Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

RORA Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS Motifs 6095 RAR-related orphan receptor A chr15 - 61521002 - 61526502 61521502 RORA_2_MA0072.1 RORA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_20_1 RORA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_19_1 RORA_1_MA0071.1 V_RORA1_01_M00156 V_RORA_Q4_M01138 V_RORA2_01_M00157 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the RORA promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 4.0E-06 TTAATTAA 8 HOXD12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 61520053 61520061 9.0E-06 GTAATTAAA 9 SP8_C2H2_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 61519759 61519770 8.0E-06 GCCACACCCCCT 12 HSF2_HSF_DBD_trimeric_13_1 SELEX - 61522243 61522255 5.0E-06 TTCTGGATCCTTC 13 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 61519760 61519770 7.0E-06 GCCACACCCCC 11 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 61521720 61521730 6.0E-06 CCCACACCCAC 11 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 61524537 61524554 1.0E-06 GCAATTAACAACTAACTA 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 4.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 61519679 61519688 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 61519679 61519688 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 61519760 61519770 4.0E-06 GCCACACCCCC 11 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 61520485 61520495 1.0E-05 CACACGCCCCC 11 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 61520036 61520047 4.0E-06 ATACATTATTTA 12 HSF1_HSF_full_trimeric_13_1 SELEX - 61522243 61522255 4.0E-06 TTCTGGATCCTTC 13 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 61520103 61520114 1.0E-05 CAAATAAATAAT 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 61520035 61520047 2.0E-06 TATACATTATTTA 13 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 61519670 61519687 6.0E-06 TTAATTAAAGGCGATTTC 18 TEF_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 61519474 61519485 1.0E-06 TGTTACATAACC 12 TEF_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 61519474 61519485 5.0E-06 GGTTATGTAACA 12 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 61520101 61520113 4.0E-06 TTCAAATAAATAA 13 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 61520037 61520047 7.0E-06 TACATTATTTA 11 ZNF435_C2H2_full_dimeric_18_1 SELEX + 61521475 61521492 3.0E-06 TCTGTTTTCAGAGCAACT 18 HLF_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX + 61519474 61519485 1.0E-06 TGTTACATAACC 12 HLF_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX - 61519474 61519485 7.0E-06 GGTTATGTAACA 12 HLF_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX + 61524729 61524740 7.0E-06 CCTTATGTAATC 12 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61519679 61519688 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 61519679 61519688 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 EWSR1-FLI1_MA0149.1 JASPAR - 61520602 61520619 4.0E-06 GGAAGGGCCGAAGGAAGC 18 PDX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 61520053 61520060 5.0E-06 GTAATTAA 8 NFIL3_MA0025.1 JASPAR - 61519473 61519483 3.0E-06 TTATGTAACAG 11 NFIL3_MA0025.1 JASPAR + 61524731 61524741 1.0E-06 TTATGTAATCT 11 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 DBP_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX + 61519474 61519485 4.0E-06 TGTTACATAACC 12 DBP_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX - 61519474 61519485 2.0E-06 GGTTATGTAACA 12 DBP_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX - 61524729 61524740 8.0E-06 GATTACATAAGG 12 IRF5_IRF_full_monomeric_11_1 SELEX - 61520399 61520409 7.0E-06 CACCGAAACTT 11 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 61518733 61518762 3.0E-06 CAAACATTTCCCATTTTCAAATCACTCTCA 30 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 2.0E-06 AGTAATTAAA 10 TCF7L1_HMG_full_monomeric_12_1 SELEX - 61522225 61522236 2.0E-06 AAACAGCAAAGG 12 BARHL2_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX + 61519671 61519686 8.0E-06 AAATCGCCTTTAATTA 16 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61519679 61519688 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 61519679 61519688 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 2.0E-06 AGTAATTAAA 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 61520033 61520048 8.0E-06 GTAAATAATGTATAAA 16 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 61520036 61520051 7.0E-06 ATACATTATTTACAAC 16 Dlx2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 61520053 61520060 5.0E-06 GTAATTAA 8 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 61520052 61520061 4.0E-06 AGTAATTAAA 10 HMX3_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 61524536 61524546 5.0E-06 TGCAATTAACA 11 HOXC12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 61520053 61520061 7.0E-06 GTAATTAAA 9 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 5.0E-06 AGTAATTAAA 10 ZNF740_C2H2_full_monomeric_10_1 SELEX - 61519775 61519784 3.0E-06 CCCCCCCCAC 10 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 61519670 61519687 7.0E-06 GAAATCGCCTTTAATTAA 18 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 61519670 61519687 9.0E-06 TTAATTAAAGGCGATTTC 18 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 1.0E-06 AGTAATTAAA 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 HSF4_HSF_DBD_trimeric_13_1 SELEX - 61522243 61522255 3.0E-06 TTCTGGATCCTTC 13 OTX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 61523101 61523108 7.0E-06 TTAATCCT 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 61518694 61518705 7.0E-06 CAGAATATGCAA 12 ONECUT2_CUT_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 61524647 61524660 8.0E-06 CATAAATCAATCAC 14 FOXI1_MA0042.1 JASPAR - 61520104 61520115 2.0E-06 GATTATTTATTT 12 Gfi_MA0038.1 JASPAR + 61518750 61518759 4.0E-06 CAAATCACTC 10 MEOX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 0.0E+00 AGTAATTAAA 10 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 61519757 61519773 6.0E-06 TTAGCCACACCCCCTGT 17 ATF4_bZIP_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 61518713 61518725 3.0E-06 AGATGATGTAATG 13 Atf4_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 61518713 61518726 5.0E-06 CAGATGATGTAATG 14 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61520053 61520060 9.0E-06 TTAATTAC 8 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 61519679 61519688 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 61519679 61519688 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 8.0E-06 AGTAATTAAA 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 Tcf7_HMG_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 61522225 61522236 3.0E-06 AAACAGCAAAGG 12 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 61519760 61519770 8.0E-06 GCCACACCCCC 11 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 61520102 61520112 