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SHISA9 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 729993 shisa homolog 9 (Xenopus laevis) chr16 + 12990476 - 12995976 12995476 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the SHISA9 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 4.0E-06 TTAATTAA 8 FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 12993656 12993673 6.0E-06 TCAGCAAATATTTCCAGA 18 VSX1_homeodomain_full_monomeric_11_1 SELEX + 13000269 13000279 7.0E-06 GGCTAATTAGG 11 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 4.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 ZBTB7A_C2H2_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 12995766 12995777 3.0E-06 GCCGACCACCGA 12 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 12992617 12992626 1.0E-06 TTTAATTAAC 10 EN2_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 13000270 13000279 2.0E-06 CCTAATTAGC 10 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 12996906 12996916 1.0E-05 CACACGCCCCC 11 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 12997284 12997295 5.0E-06 TTGCATAATGAA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 12997284 12997296 4.0E-06 CTTGCATAATGAA 13 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 13000405 13000417 9.0E-06 TTAGAATAAATGA 13 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 13000401 13000418 3.0E-06 GTCATTTATTCTAATAAA 18 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 12997284 12997294 7.0E-06 TGCATAATGAA 11 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 12992617 12992626 5.0E-06 TTTAATTAAC 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 12992617 12992626 2.0E-06 TTTAATTAAC 10 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR - 12995433 12995450 1.0E-06 GGAGGGCAGGAGGGAAGG 18 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR - 12995437 12995454 1.0E-06 GAAGGGAGGGCAGGAGGG 18 POU1F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 13000401 13000414 4.0E-06 TTTATTCTAATAAA 14 STAT1_MA0137.2 JASPAR + 13000302 13000316 3.0E-06 CAATTCCAGGAAGCG 15 STAT1_MA0137.2 JASPAR - 13000302 13000316 7.0E-06 CGCTTCCTGGAATTG 15 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 12993658 12993671 7.0E-06 AGCAAATATTTCCA 14 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12992617 12992626 4.0E-06 GTTAATTAAA 10 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 12992617 12992626 7.0E-06 TTTAATTAAC 10 ZNF238_C2H2_full_monomeric_13_1 SELEX - 12997535 12997547 4.0E-06 CATCCAGCTGTTC 13 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12992617 12992626 6.0E-06 GTTAATTAAA 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 12997280 12997295 8.0E-06 TTGCATAATGAACAAG 16 POU3F3_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 13000402 13000414 2.0E-06 TTTATTCTAATAA 13 ZNF740_C2H2_full_monomeric_10_1 SELEX + 12995389 12995398 3.0E-06 CCCCCCCCAC 10 NR2E1_nuclearreceptor_full_dimeric_14_1 SELEX + 13000446 13000459 9.0E-06 AAACCATGTAGTCA 14 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12992617 12992626 6.0E-06 GTTAATTAAA 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 13000270 13000279 5.0E-06 CCTAATTAGC 10 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 SP1_MA0079.2 JASPAR + 12995425 12995434 3.0E-06 CCCCTCCCCC 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 12993658 12993671 6.0E-06 AGCAAATATTTCCA 14 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 12993658 12993671 7.0E-06 TGGAAATATTTGCT 14 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 13000270 13000279 7.0E-06 CCTAATTAGC 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 12992617 12992626 2.0E-06 GTTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 12992617 12992626 1.0E-06 TTTAATTAAC 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 EN1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 13000270 13000279 5.0E-06 CCTAATTAGC 10 PBX1_MA0070.1 JASPAR - 13000463 13000474 9.0E-06 AGATCAAGCAAA 12 PAX4_PAX_full_monomeric_8_1 SELEX + 13000271 13000278 7.0E-06 CTAATTAG 8 PAX4_PAX_full_monomeric_8_1 SELEX - 13000271 13000278 7.0E-06 CTAATTAG 8 GBX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 13000270 13000279 4.0E-06 CCTAATTAGC 10 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12992617 12992626 6.0E-06 GTTAATTAAA 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12992617 12992626 6.0E-06 GTTAATTAAA 10 LHX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 13000270 13000279 8.0E-06 GCTAATTAGG 10 LHX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 13000270 13000279 9.0E-06 CCTAATTAGC 