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RTN1 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 6252 reticulon 1 chr14 - 60337057 - 60342557 60337557 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the RTN1 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints POU4F2_POU_full_monomeric_16_1 SELEX - 60334866 60334881 3.0E-06 ATAAATAAATAACTAG 16 Foxa2_MA0047.2 JASPAR - 60335018 60335029 1.0E-05 TATTTATATAGA 12 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 60335022 60335035 0.0E+00 TATAAATATGCAAA 14 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 60335022 60335035 0.0E+00 TTTGCATATTTATA 14 SPIC_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX + 60336852 60336865 5.0E-06 TTAAAGCGGAAATA 14 SPIC_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX + 60337773 60337786 0.0E+00 AAAAAAAGGAAGAA 14 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 60335013 60335029 7.0E-06 TATTTATATAGAAATTT 17 ETV5_ETS_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60334916 60334925 6.0E-06 ACCGGATGTG 10 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 60334870 60334881 1.0E-06 ATAAATAAATAA 12 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 60335023 60335034 8.0E-06 TTGCATATTTAT 12 ETV3_ETS_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60334916 60334925 6.0E-06 ACCGGATGTG 10 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 60334873 60334884 5.0E-06 TGTATAAATAAA 12 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 60335020 60335031 9.0E-06 TATATAAATATG 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 60334870 60334882 1.0E-06 TATAAATAAATAA 13 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 60335023 60335035 4.0E-06 TTTGCATATTTAT 13 RFX4_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 60337118 60337133 0.0E+00 AGTTTCCATGGCAACG 16 RFX4_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 60337118 60337133 0.0E+00 CGTTGCCATGGAAACT 16 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX - 60334870 60334882 0.0E+00 TATAAATAAATAA 13 FOXC1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 60334874 60334884 6.0E-06 TGTATAAATAA 11 FOXC1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 60335020 60335030 0.0E+00 TATATAAATAT 11 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR - 60337506 60337523 8.0E-06 GGAAGAGCGGCAGGCAGC 18 ETV1_ETS_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60334916 60334925 9.0E-06 ACCGGATGTG 10 NFYA_MA0060.1 JASPAR + 60334957 60334972 1.0E-06 ATTAACCAATCAACAA 16 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 60336852 60336865 7.0E-06 TTAAAGCGGAAATA 14 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 60337773 60337786 4.0E-06 AAAAAAAGGAAGAA 14 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 60334866 60334881 2.0E-06 ATAAATAAATAACTAG 16 RFX2_RFX_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 60337119 60337133 5.0E-06 CGTTGCCATGGAAAC 15 Rfx3_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 60337118 60337133 0.0E+00 AGTTTCCATGGCAACG 16 Rfx3_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 60337118 60337133 0.0E+00 CGTTGCCATGGAAACT 16 NFATC1_NFAT_full_dimeric_14_1 SELEX + 60337119 60337132 4.0E-06 GTTTCCATGGCAAC 14 NFATC1_NFAT_full_dimeric_14_1 SELEX - 60337119 60337132 3.0E-06 GTTGCCATGGAAAC 14 Foxc1_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 60334871 60334881 0.0E+00 ATAAATAAATA 11 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 60334868 60334882 1.0E-06 TATAAATAAATAACT 15 Pou2f2_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 60335022 60335035 0.0E+00 TATAAATATGCAAA 14 Pou2f2_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 60335022 60335035 1.0E-06 TTTGCATATTTATA 14 