8.0E-06 TCAAATAAATA 11 NFIL3_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 61518713 61518724 4.0E-06 CATTACATCATC 12 NFIL3_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 61519474 61519485 1.0E-06 TGTTACATAACC 12 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 2.0E-06 AGTAATTAAA 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 61524537 61524554 5.0E-06 GCAATTAACAACTAACTA 18 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 61520104 61520115 0.0E+00 GATTATTTATTT 12 PITX1_homeodomain_full_monomeric_9_1 SELEX + 61523100 61523108 9.0E-06 CTTAATCCT 9 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 2.0E-06 AGTAATTAAA 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 0.0E+00 AGTAATTAAA 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 61520036 61520047 1.0E-06 ATACATTATTTA 12 Hltf_MA0109.1 JASPAR - 61520877 61520886 1.0E-05 AAACTTTTAA 10 DUXA_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 61524647 61524659 6.0E-06 ATAAATCAATCAC 13 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 61518694 61518705 6.0E-06 CAGAATATGCAA 12 VAX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61520053 61520060 5.0E-06 TTAATTAC 8 MEOX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 5.0E-06 AGTAATTAAA 10 HLF_MA0043.1 JASPAR + 61519474 61519485 9.0E-06 TGTTACATAACC 12 Zfp740_C2H2_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 61519775 61519784 5.0E-06 CCCCCCCCAC 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61519679 61519688 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 61519679 61519688 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 4.0E-06 AGTAATTAAA 10 FOXB1_forkhead_full_monomeric_9_1 SELEX - 61520041 61520049 4.0E-06 TGTAAATAA 9 REST_MA0138.2 JASPAR + 61522174 61522194 5.0E-06 AGAAGCGCCATGGACAGTTTC 21 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 61524537 61524554 1.0E-06 GCAATTAACAACTAACTA 18 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61519679 61519688 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 61519679 61519688 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 61520052 61520061 0.0E+00 AGTAATTAAA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 61520100 61520112 3.0E-06 ATTCAAATAAATA 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 61520104 61520116 3.0E-06 AAATAAATAATCC 13 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 61520035 61520048 8.0E-06 GTAAATAATGTATA 14 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 61520036 61520049 6.0E-06 ATACATTATTTACA 14 RREB1_MA0073.1 JASPAR + 61520225 61520244 1.0E-06 CCCCCCAACACACGCAGACA 20 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 61520052 61520062 8.0E-06 AGTAATTAAAG 11 ONECUT3_CUT_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 61524647 61524660 6.0E-06 CATAAATCAATCAC 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 4.0E-06 TTAATTAA 8 IRF2_MA0051.1 JASPAR - 61520293 61520310 8.0E-06 GGATAGTGCAAGCAATGT 18 FOXO1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 61520834 61520847 6.0E-06 AAAAATCTGTTTAT 14 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61519680 61519687 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 61520053 61520060 9.0E-06 TTAATTAC 8 V_RUSH1A_02_M01107 TRANSFAC - 61520877 61520886 1.0E-05 AAACTTTTAA 10 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 61521500 61521519 4.0E-06 TTTTTTTTTTTTTTTTTGGT 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 61521501 61521520 