Search TFs
or Genes
Construction
and Validation
Optimal
Promoter Size
Download Citation and
Contact

MECP2 target genes for motif:
V_MECP2_01_M01298

The V_MECP2_01_M01298 motif was discovered for MECP2 and was found in the TRANSFAC repository.

MECP2 motif sequence logo


MECP2 motif positions


 

MECP2 target gene list


Download all MECP2 TF binding sites
GeneEntrez# of SitesStrandChromosomePromoter LocationTSS
LASP1 3927 1 chr17 + 37021111-37026611 37026111
FAM222A 84915 1 chr12 + 110147186-110152686 110152186
STK40 83931 1 chr1 - 36850985-36856485 36851485
IL4I1 259307 1 chr19 - 50432296-50437796 50432796
NFIL3 4783 1 chr9 - 94185644-94191144 94186144
EIF2A 83939 1 chr3 + 150259573-150265073 150264573
ZDHHC3 51304 1 chr3 - 45017174-45022674 45017674
PNPLA8 50640 1 chr7 - 108166262-108173605 108166762
CALU 813 1 chr7 + 128374345-128379845 128379345
DCLRE1A 9937 1 chr10 - 115613475-115619163 115613975
CAMK2D 817 1 chr4 - 114682583-114688083 114683083
RNF168 165918 1 chr3 - 196230139-196235639 196230639
CDCA7L 55536 1 chr7 - 21985042-21990542 21985542
MAML3 55534 1 chr4 - 141074733-141080233 141075233
MSANTD4 84437 1 chr11 - 105892454-105897954 105892954
ROCK1 6093 1 chr18 - 18691312-18696812 18691812
ACTR3 10096 1 chr2 + 114642536-114648036 114647536
C3orf18 51161 1 chr3 - 50604723-50613458 50605223
CPEB2 132864 1 chr4 + 14999297-15004797 15004297
COPS7B 64708 1 chr2 + 232646161-232651661 232651161
AASDH 132949 1 chr4 - 57253138-57258638 57253638
C7orf55 154791 1 chr7 + 139020877-139026377 139025877
ZNF253 56242 1 chr19 + 19971713-19977213 19976713
RNF32 140545 1 chr7 + 156428352-156436170 156435670
HLTF 6596 1 chr3 - 148803841-148809341 148804341
GLTPD2 388323 1 chr17 + 4687253-4692753 4692253
INTS12 57117 1 chr4 - 106629381-106634881 106629881
ZBED6 100381270 1 chr1 + 203761650-203767150 203766650
TSHZ3 57616 1 chr19 - 31839690-31845190 31840190
KCNC3 3748 1 chr19 - 50832134-50837634 50832634
NEK9 91754 1 chr14 - 75593278-75598778 75593778
FGFR3 2261 1 chr4 + 1790038-1795538 1795038
MEIS2 4212 1 chr15 - 37390062-37398500 37390562
VPS4B 9525 1 chr18 - 61089252-61094752 61089752
MESDC1 59274 1 chr15 + 81288294-81293794 81293294
TCF7L2 6934 1 chr10 + 114705008-114710508 114710008
PTPN2 5771 1 chr18 - 12883834-12889334 12884334
SLC39A10 57181 1 chr2 + 196516531-196522351 196521851
CDK19 23097 1 chr6 - 111135912-111141412 111136412
SLTM 79811 1 chr15 - 59225352-59230852 59225852
DUSP4 1846 1 chr8 - 29205822-29213267 29206322
HEATR1 55127 1 chr1 - 236767341-236772841 236767841
TBX20 57057 1 chr7 - 35293211-35298711 35293711
GGA2 23062 1 chr16 - 23521315-23526815 23521815
HMBOX1 79618 1 chr8 + 28742910-28748724 28748224
FABP4 2167 1 chr8 - 82394973-82400473 82395473
SAP130 79595 1 chr2 - 128784369-128789869 128784869
PANK1 53354 1 chr10 - 91403148-91410329 91403648
MYLK3 91807 1 chr16 - 46781721-46787221 46782221
G3BP1 10146 1 chr5 + 151146475-151151975 151151475
