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DNAI1 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 27019 dynein, axonemal, intermediate chain 1 chr9 + 34453810 - 34459310 34458810 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the DNAI1 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 34454784 34454801 1.0E-05 CAATTAAATAATTAAAAA 18 FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 34463785 34463802 3.0E-06 TTTAGAAATATTGATCTA 18 FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 34463785 34463802 3.0E-06 TAGATCAATATTTCTAAA 18 POU4F2_POU_full_monomeric_16_1 SELEX + 34454787 34454802 5.0E-06 TTAAATAATTAAAAAA 16 POU4F2_POU_full_monomeric_16_1 SELEX + 34458607 34458622 0.0E+00 TTGCATTATTCATGAG 16 NKX2-8_homeodomain_full_monomeric_9_1 SELEX + 34456513 34456521 8.0E-06 ACACTTGAA 9 SP8_C2H2_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 34454742 34454753 3.0E-06 GCCACGCCCCCA 12 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 34454791 34454800 6.0E-06 ATAATTAAAA 10 MYBL2_MYB_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 34458884 34458899 4.0E-06 ACCGTTGCGACTGGTA 16 GABPA_MA0062.2 JASPAR - 34458575 34458585 1.0E-06 CCGGAAGTGGA 11 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 34454742 34454752 3.0E-06 GCCACGCCCCC 11 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 34463601 34463618 2.0E-06 CCAGTTAAAAGCTAATTT 18 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454791 34454800 3.0E-06 ATAATTAAAA 10 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 34454786 34454799 7.0E-06 ATTAAATAATTAAA 14 DLX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 1.0E-05 AATAATTAAA 10 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 34463619 34463630 7.0E-06 AGTCATAAACTA 12 IRF7_IRF_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 34463730 34463743 1.0E-06 TCCAAAATGAAAGT 14 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 34454782 34454791 2.0E-06 TTCAATTAAA 10 Pax6_MA0069.1 JASPAR + 34454763 34454776 5.0E-06 TTCAAGCCTGAGTT 14 PKNOX1_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 34460108 34460119 4.0E-06 GGACAGATGTCA 12 PKNOX1_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34460108 34460119 6.0E-06 TGACATCTGTCC 12 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 34463602 34463618 6.0E-06 CAGTTAAAAGCTAATTT 17 ETV5_ETS_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34456320 34456329 9.0E-06 ACCGGAAGCA 10 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 34454742 34454752 1.0E-06 GCCACGCCCCC 11 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 34458702 34458712 1.0E-05 GCCCCGCCCCC 11 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 34454682 34454693 6.0E-06 ATGCTTAAATTA 12 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 34454787 34454798 2.0E-06 TTAAATAATTAA 12 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 34458607 34458618 8.0E-06 TTGCATTATTCA 12 PROX1_PROX_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34460226 34460237 6.0E-06 GAAGACTCCTTG 12 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 34454784 34454797 0.0E+00 CAATTAAATAATTA 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 34454784 34454797 0.0E+00 TAATTATTTAATTG 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 34454792 34454805 1.0E-06 TAATTAAAAAAATA 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 34454792 34454805 1.0E-05 TATTTTTTTAATTA 14 FOXG1_forkhead_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 34454787 34454803 3.0E-06 TTAAATAATTAAAAAAA 17 MEF2D_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34463611 34463622 2.0E-06 ACTAAAATTAGC 12 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 34454796 34454807 7.0E-06 TAAAAAAATAAA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 34454681 34454693 4.0E-06 AATGCTTAAATTA 13 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 34454786 34454798 7.0E-06 ATTAAATAATTAA 13 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 