4.0E-06 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGG 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 61521502 61521521 1.0E-06 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 20 V_HNF3B_01_M00131 TRANSFAC - 61520103 61520117 2.0E-06 GGGATTATTTATTTG 15 V_KLF15_Q2_M01714 TRANSFAC - 61524493 61524506 9.0E-06 AAGTAGGGGAGTGA 14 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC + 61520048 61520063 8.0E-06 CAACAGTAATTAAAGC 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 61519678 61519694 5.0E-06 AAAACATTTAATTAAAG 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 61520034 61520050 9.0E-06 TTATACATTATTTACAA 17 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC + 61520101 61520116 8.0E-06 TTCAAATAAATAATCC 16 V_APOLYA_B_M00310 TRANSFAC - 61519670 61519684 5.0E-06 ATTAAAGGCGATTTC 15 V_OBOX5_05_M03066 TRANSFAC - 61520105 61520121 1.0E-06 GTGGGGGATTATTTATT 17 V_GCM_Q2_M00634 TRANSFAC + 61521722 61521733 6.0E-06 CACACCCACATT 12 V_FOXA2_04_M02749 TRANSFAC - 61520037 61520053 7.0E-06 CTGTTGTAAATAATGTA 17 V_FOXA2_04_M02749 TRANSFAC + 61520101 61520117 9.0E-06 TTCAAATAAATAATCCC 17 V_OBOX1_01_M01450 TRANSFAC - 61520106 61520122 4.0E-06 AGTGGGGGATTATTTAT 17 V_SIX6_02_M01398 TRANSFAC - 61523089 61523105 4.0E-06 ATTAAGGTATCAGGACT 17 V_DLX3_01_M01400 TRANSFAC - 61520049 61520065 7.0E-06 CAGCTTTAATTACTGTT 17 V_FOXD3_01_M00130 TRANSFAC - 61520104 61520115 0.0E+00 GATTATTTATTT 12 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 61519679 61519694 8.0E-06 TTTAATTAAATGTTTT 16 V_MMEF2_Q6_M00405 TRANSFAC + 61519513 61519528 2.0E-06 GGGTCTAAATATACTC 16 V_IK_Q5_M01169 TRANSFAC + 61521781 61521790 3.0E-06 TTTGGGAGGT 10 V_MAFB_03_M02879 TRANSFAC + 61520965 61520979 1.0E-06 TGTTTGCAGAAAAAT 15 V_ZFP740_03_M02834 TRANSFAC - 61519771 61519786 5.0E-06 CCCCCCCCCCACCTTA 16 V_ZFP740_03_M02834 TRANSFAC - 61519772 61519787 0.0E+00 TCCCCCCCCCCACCTT 16 V_ZFP740_03_M02834 TRANSFAC - 61519774 61519789 3.0E-06 TATCCCCCCCCCCACC 16 V_POU1F1_Q6_M00744 TRANSFAC - 61520032 61520041 1.0E-06 ATGTATAAAT 10 V_ATF3_Q6_01_M01863 TRANSFAC + 61518714 61518724 4.0E-06 ATTACATCATC 11 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 61519676 61519692 8.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 61519676 61519692 5.0E-06 AACATTTAATTAAAGGC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 61519675 61519691 4.0E-06 ACATTTAATTAAAGGCG 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 61519676 61519692 1.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_VAX2_01_M01327 TRANSFAC + 61520048 61520063 4.0E-06 CAACAGTAATTAAAGC 16 V_PU1_Q4_M01172 TRANSFAC - 61521539 61521557 6.0E-06 GCCTTCTCCTTCTTTTTTT 19 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 61519678 61519687 3.0E-06 CTTTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 61519680 61519689 0.0E+00 ATTTAATTAA 10 V_LYF1_01_M00141 TRANSFAC + 61521781 61521789 9.0E-06 TTTGGGAGG 9 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC + 61519676 61519692 5.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_TCFAP2E_04_M02926 TRANSFAC + 61521499 61521512 0.0E+00 TACCAAAAAAAAAA 14 V_TCFAP2E_04_M02926 TRANSFAC + 61521500 61521513 2.0E-06 ACCAAAAAAAAAAA 14 V_TCFAP2E_04_M02926 TRANSFAC + 61521502 61521515 2.0E-06 CAAAAAAAAAAAAA 14 V_CEBPB_01_M00109 TRANSFAC - 61518712 61518725 9.0E-06 AGATGATGTAATGG 14 V_OCT2_02_M01761 TRANSFAC - 61518695 61518704 5.0E-06 AGAATATGCA 10 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 61519675 61519691 6.0E-06 ACATTTAATTAAAGGCG 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 61519676 61519692 1.