Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

NEUROD4 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 58158 neuronal differentiation 4 chr12 + 55408728 - 55414228 55413728 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the NEUROD4 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints POU4F2_POU_full_monomeric_16_1 SELEX - 55418644 55418659 0.0E+00 ATAAATAATTAATGTA 16 NKX2-8_homeodomain_full_monomeric_9_1 SELEX - 55413640 55413648 3.0E-06 CCACTTGAA 9 SP8_C2H2_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 55413644 55413655 0.0E+00 GACACGCCCACT 12 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 55418647 55418660 7.0E-06 ATTAATTATTTATA 14 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 55418647 55418660 4.0E-06 TATAAATAATTAAT 14 DLX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 8.0E-06 AATAATTAAT 10 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 55413645 55413655 4.0E-06 GACACGCCCAC 11 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 55418643 55418654 6.0E-06 TTACATTAATTA 12 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 55418647 55418658 8.0E-06 ATTAATTATTTA 12 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 55418648 55418659 1.0E-06 ATAAATAATTAA 12 MEF2D_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 55418651 55418662 5.0E-06 CCTATAAATAAT 12 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 55413594 55413605 2.0E-06 TAAACAAACAAA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 55418648 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAA 13 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 55418648 55418655 4.0E-06 ATAATTAA 8 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 55418640 55418654 1.0E-06 CAGTTACATTAATTA 15 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 55418640 55418654 4.0E-06 TAATTAATGTAACTG 15 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 55413643 55413656 0.0E+00 AGACACGCCCACTT 14 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 55413592 55413604 0.0E+00 TTTAAACAAACAA 13 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX - 55418648 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAA 13 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 55418644 55418654 7.0E-06 TACATTAATTA 11 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 55418648 55418658 7.0E-06 TAAATAATTAA 11 CEBPA_MA0102.2 JASPAR + 55418630 55418638 2.0E-06 TTTCGCAAT 9 MEF2A_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 55418651 55418662 4.0E-06 CCTATAAATAAT 12 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 55418643 55418655 6.0E-06 TTACATTAATTAT 13 KLF13_C2H2_full_monomeric_18_1 SELEX - 55413640 55413657 1.0E-06 AAGACACGCCCACTTGAA 18 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 55418647 55418656 5.0E-06 ATTAATTATT 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 0.0E+00 AATAATTAAT 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 55418643 55418658 9.0E-06 TTACATTAATTATTTA 16 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 55418644 55418659 0.0E+00 ATAAATAATTAATGTA 16 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 55418647 55418662 1.0E-06 ATTAATTATTTATAGG 16 MEF2B_MADS_full_dimeric_12_1 SELEX - 55418651 55418662 8.0E-06 CCTATAAATAAT 12 Foxc1_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 55413593 55413603 2.0E-06 TTAAACAAACA 11 MEF2A_MA0052.1 JASPAR + 55418652 55418661 1.0E-06 TTATTTATAG 10 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 6.0E-06 AATAATTAAT 10 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 55418646 55418660 2.0E-06 CATTAATTATTTATA 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 55418646 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATG 15 NR2E1_nuclearreceptor_full_dimeric_14_1 SELEX + 55418572 55418585 1.0E-06 