ING3 54556 1 chr7 + 120585816-120591316 120590816
SHC3 53358 1 chr9 - 91793182-91798682 91793682
ODZ3 55714 1 chr4 + 183240136-183250136 0
SUMO1 7341 1 chr2 - 203102822-203108322 203103322
HIST1H2BM 8342 1 chr6 + 27777821-27783321 27782821
HIST1H2BL 8340 1 chr6 - 27775209-27780709 27775709
HIST1H2BH 8345 1 chr6 + 26246878-26252378 26251878
S1PR1 1901 1 chr1 + 101697304-101702804 101702304
CAPS2 84698 1 chr12 - 75723336-75728836 75723836
TP53I13 90313 1 chr17 + 27890738-27896238 27895738
PIP5K1C 23396 1 chr19 - 3699977-3705477 3700477
CCDC148 130940 1 chr2 - 159312765-159318265 159313265
ZNF486 90649 1 chr19 + 20273022-20278522 20278022
STX3 6809 1 chr11 + 59517531-59523031 59522531
KDM2B 84678 1 chr12 - 122017864-122023920 122018364
PDRG1 81572 1 chr20 - 30539383-30544883 30539883
FGD6 55785 1 chr12 - 95610740-95616240 95611240
TEAD1 7003 1 chr11 + 12690968-12696468 12695968
~ 84717 1 chr19 + 4467254-4472754 4472254
CLPX 10845 1 chr15 - 65477063-65482563 65477563
TXNDC11 51061 1 chr16 - 11836148-11841648 11836648
CCDC159 126075 1 chr19 + 11452180-11457680 11457180
PTPRE 5791 1 chr10 + 129700324-129705824 129705324
SOCS2 8835 1 chr12 + 93958597-93966801 93966301
GGH 8836 1 chr8 - 63951110-63956610 63951610
UBAP2 55833 1 chr9 - 34048447-34053947 34048947
GNL2 29889 1 chr1 - 38061086-38066586 38061586
ZNF302 55900 1 chr19 + 35163566-35169066 35168566
PPP1R14A 94274 1 chr19 - 38746731-38752231 38747231
SOX14 8403 1 chr3 + 137478133-137483633 137483133
RBP5 83758 1 chr12 - 7280966-7286466 7281466
TIMP2 7077 1 chr17 - 76920972-76926472 76921472
PLS3 5358 1 chrX + 114790176-114795676 114795176
MYL10 93408 1 chr7 - 101272076-101277576 101272576
RASD1 51655 1 chr17 - 17399209-17404709 17399709
OCEL1 79629 1 chr19 + 17332054-17337554 17337054
C19orf10 56005 1 chr19 - 4669915-4675415 4670415
LATS1 9113 1 chr6 - 150038892-150044392 150039392
MED17 9440 1 chr11 + 93512404-93517904 93517404
NAGA 4668 1 chr22 - 42466346-42471846 42466846
NTRK1 4914 1 chr1 + 156780541-156786041 156785541
CST2 1470 1 chr20 - 23806812-23812312 23807312
TBX5 6910 1 chr12 - 114843468-114851247 114843968
RNASE1 6035 1 chr14 - 21270058-21276036 21270558
COX7B 1349 2 chrX + 77149960-77155460 77154960
RAB28 9364 1 chr4 - 13485489-13490989 13485989
PKP4 8502 1 chr2 + 159308475-159313975 159313475
AMOTL1 154810 1 chr11 + 94496507-94502007 94501507
NR4A3 8013 1 chr9 + 102579136-102584636 102584136
FAM100A 124402 1 chr16 - 4664427-4669927 4664927
COBLL1 22837 1 chr2 - 165697428-165702928 165697928
CDAN1 146059 2 chr15 - 43028917-43034417 43029417
TOR1B 27348 1 chr9 + 132560431-132565931 132565431
SMYD2 56950 1 chr1 + 214449564-214455064 214454564
PPTC7 160760 1 chr12 - 111020564-111026064 111021064
CBX4 8535 1 chr17 - 77812713-77818213 77813213
SCML1 6322 1 chrX + 17750591-17756091 17755591
ZNF207 7756 1 chr17 + 30672156-30677656 30677156
FBXW11 23291 1 chr5 - 171433377-171438877 171433877