34458606 34458618 8.0E-06 CTTGCATTATTCA 13 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 34454791 34454798 4.0E-06 ATAATTAA 8 ELF4_ETS_full_monomeric_12_1 SELEX - 34458577 34458588 1.0E-06 GACCCGGAAGTG 12 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 34454792 34454806 5.0E-06 TAATTAAAAAAATAA 15 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 34454741 34454754 5.0E-06 TGCCACGCCCCCAG 14 IRF8_IRF_full_dimeric_14_1 SELEX - 34454773 34454786 3.0E-06 TTGAAAGAGAAACT 14 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 34454786 34454798 2.0E-06 ATTAAATAATTAA 13 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 34454788 34454798 7.0E-06 TAAATAATTAA 11 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 34458608 34458618 6.0E-06 TGCATTATTCA 11 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 9.0E-06 AATAATTAAA 10 HINFP1_C2H2_full_dimeric_20_1 SELEX - 34458301 34458320 1.0E-06 GCGGTCCTGTCGGCGTCCGC 20 CUX1_CUT_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 34463670 34463686 9.0E-06 ATAAAAAAAAAATCAAA 17 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454782 34454791 6.0E-06 TTCAATTAAA 10 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR - 34454717 34454734 3.0E-06 GGAGAGAAGGCAGCCAGC 18 ETV1_ETS_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34456320 34456329 7.0E-06 ACCGGAAGCA 10 GLI2_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 34458925 34458938 6.0E-06 GACCACACACAAGA 14 MEF2A_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34463611 34463622 3.0E-06 ACTAAAATTAGC 12 GCM1_GCM_full_dimeric_16_1 SELEX - 34454894 34454909 7.0E-06 ACATGGGCGCCATCAT 16 Pknox2_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 34460108 34460119 7.0E-06 GGACAGATGTCA 12 Pknox2_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34460108 34460119 6.0E-06 TGACATCTGTCC 12 TGIF2_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 34460108 34460119 6.0E-06 GGACAGATGTCA 12 TGIF2_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34460108 34460119 5.0E-06 TGACATCTGTCC 12 Creb5_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 34457388 34457399 4.0E-06 GATGACATCATT 12 Creb5_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34457388 34457399 7.0E-06 AATGATGTCATC 12 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 34456192 34456221 3.0E-06 AAAAAAAAGAAAAAAAAGTATTCTCTTGCA 30 Klf4_MA0039.2 JASPAR - 34458645 34458654 5.0E-06 TGGGTGGGGC 10 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 34454947 34454960 1.0E-06 GTCATCATCATTGC 14 TBX1_TBX_DBD_dimeric_19_1 SELEX + 34456223 34456241 3.0E-06 AAGGGTGACTTTAGCAGTT 19 JDP2_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX + 34457388 34457399 5.0E-06 GATGACATCATT 12 JDP2_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX - 34457388 34457399 7.0E-06 AATGATGTCATC 12 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 0.0E+00 AATAATTAAA 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 34454787 34454802 1.0E-06 TTAAATAATTAAAAAA 16 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 34458607 34458622 0.0E+00 TTGCATTATTCATGAG 16 RUNX3_RUNX_full_monomeric_10_1 SELEX - 34463748 34463757 6.0E-06 AGACCACAAA 10 MEF2B_MADS_full_dimeric_12_1 SELEX - 34463611 34463622 1.0E-06 ACTAAAATTAGC 12 IRF1_MA0050.1 JASPAR - 34463730 34463741 2.0E-06 CAAAATGAAAGT 12 Meis3_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34460108 34460119 7.0E-06 TGACATCTGTCC 12 Egr1_C2H2_mouse-DBD_mutant_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 34458188 34458203 3.0E-06 GCCCGCCCCCTCACCA 16 CUX1_CUT_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 34454782 34454799 6.0E-06 TTCAATTAAATAATTAAA 18 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 34454790 34454799 7.0E-06 AATAATTAAA 10 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 34454783 34454798 5.0E-06 TCAATTAAATAATTAA 16 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 34454783 34454798 4.0E-06 TTAATTATTTAATTGA 