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DCLK3 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 85443 doublecortin-like kinase 3 chr3 - 36780852 - 36786352 36781352 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the DCLK3 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints CTCF_MA0139.1 JASPAR + 36782965 36782983 5.0E-06 TGGTCACAAGAGGGCAGAC 19 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX - 36782421 36782430 6.0E-06 ATAATTAAAA 10 NEUROD2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 36785516 36785525 4.0E-06 AACATATGGT 10 NEUROD2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 36785516 36785525 0.0E+00 ACCATATGTT 10 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 36782421 36782430 3.0E-06 ATAATTAAAA 10 ESRRA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_19_1 SELEX + 36780422 36780440 2.0E-06 CGAGGGCAGAACAAGGGCA 19 NFIA_NFI_full_dimeric_15_1 SELEX + 36780488 36780502 8.0E-06 CTGGCAGGCAGCCAG 15 NFIA_NFI_full_dimeric_15_1 SELEX - 36780488 36780502 7.0E-06 CTGGCTGCCTGCCAG 15 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 36782422 36782431 2.0E-06 TTTAATTATA 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 36782422 36782431 6.0E-06 TATAATTAAA 10 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 36782301 36782317 2.0E-06 CCTTTAAAAAGAAATTT 17 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 36780537 36780548 4.0E-06 TTAAATATTTTA 12 FOXG1_forkhead_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 36782410 36782426 2.0E-06 TTAAAAAACAAAAAACA 17 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 36780536 36780548 1.0E-05 CTTAAATATTTTA 13 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 36782423 36782430 4.0E-06 ATAATTAA 8 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 36782316 36782328 9.0E-06 TTAAAATAATCAT 13 ZNF75A_C2H2_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 36782921 36782932 0.0E+00 CCTTTTCCCACA 12 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 36782422 36782431 4.0E-06 TTTAATTATA 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 36782422 36782431 6.0E-06 TATAATTAAA 10 POU1F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 36776498 36776511 8.0E-06 AAAATGCAAACTAA 14 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 36782320 36782333 2.0E-06 AATAATCATTTATA 14 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 36776406 36776435 8.0E-06 AAAAATAACTGATAAATCCCTTCACACAAA 30 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 36782423 36782436 2.0E-06 TACATTATAATTAA 14 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 36782422 36782431 5.0E-06 TATAATTAAA 10 ESRRG_nuclearreceptor_full_dimeric_18_1 SELEX + 36780423 36780440 6.0E-06 GAGGGCAGAACAAGGGCA 18 BHLHE23_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 36785516 36785525 2.0E-06 AACATATGGT 10 BHLHE23_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 36785516 36785525 1.0E-06 ACCATATGTT 10 FOXJ3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 36782410 36782423 1.0E-06 AAAAACAAAAAACA 14 FOXJ3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 36782417 36782430 2.0E-06 ATAATTAAAAAACA 14 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 36782422 36782431 5.0E-06 TATAATTAAA 10 ESR1_MA0112.2 JASPAR - 36777940 36777959 5.0E-06 AGATAAGGCCACTCTGACCA 20 BHLHE22_bHLH_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 36785515 36785526 1.0E-06 GAACATATGGTT 12 BHLHE22_bHLH_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 36785515 36785526 1.0E-06 AACCATATGTTC 12 Pou2f2_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 36776494 36776507 4.0E-06 TTAGAAAATGCAAA 14 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 36780537 36780548 7.0E-06 TAAAATATTTAA 12 OLIG1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 36785516 36785525 1.0E-06 AACATATGGT 10 OLIG1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 36785516 36785525 1.0E-06 ACCATATGTT 10 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 36782423 36782430 9.0E-06 ATAATTAA 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 36782423 36782430 9.0E-06 TTAATTAT 8 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 36782423 36782430 9.0E-06 ATAATTAA 8 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 36782413 36782423 8.0E-06 AAAAACAAAAA 11 MAFK_bZIP_DBD_dimeric_21_1 SELEX + 36776498 36776518 5.0E-06 AAAATGCAAACTAAGCTAACT 21 MAFK_bZIP_DBD_dimeric_21_1 SELEX - 36776498 36776518 4.0E-06 AGTTAGCTTAGTTTGCATTTT 21 Gata1_MA0035.2 JASPAR - 36777882 36777892 5.0E-06 GCAGATAAAAA 11 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 36782422 36782431 5.0E-06 TATAATTAAA 10 Atoh1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 36785516 36785525 1.0E-06 AACATATGGT 10 Atoh1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 36785516 36785525 2.0E-06 ACCATATGTT 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 36782422 36782431 9.0E-06 TATAATTAAA 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 36780537 36780548 3.0E-06 TTAAATATTTTA 12 NFIB_NFI_full_dimeric_15_1 SELEX - 36780488 36780502 