EMP1 2012 1 chr12 + 13344601-13350101 13349601
KLC1 3831 1 chr14 + 104090524-104096024 104095524
BCAS2 10286 1 chr1 - 115123765-115129265 115124265
STAP2 55620 1 chr19 - 4338347-4343847 4338847
TMEM205 374882 1 chr19 - 11456481-11461981 11456981
PLEKHM3 389072 1 chr2 - 208889784-208895284 208890284
CHCHD4 131474 1 chr3 - 14165871-14171371 14166371
SQLE 6713 1 chr8 + 126005719-126011219 126010719
EHBP1L1 254102 1 chr11 + 65338508-65344008 65343508
MGARP 84709 1 chr4 - 140200992-140206492 140201492
INTS9 55756 1 chr8 - 28746932-28752698 28747432
MGAM 8972 1 chr7 + 141690678-141696178 141695678
STEAP3 55240 1 chr2 + 119976383-119981883 119981383
RPL18 6141 1 chr19 - 49122175-49127675 49122675
HSPA5 3309 1 chr9 - 128003166-128008666 128003666
RHOH 399 2 chr4 + 40193526-40199026 40198526
FOXC2 2303 1 chr16 + 86595856-86601356 86600856
DHCR24 1718 1 chr1 - 55352421-55357921 55352921
ZNF639 51193 1 chr3 + 179036550-179042050 179041550
SLC13A3 64849 1 chr20 - 45312624-45318124 45313124
ISL2 64843 1 chr15 + 76624146-76629646 76629146
BARD1 580 1 chr2 - 215673928-215679428 215674428
LUC7L2 51631 1 chr7 + 139020104-139025604 139025104
SLC39A8 64116 1 chr4 - 103265848-103271655 103266348
PPM1L 151742 1 chr3 + 160468995-160474495 160473995
IRF2BP1 26145 1 chr19 - 46388876-46394376 46389376
SLC16A5 9121 1 chr17 + 73078821-73084535 73084035
SLC16A3 9123 1 chr17 + 80181281-80194149 80193649
GCC1 79571 1 chr7 - 127225154-127230654 127225654
RASSF3 283349 1 chr12 + 64999292-65004792 65004292
ZC3H11A 9877 1 chr1 + 203759750-203765250 203764750
GLIPR1L1 256710 1 chr12 + 75723462-75728962 75728462
PTP4A3 11156 1 chr8 + 142427006-142432506 142432006
~ 653689 1 chr22 + 24298368-24308368 0
TRPC4AP 26133 1 chr20 - 33680118-33685618 33680618
EXOSC7 23016 1 chr3 + 45012740-45018240 45017740
ETV1 2115 1 chr7 - 14025639-14036050 14026139
GATA4 2626 1 chr8 + 11556716-11562216 11561716
GATA2 2624 1 chr3 - 128206264-128217030 128206764
GATA3 2625 1 chr10 + 8091666-8097166 8096666
ZNF461 92283 1 chr19 - 37157239-37162739 37157739
ATF5 22809 1 chr19 + 50426958-50432899 50432399
CELSR1 9620 1 chr22 - 46932567-46938067 46933067
HEMK1 51409 1 chr3 + 50601908-50607408 50606908
ABHD15 116236 1 chr17 - 27893542-27899042 27894042
UBXN1 51035 1 chr11 - 62446027-62451527 62446527
MAGT1 84061 2 chrX - 77150565-77156065 77151065
GHR 2690 1 chr5 + 42418876-42425593 42425093
HRC 3270 1 chr19 - 49658181-49663681 49658681
WDR83OS 51398 1 chr19 - 12779965-12785465 12780465
NEUROD1 4760 1 chr2 - 182544892-182550392 182545392
COX16 51241 1 chr14 - 70825948-70831448 70826448
PANX1 24145 1 chr11 + 93857093-93862593 93862093
EIF2S3 1968 1 chrX + 24068064-24073564 24073064
AXIN2 8313 1 chr17 - 63557240-63562740 63557740
HS3ST3B1 9953 1 chr17 + 14199505-14205005 14204505
TSPAN8 7103 1 chr12 - 71551279-71556779 71551779
GPR137B 7107 1 chr1 + 236300831-236306331 236305831
AJAP1 55966 1 chr1 + 4710104-4715604 4715104