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 60335023 60335034 0.0E+00 ATAAATATGCAA 12 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 60335023 60335034 2.0E-06 TTGCATATTTAT 12 FOXI1_MA0042.1 JASPAR - 60335021 60335032 2.0E-06 GCATATTTATAT 12 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 60334871 60334881 0.0E+00 ATAAATAAATA 11 RFX2_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 60337118 60337133 0.0E+00 AGTTTCCATGGCAACG 16 RFX2_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 60337118 60337133 0.0E+00 CGTTGCCATGGAAACT 16 POU1F1_POU_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 60334868 60334884 5.0E-06 TGTATAAATAAATAACT 17 POU1F1_POU_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 60335021 60335037 3.0E-06 ATTTTGCATATTTATAT 17 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 60334869 60334881 4.0E-06 GTTATTTATTTAT 13 RFX5_RFX_DBD_dimeric_16_3 SELEX + 60337118 60337133 0.0E+00 AGTTTCCATGGCAACG 16 RFX5_RFX_DBD_dimeric_16_3 SELEX - 60337118 60337133 0.0E+00 CGTTGCCATGGAAACT 16 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 60334870 60334881 1.0E-06 ATAAATAAATAA 12 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 60335023 60335034 0.0E+00 ATAAATATGCAA 12 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 60335023 60335034 2.0E-06 TTGCATATTTAT 12 Pou5f1_MA0142.1 JASPAR + 60335022 60335036 8.0E-06 TATAAATATGCAAAA 15 SPI1_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX + 60337773 60337786 4.0E-06 AAAAAAAGGAAGAA 14 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 60334868 60334882 1.0E-06 TATAAATAAATAACT 15 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 60334870 60334881 4.0E-06 ATAAATAAATAA 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 60335023 60335034 0.0E+00 ATAAATATGCAA 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 60335023 60335034 5.0E-06 TTGCATATTTAT 12 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 60334871 60334883 0.0E+00 GTATAAATAAATA 13 FOXB1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 60334874 60334884 8.0E-06 TGTATAAATAA 11 FOXB1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 60335020 60335030 0.0E+00 TATATAAATAT 11 NFIA_NFI_full_monomeric_10_1 SELEX + 60337732 60337741 2.0E-06 TGTGCCAAAT 10 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 60334868 60334881 4.0E-06 ATAAATAAATAACT 14 HNF1A_MA0046.1 JASPAR + 60334868 60334881 2.0E-06 AGTTATTTATTTAT 14 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 60335005 60335024 4.0E-06 ATATAGAAATTTTTTAGTTT 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 60335011 60335030 5.0E-06 ATATTTATATAGAAATTTTT 20 V_HNF3B_01_M00131 TRANSFAC - 60335020 60335034 2.0E-06 TTGCATATTTATATA 15 V_SPI1_01_M01203 TRANSFAC + 60337773 60337789 7.0E-06 AAAAAAAGGAAGAACCA 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 60334867 60334883 8.0E-06 GTATAAATAAATAACTA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 60334867 60334883 1.0E-06 TAGTTATTTATTTATAC 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 60334867 60334883 3.0E-06 GTATAAATAAATAACTA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 60335009 60335025 1.0E-05 TAAAAAATTTCTATATA 17 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC - 60334867 60334882 0.0E+00 TATAAATAAATAACTA 16 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC - 60334871 60334886 4.0E-06 GCTGTATAAATAAATA 16 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC + 60335018 60335033 1.0E-06 TCTATATAAATATGCA 16 V_CDX2_Q5_01_M01659 TRANSFAC - 60334874 60334884 1.0E-05 TGTATAAATAA 11 V_POU3F3_01_M03090 TRANSFAC - 60335023 60335039 1.0E-06 ATATTTTGCATATTTAT 17 V_DUXL_01_M01390 TRANSFAC + 60334958 60334974 3.0E-06 TTAACCAATCAACAACT 17 V_ZFP410_04_M02936 TRANSFAC - 60337760 60337776 6.0E-06 TTTTTCCTCCCCAAACG 17 V_FOXA2_04_M02749 TRANSFAC - 60334866 60334882 3.0E-06 TATAAATAAATAACTAG 17 V_NRSF_Q4_M01028 TRANSFAC + 60337514 60337532 7.0E-06 CCGCTCTTCCCGCTTCAGC 19 V_NFY_Q6_M00185 TRANSFAC + 60334959 60334969 6.0E-06 TAACCAATCAA 11 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC - 60335009 60335023 5.0E-06 TATAGAAATTTTTTA 15 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC - 60335010 60335025 1.0E-06 TATATAGAAATTTTTT 16 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC - 60335011 60335026 1.0E-06 TTATATAGAAATTTTT 16 V_POU5F1_02_M02245 TRANSFAC + 60335022 60335036 8.0E-06 TATAAATATGCAAAA 15 V_OCTAMER_01_M01324 TRANSFAC - 60335023 60335039 1.0E-06 ATATTTTGCATATTTAT 17 V_NFAT3_Q3_M01734 TRANSFAC - 60337769 60337778 6.0E-06 TTTTTTTCCT 10 V_OCT1_01_M00135 TRANSFAC + 60335023 60335041 1.0E-06 ATAAATATGCAAAATATGT 19 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 60334866 60334882 1.0E-05 TATAAATAAATAACTAG 17 V_FOXO3A_Q1_M01137 TRANSFAC - 60334871 60334882 0.0E+00 TATAAATAAATA 12 V_SOX11_04_M02899 TRANSFAC - 60336839 60336852 1.0E-06 AAAATTGTTCTCAT 14 V_RFX4_03_M02789 TRANSFAC + 60337121 60337135 2.0E-06 TTCCATGGCAACGGG 15 V_HNF3_Q6_01_M01012 TRANSFAC + 60334866 60334883 8.0E-06 CTAGTTATTTATTTATAC 18 V_HNF3_Q6_01_M01012 TRANSFAC + 60334870 60334887 5.0E-06 TTATTTATTTATACAGCA 18 V_NKX24_01_M01350 TRANSFAC + 60337738 60337753 1.0E-06 AAATCCACTCGAATCT 16 V_AFP1_Q6_M00616 TRANSFAC - 60337636 60337646 1.0E-05 AATAACAGGAT 11 V_PU1_Q4_M01172 TRANSFAC - 60337774 60337792 7.0E-06 TGCTGGTTCTTCCTTTTTT 19 V_NFY_Q6_01_M00775 TRANSFAC + 60334956 60334968 0.0E+00 CATTAACCAATCA 13 V_CETS2_02_M02064 TRANSFAC - 60334916 60334925 1.0E-05 ACCGGATGTG 10 V_MEF2A_Q6_M02024 TRANSFAC + 60334875 60334884 7.0E-06 TATTTATACA 10 V_MEF2A_Q6_M02024 TRANSFAC - 60335020 60335029 5.0E-06 TATTTATATA 10 V_NFY_C_M00209 TRANSFAC - 60334957 60334970 0.0E+00 GTTGATTGGTTAAT 14 V_PDEF_02_M02075 TRANSFAC - 60334916 60334925 8.0E-06 ACCGGATGTG 10 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC - 60334867 60334883 9.0E-06 GTATAAATAAATAACTA 17 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC + 60335016 60335032 7.0E-06 TTTCTATATAAATATGC 17 V_SOX13_03_M02797 TRANSFAC + 60336839 60336854 0.0E+00 ATGAGAACAATTTTTA 16 V_POU3F2_01_M00463 TRANSFAC - 60335021 60335034 9.0E-06 TTGCATATTTATAT 14 V_ELK1_05_M01981 TRANSFAC - 60334916 60334925 9.0E-06 ACCGGATGTG 10 V_OCT1_02_M00136 TRANSFAC + 60335023 60335037 1.0E-06 ATAAATATGCAAAAT 15 V_SAP1A_02_M01983 TRANSFAC - 60334916 60334925 9.0E-06 ACCGGATGTG 10 V_GFI1_01_M00250 TRANSFAC - 60334935 60334958 7.0E-06 ATGTCTTAAATCTCTGTGTTTCTT 24 V_HNF1_Q6_M00790 TRANSFAC + 60334867 60334884 0.0E+00 TAGTTATTTATTTATACA 18 V_HNF1_Q6_M00790 TRANSFAC - 60334947 60334964 1.0E-05 TGGTTAATGTCTTAAATC 18 V_NKX26_01_M01322 TRANSFAC + 60337738 60337753 6.0E-06 AAATCCACTCGAATCT 16 V_RSRFC4_Q2_M00407 TRANSFAC - 60334870 60334886 4.0E-06 GCTGTATAAATAAATAA 17 V_IK1_01_M00086 TRANSFAC - 60337626 60337638 4.0E-06 GATTGGGAATAGC 13 V_HNF3_Q6_M00791 TRANSFAC - 60334869 60334881 3.0E-06 ATAAATAAATAAC 13 V_HNF3ALPHA_Q6_M00724 TRANSFAC + 60334871 60334881 2.0E-06 TATTTATTTAT 11 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC - 60334865 60334885 3.0E-06 CTGTATAAATAAATAACTAGA 21 V_NKX22_02_M01372 TRANSFAC + 60337738 60337754 5.0E-06 AAATCCACTCGAATCTT 17 V_SOX18_03_M02801 TRANSFAC - 60336838 60336853 1.0E-06 AAAAATTGTTCTCATA 16 V_RFXDC2_03_M02790 TRANSFAC + 60337121 60337135 7.0E-06 TTCCATGGCAACGGG 15 V_PBX1_01_M00096 TRANSFAC + 60334961 60334969 1.0E-05 ACCAATCAA 9 V_DUXBL_01_M02968 TRANSFAC + 60334958 60334974 3.0E-06 TTAACCAATCAACAACT 17 V_OCT1_04_M00138 TRANSFAC - 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