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 61519676 61519692 1.0E-05 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_REX1_01_M01695 TRANSFAC - 61524516 61524525 1.0E-05 GGAGCCATTA 10 V_HNF6_Q6_M00639 TRANSFAC - 61524648 61524659 1.0E-06 ATAAATCAATCA 12 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC + 61520100 61520116 1.0E-06 ATTCAAATAAATAATCC 17 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC + 61521498 61521514 0.0E+00 GTACCAAAAAAAAAAAA 17 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC + 61521499 61521515 2.0E-06 TACCAAAAAAAAAAAAA 17 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC + 61521500 61521516 3.0E-06 ACCAAAAAAAAAAAAAA 17 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC + 61521501 61521517 4.0E-06 CCAAAAAAAAAAAAAAA 17 V_ZNF219_01_M01122 TRANSFAC + 61519625 61519636 0.0E+00 CGCCCCCCTCCC 12 V_GC_01_M00255 TRANSFAC + 61521668 61521681 7.0E-06 AAGAGGCGGGTCTG 14 V_OBOX5_02_M01480 TRANSFAC - 61520105 61520121 1.0E-06 GTGGGGGATTATTTATT 17 V_DBP_Q6_01_M01872 TRANSFAC - 61519476 61519483 5.0E-06 TTATGTAA 8 V_DBP_Q6_01_M01872 TRANSFAC + 61524731 61524738 5.0E-06 TTATGTAA 8 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC - 61520034 61520049 4.0E-06 TGTAAATAATGTATAA 16 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 61519675 61519691 8.0E-06 ACATTTAATTAAAGGCG 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 61519676 61519692 1.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_OCT1_02_M00136 TRANSFAC - 61518691 61518705 3.0E-06 CAGAATATGCAAGCC 15 V_ZFP105_03_M02827 TRANSFAC + 61521499 61521513 2.0E-06 TACCAAAAAAAAAAA 15 V_ZFP105_03_M02827 TRANSFAC + 61521500 61521514 0.0E+00 ACCAAAAAAAAAAAA 15 V_ZFP105_03_M02827 TRANSFAC + 61521501 61521515 6.0E-06 CCAAAAAAAAAAAAA 15 V_ZFP105_03_M02827 TRANSFAC + 61521502 61521516 1.0E-06 CAAAAAAAAAAAAAA 15 V_ZFP105_03_M02827 TRANSFAC + 61524536 61524550 8.0E-06 TGCAATTAACAACTA 15 V_ZFP410_03_M02832 TRANSFAC - 61523172 61523188 8.0E-06 TGATTTGGGATGGAGGA 17 V_E4BP4_01_M00045 TRANSFAC - 61519474 61519485 2.0E-06 GGTTATGTAACA 12 V_E4BP4_01_M00045 TRANSFAC + 61524729 61524740 4.0E-06 CCTTATGTAATC 12 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC + 61519675 61519691 4.0E-06 CGCCTTTAATTAAATGT 17 V_SIX1_01_M01313 TRANSFAC - 61523089 61523105 1.0E-06 ATTAAGGTATCAGGACT 17 V_GFI1_01_M00250 TRANSFAC - 61524637 61524660 1.0E-06 CATAAATCAATCACAGCCCACACC 24 V_HNF1_Q6_M00790 TRANSFAC - 61520033 61520050 7.0E-06 TTGTAAATAATGTATAAA 18 V_HNF1_Q6_M00790 TRANSFAC - 61524537 61524554 7.0E-06 TAGTTAGTTGTTAATTGC 18 V_CEBPD_Q6_M00621 TRANSFAC + 61518713 61518724 7.0E-06 CATTACATCATC 12 V_SIX3_01_M01358 TRANSFAC - 61523089 61523105 7.0E-06 ATTAAGGTATCAGGACT 17 V_AMEF2_Q6_M00403 TRANSFAC + 61519513 61519530 1.0E-06 GGGTCTAAATATACTCTT 18 V_HOXB9_01_M01426 TRANSFAC - 61524510 61524525 2.0E-06 GGAGCCATTAAAGTCT 16 V_HNF3_Q6_M00791 TRANSFAC + 61520102 61520114 8.0E-06 TCAAATAAATAAT 13 V_STAT5A_02_M00460 TRANSFAC - 61519718 61519741 3.0E-06 TTCACGGAATTCGAGTACAGTAAA 24 V_CDX2_Q5_M00729 TRANSFAC + 61524510 61524523 4.0E-06 AGACTTTAATGGCT 14 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC - 61519675 61519691 9.0E-06 ACATTTAATTAAAGGCG 17 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC + 61524536 61524556 1.0E-06 TGCAATTAACAACTAACTAGT 21 V_OBOX2_01_M01364 TRANSFAC - 61520106 61520122 0.0E+00 