Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

FABP9 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 646480 chr8 + 82368758 - 82378758 0 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the FABP9 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints NF-kappaB_MA0061.1 JASPAR + 82371928 82371937 1.0E-06 GGGAATTTCC 10 NF-kappaB_MA0061.1 JASPAR - 82371929 82371938 9.0E-06 GGGAAATTCC 10 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 82373064 82373081 6.0E-06 TTAGTTACACATTAATTA 18 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 82373068 82373084 6.0E-06 CATTTAGTTACACATTA 17 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 82373057 82373074 8.0E-06 CACATTAATTATAATGAC 18 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 82373063 82373070 4.0E-06 ATAATTAA 8 HNF1B_MA0153.1 JASPAR + 82373067 82373078 1.0E-06 TTAATGTGTAAC 12 NFKB1_MA0105.1 JASPAR + 82371928 82371938 9.0E-06 GGGAATTTCCC 11 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 82373057 82373070 0.0E+00 GTCATTATAATTAA 14 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 82373062 82373071 5.0E-06 TATAATTAAT 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 82373062 82373071 5.0E-06 ATTAATTATA 10 REL_MA0101.1 JASPAR + 82371928 82371937 2.0E-06 GGGAATTTCC 10 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 82373065 82373079 2.0E-06 AATTAATGTGTAACT 15 NR2E1_nuclearreceptor_full_dimeric_14_1 SELEX - 82373075 82373088 1.0E-06 AAGTCATTTAGTTA 14 RELA_MA0107.1 JASPAR + 82371928 82371937 1.0E-06 GGGAATTTCC 10 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 82373062 82373071 1.0E-05 TATAATTAAT 10 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 82373063 82373070 9.0E-06 ATAATTAA 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 82373063 82373070 9.0E-06 TTAATTAT 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 82373061 82373073 3.0E-06 ACATTAATTATAA 13 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 82373063 82373070 9.0E-06 ATAATTAA 8 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 82373064 82373081 7.0E-06 TTAGTTACACATTAATTA 18 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 82373066 82373078 4.0E-06 GTTACACATTAAT 13 RUNX1_MA0002.2 JASPAR + 82371913 82371923 3.0E-06 CCCTGTGGTTT 11 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 82373065 82373079 3.0E-06 AATTAATGTGTAACT 15 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 82373063 82373080 7.0E-06 ATAATTAATGTGTAACTA 18 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 82373064 82373081 7.0E-06 TTAGTTACACATTAATTA 18 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 82373062 82373071 5.0E-06 ATTAATTATA 10 DLX5_homeodomain_FL_monomeric_8_1 SELEX + 82373063 82373070 8.0E-06 ATAATTAA 8 V_NFKAPPAB65_01_M00052 TRANSFAC + 82371928 82371937 1.0E-06 GGGAATTTCC 10 V_NFKB_C_M00208 TRANSFAC + 82371927 82371938 4.0E-06 TGGGAATTTCCC 12 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 82373061 82373077 9.0E-06 TTATAATTAATGTGTAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 82373061 82373077 4.0E-06 TTACACATTAATTATAA 17 V_NFKB_Q6_01_M00774 TRANSFAC - 82371927 82371942 0.0E+00 CAATGGGAAATTCCCA 16 V_BTEB3_Q5_M01865 TRANSFAC + 82371884 82371896 2.0E-06 GTGCGGGAGGAGT 13 V_SRY_07_M02813 TRANSFAC + 82373056 82373071 2.0E-06 AGTCATTATAATTAAT 16 V_SRY_07_M02813 TRANSFAC - 82373056 82373071 1.0E-06 ATTAATTATAATGACT 16 V_RELBP52_01_M01239 TRANSFAC + 82371928 82371937 7.0E-06 GGGAATTTCC 10 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 82373060 82373075 4.0E-06 ACACATTAATTATAAT 16 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 82373058 82373074 4.0E-06 CACATTAATTATAATGA 17 V_P50RELAP65_Q5_01_M01224 TRANSFAC + 82371929 82371940 0.0E+00 GGAATTTCCCAT 12 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 82373053 82373069 7.0E-06 TAATTATAATGACTTGG 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 82373058 82373074 2.0E-06 TCATTATAATTAATGTG 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 82373059 82373075 4.0E-06 ACACATTAATTATAATG 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 82373058 82373074 6.0E-06 CACATTAATTATAATGA 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 82373058 82373074 9.0E-06 CACATTAATTATAATGA 17 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 82373063 82373072 4.0E-06 CATTAATTAT 10 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC + 82373056 82373071 0.0E+00 