AAGTGAGTAAGTCA 14 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 2.0E-06 AATAATTAAT 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 9.0E-06 AATAATTAAT 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 4.0E-06 AATAATTAAT 10 ESR1_MA0112.2 JASPAR - 55418580 55418599 3.0E-06 AAATCATGTCAGCTTGACTT 20 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 55418648 55418659 2.0E-06 ATAAATAATTAA 12 FOXI1_MA0042.1 JASPAR - 55413595 55413606 1.0E-06 GTTTGTTTGTTT 12 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 55413642 55413658 1.0E-06 AAAGACACGCCCACTTG 17 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 55418648 55418655 9.0E-06 ATAATTAA 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 55418648 55418655 9.0E-06 TTAATTAT 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 55418645 55418657 0.0E+00 ACATTAATTATTT 13 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 55418648 55418655 9.0E-06 ATAATTAA 8 NFATC1_NFAT_full_dimeric_15_1 SELEX + 55413656 55413670 2.0E-06 TTTCGGCTGGGGAAA 15 NFATC1_NFAT_full_dimeric_15_1 SELEX - 55413656 55413670 9.0E-06 TTTCCCCAGCCGAAA 15 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 55413593 55413603 1.0E-06 TTAAACAAACA 11 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 55418649 55418659 4.0E-06 ATAAATAATTA 11 POU1F1_POU_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 55418646 55418662 0.0E+00 CCTATAAATAATTAATG 17 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 55418647 55418659 2.0E-06 ATTAATTATTTAT 13 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 55418647 55418659 1.0E-06 ATAAATAATTAAT 13 NKX2-3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 55413640 55413649 8.0E-06 CCCACTTGAA 10 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 55413595 55413606 0.0E+00 GTTTGTTTGTTT 12 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 3.0E-06 AATAATTAAT 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 3.0E-06 AATAATTAAT 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 55418643 55418654 6.0E-06 TTACATTAATTA 12 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 55418647 55418658 5.0E-06 ATTAATTATTTA 12 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 55418648 55418659 0.0E+00 ATAAATAATTAA 12 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 55418639 55418655 7.0E-06 GCAGTTACATTAATTAT 17 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 55418648 55418659 7.0E-06 ATAAATAATTAA 12 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 55418646 55418660 2.0E-06 CATTAATTATTTATA 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 55418646 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATG 15 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 55418648 55418659 3.0E-06 TTAATTATTTAT 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 55418648 55418659 0.0E+00 ATAAATAATTAA 12 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 55418647 55418656 4.0E-06 AATAATTAAT 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 55413591 55413603 0.0E+00 ATTTAAACAAACA 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 55413595 55413607 4.0E-06 AAACAAACAAACG 13 E2F2_E2F_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 55413602 55413619 8.0E-06 CAAACGGGCGGCAAAACT 18 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 55418643 55418656 6.0E-06 TTACATTAATTATT 14 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 55418646 55418659 0.0E+00 ATAAATAATTAATG 14 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 55418647 55418660 0.0E+00 ATTAATTATTTATA 14 DLX5_homeodomain_FL_monomeric_8_1 SELEX - 55418648 55418655 8.0E-06 ATAATTAA 8 V_MEQ_01_M02049 TRANSFAC - 55418530 55418538 2.0E-06 AACACACAT 9 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 55418641 55418657 3.0E-06 AAATAATTAATGTAACT 