Search TFs
or Genes
Construction
and Validation
Optimal
Promoter Size
Download Citation and
Contact

E2F3 target genes for motif:
E2F3_E2F_DBD_dimeric_18_3

The E2F3_E2F_DBD_dimeric_18_3 motif was discovered for E2F3 and was found in the SELEX repository.

E2F3 motif sequence logo


E2F3 motif positions


 

E2F3 target gene list


Download all E2F3 TF binding sites
GeneEntrez# of SitesStrandChromosomePromoter LocationTSS
CA9 768 1 chr9 + 35668914-35674414 35673914
IFITM5 387733 2 chr11 - 299026-304526 299526
ARL6IP1 23204 2 chr16 - 18812357-18817857 18812857
ITPR3 3710 2 chr6 + 33584155-33589655 33589155
RPS19BP1 91582 2 chr22 - 39928360-39933860 39928860
DNAJB14 79982 1 chr4 - 100867379-100872879 100867879
GPR19 2842 2 chr12 - 12848621-12854121 12849121
SART3 9733 1 chr12 - 108954665-108960165 108955165
DNMT1 1786 2 chr19 - 10305255-10310755 10305755
TRDMT1 1787 1 chr10 - 17243570-17249070 17244070
MTRNR2L8 100462981 2 chr5 - 79946354-79951854 79946854
CYBRD1 79901 1 chr2 + 172373756-172379365 172378865
FAM222A 84915 2 chr12 + 110147186-110152686 110152186
SLC25A29 123096 1 chr14 - 100772360-100777860 100772860
GNB2L1 10399 2 chr5 - 180670406-180675906 180670906
LMF2 91289 1 chr22 - 50945635-50951135 50946135
NR4A3 8013 2 chr9 + 102579136-102584636 102584136
ARPC4-TTLL3 100526693 2 chr3 + 9829231-9834731 9834231
SVIP 258010 2 chr11 - 22850882-22856382 22851382
TACR3 6870 1 chr4 - 104640473-104645973 104640973
~ 404734 2 chr5 + 139776398-139781898 139781398
RAB11FIP1 80223 1 chr8 - 37756515-37762015 37757015
FUS 2521 2 chr16 + 31186430-31191930 31191430
PROX1 5629 1 chr1 + 214156277-214162343 214161843
NASP 4678 2 chr1 + 46044659-46050159 46049659
ZNF267 10308 2 chr16 + 31880078-31885578 31885078
ZSCAN29 146050 1 chr15 - 43661758-43667258 43662258
GINS1 9837 1 chr20 + 25383322-25388822 25388322
ACVRL1 94 1 chr12 + 52296201-52306612 52306112
SCN2A 6326 2 chr2 + 166090911-166096411 166095911
ZNF260 339324 1 chr19 - 37018748-37024248 37019248
DNAJB5 25822 2 chr9 + 34984637-34990766 34990266
SPG20 23111 1 chr13 - 36943817-36949317 36944317
FBXO5 26271 4 chr6 - 153303703-153309740 153304203
RRM2 6241 2 chr2 + 10257694-10263362 10262862
PNP 4860 1 chr14 + 20932537-20938037 20937537
N4BP2L2 10443 1 chr13 - 33112432-33117936 33112932
MYLIP 29116 1 chr6 + 16124316-16129816 16129316
ZMYM2 7750 2 chr13 + 20527809-20533473 20532973
SCN3A 6328 2 chr2 - 166060077-166065577 166060577
MCM5 4174 2 chr22 + 35791115-35796615 35796115
LAPTM5 7805 2 chr1 - 31230183-31235683 31230683
TSPAN18 90139 1 chr11 + 44780975-44786475 44785975
HGSNAT 138050 2 chr8 + 42990591-42996091 42995591
ERRFI1 54206 1 chr1 - 8085893-8091393 8086393
E2F8 79733 2 chr11 - 19262007-19268202 19262507
NPC2 10577 2 chr14 - 74959584-74965084 74960084
SLFN5 162394 1 chr17 + 33565085-33570585 33570085
SMC4 10051 2 chr3 + 160112429-160118846 160118346
~ 8332 1 chr6 + 27828106-27833606 27833106
CDH16 1014 2 chr16 - 66952387-66957887 66952887
ARHGEF39 84904 1 chr9 - 35664778-35670278 35665278
AP4M1 9179 1 chr7 + 99694129-99699629 99699129
MFAP1 4236 1 chr15 - 44116451-44121951 44116951
IDH2 3418 1 chr15 - 90645208-90650708 90645708
CBX4 8535 2 chr17 - 77812713-77818213 77813213
