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SSR1 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 6745 signal sequence receptor, alpha chr6 - 7313041 - 7318541 7313541 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the SSR1 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 9.0E-06 CTAATTAA 8 MYBL2_MYB_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 7313636 7313649 6.0E-06 AACGGCTAACCGCA 14 VSX1_homeodomain_full_monomeric_11_1 SELEX - 7313675 7313685 2.0E-06 TGCTAATTAAT 11 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 7313480 7313490 1.0E-05 GCCACGCCCCT 11 SOX10_HMG_full_dimeric_16_1 SELEX - 7313789 7313804 6.0E-06 AACAATGTCCTCTCTT 16 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 9.0E-06 CTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 SPIC_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX + 7312587 7312600 2.0E-06 AAGAAGAGGAAGAA 14 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 7313480 7313490 7.0E-06 GCCACGCCCCT 11 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 7313893 7313904 6.0E-06 AATAATAATTTA 12 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 7313479 7313492 3.0E-06 TGCCACGCCCCTCC 14 YY1_C2H2_full_monomeric_11_1 SELEX - 7313411 7313421 5.0E-06 AACGCCATTAC 11 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 7.0E-06 ATTAATTAGC 10 CEBPA_MA0102.2 JASPAR - 7311706 7311714 4.0E-06 TTTTGCAAT 9 SOX8_HMG_full_dimeric_15_1 SELEX + 7313682 7313696 1.0E-05 AGCATTGTCAGTGGT 15 POU1F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 7313676 7313689 3.0E-06 ACAATGCTAATTAA 14 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 ISL2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 7313762 7313769 1.0E-05 GCACTTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 RUNX3_RUNX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 7313635 7313650 7.0E-06 GAACGGCTAACCGCAA 16 KLF13_C2H2_full_monomeric_18_1 SELEX + 7313478 7313495 1.0E-06 TTGCCACGCCCCTCCCTG 18 MSX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 7313672 7313679 7.0E-06 CCAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 9.0E-06 CTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 4.0E-06 ATTAATTAGC 10 NR2F1_MA0017.1 JASPAR - 7313932 7313945 5.0E-06 TGAACTCTGGCCTG 14 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 7312587 7312600 1.0E-05 AAGAAGAGGAAGAA 14 MSX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 7313672 7313679 7.0E-06 CCAATTAA 8 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 7313889 7313904 9.0E-06 AATAATAATTTAAGAA 16 RUNX2_RUNX_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 7313635 7313643 6.0E-06 TAACCGCAA 9 POU3F3_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 7313677 7313689 5.0E-06 ACAATGCTAATTA 13 RUNX2_RUNX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 7313628 7313643 9.0E-06 TAACCGCAAGCTGCCG 16 RUNX2_RUNX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 7313635 7313650 5.0E-06 GAACGGCTAACCGCAA 16 TCF4_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 7314164 7314173 3.0E-06 CACACCTGTA 10 SOX2_HMG_full_dimeric_15_1 SELEX + 7312291 7312305 9.0E-06 GTGAATACCTGTCAC 15 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 7313673 7313682 9.0E-06 CAATTAATTA 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 9.0E-06 ATTAATTAGC 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 2.0E-06 GCTAATTAAT 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 9.0E-06 ATTAATTAGC 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 9.0E-06 CTAATTAA 8 XBP1_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 7312833 7312846 0.0E+00 AAAGACACGTCAGC 14 EMX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 1.0E-06 ATTAATTAGC 10 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 FOXI1_MA0042.1 JASPAR - 7310823 7310834 4.0E-06 GGTTGTTTAGTT 12 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX + 7313477 7313493 3.0E-06 TTTGCCACGCCCCTCCC 17 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 7.0E-06 ATTAATTAGC 10 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 4.0E-06 GCTAATTAAT 10 NFATC1_NFAT_full_dimeric_20_1 SELEX + 7313830 7313849 0.0E+00 AGTGGAAAATCTTTGTCCCC 20 SOX9_HMG_full_dimeric_16_3 SELEX + 7311653 7311668 1.0E-06 ATGCATTTGCAGTCTT 16 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 6.0E-06 ATTAATTAGC 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 9.0E-06 CTAATTAA 8 EN1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 1.0E-05 GCTAATTAAT 10 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 9.0E-06 ATTAATTAGC 10 