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 55418642 55418658 2.0E-06 GTTACATTAATTATTTA 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 55418645 55418661 2.0E-06 CTATAAATAATTAATGT 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC - 55418645 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 55418642 55418658 2.0E-06 TAAATAATTAATGTAAC 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 55418645 55418661 2.0E-06 ACATTAATTATTTATAG 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 55418645 55418661 4.0E-06 CTATAAATAATTAATGT 17 V_GEN_INI_B_M00315 TRANSFAC - 55418667 55418674 1.0E-05 CCTCATTT 8 V_CDX2_Q5_01_M01659 TRANSFAC - 55418652 55418662 7.0E-06 CCTATAAATAA 11 V_FOXA2_04_M02749 TRANSFAC + 55413588 55413604 7.0E-06 TCTATTTAAACAAACAA 17 V_ESR1_01_M02261 TRANSFAC - 55418580 55418599 3.0E-06 AAATCATGTCAGCTTGACTT 20 V_DLX3_01_M01400 TRANSFAC - 55418644 55418660 7.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_FOXD3_01_M00130 TRANSFAC - 55413595 55413606 0.0E+00 GTTTGTTTGTTT 12 V_FOXO4_02_M00476 TRANSFAC - 55418679 55418692 5.0E-06 AGCTTGTTTTCCTT 14 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC + 55418644 55418660 3.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_MEF2_02_M00231 TRANSFAC - 55413584 55413605 8.0E-06 TTTGTTTGTTTAAATAGAGATG 22 V_MEF2_02_M00231 TRANSFAC - 55418647 55418668 5.0E-06 TTACCTCCTATAAATAATTAAT 22 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 55418567 55418582 9.0E-06 CTTACTCACTTAATAA 16 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC + 55418643 55418658 7.0E-06 TTACATTAATTATTTA 16 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 55418645 55418660 8.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_NKX25_Q6_M02108 TRANSFAC - 55413639 55413649 1.0E-06 CCCACTTGAAA 11 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 55418643 55418659 9.0E-06 TTACATTAATTATTTAT 17 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 55418644 55418660 0.0E+00 TATAAATAATTAATGTA 17 V_POU2F3_01_M01476 TRANSFAC + 55411531 55411546 7.0E-06 ATGCATGCAAATGCCT 16 V_FOXO3A_Q1_M01137 TRANSFAC - 55418649 55418660 2.0E-06 TATAAATAATTA 12 V_POU3F2_02_M00464 TRANSFAC - 55418608 55418617 9.0E-06 TCATGTTAAT 10 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC + 55418644 55418660 7.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 55418643 55418659 7.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_FOXJ1_03_M02750 TRANSFAC + 55413590 55413605 7.0E-06 TATTTAAACAAACAAA 16 V_HOXA2_01_M01402 TRANSFAC + 55418645 55418660 9.0E-06 ACATTAATTATTTATA 16 V_HFH4_01_M00742 TRANSFAC - 55413594 55413606 0.0E+00 GTTTGTTTGTTTA 13 V_OCT_C_M00210 TRANSFAC - 55411533 55411545 8.0E-06 GGCATTTGCATGC 13 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 55418643 55418659 4.0E-06 TTACATTAATTATTTAT 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 55418644 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 55418643 55418659 6.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC + 55418644 55418660 0.0E+00 TACATTAATTATTTATA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 55418643 55418659 4.0E-06 TTACATTAATTATTTAT 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 55418644 55418660 0.0E+00 TATAAATAATTAATGTA 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 55418643 55418659 5.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 55418644 55418660 3.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_VAX2_01_M01327 TRANSFAC + 55418643 55418658 9.0E-06 TTACATTAATTATTTA 16 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 55418646 55418655 4.0E-06 CATTAATTAT 10 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC - 55418643 55418659 9.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_EVX1_01_M01475 TRANSFAC - 55418643 55418659 7.