MLL5 55904 2 chr7 + 104649636-104655136 104654636
HOXA5 3202 1 chr7 - 27182787-27188287 27183287
PRKDC 5591 2 chr8 - 48872243-48877743 48872743
OLIG2 10215 1 chr21 + 34393215-34398715 34398215
PAN3 255967 1 chr13 + 28707642-28713142 28712642
HCAR3 8843 2 chr12 - 123200939-123206439 123201439
ERP29 10961 1 chr12 + 112446151-112451651 112451151
MRPS36 92259 2 chr5 + 68508572-68514072 68513572
TMPO 7112 2 chr12 + 98904350-98909850 98909350
LIPC 3990 2 chr15 + 58719174-58724674 58724174
MCM4 4173 2 chr8 + 48867762-48873262 48872762
MID2 11043 2 chrX + 107064083-107069583 107069083
LRRIQ3 127255 1 chr1 - 74663371-74668871 74663871
DNAJC27 51277 2 chr2 - 25194463-25199963 25194963
ZNF454 285676 2 chr5 + 178363193-178368693 178368193
FAM174A 345757 1 chr5 + 99866123-99871623 99871123
EBF3 253738 2 chr10 - 131761591-131767091 131762091
RARB 5915 1 chr3 + 25464753-25470333 25469833
TMEM116 89894 1 chr12 - 112450523-112456023 112451023
TRIM23 373 1 chr5 - 64919687-64925187 64920187
TUBGCP4 27229 1 chr15 + 43658312-43663812 43663312
PNISR 25957 1 chr6 - 99872707-99878207 99873207
GPR137C 283554 2 chr14 + 53014865-53020365 53019865
ITGA8 8516 2 chr10 - 15761270-15766770 15761770
~ 653604 2 chr1 - 149784736-149790236 149785236
PLBD1 79887 2 chr12 - 14720291-14725791 14720791
MRPL53 116540 1 chr2 - 74699442-74704942 74699942
GNAI1 2770 2 chr7 + 79759139-79765570 79765070
SLC11A2 4891 1 chr12 - 51419424-51427058 51419924
STAG2 10735 2 chrX + 123089474-123096055 123095555
TMEM206 55248 1 chr1 - 212587743-212593267 212588243
SLC25A12 8604 1 chr2 - 172750316-172755816 172750816
TIPIN 54962 2 chr15 - 66648554-66654054 66649054
PWP1 11137 1 chr12 + 108074589-108080089 108079589
ADCY8 114 2 chr8 - 132052335-132057835 132052835
EPM2AIP1 9852 2 chr3 - 37034295-37039795 37034795
ITGA7 3679 1 chr12 - 56101186-56111089 56101686
~ 206338 1 chr5 + 115293150-115298650 115298150
USP6NL 9712 1 chr10 - 11653179-11658679 11653679
MMRN1 22915 1 chr4 + 90811051-90816551 90816051
ANXA2R 389289 2 chr5 - 43039947-43045447 43040447
ARHGAP1 392 1 chr11 - 46721715-46727215 46722215
DGKZ 8525 1 chr11 + 46349454-46354954 46354454
PTPRQ 374462 1 chr12 + 80833125-80838625 80838125
SEC31A 22872 1 chr4 - 83811835-83817419 83812335
WRAP73 49856 1 chr1 - 3566171-3571671 3566671
KDM2A 22992 1 chr11 + 66881739-66887239 66886739
PHF17 79960 2 chr4 + 129725778-129731278 129730778
KIAA1467 57613 1 chr12 + 13192314-13197814 13197314
NDUFS5 4725 2 chr1 + 39486966-39492466 39491966
EXPH5 23086 2 chr11 - 108463874-108469374 108464374
NTNG1 22854 1 chr1 + 107677628-107683244 107682744
FAM171A2 284069 2 chr17 - 42440735-42446235 42441235
NAV1 89796 2 chr1 + 201612449-201617949 201617449
CEBPE 1053 2 chr14 - 23588320-23593820 23588820
WDR76 79968 1 chr15 + 44114111-44119611 44119111
LIMD2 80774 2 chr17 - 61777019-61782519 61777519
~ 8969 2 chr6 + 27095816-27101316 27100816
GDI2 2665 2 chr10 - 5855012-5860512 5855512
ZNF688 146542 1 chr16 - 30583228-30588728 30583728
FBXW8 26259 2 chr12 + 117343760-117349260 117348760
ENAH 55740 2 chr1 - 225840345-225845845 225840845
FAM32A 26017 1 chr19 + 16291234-16296734 16296234
KCTD15 79047 1 chr19 + 34282750-34288250 34287750