16 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 34463638 34463653 5.0E-06 TTTAGTACCTCTTTAT 16 NKX3-1_homeodomain_full_monomeric_9_1 SELEX + 34460149 34460157 5.0E-06 CCCACTTAA 9 ELF3_ETS_full_monomeric_13_1 SELEX - 34458576 34458588 1.0E-06 GACCCGGAAGTGG 13 MEF2A_MA0052.1 JASPAR + 34463612 34463621 6.0E-06 CTAATTTTAG 10 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 8.0E-06 AATAATTAAA 10 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 34454786 34454800 1.0E-06 ATTAAATAATTAAAA 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 34454786 34454800 5.0E-06 TTTTAATTATTTAAT 15 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 1.0E-06 AATAATTAAA 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 1.0E-06 AATAATTAAA 10 ATF7_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 34457387 34457400 1.0E-05 GAATGATGTCATCG 14 HOXC11_homeodomain_full_monomeric_11_2 SELEX + 34463666 34463676 1.0E-05 TACCATAAAAA 11 SP1_MA0079.2 JASPAR - 34458702 34458711 7.0E-06 CCCCGCCCCC 10 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 34454787 34454798 5.0E-06 TTAAATAATTAA 12 NFAT5_NFAT_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 34463689 34463702 8.0E-06 ATGTAAAATTCCAG 14 ELK4_ETS_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34456320 34456329 8.0E-06 ACCGGAAGCA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 34463787 34463800 6.0E-06 TAGAAATATTGATC 14 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 34463787 34463800 7.0E-06 GATCAATATTTCTA 14 RFX3_RFX_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 34458803 34458817 3.0E-06 GGTTGCTGGGTAACC 15 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 34458699 34458715 0.0E+00 TAAGCCCCGCCCCCTCA 17 CREB3_bZIP_full_dimeric_14_1 SELEX - 34457387 34457400 1.0E-05 GAATGATGTCATCG 14 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 34454791 34454798 9.0E-06 ATAATTAA 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 34454791 34454798 9.0E-06 TTAATTAT 8 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 34454782 34454791 3.0E-06 TTCAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 8.0E-06 AATAATTAAA 10 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 34454791 34454798 9.0E-06 ATAATTAA 8 Tcf7_HMG_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 34463677 34463688 7.0E-06 AAAAATCAAAGT 12 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 34454742 34454752 5.0E-06 GCCACGCCCCC 11 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 34454799 34454809 9.0E-06 AAAAATAAAGA 11 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 2.0E-06 AATAATTAAA 10 RFX4_RFX_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 34458803 34458817 0.0E+00 GGTTGCTGGGTAACC 15 RFX4_RFX_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 34458803 34458817 4.0E-06 GGTTACCCAGCAACC 15 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 34463601 34463618 4.0E-06 CCAGTTAAAAGCTAATTT 18 POU1F1_POU_DBD_monomeric_17_1 SELEX + 34458604 34458620 1.0E-06 ATCTTGCATTATTCATG 17 POU1F1_POU_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 34458606 34458622 1.0E-06 CTCATGAATAATGCAAG 17 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 34454787 34454799 4.0E-06 TTAAATAATTAAA 13 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 34454787 34454799 8.0E-06 TTTAATTATTTAA 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 34454783 34454795 8.0E-06 ATTATTTAATTGA 13 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 34454785 34454796 5.0E-06 AATTATTTAATT 12 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 34454797 34454808 1.0E-05 CTTTATTTTTTT 12 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 34463672 34463683 7.0E-06 GATTTTTTTTTT 12 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 34454783 34454795 5.0E-06 ATTATTTAATTGA 13 EN1_homeodomain_full_dimeric_14_1 SELEX + 34454784 34454797 7.0E-06 CAATTAAATAATTA 14 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 8.0E-06 AATAATTAAA 