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC + 55418644 55418659 8.0E-06 TACATTAATTATTTAT 16 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC - 55418643 55418658 0.0E+00 TAAATAATTAATGTAA 16 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC + 55418645 55418660 3.0E-06 ACATTAATTATTTATA 16 V_HBP1_Q2_M01661 TRANSFAC + 55418539 55418547 4.0E-06 TTCAATAAA 9 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC - 55418643 55418659 5.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC + 55418644 55418660 3.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 55418644 55418660 2.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 55418644 55418660 4.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_NKX62_Q2_M00489 TRANSFAC + 55418645 55418656 1.0E-05 ACATTAATTATT 12 V_NKX62_Q2_M00489 TRANSFAC - 55418647 55418658 5.0E-06 TAAATAATTAAT 12 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC + 55418643 55418659 8.0E-06 TTACATTAATTATTTAT 17 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC - 55418644 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_GEN_INI3_B_M00314 TRANSFAC - 55418667 55418674 1.0E-05 CCTCATTT 8 V_HELIOSA_02_M01004 TRANSFAC + 55418677 55418687 4.0E-06 ACAAGGAAAAC 11 V_HOXA6_01_M01392 TRANSFAC + 55418645 55418660 3.0E-06 ACATTAATTATTTATA 16 V_EN1_02_M01365 TRANSFAC + 55418643 55418658 9.0E-06 TTACATTAATTATTTA 16 V_EN1_02_M01365 TRANSFAC - 55418645 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_POU3F2_01_M00463 TRANSFAC + 55418643 55418656 8.0E-06 TTACATTAATTATT 14 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 55418643 55418658 0.0E+00 TTACATTAATTATTTA 16 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC - 55418645 55418660 0.0E+00 TATAAATAATTAATGT 16 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 55418644 55418660 8.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_HNF3G_Q4_M02015 TRANSFAC - 55413596 55413603 7.0E-06 TGTTTGTT 8 V_CART1_01_M00416 TRANSFAC - 55418640 55418657 4.0E-06 AAATAATTAATGTAACTG 18 V_XFD3_01_M00269 TRANSFAC + 55413590 55413603 9.0E-06 TATTTAAACAAACA 14 V_HOXA3_02_M01337 TRANSFAC + 55418643 55418656 1.0E-05 TTACATTAATTATT 14 V_HOXA3_02_M01337 TRANSFAC - 55418647 55418660 6.0E-06 TATAAATAATTAAT 14 V_IRX4_01_M01410 TRANSFAC - 55418606 55418622 7.0E-06 AGGTTTCATGTTAATCA 17 V_HOXA1_01_M01487 TRANSFAC - 55418645 55418660 5.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_HNF3_Q6_M00791 TRANSFAC + 55413593 55413605 0.0E+00 TTAAACAAACAAA 13 V_HNF3ALPHA_Q6_M00724 TRANSFAC - 55413593 55413603 1.0E-06 TGTTTGTTTAA 11 V_PMX2A_01_M01444 TRANSFAC + 55418643 55418658 1.0E-06 TTACATTAATTATTTA 16 V_PMX2A_01_M01444 TRANSFAC - 55418645 55418660 9.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_LHX2_01_M01325 TRANSFAC - 55418643 55418659 6.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_LHX2_01_M01325 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC - 55418643 55418663 4.0E-06 TCCTATAAATAATTAATGTAA 21 V_MEF2_03_M00232 TRANSFAC - 55418647 55418668 8.0E-06 TTACCTCCTATAAATAATTAAT 22 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 55418643 55418658 0.0E+00 TTACATTAATTATTTA 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 55418645 55418660 2.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC - 55418644 55418660 6.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 55418641 55418657 3.0E-06 AAATAATTAATGTAACT 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 55418642 55418658 4.0E-06 GTTACATTAATTATTTA 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 55418645 55418661 3.0E-06 CTATAAATAATTAATGT 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 55418646 55418662 2.0E-06 CATTAATTATTTATAGG 17 V_MEF2_04_M00233 TRANSFAC - 55413584 55413605 2.0E-06 TTTGTTTGTTTAAATAGAGATG 22 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC - 55418644 55418660 4.