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IQCJ Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 654502 IQ motif containing J chr3 + 158782040 - 158787540 158787040 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the IQCJ promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 4.0E-06 TTAATTAA 8 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 158782530 158782542 4.0E-06 GTACACATACACA 13 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 4.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 158782693 158782702 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 158782693 158782702 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 SRY_HMG_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 158782720 158782734 3.0E-06 TGCAATAACATTTTT 15 SOX2_HMG_full_dimeric_17_1 SELEX - 158782719 158782735 7.0E-06 ATGCAATAACATTTTTT 17 IRX2_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 158787541 158787552 9.0E-06 TTACACAACAAC 12 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 158782693 158782702 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 158782693 158782702 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 158782719 158782732 3.0E-06 CAATAACATTTTTT 14 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 158782693 158782702 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 158782693 158782702 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 NR4A2_nuclearreceptor_full_dimeric_17_1 SELEX - 158782577 158782593 5.0E-06 ATGACAAATAGTGACAT 17 FOXD3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 158782719 158782732 6.0E-06 CAATAACATTTTTT 14 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 HSF4_HSF_DBD_trimeric_13_1 SELEX + 158787004 158787016 1.0E-05 TGCCAGAAGTTTC 13 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 158782693 158782702 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 158782693 158782702 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 SOX7_HMG_full_dimeric_17_1 SELEX + 158782719 158782735 9.0E-06 AAAAAATGTTATTGCAT 17 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 158782693 158782702 2.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 158782693 158782702 2.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 158782693 158782702 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 158782693 158782702 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 FOXB1_forkhead_full_monomeric_9_1 SELEX + 158787531 158787539 5.0E-06 TGTAAATAT 9 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 Sox3_HMG_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 158782719 158782735 5.0E-06 AAAAAATGTTATTGCAT 17 Sox3_HMG_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 158782719 158782735 2.0E-06 ATGCAATAACATTTTTT 17 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 158782693 158782702 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 158782693 158782702 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 158782530 158782542 7.0E-06 GTACACATACACA 13 FOXB1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 158787529 158787539 4.0E-06 TCTGTAAATAT 11 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 4.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 158782694 158782701 9.0E-06 TTAATTAA 8 IRX5_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 158787541 158787552 5.0E-06 TTACACAACAAC 12 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 158782520 158782539 1.0E-06 GTATGTGTACTTGTGTGTTT 20 V_HSF1_Q6_M01023 TRANSFAC + 158787003 158787019 1.0E-06 GTGCCAGAAGTTTCTCA 17 V_DLX3_01_M01400 TRANSFAC + 158782689 158782705 1.0E-05 GAACTTTAATTAAAATC 17 V_GM397_03_M02760 TRANSFAC + 158782525 158782541 8.0E-06 CACAAGTACACATACAC 17 V_SPDEF_04_M02915 TRANSFAC + 158782697 158782712 5.0E-06 ATTAAAATCCTTGTTG 16 V_FOXJ2_02_M00423 TRANSFAC - 158782720 158782733 0.0E+00 GCAATAACATTTTT 14 V_MEF2_02_M00231 TRANSFAC + 158782685 158782706 8.0E-06 CCTGGAACTTTAATTAAAATCC 22 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 158782690 158782706 7.0E-06 GGATTTTAATTAAAGTT 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 158782690 158782706 6.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 158782689 158782705 7.0E-06 GAACTTTAATTAAAATC 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 158782690 158782706 3.0E-06 GGATTTTAATTAAAGTT 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 158782690 158782706 7.0E-06 GGATTTTAATTAAAGTT 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 158782689 158782705 2.0E-06 GATTTTAATTAAAGTTC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 158782690 158782706 1.