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SNRNP40 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 9410 small nuclear ribonucleoprotein 40kDa (U5) chr1 - 31769144 - 31774644 31769644 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the SNRNP40 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 9.0E-06 CTAATTAA 8 FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 31769714 31769731 6.0E-06 AATGGAAATATTGAAAGC 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 31769657 31769674 3.0E-06 GCAATTGGTTCCAAATTA 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 31769658 31769675 5.0E-06 CTAATTTGGAACCAATTG 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 9.0E-06 CTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 En1_MA0027.1 JASPAR - 31770668 31770678 2.0E-06 AAGTAGTTCTC 11 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 PDX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31770627 31770634 5.0E-06 GTAATTAA 8 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR - 31769677 31769694 6.0E-06 GGAAGTTGTGGAGGAAGG 18 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR + 31770640 31770657 8.0E-06 TGAAGAAGTGAAGGCAGA 18 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR + 31772382 31772399 3.0E-06 GGAAAGAAGGAGGGTGTG 18 NFYA_MA0060.1 JASPAR + 31769702 31769717 5.0E-06 AAGAACCAATCGGCTT 16 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 XBP1_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 31769773 31769784 8.0E-06 TCTGACGTCATG 12 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 31770631 31770643 5.0E-06 TTCACCTAATTAA 13 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 9.0E-06 CTAATTAA 8 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 31770494 31770523 6.0E-06 GAAAACGTTAAACAATGACCTCACTAATAC 30 JDP2_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX + 31769773 31769784 9.0E-06 TCTGACGTCATG 12 JDP2_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX - 31769773 31769784 6.0E-06 CATGACGTCAGA 12 TFAP2B_TFAP_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 31770685 31770696 5.0E-06 AGCCCTGAGGCA 12 Dlx2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31770627 31770634 5.0E-06 GTAATTAA 8 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 31770628 31770637 1.0E-06 TAATTAATTA 10 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 31770628 31770637 1.0E-06 TAATTAATTA 10 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31770626 31770635 7.0E-06 TGTAATTAAT 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 9.0E-06 CTAATTAA 8 ATF7_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 31769772 31769785 9.0E-06 TTCTGACGTCATGA 14 ATF7_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 31769772 31769785 7.0E-06 TCATGACGTCAGAA 14 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 SRY_MA0084.1 JASPAR + 31770501 31770509 1.0E-06 TTAAACAAT 9 MEOX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31770626 31770635 3.0E-06 TGTAATTAAT 10 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 31772354 31772364 9.0E-06 AAATTCAATTT 11 CREB3_bZIP_full_dimeric_14_1 SELEX + 31769772 31769785 7.0E-06 TTCTGACGTCATGA 14 CREB3_bZIP_full_dimeric_14_1 SELEX - 31769772 31769785 4.0E-06 TCATGACGTCAGAA 14 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31770630 31770639 7.0E-06 CCTAATTAAT 10 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770627 31770634 9.0E-06 TTAATTAC 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 9.0E-06 CTAATTAA 8 EN1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31770630 31770639 1.0E-05 CCTAATTAAT 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31770630 31770639 6.0E-06 CCTAATTAAT 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 31769657 31769674 2.0E-06 GCAATTGGTTCCAAATTA 18 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 31769658 31769675 3.0E-06 CTAATTTGGAACCAATTG 18 LHX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31770630 31770639 5.0E-06 CCTAATTAAT 10 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31770626 31770635 8.0E-06 TGTAATTAAT 10 LHX9_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31770626 31770635 9.0E-06 TGTAATTAAT 10 POU6F2_POU_full_monomeric_10_1 SELEX - 31770630 31770639 6.0E-06 CCTAATTAAT 10 JDP2_bZIP_full_dimeric_9_1 SELEX - 31772397 31772405 7.0E-06 ATGACTCAC 9 TFAP2C_TFAP_full_dimeric_12_1 SELEX + 31770685 31770696 8.0E-06 AGCCCTGAGGCA 12 HNF4A_MA0114.1 JASPAR + 31769428 31769440 8.0E-06 GGGCCAAAGGCCG 13 VAX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770627 31770634 5.0E-06 TTAATTAC 8 FOXO3_forkhead_full_putatively-multimeric_11_1 SELEX - 31770487 31770497 6.0E-06 TTTCCCCACCA 11 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 31772354 31772364 1.0E-05 AAATTCAATTT 11 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31770630 31770639 1.0E-06 