AGTGGGGGATTATTTAT 17 V_SZF11_01_M01109 TRANSFAC - 61519635 61519649 6.0E-06 CCGCGGTTTCAGCGG 15 V_NKX52_01_M01315 TRANSFAC + 61524533 61524549 2.0E-06 CCATGCAATTAACAACT 17 V_ELF5_01_M01197 TRANSFAC - 61524724 61524734 1.0E-06 ATAAGGATGTA 11 V_REST_01_M01256 TRANSFAC - 61522177 61522198 0.0E+00 GCCAGAAACTGTCCATGGCGCT 22 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC - 61519676 61519692 1.0E-06 AACATTTAATTAAAGGC 17 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC + 61520931 61520947 8.0E-06 CGTATTTAATTGAGGCA 17 V_IK2_01_M00087 TRANSFAC - 61521420 61521431 3.0E-06 CATTGGGAAAAA 12 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 61519677 61519693 9.0E-06 AAACATTTAATTAAAGG 17 V_HMX1_02_M01481 TRANSFAC + 61520049 61520065 5.0E-06 AACAGTAATTAAAGCTG 17 V_HMX1_02_M01481 TRANSFAC + 61524533 61524549 4.0E-06 CCATGCAATTAACAACT 17 V_MEF2_04_M00233 TRANSFAC + 61520825 61520846 1.0E-06 AGGGTGGCCATAAACAGATTTT 22 V_MEF2_04_M00233 TRANSFAC + 61521494 61521515 3.0E-06 TATGGTACCAAAAAAAAAAAAA 22 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC + 61519675 61519691 6.0E-06 CGCCTTTAATTAAATGT 17 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC - 61519676 61519692 6.0E-06 AACATTTAATTAAAGGC 17 V_RREB1_01_M00257 TRANSFAC + 61521719 61521732 9.0E-06 CCCCACACCCACAT 14 V_OCAB_Q6_M02113 TRANSFAC - 61518691 61518701 9.0E-06 ATATGCAAGCC 11 V_CDC5_01_M00478 TRANSFAC - 61524656 61524667 1.0E-06 GAGATAACATAA 12 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 61519678 61519694 5.0E-06 AAAACATTTAATTAAAG 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC + 61520034 61520050 4.0E-06 TTATACATTATTTACAA 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC + 61524534 61524550 6.0E-06 CATGCAATTAACAACTA 17 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC + 61519678 61519692 6.0E-06 CTTTAATTAAATGTT 15 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC - 61519679 61519693 2.0E-06 AAACATTTAATTAAA 15 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC + 61519676 61519692 0.0E+00 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC + 61519676 61519692 5.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_ISGF3G_03_M02771 TRANSFAC - 61520398 61520412 8.0E-06 AAGCACCGAAACTTA 15 V_POU6F1_01_M00465 TRANSFAC + 61520104 61520114 6.0E-06 AAATAAATAAT 11 V_CREB_Q2_01_M00916 TRANSFAC + 61518713 61518726 1.0E-05 CATTACATCATCTG 14 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 61519680 61519689 1.0E-06 ATTTAATTAA 10 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 61519676 61519692 4.0E-06 AACATTTAATTAAAGGC 17 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 61520049 61520065 4.0E-06 CAGCTTTAATTACTGTT 17 V_SIX2_01_M01433 TRANSFAC - 61523089 61523105 2.0E-06 ATTAAGGTATCAGGACT 17 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC + 61519675 61519691 4.0E-06 CGCCTTTAATTAAATGT 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 61519675 61519691 6.0E-06 ACATTTAATTAAAGGCG 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC + 61519676 61519692 4.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_SOX17_04_M02904 TRANSFAC - 61519732 61519748 5.0E-06 TTTCCCATTCACGGAAT 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 61519676 61519692 7.