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SNCAIP Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 9627 synuclein, alpha interacting protein chr5 + 121642819 - 121648319 121647819 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the SNCAIP promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 4.0E-06 TTAATTAA 8 SOX21_HMG_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 121648739 121648753 9.0E-06 AAGAATGCTAGTATT 15 FOXJ2_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121646214 121646221 5.0E-06 ATAAACAA 8 FOXJ2_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648662 121648669 5.0E-06 ATAAACAA 8 VSX1_homeodomain_full_monomeric_11_1 SELEX + 121648639 121648649 9.0E-06 AGCTAATTGTC 11 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 121646930 121646947 1.0E-06 ACAATTAAGAGACAATAA 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 121648895 121648912 8.0E-06 TTAATTAAGGAAGCATTA 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 4.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 121650098 121650107 8.0E-06 TTCAATTAGA 10 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 121646931 121646947 8.0E-06 CAATTAAGAGACAATAA 17 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 121648896 121648912 5.0E-06 TAATTAAGGAAGCATTA 17 SRY_HMG_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 121648739 121648753 1.0E-05 AATACTAGCATTCTT 15 SRY_HMG_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 121648803 121648817 9.0E-06 GGCAACAGCATTGTT 15 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 121646212 121646225 2.0E-06 CAATAAACAAATTA 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 121646212 121646225 8.0E-06 TAATTTGTTTATTG 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 121648634 121648647 8.0E-06 CAATTAGCTAAAAT 14 FOXF2_MA0030.1 JASPAR + 121646209 121646222 4.0E-06 TTACAATAAACAAA 14 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121646214 121646226 5.0E-06 ATAAACAAATTAC 13 FOXG1_forkhead_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 121646204 121646220 0.0E+00 ATAAATTACAATAAACA 17 FOXG1_forkhead_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 121646214 121646230 3.0E-06 ATAAACAAATTACAACA 17 FOXG1_forkhead_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 121646940 121646956 3.0E-06 GACAATAAAAGTAAAGA 17 MEF2D_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 121646090 121646101 5.0E-06 ACTAAAAATACT 12 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 121646211 121646222 8.0E-06 ACAATAAACAAA 12 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 121648631 121648648 7.0E-06 ACAATTAGCTAAAATTGG 18 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 121648696 121648713 5.0E-06 AAAATTATGAGCCATTAC 18 TBX5_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 121649139 121649158 2.0E-06 AGGTGTCACTCTAAACACGT 20 TBX5_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX - 121649139 121649158 1.0E-06 ACGTGTTTAGAGTGACACCT 20 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 121646209 121646221 5.0E-06 TTACAATAAACAA 13 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 121646213 121646225 4.0E-06 AATAAACAAATTA 13 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX - 121648662 121648674 7.0E-06 ATGAAATAAACAA 13 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 SOX8_HMG_full_dimeric_15_1 SELEX - 121648739 121648753 8.0E-06 AAGAATGCTAGTATT 15 MAX_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 121649033 121649042 8.0E-06 ACCACGTGCC 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 121648894 121648903 1.0E-05 CTTAATTAAC 10 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR + 121646852 121646869 1.0E-06 GGAAATAAGGAAAGAAGT 18 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR + 121647348 121647365 5.0E-06 GCCAAGAAGCAAGGAAGG 18 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121646214 121646226 5.0E-06 ATAAACAAATTAC 13 BARX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121646930 121646937 5.0E-06 ACAATTAA 8 SOX9_HMG_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 121649880 121649888 4.0E-06 AAACAATAG 9 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121648890 121648902 7.0E-06 GAAAGTTAATTAA 13 IRF7_IRF_DBD_trimeric_17_1 SELEX - 121650070 121650086 2.0E-06 AAAGAGAAATTCCCTTG 17 Pax4_MA0068.1 JASPAR - 121646136 121646165 4.0E-06 CACAATTTTAAAAATACACATTATCCCCCA 30 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 121646203 121646232 1.0E-06 GATAAATTACAATAAACAAATTACAACACC 30 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 121648894 121648903 7.0E-06 GTTAATTAAG 10 TCF7L1_HMG_full_monomeric_12_1 SELEX - 121649960 121649971 3.0E-06 TAATATCAAAGA 12 BARHL2_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX + 121646205 121646220 8.0E-06 TAAATTACAATAAACA 16 BARHL2_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX - 121648697 121648712 3.0E-06 TAATGGCTCATAATTT 16 JDP2_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX + 121646106 121646117 7.0E-06 CATGATGTCATC 12 JDP2_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX - 121646106 121646117 7.0E-06 GATGACATCATG 12 MEF2B_MADS_full_dimeric_12_1 SELEX - 121646090 121646101 4.0E-06 ACTAAAAATACT 12 Barhl1_homeodomain_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 121646205 121646220 9.0E-06 TAAATTACAATAAACA 16 Barhl1_homeodomain_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 121648697 121648712 3.0E-06 TAATGGCTCATAATTT 16 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 121646215 121646225 3.0E-06 TAAACAAATTA 11 HMX3_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 121646929 121646939 3.0E-06 AACAATTAAGA 11 POU3F3_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 121646206 121646218 5.0E-06 TTTATTGTAATTT 13 NFATC1_NFAT_full_dimeric_14_1 SELEX + 121648880 121648893 7.0E-06 CTTTCCTTGGGAAA 14 NFATC1_NFAT_full_dimeric_14_1 SELEX - 121648880 121648893 5.0E-06 TTTCCCAAGGAAAG 14 Foxq1_MA0040.1 JASPAR - 121646213 