CCTAATTAAT 10 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 5.0E-06 CTAATTAA 8 EMX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31770630 31770639 9.0E-06 ATTAATTAGG 10 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 31769657 31769674 3.0E-06 GCAATTGGTTCCAAATTA 18 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 31769658 31769675 2.0E-06 CTAATTTGGAACCAATTG 18 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31770626 31770635 7.0E-06 TGTAATTAAT 10 BATF3_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 31769772 31769785 5.0E-06 TTCTGACGTCATGA 14 BATF3_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 31769772 31769785 3.0E-06 TCATGACGTCAGAA 14 PAX7_PAX_full_dimeric_10_1 SELEX + 31770628 31770637 1.0E-06 TAATTAATTA 10 PAX7_PAX_full_dimeric_10_1 SELEX - 31770628 31770637 1.0E-06 TAATTAATTA 10 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770631 31770638 9.0E-06 CTAATTAA 8 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 31770630 31770639 9.0E-06 ATTAATTAGG 10 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 31770630 31770639 9.0E-06 CCTAATTAAT 10 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31770627 31770634 9.0E-06 TTAATTAC 8 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 31770624 31770640 0.0E+00 ACCTAATTAATTACAAC 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 31770625 31770641 0.0E+00 TTGTAATTAATTAGGTG 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC - 31770628 31770643 4.0E-06 TTCACCTAATTAATTA 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 31770621 31770637 7.0E-06 TAATTAATTACAACACT 17 V_MEQCJUN_02_M02048 TRANSFAC - 31770508 31770518 5.0E-06 AGTGAGGTCAT 11 V_BACH2_01_M00490 TRANSFAC + 31772396 31772406 4.0E-06 TGTGAGTCATC 11 V_SOX30_03_M02804 TRANSFAC + 31770500 31770515 8.0E-06 GTTAAACAATGACCTC 16 V_ACAAT_B_M00309 TRANSFAC + 31769800 31769808 8.0E-06 GATTGGTGG 9 V_HP1SITEFACTOR_Q6_M00725 TRANSFAC + 31772432 31772443 6.0E-06 AAATTTCTCCAG 12 V_CREB_Q4_M00178 TRANSFAC + 31769773 31769784 5.0E-06 TCTGACGTCATG 12 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 31770626 31770642 2.0E-06 TCACCTAATTAATTACA 17 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 31770628 31770643 6.0E-06 TTCACCTAATTAATTA 16 V_NFAT3_Q3_M01734 TRANSFAC - 31770703 31770712 3.0E-06 TCATTTTCCT 10 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 31770626 31770642 4.0E-06 TGTAATTAATTAGGTGA 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC - 31770626 31770642 2.0E-06 TCACCTAATTAATTACA 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC + 31770627 31770643 8.0E-06 GTAATTAATTAGGTGAA 17 V_ATF3_Q6_01_M01863 TRANSFAC - 31769773 31769783 6.0E-06 ATGACGTCAGA 11 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC - 31770626 31770642 3.0E-06 TCACCTAATTAATTACA 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 31770622 31770638 5.0E-06 CTAATTAATTACAACAC 17 V_STAT6_01_M00494 TRANSFAC + 31769722 31769729 7.0E-06 TATTTCCA 8 V_HNF4A_03_M02220 TRANSFAC + 31769428 31769440 8.0E-06 GGGCCAAAGGCCG 13 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 31770623 31770639 4.0E-06 CCTAATTAATTACAACA 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 31770626 31770642 9.0E-06 TGTAATTAATTAGGTGA 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 31770622 31770638 3.0E-06 CTAATTAATTACAACAC 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC + 31770623 31770639 3.0E-06 TGTTGTAATTAATTAGG 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 31770626 31770642 8.0E-06 TCACCTAATTAATTACA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 31770623 31770639 9.0E-06 CCTAATTAATTACAACA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 31770626 31770642 0.0E+00 TGTAATTAATTAGGTGA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 31770627 31770643 9.0E-06 TTCACCTAATTAATTAC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 31770622 31770638 2.0E-06 CTAATTAATTACAACAC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 31770626 31770642 4.0E-06 TCACCTAATTAATTACA 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 31770627 31770643 3.0E-06 GTAATTAATTAGGTGAA 17 V_AP4_Q6_02_M01860 TRANSFAC + 31770052 31770064 3.0E-06 CCAGCTGTGGTAA 13 V_COUPTF_Q6_M01036 TRANSFAC - 31769373 31769395 2.0E-06 TCTGGTGATCCCTGACCCTTTCC 23 V_PU1_Q4_M01172 TRANSFAC - 31770637 31770655 7.0E-06 TGCCTTCACTTCTTCACCT 19 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 31770627 31770636 2.0E-06 AATTAATTAC 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 31770629 31770638 1.0E-06 AATTAATTAG 10 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC - 31770626 31770642 2.0E-06 TCACCTAATTAATTACA 17 V_EVX1_01_M01475 TRANSFAC - 31770626 31770642 9.0E-06 TCACCTAATTAATTACA 17 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC - 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