AGTCATTATAATTAAT 16 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC - 82373056 82373071 1.0E-06 ATTAATTATAATGACT 16 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 82373058 82373074 1.0E-05 CACATTAATTATAATGA 17 V_CDP_04_M01344 TRANSFAC - 82373055 82373069 3.0E-06 TAATTATAATGACTT 15 V_CDP_04_M01344 TRANSFAC + 82373058 82373072 5.0E-06 TCATTATAATTAATG 15 V_COMP1_01_M00057 TRANSFAC - 82371931 82371954 4.0E-06 AGTCAAGTTTGACAATGGGAAATT 24 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 82373062 82373077 3.0E-06 TATAATTAATGTGTAA 16 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 82373058 82373074 3.0E-06 CACATTAATTATAATGA 17 V_RUNX1_01_M02257 TRANSFAC + 82371913 82371923 3.0E-06 CCCTGTGGTTT 11 V_HNF1_Q6_M00790 TRANSFAC + 82373064 82373081 6.0E-06 TAATTAATGTGTAACTAA 18 V_CREL_01_M00053 TRANSFAC + 82371928 82371937 2.0E-06 GGGAATTTCC 10 V_NFKB_Q6_M00194 TRANSFAC + 82371926 82371939 0.0E+00 TTGGGAATTTCCCA 14 V_NFKB_Q6_M00194 TRANSFAC - 82371927 82371940 6.0E-06 ATGGGAAATTCCCA 14 V_HNF1B_04_M02266 TRANSFAC + 82373067 82373078 1.0E-06 TTAATGTGTAAC 12 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC + 82373062 82373082 1.0E-06 TATAATTAATGTGTAACTAAA 21 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC - 82373062 82373082 1.0E-06 TTTAGTTACACATTAATTATA 21 V_CUX1_04_M02959 TRANSFAC - 82373055 82373069 3.0E-06 TAATTATAATGACTT 15 V_CUX1_04_M02959 TRANSFAC + 82373058 82373072 5.0E-06 TCATTATAATTAATG 15 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 82373058 82373073 6.0E-06 TCATTATAATTAATGT 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 82373060 82373075 6.0E-06 ACACATTAATTATAAT 16 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 82373060 82373076 5.0E-06 TACACATTAATTATAAT 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 82373061 82373077 4.0E-06 TTACACATTAATTATAA 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC - 82373058 82373074 6.0E-06 CACATTAATTATAATGA 17 V_POU6F1_01_M00465 TRANSFAC - 82373063 82373073 2.0E-06 ACATTAATTAT 11 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 82373053 82373069 4.0E-06 TAATTATAATGACTTGG 17 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC + 82373058 82373074 1.0E-06 TCATTATAATTAATGTG 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 82373058 82373074 7.0E-06 CACATTAATTATAATGA 17 V_HBP1_04_M02866 TRANSFAC + 82371932 82371948 0.0E+00 ATTTCCCATTGTCAAAC 17 V_DLX7_01_M01486 TRANSFAC + 82373058 82373074 5.0E-06 TCATTATAATTAATGTG 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC - 82373058 82373074 3.0E-06 CACATTAATTATAATGA 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC + 82373059 82373075 6.0E-06 CATTATAATTAATGTGT 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 82373060 82373076 5.0E-06 TACACATTAATTATAAT 17 V_IPF1_05_M01255 TRANSFAC - 82373064 82373075 3.0E-06 ACACATTAATTA 12 V_MSX1_02_M01412 TRANSFAC + 82373058 82373073 8.0E-06 TCATTATAATTAATGT 16 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 82373058 82373074 4.0E-06 TCATTATAATTAATGTG 17 V_NFKAPPAB_01_M00054 TRANSFAC + 82371928 82371937 1.0E-06 GGGAATTTCC 10 V_NFKAPPAB_01_M00054 TRANSFAC - 82371929 82371938 7.0E-06 GGGAAATTCC 10 V_SOX14_04_M02901 TRANSFAC + 82371919 82371935 5.0E-06 GGTTTGGTTGGGAATTT 17 V_COREBINDINGFACTOR_Q6_M00722 TRANSFAC + 82371916 82371923 1.0E-05 TGTGGTTT 8 V_SATB1_01_M01232 TRANSFAC - 82373061 82373072 6.0E-06 CATTAATTATAA 12 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC + 82373060 82373076 4.0E-06 ATTATAATTAATGTGTA 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 82373058 82373074 7.0E-06 CACATTAATTATAATGA 17 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC - 82373060 82373075 4.0E-06 ACACATTAATTATAAT 16 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 82373062 82373077 7.0E-06 TATAATTAATGTGTAA 16 V_HOXD10_01_M01375 TRANSFAC + 82373055 82373071 6.0E-06 AAGTCATTATAATTAAT 17 V_TAACC_B_M00331 TRANSFAC - 82371913 82371935 1.0E-06 AAATTCCCAACCAAACCACAGGG 23 V_SOX5_04_M02910 TRANSFAC + 82373059 82373073 1.0E-05 CATTATAATTAATGT 15 V_SOX14_03_M02798 TRANSFAC + 82373056 82373071 1.0E-06 AGTCATTATAATTAAT 16 V_SOX14_03_M02798 TRANSFAC - 82373056 82373071 1.0E-06 ATTAATTATAATGACT 16 V_TCF11_01_M00285 TRANSFAC - 82373074 82373086 3.0E-06 GTCATTTAGTTAC 13 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC + 82373058 82373073 3.0E-06 TCATTATAATTAATGT 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.