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_XFD2_01_M00268 TRANSFAC - 55418649 55418662 5.0E-06 CCTATAAATAATTA 14 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 55418642 55418658 5.0E-06 TAAATAATTAATGTAAC 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC + 55418645 55418661 7.0E-06 ACATTAATTATTTATAG 17 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC + 55418646 55418660 1.0E-06 CATTAATTATTTATA 15 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC - 55418647 55418661 3.0E-06 CTATAAATAATTAAT 15 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC - 55418643 55418659 1.0E-05 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_POU6F1_01_M00465 TRANSFAC + 55418645 55418655 2.0E-06 ACATTAATTAT 11 V_POU6F1_01_M00465 TRANSFAC - 55418647 55418657 5.0E-06 AAATAATTAAT 11 V_PMX2B_01_M01356 TRANSFAC - 55418644 55418660 2.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_TBP_06_M02814 TRANSFAC - 55418649 55418664 4.0E-06 CTCCTATAAATAATTA 16 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 55418644 55418653 1.0E-05 AATTAATGTA 10 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 55418648 55418657 7.0E-06 AAATAATTAA 10 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC + 55418643 55418659 2.0E-06 TTACATTAATTATTTAT 17 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 55418644 55418660 0.0E+00 TATAAATAATTAATGTA 17 V_OCT1_B_M00342 TRANSFAC + 55411534 55411543 5.0E-06 CATGCAAATG 10 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC + 55418644 55418660 4.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_EN2_01_M01455 TRANSFAC - 55418643 55418659 3.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_EN2_01_M01455 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_HFH8_01_M00294 TRANSFAC - 55413594 55413606 3.0E-06 GTTTGTTTGTTTA 13 V_DLX7_01_M01486 TRANSFAC - 55418644 55418660 5.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_HOXB7_01_M01396 TRANSFAC - 55418643 55418658 0.0E+00 TAAATAATTAATGTAA 16 V_HOXB7_01_M01396 TRANSFAC + 55418645 55418660 2.0E-06 ACATTAATTATTTATA 16 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC - 55418643 55418659 7.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC + 55418644 55418660 2.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_S8_01_M00099 TRANSFAC + 55418643 55418658 5.0E-06 TTACATTAATTATTTA 16 V_S8_01_M00099 TRANSFAC - 55418645 55418660 0.0E+00 TATAAATAATTAATGT 16 V_TBP_01_M00471 TRANSFAC - 55418653 55418660 4.0E-06 TATAAATA 8 V_LBP9_01_M01592 TRANSFAC - 55413615 55413631 8.0E-06 CCGGCCAGGTCCAGTTT 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 55418641 55418657 4.0E-06 AAATAATTAATGTAACT 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 55418642 55418658 2.0E-06 GTTACATTAATTATTTA 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 55418645 55418661 2.0E-06 CTATAAATAATTAATGT 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 55418646 55418662 3.0E-06 CATTAATTATTTATAGG 17 V_BARHL1_01_M01332 TRANSFAC - 55418645 55418660 2.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_FOXL1_02_M02857 TRANSFAC + 55413589 55413604 5.0E-06 CTATTTAAACAAACAA 16 V_OCT1_Q6_M00195 TRANSFAC + 55411531 55411545 4.0E-06 ATGCATGCAAATGCC 15 V_FOXL1_04_M02753 TRANSFAC + 55413588 55413604 9.0E-06 TCTATTTAAACAAACAA 17 V_LUN1_01_M00480 TRANSFAC - 55413704 55413720 4.0E-06 TCCCAGCTGACCAGGGA 17 V_MSX2_01_M01393 TRANSFAC + 55418643 55418659 4.0E-06 TTACATTAATTATTTAT 17 V_GEN_INI2_B_M00313 TRANSFAC - 55418667 55418674 1.0E-05 CCTCATTT 8 V_NKX61_02_M01469 TRANSFAC - 55418645 55418660 8.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_AIRE_01_M00999 TRANSFAC + 55418655 55418680 1.0E-06 TTTATAGGAGGTAAATGAGGTTACAA 26 V_TCF7_04_M02921 TRANSFAC - 55418534 55418548 5.0E-06 CTTTATTGAAAACAC 15 V_DMRT7_01_M01151 TRANSFAC - 55413728 55413741 2.0E-06 TTGCTGCAGTTTTG 14 V_MSX1_02_M01412 TRANSFAC + 55418643 55418658 0.0E+00 TTACATTAATTATTTA 16 V_MSX1_02_M01412 TRANSFAC - 55418645 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 55418644 55418660 3.