KLHL31 401265 1 chr6 - 53530006-53535506 53530506
CWC22 57703 1 chr2 - 180871280-180876780 180871780
FNTA 2339 1 chr8 + 42906441-42911941 42911441
C8orf86 389649 1 chr8 - 38385680-38391180 38386180
VMO1 284013 1 chr17 - 4689229-4694729 4689729
DYNC1LI1 51143 1 chr3 - 32611866-32617366 32612366
C22orf13 83606 1 chr22 - 24950775-24956275 24951275
EPDR1 54749 1 chr7 + 37955162-37961420 37960920
PLK3 1263 1 chr1 + 45261035-45266535 45266035
ITGA6 3655 1 chr2 + 173287313-173292813 173292313
PPP1CB 5500 1 chr2 + 28969613-28975125 28974625
NRL 4901 1 chr14 + 24548832-24558832 0
MYO3B 140469 1 chr2 + 171029654-171035154 171034654
RHEB 6009 1 chr7 - 151216510-151222010 151217010
FBXO6 26270 1 chr1 + 11719149-11724649 11724149
PDE5A 8654 1 chr4 - 120547942-120554981 120548442
SNX9 51429 1 chr6 + 158239293-158244793 158244293
NPPC 4880 1 chr2 - 232790538-232796038 232791038
PDE6D 5147 1 chr2 - 232645474-232650974 232645974
NUS1 116150 1 chr6 + 117991616-117997116 117996616
MAP3K13 9175 1 chr3 + 184995728-185001228 185000728
MEST 4232 2 chr7 + 130121015-130131669 130131169
DIRC1 116093 1 chr2 - 189654331-189659831 189654831
SLFN12 55106 1 chr17 - 33759043-33764543 33759543
ZNF556 80032 1 chr19 + 2862332-2867832 2867332
BIVM 54841 1 chr13 + 103446398-103451898 103451398
RBCK1 10616 1 chr20 + 383708-389208 388708
CCRN4L 25819 1 chr4 + 139931942-139937442 139936942
LRRC8E 80131 1 chr19 + 7948389-7953889 7953389
SNX21 90203 1 chr20 + 44457469-44462969 44462469
ERCC1 2067 1 chr19 - 45926320-45932177 45926820
SSSCA1 10534 1 chr11 + 65332942-65338442 65337942
HIST1H2AM 8329 1 chr6 + 27770976-27776476 27775976
TTLL4 9654 1 chr2 + 219570567-219576067 219575567
MDGA2 161357 1 chr14 - 48143657-48149157 48144157
CDC42EP2 10435 1 chr11 + 65077288-65082788 65082288
~ 653519 1 chr1 - 145826603-145832103 145827103
ATXN3 4287 1 chr14 - 92572465-92577965 92572965
UGP2 7360 1 chr2 + 64063097-64069513 64069013
HVCN1 84329 1 chr12 - 111126462-111132617 111126962
COMMD4 54939 1 chr15 + 75623373-75628873 75628373
MAN2B1 4125 1 chr19 - 12777091-12782591 12777591
~ 8968 1 chr6 - 26250335-26255835 26250835
TTI2 80185 1 chr8 - 33370203-33375703 33370703
AP5M1 55745 1 chr14 + 57730605-57736105 57735605
WDR44 54521 1 chrX + 117475035-117480535 117480035
ZNF823 55552 1 chr19 - 11849260-11854760 11849760
ARF5 381 1 chr7 + 127223405-127228905 127228405
AMN 81693 1 chr14 + 103383992-103389492 103388992
LRRC8D 55144 1 chr1 + 90281572-90287979 90287479
PLAUR 5329 1 chr19 - 44173998-44179498 44174498
GADD45A 1647 1 chr1 + 68145859-68151359 68150859
HSPA14 51182 1 chr10 + 14875260-14880760 14880260
~ 152687 1 chr4 + 48226-53726 53226
~ 255403 1 chr4 + 48276-53776 53276
H1F0 3005 1 chr22 + 38196113-38201613 38201113
BEND3 57673 1 chr6 - 107435136-107440636 107435636
KIAA1549 57670 1 chr7 - 138665564-138671064 138666064
SLC16A9 220963 1 chr10 - 61469149-61474649 61469649