121646223 5.0E-06 ATTTGTTTATT 11 Foxq1_MA0040.1 JASPAR + 121648660 121648670 2.0E-06 TTTTGTTTATT 11 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 121646214 121646226 5.0E-06 ATAAACAAATTAC 13 FOXJ3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 121646207 121646220 9.0E-06 AATTACAATAAACA 14 MNT_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 121649033 121649042 7.0E-06 ACCACGTGCC 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 HIC2_C2H2_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 121647211 121647219 1.0E-05 ATGCCCACC 9 FOXI1_MA0042.1 JASPAR + 121648660 121648671 0.0E+00 TTTTGTTTATTT 12 FOXI1_MA0042.1 JASPAR - 121649933 121649944 1.0E-05 AGATGTTTGTGT 12 FOXI1_MA0042.1 JASPAR - 121649946 121649957 6.0E-06 ATTTGTTTGTAT 12 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121646214 121646226 5.0E-06 ATAAACAAATTAC 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 121646076 121646089 9.0E-06 ACCCAATATTTTCA 14 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 121646215 121646225 9.0E-06 TAAACAAATTA 11 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121646214 121646226 3.0E-06 ATAAACAAATTAC 13 CREB3_bZIP_full_dimeric_14_1 SELEX + 121646105 121646118 1.0E-05 ACATGATGTCATCC 14 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 121648894 121648903 7.0E-06 CTTAATTAAC 10 NFATC1_NFAT_full_dimeric_20_1 SELEX - 121648869 121648888 2.0E-06 CAAGGAAAGCAACGTTCCCA 20 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 121648894 121648903 6.0E-06 CTTAATTAAC 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 121648889 121648901 2.0E-06 TAATTAACTTTCC 13 SOX15_HMG_full_dimeric_15_1 SELEX + 121648739 121648753 5.0E-06 AATACTAGCATTCTT 15 TBX4_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 121649139 121649158 2.0E-06 AGGTGTCACTCTAAACACGT 20 TBX4_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX - 121649139 121649158 1.0E-06 ACGTGTTTAGAGTGACACCT 20 SOX7_HMG_full_dimeric_17_1 SELEX - 121648738 121648754 5.0E-06 AAAGAATGCTAGTATTT 17 Gata1_MA0035.2 JASPAR + 121648362 121648372 6.0E-06 TGAGATAAGGA 11 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 121646930 121646947 1.0E-06 ACAATTAAGAGACAATAA 18 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 121648895 121648912 8.0E-06 TTAATTAAGGAAGCATTA 18 VENTX_homeodomain_DBD_dimeric_21_1 SELEX + 121646917 121646937 1.0E-05 CCCCAATCCCTCAACAATTAA 21 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 121648891 121648901 1.0E-05 AAAGTTAATTA 11 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121648890 121648902 7.0E-06 GAAAGTTAATTAA 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121650094 121650106 8.0E-06 AAAATCTAATTGA 13 Foxd3_MA0041.1 JASPAR + 121648660 121648671 1.0E-06 TTTTGTTTATTT 12 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 121649950 121649961 7.0E-06 GATCATTTGTTT 12 LHX9_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 121648700 121648712 9.0E-06 TAATGGCTCATAA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121648890 121648902 8.0E-06 GAAAGTTAATTAA 13 FEV_MA0156.1 JASPAR + 121648734 121648741 1.0E-05 CAGGAAAT 8 MTF1_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 121649059 121649072 2.0E-06 TTTGCAAACTGCAC 14 Pou5f1_MA0142.1 JASPAR + 121650083 121650097 1.0E-06 CTTTTAAATGCAAAA 15 HMX2_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 121646929 121646939 3.0E-06 AACAATTAAGA 11 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 121646215 121646225 9.0E-06 TAAACAAATTA 11 SOX9_MA0077.1 JASPAR - 121649880 121649888 7.0E-06 AAACAATAG 9 TP53_MA0106.1 JASPAR + 121646234 121646253 4.0E-06 CCGGACATGCTCTTGGCTGT 20 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 Foxj3_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121646214 121646221 5.0E-06 ATAAACAA 8 Foxj3_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648662 121648669 5.0E-06 ATAAACAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 121646212 121646225 2.0E-06 CAATAAACAAATTA 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 121648634 121648647 8.0E-06 CAATTAGCTAAAAT 14 Sox3_HMG_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 121648738 121648754 4.0E-06 AAAGAATGCTAGTATTT 17 Sox3_HMG_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 121648802 121648818 1.0E-05 AGGCAACAGCATTGTTG 17 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 121646930 121646947 0.0E+00 ACAATTAAGAGACAATAA 18 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 121648895 121648912 7.0E-06 TTAATTAAGGAAGCATTA 18 Sox2_MA0143.1 JASPAR + 121649880 121649894 5.0E-06 CTATTGTTTTGGAAG 15 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 121646208 121646220 6.0E-06 ATTACAATAAACA 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 121648659 121648671 2.0E-06 AAATAAACAAAAT 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 121648663 121648675 5.0E-06 AATGAAATAAACA 13 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 4.0E-06 TTAATTAA 8 SOX9_HMG_full_dimeric_17_1 SELEX - 121648738 121648754 4.0E-06 AAAGAATGCTAGTATTT 17 HMX1_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 121646929 121646939 2.0E-06 AACAATTAAGA 11 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 121648895 121648902 9.0E-06 TTAATTAA 8 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 121646214 121646227 5.0E-06 ATAAACAAATTACA 14 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 121646934 121646953 2.0E-06 TTACTTTTATTGTCTCTTAA 20 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 121648892 121648908 4.0E-06 GCTTCCTTAATTAACTT 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 121648893 121648909 6.0E-06 AGTTAATTAAGGAAGCA 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC + 121648890 121648905 4.0E-06 GAAAGTTAATTAAGGA 16 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC + 121646209 121646224 1.0E-06 TTACAATAAACAAATT 16 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC - 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