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 13000402 13000413 4.0E-06 TTATTCTAATAA 12 Stat3_MA0144.1 JASPAR + 13000305 13000314 1.0E-06 TTCCAGGAAG 10 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 12993658 12993671 9.0E-06 AGCAAATATTTCCA 14 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 13000393 13000406 5.0E-06 AATAAATAGTGACT 14 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 12997284 12997295 3.0E-06 TTGCATAATGAA 12 POU6F2_POU_full_monomeric_10_1 SELEX + 13000270 13000279 7.0E-06 GCTAATTAGG 10 Rhox11_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 12990655 12990663 2.0E-06 TGCTGTTAA 9 Zfp740_C2H2_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12995389 12995398 5.0E-06 CCCCCCCCAC 10 Lhx8_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 13000271 13000278 7.0E-06 CTAATTAG 8 Lhx8_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 13000271 13000278 7.0E-06 CTAATTAG 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F2_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 13000402 13000413 7.0E-06 TTATTCTAATAA 12 EMX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 13000270 13000279 5.0E-06 GCTAATTAGG 10 EMX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 13000270 13000279 9.0E-06 CCTAATTAGC 10 EN1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 13000271 13000278 7.0E-06 CTAATTAG 8 EN1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 13000271 13000278 7.0E-06 CTAATTAG 8 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12992617 12992626 3.0E-06 GTTAATTAAA 10 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12990596 12990608 8.0E-06 ACAAACAAAAATG 13 Irx3_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 12994142 12994153 7.0E-06 CGACATGTAAAA 12 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 4.0E-06 TTAATTAA 8 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 13000270 13000279 8.0E-06 CCTAATTAGC 10 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12992618 12992625 9.0E-06 TTAATTAA 8 V_APOLYA_B_M00310 TRANSFAC + 13000353 13000367 1.0E-06 AACAAATGCCCATTG 15 V_ATF5_01_M01295 TRANSFAC - 12993616 12993626 2.0E-06 TCTCTCCCTTA 11 V_RHOX11_01_M01347 TRANSFAC + 12990651 12990667 6.0E-06 GGGATGCTGTTAAATGT 17 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 12992613 12992629 9.0E-06 CGCTTTAATTAACAGAG 17 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC + 12992614 12992630 1.0E-06 TCTGTTAATTAAAGCGA 17 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 13000266 13000282 6.0E-06 AGCCCTAATTAGCCCAG 17 V_ZFP740_03_M02834 TRANSFAC + 12995386 12995401 5.0E-06 CGCCCCCCCCCACCCG 16 V_GBX2_01_M01382 TRANSFAC + 13000267 13000283 6.0E-06 TGGGCTAATTAGGGCTG 17 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 12992613 12992629 2.0E-06 CTCTGTTAATTAAAGCG 17 V_POU2F3_01_M01476 TRANSFAC - 13000400 13000415 5.0E-06 ATTTATTCTAATAAAT 16 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC - 12992613 12992629 5.0E-06 CGCTTTAATTAACAGAG 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 12992613 12992629 0.0E+00 CGCTTTAATTAACAGAG 17 V_SP1_03_M02281 TRANSFAC + 12995425 12995434 3.0E-06 CCCCTCCCCC 10 V_STAT6_01_M00494 TRANSFAC + 12993664 12993671 7.0E-06 TATTTCCA 8 V_SPZ1_01_M00446 TRANSFAC - 12995431 12995445 6.0E-06 GCAGGAGGGAAGGGG 15 V_HOXA2_01_M01402 TRANSFAC - 13000266 13000281 7.0E-06 GCCCTAATTAGCCCAG 16 V_NERF_Q2_M00531 TRANSFAC + 13000305 13000322 2.0E-06 TTCCAGGAAGCGGTGGGG 18 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 12992613 12992629 8.0E-06 CGCTTTAATTAACAGAG 17 V_SP1_02_M01303 TRANSFAC - 12995360 12995370 8.0E-06 GGGGCGGGGGC 11 V_VAX2_01_M01327 TRANSFAC + 13000266 13000281 5.0E-06 CTGGGCTAATTAGGGC 16 V_AP4_Q6_02_M01860 TRANSFAC - 12997532 12997544 1.0E-05 CCAGCTGTTCGCA 13 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 12992618 12992627 3.0E-06 CTTTAATTAA 10 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC + 12992614 12992630 6.0E-06 TCTGTTAATTAAAGCGA 17 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC - 13000266 13000282 5.0E-06 AGCCCTAATTAGCCCAG 17 V_EVX1_01_M01475 TRANSFAC - 13000266 13000282 4.0E-06 AGCCCTAATTAGCCCAG 17 V_EVX1_01_M01475 TRANSFAC + 13000267 13000283 8.0E-06 TGGGCTAATTAGGGCTG 17 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC + 13000400 13000415 3.0E-06 ATTTATTAGAATAAAT 16 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC - 13000400 13000415 3.0E-06 ATTTATTCTAATAAAT 16 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC - 12992613 12992629 0.0E+00 CGCTTTAATTAACAGAG 17 V_BRN2_01_M00145 TRANSFAC - 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