10 IRF9_IRF_full_trimeric_15_1 SELEX - 34454773 34454787 1.0E-06 ATTGAAAGAGAAACT 15 IRF9_IRF_full_trimeric_15_1 SELEX - 34463730 34463744 6.0E-06 ATCCAAAATGAAAGT 15 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 2.0E-06 AATAATTAAA 10 ELK1_ETS_full_monomeric_10_1 SELEX + 34456320 34456329 8.0E-06 ACCGGAAGCA 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 34454682 34454693 8.0E-06 ATGCTTAAATTA 12 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 34454787 34454798 1.0E-06 TTAAATAATTAA 12 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 34458607 34458618 4.0E-06 TTGCATTATTCA 12 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 34458608 34458619 2.0E-06 ATGAATAATGCA 12 TGIF2LX_MEIS_full_dimeric_12_1 SELEX + 34460108 34460119 6.0E-06 GGACAGATGTCA 12 TGIF2LX_MEIS_full_dimeric_12_1 SELEX - 34460108 34460119 4.0E-06 TGACATCTGTCC 12 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 34454791 34454807 8.0E-06 ATAATTAAAAAAATAAA 17 EHF_ETS_full_monomeric_12_1 SELEX - 34458577 34458588 2.0E-06 GACCCGGAAGTG 12 PPARG_MA0066.1 JASPAR + 34458844 34458863 1.0E-06 CAAGGGCACGGGGACCCACA 20 ELF5_ETS_full_monomeric_11_1 SELEX - 34458577 34458587 2.0E-06 ACCCGGAAGTG 11 ELF1_ETS_full_monomeric_12_1 SELEX - 34458577 34458588 6.0E-06 GACCCGGAAGTG 12 Meis2_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34460108 34460119 7.0E-06 TGACATCTGTCC 12 ELF3_ETS_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 34458577 34458588 1.0E-06 GACCCGGAAGTG 12 Elk3_ETS_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34456320 34456329 9.0E-06 ACCGGAAGCA 10 ZNF410_C2H2_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 34454865 34454881 7.0E-06 CCCATCCCATAGTGATG 17 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 6.0E-06 AATAATTAAA 10 GBX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 34454784 34454797 7.0E-06 CAATTAAATAATTA 14 RUNX1_MA0002.2 JASPAR + 34463747 34463757 8.0E-06 TTTTGTGGTCT 11 REST_MA0138.2 JASPAR + 34456383 34456403 3.0E-06 AGAAGCACCAAGGACAACTGA 21 IRF3_IRF_full_trimeric_21_1 SELEX - 34454772 34454792 5.0E-06 ATTTAATTGAAAGAGAAACTC 21 IRF3_IRF_full_trimeric_21_1 SELEX + 34463571 34463591 7.0E-06 AGAAAACCGAATTAGAATCTT 21 ETV6_ETS_full_dimeric_15_1 SELEX - 34456496 34456510 3.0E-06 CAGGAAAAGGAAGCA 15 ETV6_ETS_full_dimeric_15_1 SELEX - 34458577 34458591 0.0E+00 CCGGACCCGGAAGTG 15 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 34454784 34454797 0.0E+00 CAATTAAATAATTA 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 34454784 34454797 0.0E+00 TAATTATTTAATTG 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 34454792 34454805 3.0E-06 TAATTAAAAAAATA 14 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 34454786 34454800 2.0E-06 ATTAAATAATTAAAA 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 34454786 34454800 7.0E-06 TTTTAATTATTTAAT 15 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 34454787 34454798 1.0E-06 TTAAATAATTAA 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 34454787 34454798 3.0E-06 TTAATTATTTAA 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 34454791 34454802 9.0E-06 ATAATTAAAAAA 12 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 34463601 34463618 2.0E-06 CCAGTTAAAAGCTAATTT 18 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 34454790 34454800 9.0E-06 AATAATTAAAA 11 Sox2_MA0143.1 JASPAR + 34463702 34463716 5.0E-06 TCATTCTCCTGTAAA 15 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 34454790 34454799 1.0E-06 AATAATTAAA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 34454785 34454797 2.0E-06 AATTAAATAATTA 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 34454797 34454809 1.0E-06 AAAAAAATAAAGA 13 BATF3_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 34457387 34457400 7.0E-06 CGATGACATCATTC 14 NFE2L2_MA0150.1 JASPAR + 34458562 34458572 9.0E-06 GTGACTCGGCA 11 TBX1_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX - 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