TMEM43 79188 1 chr3 + 14161439-14166939 14166439
SPG7 6687 1 chr16 + 89569804-89575304 89574804
TWIST1 7291 1 chr7 - 19156795-19162295 19157295
SRRM2 23524 1 chr16 + 2797329-2802829 2802329
ZNF281 23528 1 chr1 - 200378666-200384166 200379166
EXOC5 10640 1 chr14 - 57735117-57740617 57735617
CDYL2 124359 1 chr16 - 80837675-80843175 80838175
GSTCD 79807 1 chr4 + 106624940-106632469 106631969
IBTK 25998 1 chr6 - 82956948-82962448 82957448
ESYT2 57488 1 chr7 - 158621819-158627319 158622319
CSNK1E 1454 1 chr22 - 38712913-38719089 38713413
EIF3A 8661 1 chr10 - 120839834-120845334 120840334
WDFY3 23001 1 chr4 - 85887044-85892544 85887544
TCTN3 26123 1 chr10 - 97453400-97458900 97453900
ZCCHC24 219654 1 chr10 - 81204883-81210383 81205383
KIAA1279 26128 1 chr10 + 70743476-70748976 70748476
MARCKS 4082 1 chr6 + 114173526-114179026 114178526
HIST1H4G 8369 1 chr6 - 26246705-26252205 26247205
NUP62 23636 1 chr19 - 50432273-50437988 50432773
HRASLS2 54979 1 chr11 - 63330355-63335855 63330855
KEAP1 9817 1 chr19 - 10612981-10619054 10613481
SERPINH1 871 1 chr11 + 75268100-75273600 75273100
ZDHHC5 25921 1 chr11 + 57430473-57435973 57435473
NHLRC2 374354 1 chr10 + 115609390-115614890 115614390
INTS10 55174 1 chr8 + 19669917-19675417 19674917
CAPN10 11132 1 chr2 + 241521132-241526632 241526132
CACNG7 59284 1 chr19 + 54410990-54416490 54415990
SERINC5 256987 1 chr5 - 79551398-79556898 79551898
MLEC 9761 1 chr12 + 121119948-121125448 121124948
ZFYVE16 9765 1 chr5 + 79698837-79704337 79703837
SH2D2A 9047 1 chr1 - 156785439-156791640 156785939
SNRPD3 6634 1 chr22 + 24946617-24952117 24951617
ZNF737 100129842 1 chr19 - 20748126-20753626 20748626
SDCBP2 27111 1 chr20 - 1306013-1314879 1306513
CD55 1604 1 chr1 + 207489816-207495316 207494816
XK 7504 1 chrX + 37540132-37545632 37545132
HIST1H2AJ 8331 1 chr6 - 27782018-27787518 27782518
NSUN6 221078 1 chr10 - 18940050-18945550 18940550
LIMS1 3987 1 chr2 + 109145810-109151310 109150810
ALCAM 214 1 chr3 + 105080556-105086056 105085556
~ 100996928 1 chr7 + 139020877-139026377 139025877
RALGDS 5900 1 chr9 - 136024107-136029607 136024607
VEZT 55591 1 chr12 + 95606521-95612021 95611521
ZFP36L2 678 1 chr2 - 43453245-43458745 43453745
ANKRD34A 284615 1 chr1 + 145465507-145471007 145470507
VIMP 55829 2 chr15 - 101817200-101822700 101817700
NR5A2 2494 1 chr1 + 199991769-199997269 199996769
RNF185 91445 1 chr22 + 31551137-31556637 31556137
OTX1 5013 1 chr2 + 63272191-63278436 63277936
MAP3K8 1326 1 chr10 + 30717949-30723449 30722949
CDNF 441549 1 chr10 - 14879483-14884983 14879983
SLMAP 7871 1 chr3 + 57738173-57743673 57743173
PRRX2 51450 1 chr9 + 132422919-132428419 132427919
NCBP2 22916 1 chr3 - 196668964-196674464 196669464
SLC2A1 6513 1 chr1 - 43424347-43429847 43424847
RBM28 55131 1 chr7 - 127983462-127988962 127983962
SH3BP5 9467 1 chr3 - 15382401-15387901 15382901
MAPK12 6300 1 chr22 - 50699589-50705089 50700089
SDK2 54549 1 chr17 - 71639727-71645227 71640227