SHCBP1L 81626 1 chr1 - 182922053-182927553 182922553
STYK1 55359 1 chr12 - 10826391-10831891 10826891
ZNF408 79797 1 chr11 + 46717316-46723143 46722643
PSMA1 5682 1 chr11 - 14664680-14670180 14665180
POLR1E 64425 1 chr9 + 37480944-37486444 37485944
EZH1 2145 2 chr17 - 40896571-40902071 40897071
FAM165B 54065 2 chr21 + 35742748-35748248 35747748
PRPF39 55015 2 chr14 + 45548301-45553801 45553301
ZNF613 79898 2 chr19 + 52425687-52431187 52430687
HEBP1 50865 1 chr12 - 13152743-13158243 13153243
ZC3H6 376940 1 chr2 + 113028177-113033677 113033177
HIST1H2BJ 8970 2 chr6 - 27100075-27105575 27100575
TCF21 6943 2 chr6 + 134205258-134210759 134210259
~ 100526835 1 chr1 + 74658895-74664395 74663895
ISCU 23479 1 chr12 + 108951293-108956793 108956293
MYH8 4626 1 chr17 - 10324767-10330267 10325267
ZEB1 6935 1 chr10 + 31603100-31610563 31610063
KCNN4 3783 1 chr19 - 44284909-44290409 44285409
ISCA2 122961 2 chr14 + 74955422-74960922 74960422
PCSK1 5122 1 chr5 - 95767363-95773985 95767863
AKAP8L 26993 1 chr19 - 15529333-15534833 15529833
EID3 493861 1 chr12 + 104692509-104698009 104697509
HIST1H2AH 85235 6 chr6 + 27109860-27115360 27114860
HIST1H2BK 85236 6 chr6 - 27114137-27119637 27114637
FCRL4 83417 1 chr1 - 157567370-157572870 157567870
IL24 11009 2 chr1 + 207065787-207071287 207070787
SRSF3 6428 1 chr6 + 36557089-36562589 36562089
PGS1 9489 1 chr17 + 76369734-76375234 76374734
MTFP1 51537 1 chr22 + 30816610-30822110 30821610
MLH1 4292 2 chr3 + 37029840-37035767 37035267
DMC1 11144 2 chr22 - 38965689-38971189 38966189
ATAD2 29028 2 chr8 - 124408205-124413705 124408705
YIPF1 54432 1 chr1 - 54354987-54360487 54355487
TBX20 57057 1 chr7 - 35293211-35298711 35293711
DICER1 23405 2 chr14 - 95623259-95628759 95623759
FAM63B 54629 1 chr15 + 59058392-59063892 59063392
RPL36 25873 1 chr19 + 5685271-5690845 5690345
HK2 3099 2 chr2 + 75054781-75060281 75059781
INTU 27152 2 chr4 + 128549086-128554586 128554086
PARP2 10038 1 chr14 + 20806772-20812272 20811772
OSBPL6 114880 2 chr2 + 179054207-179059707 179059207
STK35 140901 2 chr20 + 2077527-2083027 2082527
PIK3R3 8503 2 chr1 - 46597880-46603708 46598380
~ 162972 1 chr19 - 58067225-58072725 58067725
IFT80 57560 2 chr3 - 160116820-160122320 160117320
TMEM178A 130733 2 chr2 + 39887637-39893534 39893034
METTL23 124512 2 chr17 + 74717911-74723411 74722911
TNFSF10 8743 1 chr3 - 172240765-172246297 172241265
GPBP1 65056 3 chr5 + 56464774-56471774 56471274
ANKHD1 54882 2 chr5 + 139776398-139781898 139781398
MSH3 4437 2 chr5 + 79945466-79950966 79950466
TMEM109 79073 2 chr11 + 60676370-60681870 60681370
EFCAB4A 283229 2 chr11 + 822584-828084 827584
MBNL3 55796 2 chrX - 131623496-131628996 131623996
E2F2 1870 2 chr1 - 23857212-23862712 23857712
SF3B3 23450 2 chr16 + 70552690-70558190 70557690
EDN1 1906 2 chr6 + 12285528-12291028 12290528
CD200 4345 2 chr3 + 112046915-112052415 112051915
PDCD2 5134 2 chr6 - 170893242-170898780 170893742
HIST1H1B 3009 1 chr6 - 27834859-27840359 27835359
HCFC1 3054 2 chrX - 153236319-153241819 153236819
FAM13C 220965 2 chr10 - 61121852-61127661 61122352
LY9 4063 2 chr1 + 160760863-160766363 160765863
NAF1 92345 1 chr4 - 164087573-164093073 164088073