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 3.0E-06 GCTAATTAAT 10 BSX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 7313672 7313679 7.0E-06 CCAATTAA 8 LHX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 2.0E-06 GCTAATTAAT 10 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 7313665 7313679 6.0E-06 TTAATTGGAAGTAAA 15 Foxd3_MA0041.1 JASPAR + 7313895 7313906 6.0E-06 AATTATTATTTT 12 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 4.0E-06 GCTAATTAAT 10 LHX9_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 Msx3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 7313672 7313679 7.0E-06 CCAATTAA 8 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 7313893 7313904 9.0E-06 AATAATAATTTA 12 POU6F2_POU_full_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 2.0E-06 GCTAATTAAT 10 HNF4A_MA0114.1 JASPAR + 7313933 7313945 2.0E-06 AGGCCAGAGTTCA 13 FOXI1_forkhead_full_dimeric_17_1 SELEX + 7311592 7311608 8.0E-06 CTGTGGATAAAAAACAT 17 MEOX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 8.0E-06 GCTAATTAAT 10 MYBL1_MYB_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 7312304 7312314 1.0E-05 ACTACCGTTAA 11 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 8.0E-06 GCTAATTAAT 10 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 5.0E-06 CTAATTAA 8 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 7313896 7313907 3.0E-06 AAAAATAATAAT 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 7313677 7313688 9.0E-06 CAATGCTAATTA 12 EMX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 3.0E-06 ATTAATTAGC 10 TBX1_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 7314155 7314174 9.0E-06 TGCTGGGATTACAGGTGTGA 20 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 7313676 7313683 9.0E-06 CTAATTAA 8 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 7313675 7313684 2.0E-06 ATTAATTAGC 10 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 7313675 7313684 3.0E-06 GCTAATTAAT 10 Zfx_MA0146.1 JASPAR - 7313080 7313093 9.0E-06 CCCGCTGCGGCCTG 14 V_CEBPG_Q6_M00622 TRANSFAC - 7312682 7312694 0.0E+00 TTGATTTCAGAAA 13 V_TGIF_01_M00418 TRANSFAC + 7312297 7312307 6.0E-06 ACCTGTCACTA 11 V_MEIS1_02_M01419 TRANSFAC + 7312293 7312308 8.0E-06 GAATACCTGTCACTAC 16 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 7313670 7313686 6.0E-06 TTCCAATTAATTAGCAT 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 7313889 7313905 4.0E-06 AAATAATAATTTAAGAA 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC + 7313667 7313682 1.0E-05 TACTTCCAATTAATTA 16 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC - 7313673 7313688 7.0E-06 CAATGCTAATTAATTG 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 7313886 7313902 1.0E-05 CAATTCTTAAATTATTA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 7313886 7313902 0.0E+00 TAATAATTTAAGAATTG 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 7313890 7313906 8.0E-06 TCTTAAATTATTATTTT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 7313890 7313906 5.0E-06 AAAATAATAATTTAAGA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 7313893 7313909 4.0E-06 TAAATTATTATTTTTGA 17 V_USF_Q6_M00187 TRANSFAC + 7313561 7313570 2.0E-06 GTCACGTGGC 10 V_PREP1_01_M01459 TRANSFAC + 7312293 7312308 3.0E-06 GAATACCTGTCACTAC 16 V_LEF1_04_M02774 TRANSFAC - 7313798 7313814 3.0E-06 TTTTCCTTTGAACAATG 17 V_AML_Q6_M00769 TRANSFAC + 7313631 7313645 1.0E-05 CAGCTTGCGGTTAGC 15 V_SRY_07_M02813 TRANSFAC + 7313892 7313907 1.0E-06 TTAAATTATTATTTTT 16 V_SRY_07_M02813 TRANSFAC - 7313892 7313907 2.0E-06 AAAAATAATAATTTAA 16 V_MAX_Q6_M01830 TRANSFAC - 7313562 7313573 1.0E-06 CCGGCCACGTGA 12 V_CEBP_Q3_M00770 TRANSFAC - 7311706 7311717 0.0E+00 ATATTTTGCAAT 12 V_ZFX_01_M01593 TRANSFAC + 7313077 7313092 0.0E+00 GGGCAGGCCGCAGCGG 16 V_FOXD3_01_M00130 TRANSFAC + 7313895 7313906 4.0E-06 AATTATTATTTT 12 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC - 7311711 7311726 7.0E-06 TGTTCTTTAATATTTT 16 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC - 7313776 7313791 7.0E-06 CTTCCAACAAAATTTT 16 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 7313890 7313905 7.0E-06 TCTTAAATTATTATTT 16 V_STAT_Q6_M00777 TRANSFAC - 7311564 7311576 5.0E-06 ATTTTTTCTGAGA 13 V_SATB1_Q3_M01723 TRANSFAC + 7313875 7313890 7.0E-06 TTAAGTAATGACAATT 16 V_EBOX_Q6_01_M01034 TRANSFAC - 7313560 7313569 4.0E-06 CCACGTGACT 10 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 7313671 7313687 1.0E-06 AATGCTAATTAATTGGA 17 V_CBF_02_M01080 TRANSFAC + 7311588 7311603 7.0E-06 AATTCTGTGGATAAAA 16 V_MAFB_03_M02879 TRANSFAC - 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