FAM109B 150368 1 chr22 + 42465254-42470754 42470254
WDR83 84292 1 chr19 + 12772617-12781016 12780516
PCSK5 5125 1 chr9 + 78500559-78506059 78505559
~ 65998 1 chr11 - 63535613-63541113 63536113
~ 8357 1 chr6 + 27772841-27778341 27777841
SFRP4 6424 1 chr7 - 37956025-37961525 37956525
CCDC150 284992 1 chr2 + 197499355-197504855 197504355
SFRP1 6422 1 chr8 - 41166490-41171990 41166990
RGAG4 340526 1 chrX - 71351251-71356751 71351751
FRYL 285527 1 chr4 - 48781816-48787316 48782316
RPP30 10556 1 chr10 + 92626708-92632208 92631708
TRPM4 54795 1 chr19 + 49656015-49661515 49661015
FAM91A1 157769 1 chr8 + 124775881-124781381 124780881
MPND 84954 1 chr19 + 4338523-4344023 4343523
C21orf33 8209 1 chr21 + 45548493-45553993 45553493
RGS7BP 401190 1 chr5 + 63796773-63802273 63801773
FOXP1 27086 1 chr3 - 71632404-71638140 71632904
POLR3GL 84265 1 chr1 - 145469887-145475387 145470387
ZNF426 79088 1 chr19 - 9648803-9654303 9649303
SPHK2 56848 1 chr19 + 49117547-49128708 49128208
ZNF697 90874 1 chr1 - 120189890-120195390 120190390
FOXA2 3170 1 chr20 - 22564601-22571101 22565101
FANCF 2188 1 chr11 - 22646887-22652387 22647387
MXI1 4601 1 chr10 + 111962362-111970488 111969988
KDELC1 79070 1 chr13 - 103450904-103456404 103451404
KIAA1522 57648 1 chr1 + 33202511-33208011 33207511
PPIL1 51645 1 chr6 - 36842300-36847800 36842800
SLX4 84464 1 chr16 - 3661085-3666585 3661585
SERP1 27230 1 chr3 - 150263928-150269428 150264428
FOS 2353 1 chr14 + 75740480-75745980 75745480
ZNF576 79177 1 chr19 + 44095543-44101237 44100737
FOSB 2354 1 chr19 + 45966252-45971752 45971252
NNT 23530 1 chr5 + 43597790-43603728 43603228
ADRB3 155 1 chr8 - 37823684-37829184 37824184
LAMC3 10319 1 chr9 + 133879503-133885003 133884503
HOMER1 9456 1 chr5 - 78809200-78814700 78809700
FSTL4 23105 1 chr5 - 132947723-132953223 132948223
HEG1 57493 1 chr3 - 124774302-124779802 124774802
IRGQ 126298 1 chr19 - 44099787-44105287 44100287
ENTPD6 955 1 chr20 + 25171338-25176838 25176338
ENTPD3 956 1 chr3 + 40423672-40429172 40428672
IQGAP3 128239 1 chr1 - 156541896-156547396 156542396
CCDC113 29070 1 chr16 + 58278839-58284339 58283839
HAND1 9421 1 chr5 - 153857324-153862824 153857824
SPRY4 81848 1 chr5 - 141704120-141709620 141704620
STK35 140901 1 chr20 + 2077527-2083027 2082527
RPS3A 6189 1 chr4 + 152015724-152021224 152020724
ZCCHC3 85364 1 chr20 + 273203-278703 278203
~ 144245 1 chr12 + 38705556-38711056 38710556
ZFAND6 54469 1 chr15 + 80346909-80353001 80352501
PPM1J 333926 1 chr1 - 113257450-113262950 113257950
NLRC3 197358 1 chr16 - 3626892-3632392 3627392
FAM89B 23625 1 chr11 + 65334819-65340319 65339819
RASA3 22821 1 chr13 - 114897595-114903095 114898095
HEATR5A 25938 1 chr14 - 31889288-31894788 31889788
ADAMTS1 9510 1 chr21 - 28217228-28222728 28217728
Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns.
Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.
A Django site.   Powered by PostgreSQL