TMEM187 8269 2 chrX + 153232990-153238490 153237990
DIO1 1733 1 chr1 + 54354860-54360360 54359860
GUCY1A2 2977 3 chr11 - 106888671-106894171 106889171
TXNIP 10628 1 chr1 + 145433461-145438961 145438461
GHRL 51738 2 chr3 - 10331919-10339631 10332419
VPS45 11311 1 chr1 + 150034341-150039841 150039341
NCAPH2 29781 1 chr22 + 50941644-50947144 50946644
ZC3H3 23144 1 chr8 - 144623120-144628620 144623620
FRMD4B 23150 1 chr3 - 69434930-69440430 69435430
DEC1 50514 2 chr9 + 117899096-117904596 117904096
~ 29128 2 chr19 + 4904509-4911065 4910565
DCTN6 10671 1 chr8 + 30008812-30014312 30013812
LAMC3 10319 2 chr9 + 133879503-133885003 133884503
SRD5A3 79644 2 chr4 + 56207387-56212887 56212387
PHF15 23338 2 chr5 + 133856797-133862297 133861797
GABPB2 126626 2 chr1 + 151038079-151043579 151043079
IGF2BP3 10643 2 chr7 - 23509495-23514995 23509995
KDM2B 84678 4 chr12 - 122017864-122023920 122018364
FAM115A 9747 2 chr7 - 143598672-143604278 143599172
USP10 9100 1 chr16 + 84728554-84734054 84733554
PBOV1 59351 2 chr6 - 138539127-138544627 138539627
E2F1 1869 2 chr20 - 32273710-32279210 32274210
JUN 3725 1 chr1 - 59249285-59254785 59249785
DNAJC9 23234 2 chr10 - 75006525-75012025 75007025
FAM123A 219287 2 chr13 - 25745357-25750857 25745857
ARPC4 10093 2 chr3 + 9829178-9835300 9834800
MCM6 4175 4 chr2 - 136633547-136639047 136634047
MCM7 4176 1 chr7 - 99697880-99704427 99698380
MCM2 4171 2 chr3 + 127312199-127317699 127317199
HCAR2 338442 2 chr12 - 123187404-123192904 123187904
TADA3 10474 2 chr3 - 9833920-9839420 9834420
HIST2H2BF 440689 2 chr1 - 149783428-149788928 149783928
TP73 7161 1 chr1 + 3564128-3569628 3569128
ANKRD39 51239 1 chr2 - 97523256-97528756 97523756
ALKBH2 121642 2 chr12 - 109530793-109536293 109531293
HN1L 90861 1 chr16 + 1723277-1728777 1728277
SPIN1 10927 1 chr9 + 90998296-91003796 91003296
KLRG2 346689 2 chr7 - 139167957-139173457 139168457
PURA 5813 1 chr5 + 139488707-139494207 139493707
HOXC5 3222 2 chr12 + 54421831-54427331 54426831
FOXJ3 22887 1 chr1 - 42800136-42806548 42800636
UNG 7374 2 chr12 + 109530398-109536422 109535922
SIX1 6495 1 chr14 - 61115655-61121155 61116155
MARCKS 4082 1 chr6 + 114173526-114179026 114178526
PCNA 5111 2 chr20 - 5106768-5112268 5107268
GLE1 2733 2 chr9 + 131261970-131267470 131266970
TXNDC16 57544 2 chr14 - 53018801-53024301 53019301
PIK3CG 5294 1 chr7 + 106500923-106506423 106505923
PIM1 5292 2 chr6 + 37132921-37138421 37137921
MCM9 254394 1 chr6 - 119252403-119261327 119252903
FBLN5 10516 1 chr14 - 92413546-92419046 92414046
PRPS1 5631 1 chrX + 106866653-106872153 106871653
ECT2 1894 2 chr3 + 172463474-172468974 172468474
ANKRD54 129138 1 chr22 - 38239853-38245353 38240353
KMO 8564 1 chr1 + 241690433-241695933 241695433
PFDN6 10471 1 chr6 + 33252373-33257911 33257411
C7orf41 222166 1 chr7 + 30169551-30175051 30174551
ARHGEF2 9181 2 chr1 - 155947466-155953336 155947966
CYTIP 9595 2 chr2 - 158300104-158305604 158300604
CDC20 991 1 chr1 + 43819625-43825125 43824625
MYCN 4613 2 chr2 + 16075682-16081182 16080682
H2AFZ 3015 1 chr4 - 100871012-100876512 100871512
ATG12 9140 2 chr5 - 115177048-115182548 115177548
HOXD3 3232 1 chr2 + 177023804-177029304 177028804