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_VBP_01_M00228 TRANSFAC + 61518714 61518723 4.0E-06 ATTACATCAT 10 V_VBP_01_M00228 TRANSFAC - 61524730 61524739 5.0E-06 ATTACATAAG 10 V_HBP1_04_M02866 TRANSFAC + 61518738 61518754 1.0E-06 ATTTCCCATTTTCAAAT 17 V_HBP1_04_M02866 TRANSFAC + 61521421 61521437 6.0E-06 TTTTCCCAATGTAGAGA 17 V_HFH8_01_M00294 TRANSFAC - 61520103 61520115 2.0E-06 GATTATTTATTTG 13 V_HOXB7_01_M01396 TRANSFAC - 61520048 61520063 4.0E-06 GCTTTAATTACTGTTG 16 V_HOXB7_01_M01396 TRANSFAC + 61520050 61520065 7.0E-06 ACAGTAATTAAAGCTG 16 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC + 61519676 61519692 1.0E-05 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC - 61520048 61520064 4.0E-06 AGCTTTAATTACTGTTG 17 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC - 61519675 61519691 9.0E-06 ACATTTAATTAAAGGCG 17 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC + 61519676 61519692 1.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_MTF1_06_M02882 TRANSFAC + 61521502 61521515 8.0E-06 CAAAAAAAAAAAAA 14 V_MAZR_01_M00491 TRANSFAC + 61519777 61519789 2.0E-06 GGGGGGGGGGATA 13 V_IRF5_03_M02769 TRANSFAC - 61520398 61520412 5.0E-06 AAGCACCGAAACTTA 15 V_GABPBETA_Q3_M01876 TRANSFAC + 61519845 61519855 1.0E-05 AGAGGAAGGGA 11 V_OBOX2_02_M03064 TRANSFAC - 61520106 61520122 0.0E+00 AGTGGGGGATTATTTAT 17 V_FAC1_01_M00456 TRANSFAC + 61521500 61521513 7.0E-06 ACCAAAAAAAAAAA 14 V_HOXB8_01_M01451 TRANSFAC + 61524533 61524548 2.0E-06 CCATGCAATTAACAAC 16 V_CACBINDINGPROTEIN_Q6_M00720 TRANSFAC - 61521735 61521743 8.0E-06 GAGGGTGGG 9 V_BARHL1_01_M01332 TRANSFAC - 61519681 61519696 4.0E-06 GAAAAACATTTAATTA 16 V_HEN1_02_M00058 TRANSFAC + 61520198 61520219 3.0E-06 GGAGGGAGCAACTGAGTCCCCC 22 V_HEN1_02_M00058 TRANSFAC - 61520198 61520219 4.0E-06 GGGGGACTCAGTTGCTCCCTCC 22 V_FOXL1_04_M02753 TRANSFAC + 61520101 61520117 7.0E-06 TTCAAATAAATAATCCC 17 V_FOXJ3_06_M02855 TRANSFAC + 61518727 61518743 2.0E-06 AAAACCCAAACATTTCC 17 V_ZSCAN4_04_M02942 TRANSFAC + 61519545 61519560 9.0E-06 CCCCGCACACAAACTC 16 V_MSX2_01_M01393 TRANSFAC + 61520048 61520064 5.0E-06 CAACAGTAATTAAAGCT 17 V_ZBTB4_04_M02929 TRANSFAC - 61520955 61520970 1.0E-05 CAAACACTGGAGGAAA 16 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 61519675 61519691 5.0E-06 CGCCTTTAATTAAATGT 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 61519676 61519692 1.0E-06 AACATTTAATTAAAGGC 17 V_DOBOX5_01_M01463 TRANSFAC - 61520105 61520121 6.0E-06 GTGGGGGATTATTTATT 17 V_VDR_Q6_M00961 TRANSFAC - 61521320 61521331 8.0E-06 CCCGCTGAACCA 12 V_OTX2_01_M01387 TRANSFAC - 61520105 61520121 2.0E-06 GTGGGGGATTATTTATT 17 V_MTATA_B_M00320 TRANSFAC - 61520025 61520041 7.0E-06 ATGTATAAATCGCGCCT 17 V_FOX_Q2_M00809 TRANSFAC - 61520103 61520115 1.0E-06 GATTATTTATTTG 13 V_REST_02_M02256 TRANSFAC + 61522174 61522194 5.0E-06 AGAAGCGCCATGGACAGTTTC 21 V_PBX1_03_M01017 TRANSFAC - 61524646 61524657 3.0E-06 AAATCAATCACA 12 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC + 61519676 61519692 5.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_BBX_03_M02739 TRANSFAC + 61519681 61519695 1.0E-05 TAATTAAATGTTTTT 15 V_PBX_Q3_M00998 TRANSFAC + 61524649 61524660 7.0E-06 GATTGATTTATG 12 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC + 61519675 61519691 4.0E-06 CGCCTTTAATTAAATGT 17 V_ZFP281_04_M02831 TRANSFAC - 61519774 61519788 0.0E+00 ATCCCCCCCCCCACC 15 V_ZFP281_04_M02831 TRANSFAC - 61519775 61519789 5.0E-06 TATCCCCCCCCCCAC 15 V_ZFP281_04_M02831 TRANSFAC + 61520217 61520231 8.0E-06 CCCCCATCCCCCCCA 15 V_SRF_06_M02916 TRANSFAC + 61521498 61521514 1.0E-06 GTACCAAAAAAAAAAAA 17 V_SRF_06_M02916 TRANSFAC + 61521499 61521515 9.0E-06 TACCAAAAAAAAAAAAA 17 V_SRF_06_M02916 TRANSFAC + 61521500 