9.0E-06 CTGGCTGCCTGCCAG 15 MAFG_bZIP_full_dimeric_21_1 SELEX + 36776498 36776518 7.0E-06 AAAATGCAAACTAAGCTAACT 21 MAFG_bZIP_full_dimeric_21_1 SELEX - 36776498 36776518 8.0E-06 AGTTAGCTTAGTTTGCATTTT 21 NEUROG2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 36785516 36785525 6.0E-06 AACATATGGT 10 NEUROG2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 36785516 36785525 6.0E-06 ACCATATGTT 10 RORA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 36780421 36780440 8.0E-06 CCGAGGGCAGAACAAGGGCA 20 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 36780537 36780548 7.0E-06 TAAAATATTTAA 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 36782317 36782328 5.0E-06 TAAAATAATCAT 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 36782419 36782430 9.0E-06 ATAATTAAAAAA 12 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 36782413 36782430 5.0E-06 ATAATTAAAAAACAAAAA 18 Sox2_MA0143.1 JASPAR - 36777989 36778003 7.0E-06 CCATTCTTCTGTTGA 15 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 36782422 36782431 3.0E-06 TATAATTAAA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 36782413 36782425 4.0E-06 TAAAAAACAAAAA 13 BHLHA15_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 36785516 36785525 1.0E-06 AACATATGGT 10 BHLHA15_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 36785516 36785525 1.0E-06 ACCATATGTT 10 OLIG2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 36785516 36785525 2.0E-06 AACATATGGT 10 OLIG2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 36785516 36785525 1.0E-06 ACCATATGTT 10 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 36782421 36782431 9.0E-06 TATAATTAAAA 11 OLIG3_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 36785516 36785525 2.0E-06 AACATATGGT 10 OLIG3_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 36785516 36785525 1.0E-06 ACCATATGTT 10 DLX5_homeodomain_FL_monomeric_8_1 SELEX - 36782423 36782430 8.0E-06 ATAATTAA 8 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 36782410 36782423 0.0E+00 AAAAACAAAAAACA 14 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 36782417 36782430 4.0E-06 ATAATTAAAAAACA 14 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 36777879 36777898 2.0E-06 TTATTTTTATCTGCATTTGG 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 36782305 36782324 2.0E-06 TTATTTTAAATTTCTTTTTA 20 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 36782308 36782324 3.0E-06 AAAGAAATTTAAAATAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 36782413 36782429 2.0E-06 TAATTAAAAAACAAAAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 36782416 36782432 1.0E-06 TTGTTTTTTAATTATAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 36782417 36782433 2.0E-06 ATTATAATTAAAAAACA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 36782420 36782436 3.0E-06 TTTTTAATTATAATGTA 17 V_TCF3_01_M01594 TRANSFAC + 36782413 36782425 0.0E+00 TTTTTGTTTTTTA 13 V_AR_02_M00953 TRANSFAC + 36782427 36782453 0.0E+00 TTATAATGTACAATCTGTTCTGAGATG 27 V_GATA1_Q6_M02004 TRANSFAC - 36777881 36777895 4.0E-06 AATGCAGATAAAAAT 15 V_GATA1_Q6_M02004 TRANSFAC - 36777950 36777964 9.0E-06 ACATCAGATAAGGCC 15 V_SOX40_04_M02908 TRANSFAC + 36782422 36782437 2.0E-06 TTTAATTATAATGTAC 16 V_SOX40_04_M02908 TRANSFAC - 36782422 36782437 1.0E-05 GTACATTATAATTAAA 16 V_SRY_07_M02813 TRANSFAC + 36782422 36782437 0.0E+00 TTTAATTATAATGTAC 16 V_SRY_07_M02813 TRANSFAC - 36782422 36782437 1.0E-06 GTACATTATAATTAAA 16 V_MAFK_03_M02776 TRANSFAC - 36782319 36782333 5.0E-06 TATAAATGATTATTT 15 TAL1_TCF3_MA0091.1 JASPAR + 36785514 36785525 3.0E-06 GGAACATATGGT 12 TAL1_TCF3_MA0091.1 JASPAR - 36785516 36785527 2.0E-06 AAACCATATGTT 12 V_ESR1_01_M02261 TRANSFAC - 36777940 36777959 5.0E-06 AGATAAGGCCACTCTGACCA 20 V_ZEC_01_M01081 TRANSFAC - 36778172 36778184 8.0E-06 CTTTCTTAGTTGC 13 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC - 36782307 36782321 3.0E-06 TTTTAAATTTCTTTT 15 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC - 36782308 36782322 3.0E-06 ATTTTAAATTTCTTT 15 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC - 36782306 36782321 7.0E-06 TTTTAAATTTCTTTTT 16 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC - 36782308 36782323 0.0E+00 TATTTTAAATTTCTTT 16 V_AR_Q6_01_M01996 TRANSFAC + 36782434 36782448 0.0E+00 GTACAATCTGTTCTG 15 V_FOXJ1_04_M02854 TRANSFAC - 36777958 36777972 3.0E-06 AGATCACAACATCAG 15 V_DR4_Q2_M00965 TRANSFAC - 36782964 36782980 5.0E-06 TGCCCTCTTGTGACCAC 17 V_IRF_Q6_01_M00972 TRANSFAC - 36778053 36778063 7.0E-06 GAAAAAGAAAA 11 V_SRY_02_M00160 TRANSFAC - 36782412 36782423 2.0E-06 AAAAACAAAAAA 12 V_IRF2_Q6_M01882 TRANSFAC - 36778050 36778065 7.0E-06 GGGAAAAAGAAAAGCA 16 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 36782418 36782434 4.0E-06 GTTTTTTAATTATAATG 17 V_FOXO3A_Q1_M01137 TRANSFAC - 36782413 36782424 4.0E-06 AAAAAACAAAAA 12 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 36782418 36782434 3.0E-06 CATTATAATTAAAAAAC 17 V_HNF3_Q6_01_M01012 TRANSFAC + 36782412 36782429 5.0E-06 TTTTTTGTTTTTTAATTA 18 V_GATA_C_M00203 TRANSFAC - 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