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_FOXO3_01_M00477 TRANSFAC - 55418679 55418692 7.0E-06 AGCTTGTTTTCCTT 14 V_FOX_Q2_M00809 TRANSFAC - 55413594 55413606 0.0E+00 GTTTGTTTGTTTA 13 V_FOX_Q2_M00809 TRANSFAC + 55418528 55418540 7.0E-06 CAATGTGTGTTTT 13 V_BARX2_01_M01431 TRANSFAC - 55418643 55418658 0.0E+00 TAAATAATTAATGTAA 16 V_BARX2_01_M01431 TRANSFAC + 55418645 55418660 0.0E+00 ACATTAATTATTTATA 16 V_RSRFC4_01_M00026 TRANSFAC - 55418649 55418664 1.0E-05 CTCCTATAAATAATTA 16 V_HOXC5_01_M01454 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_SOX8_03_M02808 TRANSFAC + 55418645 55418661 8.0E-06 ACATTAATTATTTATAG 17 V_DMRT2_01_M01147 TRANSFAC + 55418518 55418533 3.0E-06 CAATAAGTTCCAATGT 16 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC + 55418643 55418659 3.0E-06 TTACATTAATTATTTAT 17 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC - 55418644 55418660 2.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_HB9_01_M01349 TRANSFAC - 55418643 55418658 6.0E-06 TAAATAATTAATGTAA 16 V_HFH3_01_M00289 TRANSFAC - 55413594 55413606 0.0E+00 GTTTGTTTGTTTA 13 V_VAX1_01_M01397 TRANSFAC + 55418645 55418660 9.0E-06 ACATTAATTATTTATA 16 V_FOXJ2_01_M00422 TRANSFAC + 55413591 55413608 1.0E-06 ATTTAAACAAACAAACGG 18 V_FOXJ2_01_M00422 TRANSFAC - 55418648 55418665 7.0E-06 CCTCCTATAAATAATTAA 18 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC - 55418642 55418658 0.0E+00 TAAATAATTAATGTAAC 17 V_HOXB3_01_M01330 TRANSFAC + 55418644 55418660 4.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC - 55418643 55418659 5.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_NKX12_01_M01427 TRANSFAC + 55418643 55418659 2.0E-06 TTACATTAATTATTTAT 17 V_NKX12_01_M01427 TRANSFAC - 55418644 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_HNF3B_Q6_M02014 TRANSFAC - 55413596 55413604 1.0E-05 TTGTTTGTT 9 V_LHX9_01_M01367 TRANSFAC + 55418644 55418660 4.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_BARHL2_01_M01446 TRANSFAC - 55418645 55418660 3.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_HOXA7_03_M01394 TRANSFAC - 55418643 55418658 1.0E-06 TAAATAATTAATGTAA 16 V_S8_02_M01376 TRANSFAC - 55418643 55418659 4.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_S8_02_M01376 TRANSFAC + 55418644 55418660 8.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC - 55418645 55418660 2.0E-06 TATAAATAATTAATGT 16 V_LHX4_01_M01421 TRANSFAC + 55418644 55418660 3.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC + 55418644 55418660 5.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 55418643 55418658 1.0E-06 TTACATTAATTATTTA 16 V_LPOLYA_B_M00318 TRANSFAC + 55418541 55418548 7.0E-06 CAATAAAG 8 V_DLX1_01_M01439 TRANSFAC + 55418643 55418656 2.0E-06 TTACATTAATTATT 14 V_DLX1_01_M01439 TRANSFAC - 55418647 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAAT 14 V_BARX1_01_M01340 TRANSFAC - 55418643 55418658 5.0E-06 TAAATAATTAATGTAA 16 V_BARX1_01_M01340 TRANSFAC + 55418645 55418660 5.0E-06 ACATTAATTATTTATA 16 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC - 55418643 55418659 5.0E-06 ATAAATAATTAATGTAA 17 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC + 55418644 55418660 1.0E-06 TACATTAATTATTTATA 17 V_GBX1_01_M01371 TRANSFAC - 55418644 55418660 1.0E-06 TATAAATAATTAATGTA 17 V_HOXB5_01_M01319 TRANSFAC + 55418645 55418660 8.0E-06 ACATTAATTATTTATA 16 V_HOX13_02_M01452 TRANSFAC + 55418645 55418660 3.0E-06 ACATTAATTATTTATA 16 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC - 55418645 55418660 0.0E+00 TATAAATAATTAATGT 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.