61521516 1.0E-06 ACCAAAAAAAAAAAAAA 17 V_SRF_06_M02916 TRANSFAC + 61521501 61521517 0.0E+00 CCAAAAAAAAAAAAAAA 17 V_SRF_06_M02916 TRANSFAC + 61521502 61521518 0.0E+00 CAAAAAAAAAAAAAAAA 17 V_HFH3_01_M00289 TRANSFAC - 61520103 61520115 3.0E-06 GATTATTTATTTG 13 V_EWSR1FLI1_01_M02252 TRANSFAC - 61520602 61520619 4.0E-06 GGAAGGGCCGAAGGAAGC 18 V_FOXJ2_01_M00422 TRANSFAC + 61520100 61520117 1.0E-06 ATTCAAATAAATAATCCC 18 V_SIX6_01_M01345 TRANSFAC - 61523089 61523105 1.0E-06 ATTAAGGTATCAGGACT 17 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC - 61519674 61519690 5.0E-06 CATTTAATTAAAGGCGA 17 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC + 61524534 61524550 9.0E-06 CATGCAATTAACAACTA 17 V_EKLF_Q5_M01874 TRANSFAC + 61521721 61521730 9.0E-06 CCACACCCAC 10 V_HLF_01_M00260 TRANSFAC + 61518714 61518723 6.0E-06 ATTACATCAT 10 V_HLF_01_M00260 TRANSFAC + 61519475 61519484 7.0E-06 GTTACATAAC 10 V_GSC_01_M01428 TRANSFAC + 61520105 61520121 8.0E-06 AATAAATAATCCCCCAC 17 V_HNF3B_Q6_M02014 TRANSFAC - 61520105 61520113 1.0E-05 TTATTTATT 9 V_LHX9_01_M01367 TRANSFAC + 61519676 61519692 5.0E-06 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_BARHL2_01_M01446 TRANSFAC - 61519681 61519696 3.0E-06 GAAAAACATTTAATTA 16 V_PITX2_01_M01447 TRANSFAC - 61520105 61520121 4.0E-06 GTGGGGGATTATTTATT 17 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC - 61520050 61520065 5.0E-06 CAGCTTTAATTACTGT 16 V_UF1H3BETA_Q6_M01068 TRANSFAC + 61519774 61519787 3.0E-06 GGTGGGGGGGGGGA 14 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 61519675 61519691 4.0E-06 ACATTTAATTAAAGGCG 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC + 61519676 61519692 0.0E+00 GCCTTTAATTAAATGTT 17 V_HMX3_02_M01413 TRANSFAC + 61524533 61524549 2.0E-06 CCATGCAATTAACAACT 17 V_MAFK_04_M02880 TRANSFAC + 61520268 61520282 8.0E-06 GTAAAAATCGCCAGG 15 V_HOXD10_01_M01375 TRANSFAC + 61519677 61519693 4.0E-06 CCTTTAATTAAATGTTT 17 V_OBOX5_01_M01381 TRANSFAC - 61520105 61520121 1.0E-06 GTGGGGGATTATTTATT 17 V_OBOX3_02_M03065 TRANSFAC - 61520106 61520122 1.0E-06 AGTGGGGGATTATTTAT 17 V_PBX1_Q3_M02028 TRANSFAC - 61524647 61524655 8.0E-06 ATCAATCAC 9 V_PBX1_Q3_M02028 TRANSFAC - 61524651 61524659 6.0E-06 ATAAATCAA 9 V_PBX1_04_M01357 TRANSFAC - 61524645 61524661 6.0E-06 ACATAAATCAATCACAG 17 V_TCF3_05_M02920 TRANSFAC + 61521498 61521512 7.0E-06 GTACCAAAAAAAAAA 15 V_TCF3_05_M02920 TRANSFAC + 61521499 61521513 0.0E+00 TACCAAAAAAAAAAA 15 V_TCF3_05_M02920 TRANSFAC + 61521500 61521514 3.0E-06 ACCAAAAAAAAAAAA 15 V_OTX1_01_M01366 TRANSFAC - 61520105 61520121 1.0E-06 GTGGGGGATTATTTATT 17 V_CEBPG_Q6_01_M01869 TRANSFAC - 61518744 61518755 5.0E-06 GATTTGAAAATG 12 V_EVI1_03_M00080 TRANSFAC - 61524656 61524666 4.0E-06 AGATAACATAA 11 V_OBOX6_06_M03067 TRANSFAC + 61520105 61520121 1.0E-06 AATAAATAATCCCCCAC 17 V_OBOX3_01_M01466 TRANSFAC - 61520106 61520122 1.0E-06 AGTGGGGGATTATTTAT 17 V_PAX4_04_M00380 TRANSFAC - 61520819 61520848 1.0E-05 AAAAAATCTGTTTATGGCCACCCTCCTTCC 30 V_PAX4_04_M00380 TRANSFAC - 61524637 61524666 3.0E-06 AGATAACATAAATCAATCACAGCCCACACC 30 V_HOX13_02_M01452 TRANSFAC + 61520050 61520065 1.0E-05 ACAGTAATTAAAGCTG 16 V_NANOG_02_M01247 TRANSFAC + 61521502 61521521 9.0E-06 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 20 V_OTX3_01_M01403 TRANSFAC - 61523097 61523113 2.0E-06 GAGACAGGATTAAGGTA 17 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC - 61520050 61520065 8.0E-06 CAGCTTTAATTACTGT 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.