441-102594941 102594441
SLC25A3 5250 2 chr12 + 98982402-98987902 98987402
GCKR 2646 1 chr2 + 27714705-27720205 27719705
BLOC1S1 2647 1 chr12 + 56104817-56110317 56109817
DNMT3B 1789 1 chr20 + 31345190-31350690 31350190
P2RX7 5027 1 chr12 + 121565630-121571130 121570630
DKK1 22943 1 chr10 + 54069040-54074540 54074040
ACPT 93650 1 chr19 + 51288671-51298671 0
MDN1 23195 1 chr6 - 90528942-90534442 90529442
STX7 8417 1 chr6 - 132833837-132839337 132834337
STXBP5 134957 1 chr6 + 147520493-147525993 147525493
ENY2 56943 1 chr8 + 110341551-110347051 110346551
C6orf130 221443 1 chr6 - 41039688-41045188 41040188
MSL2 55167 1 chr3 - 135912810-135919688 135913310
GALC 2581 1 chr14 - 88459115-88465009 88459615
PNPO 55163 1 chr17 + 46013888-46019388 46018888
SCRN1 9805 1 chr7 - 30028925-30034905 30029425
CD276 80381 1 chr15 + 73971621-73977121 73976621
C8orf42 157695 1 chr8 - 494345-500781 494845
UBE2O 63893 1 chr17 - 74448788-74454288 74449288
PUM1 9698 1 chr1 - 31538064-31543564 31538564
RPS25 6230 1 chr11 - 118888557-118894057 118889057
CLIC4 25932 1 chr1 + 25066759-25072259 25071759
RPS27 6232 1 chr1 + 153958238-153963738 153963238
Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns.
Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.
A Django site.   Powered by PostgreSQL