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 158782692 158782701 3.0E-06 CTTTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 158782694 158782703 9.0E-06 TTTTAATTAA 10 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC + 158782691 158782706 9.0E-06 ACTTTAATTAAAATCC 16 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC - 158782693 158782708 1.0E-05 AAGGATTTTAATTAAA 16 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC + 158782690 158782706 3.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 158782689 158782705 3.0E-06 GATTTTAATTAAAGTTC 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 158782690 158782706 1.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC + 158782689 158782705 8.0E-06 GAACTTTAATTAAAATC 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 158782689 158782705 1.0E-06 GATTTTAATTAAAGTTC 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 158782690 158782706 0.0E+00 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_XFD3_01_M00269 TRANSFAC + 158787529 158787542 5.0E-06 TCTGTAAATATCTT 14 Ddit3_Cebpa_MA0019.1 JASPAR - 158782726 158782737 3.0E-06 AAATGCAATAAC 12 V_FOXK1_04_M02856 TRANSFAC - 158782722 158782736 7.0E-06 AATGCAATAACATTT 15 V_MEF2_03_M00232 TRANSFAC + 158782685 158782706 8.0E-06 CCTGGAACTTTAATTAAAATCC 22 V_MEF2_03_M00232 TRANSFAC + 158787523 158787544 9.0E-06 GTCAGATCTGTAAATATCTTAC 22 V_TATA_C_M00216 TRANSFAC + 158782714 158782723 3.0E-06 TCTTTAAAAA 10 V_ISRE_01_M00258 TRANSFAC + 158787010 158787024 4.0E-06 AAGTTTCTCATCTAG 15 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 158782689 158782704 8.0E-06 GAACTTTAATTAAAAT 16 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC + 158782689 158782705 8.0E-06 GAACTTTAATTAAAATC 17 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC - 158782690 158782706 5.0E-06 GGATTTTAATTAAAGTT 17 V_MEF2_04_M00233 TRANSFAC + 158782629 158782650 0.0E+00 TCTGTCTCCAAAAACAGATATT 22 V_GATA5_04_M02860 TRANSFAC - 158782603 158782619 7.0E-06 AACAGAGATCTCATATA 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC - 158782689 158782705 0.0E+00 GATTTTAATTAAAGTTC 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC + 158782690 158782706 0.0E+00 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC - 158782689 158782705 3.0E-06 GATTTTAATTAAAGTTC 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC + 158782690 158782706 1.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_BRACH_01_M00150 TRANSFAC - 158787011 158787034 9.0E-06 CCACAGACAGCTAGATGAGAAACT 24 V_ATF1_04_M02842 TRANSFAC - 158782582 158782595 2.0E-06 GAATGACAAATAGT 14 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 158782694 158782703 5.0E-06 TTTTAATTAA 10 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC + 158782689 158782705 9.0E-06 GAACTTTAATTAAAATC 17 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 158782690 158782706 2.0E-06 GGATTTTAATTAAAGTT 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 158782689 158782705 3.0E-06 GATTTTAATTAAAGTTC 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC + 158782690 158782706 1.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_FOXO1_Q5_M01216 TRANSFAC + 158782638 158782646 1.0E-05 AAAAACAGA 9 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 158782690 158782706 5.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_DLX7_01_M01486 TRANSFAC + 158782689 158782705 3.0E-06 GAACTTTAATTAAAATC 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC - 158782689 158782705 3.0E-06 GATTTTAATTAAAGTTC 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC + 158782690 158782706 1.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_POU5F1_01_M01307 TRANSFAC - 158782727 158782736 2.0E-06 AATGCAATAA 10 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 158782689 158782705 1.0E-06 GAACTTTAATTAAAATC 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 158782690 158782706 0.0E+00 GGATTTTAATTAAAGTT 17 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC + 158782690 158782706 3.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_HSF_Q6_M00641 TRANSFAC + 158787004 158787016 2.0E-06 TGCCAGAAGTTTC 13 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 158782689 158782705 2.0E-06 GATTTTAATTAAAGTTC 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC + 158782690 158782706 1.0E-06 AACTTTAATTAAAATCC 17 V_HOXD10_01_M01375 TRANSFAC - 158782720 158782736 4.0E-06 AATGCAATAACATTTTT 17 V_CDPCR3_01_M00105 TRANSFAC + 158782637 158782651 8.0E-06 CAAAAACAGATATTG 15 V_HSF1_Q6_01_M02017 TRANSFAC - 158787003 158787016 2.0E-06 GAAACTTCTGGCAC 14

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