KRTAP2-3 85294 2 chr17 - 39221631-39227131 39222131
MIS12 79003 1 chr17 + 5384693-5390712 5390212
EXTL2 2135 2 chr1 - 101360235-101365735 101360735
RRAD 6236 2 chr16 - 66958939-66964439 66959439
DERL2 51009 1 chr17 - 5388994-5394494 5389494
HOXD12 3238 1 chr2 + 176959529-176965029 176964529
CAB39 51719 2 chr2 + 231572556-231578762 231578262
TMX1 81542 2 chr14 + 51701885-51707385 51706885
CHEK1 1111 2 chr11 + 125490030-125496750 125496250
RB1 5925 1 chr13 + 48872882-48878382 48877882
FOXN3 1112 1 chr14 - 90084994-90090494 90085494
MUT 4594 2 chr6 - 49430541-49436041 49431041
PLK2 10769 2 chr5 - 57755466-57760966 57755966
PRAME 23532 2 chr22 - 22901050-22906696 22901550
C5orf44 80006 1 chr5 + 64915557-64921057 64920557
CDYL 9425 1 chr6 + 4771679-4777179 4776679
SV2B 9899 2 chr15 + 91638181-91644038 91643538
CAP2 10486 2 chr6 + 17388735-17394235 17393735
KLHL5 51088 2 chr4 + 39041450-39046950 39046450
AP3S1 1176 2 chr5 + 115172618-115178118 115177618
EMR3 84658 1 chr19 - 14785230-14790730 14785730
TSHZ1 10194 1 chr18 + 72917709-72923209 72922709
TBC1D21 161514 2 chr15 + 74160967-74166467 74165967
MAP4K4 9448 3 chr2 + 102309164-102315037 102314537
MMP9 4318 2 chr20 + 44632546-44638046 44637546
ZADH2 284273 1 chr18 - 72920781-72926281 72921281
ATAD3A 55210 1 chr1 + 1442522-1448409 1447909
GPX3 2878 1 chr5 + 150394998-150400498 150399998
MGST1 4257 2 chr12 + 16495075-16501211 16500711
BLOC1S1 2647 1 chr12 + 56104817-56110317 56109817
VPS8 23355 1 chr3 + 184524930-184530430 184529930
P2RX7 5027 1 chr12 + 121565630-121571130 121570630
PDE3B 5140 1 chr11 + 14660268-14665768 14665268
JMJD6 23210 2 chr17 - 74722381-74727881 74722881
FPGT 8790 1 chr1 + 74658895-74664395 74663895
BCAR3 8412 2 chr1 - 94312206-94317706 94312706
EEA1 8411 1 chr12 - 93322607-93328107 93323107
SIGLECL1 284369 1 chr19 + 51755963-51761463 51760963
AVPI1 60370 2 chr10 - 99446515-99452015 99447015
SNRPG 6637 2 chr2 - 70520369-70525869 70520869
HNRNPM 4670 2 chr19 + 8504802-8510302 8509802
TMEM239 100288797 2 chr20 + 2791975-2797475 2796975
CWC22 57703 1 chr2 - 180871280-180876780 180871780
CENPQ 55166 2 chr6 + 49426095-49431595 49431095
FAAH 2166 1 chr1 + 46854938-46860438 46859938
MBNL1 4154 1 chr3 + 151980828-151986328 151985828
THRB 7068 1 chr3 - 24535813-24541313 24536313
COG4 25839 2 chr16 - 70556957-70562457 70557457
FAM90A1 55138 2 chr12 - 8379714-8385214 8380214
RASA3 22821 1 chr13 - 114897595-114903095 114898095
ZNF577 84765 1 chr19 - 52390689-52396229 52391189
TRAF1 7185 1 chr9 - 123688673-123696451 123689173
SLC30A7 148867 2 chr1 + 101356631-101362133 101361633
MAZ 4150 1 chr16 + 29812416-29818357 29817857
~ 128653 2 chr20 + 2790632-2796156 2795656
GALNT10 55568 1 chr5 + 153565294-153570794 153570294
ACAD9 28976 2 chr3 + 128593332-128598832 128598332
NR2C2 7182 3 chr3 + 14984235-14989735 14989235
WWTR1 25937 2 chr3 - 149420560-149426060 149421060
PTPN23 25930 1 chr3 + 47417490-47422990 47422490
DHFR 1719 2 chr5 - 79950300-79955800 79950800
ALDH1A2 8854 2 chr15 - 58357621-58363121 58358121
Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns.
Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.
A Django site.   Powered by PostgreSQL