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PRKAR2A Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 5576 protein kinase, cAMP-dependent, regulatory, type II, alpha chr3 - 48884770 - 48890270 48885270 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the PRKAR2A promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 4.0E-06 TTAATTAA 8 VSX1_homeodomain_full_monomeric_11_1 SELEX - 48882835 48882845 4.0E-06 AGTTAATTAAC 11 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 4.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 48885522 48885533 0.0E+00 AAGAATAATTTA 12 Zfp652_C2H2_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 48882839 48882851 5.0E-06 GGAAGGAGTTAAT 13 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 48885452 48885465 1.0E-06 GAATTAGGTAATGA 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 48885452 48885465 2.0E-06 TCATTACCTAATTC 14 LHX6_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX + 48882827 48882842 1.0E-06 CAATGACCGTTAATTA 16 LHX6_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX - 48882827 48882842 1.0E-06 TAATTAACGGTCATTG 16 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 48885522 48885534 1.0E-06 AAAGAATAATTTA 13 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 48882826 48882843 0.0E+00 GCAATGACCGTTAATTAA 18 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 48882826 48882843 0.0E+00 TTAATTAACGGTCATTGC 18 RFX4_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 48889020 48889035 0.0E+00 GGTTACCATGGCAACT 16 RFX4_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 48889020 48889035 0.0E+00 AGTTGCCATGGTAACC 16 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 48885522 48885532 4.0E-06 AGAATAATTTA 11 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 7.0E-06 GTTAATTAAC 10 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 7.0E-06 GTTAATTAAC 10 RARG_nuclearreceptor_full_dimeric_17_1 SELEX - 48882830 48882846 8.0E-06 GAGTTAATTAACGGTCA 17 NFIL3_MA0025.1 JASPAR + 48882715 48882725 9.0E-06 TGATGTAATGT 11 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 MAFF_bZIP_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 48884955 48884969 9.0E-06 CTGCTGTCGCAGCAC 15 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 2.0E-06 GTTAATTAAC 10 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 2.0E-06 GTTAATTAAC 10 Rfx3_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 48889020 48889035 0.0E+00 GGTTACCATGGCAACT 16 Rfx3_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 48889020 48889035 0.0E+00 AGTTGCCATGGTAACC 16 MYBL2_MYB_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 48882829 48882839 1.0E-06 ATGACCGTTAA 11 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 48882826 48882843 1.0E-06 GCAATGACCGTTAATTAA 18 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 48882826 48882843 2.0E-06 TTAATTAACGGTCATTGC 18 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 4.0E-06 GTTAATTAAC 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 4.0E-06 GTTAATTAAC 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 7.0E-06 GTTAATTAAC 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 7.0E-06 GTTAATTAAC 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 5.0E-06 GTTAATTAAC 10 EMX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 5.0E-06 GTTAATTAAC 10 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 Gfi_MA0038.1 JASPAR + 48884540 48884549 4.0E-06 CAAATCACTC 10 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 4.0E-06 GTTAATTAAC 10 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 4.0E-06 GTTAATTAAC 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 5.0E-06 GTTAATTAAC 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 5.0E-06 GTTAATTAAC 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 48884750 48884760 1.0E-05 GCCCCGCCCAC 11 ZSCAN4_C2H2_full_monomeric_15_1 SELEX + 48889211 48889225 9.0E-06 TGCACAAACTGCCAT 15 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 1.0E-06 GTTAATTAAC 10 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 1.0E-06 GTTAATTAAC 10 NFIL3_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 48882713 48882724 9.0E-06 CATTACATCATG 12 RFX2_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 48889020 48889035 0.0E+00 GGTTACCATGGCAACT 16 RFX2_RFX_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 48889020 48889035 0.0E+00 AGTTGCCATGGTAACC 16 VENTX_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 48885486 48885494 5.0E-06 ACCGATTAG 9 RFX5_RFX_DBD_dimeric_16_3 SELEX + 48889020 48889035 0.0E+00 GGTTACCATGGCAACT 16 RFX5_RFX_DBD_dimeric_16_3 SELEX - 48889020 48889035 0.0E+00 AGTTGCCATGGTAACC 16 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 48885522 48885533 0.0E+00 AAGAATAATTTA 12 MYBL1_MYB_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 48882829 48882839 2.0E-06 ATGACCGTTAA 11 IRF5_IRF_full_dimeric_14_1 SELEX + 48884447 48884460 6.0E-06 TCGAAGCCAAAACT 14 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 48885452 48885465 1.0E-06 GAATTAGGTAATGA 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 48885452 48885465 2.0E-06 TCATTACCTAATTC 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 4.0E-06 TTAATTAA 8 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 48882835 48882844 8.0E-06 GTTAATTAAC 10 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 48882835 48882844 8.0E-06 GTTAATTAAC 10 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 48882836 48882843 9.0E-06 TTAATTAA 8 V_ATF5_01_M01295 TRANSFAC - 48889116 48889126 9.0E-06 TCTCTTCCTTC 11 V_MYB_03_M02883 TRANSFAC + 48889212 48889227 2.0E-06 GCACAAACTGCCATAT 16 V_CEBP_Q3_M00770 TRANSFAC + 48885452 48885463 7.0E-06 GAATTAGGTAAT 12 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 48885519 48885534 0.0E+00 CTTTAAATTATTCTTT 16 V_HP1SITEFACTOR_Q6_M00725 TRANSFAC - 48885519 48885530 6.0E-06 AATAATTTAAAG 12 V_SATB1_Q3_M01723 TRANSFAC - 48882828 48882843 1.0E-06 TTAATTAACGGTCATT 16 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 48882831 48882847 0.0E+00 GACCGTTAATTAACTCC 17 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 48882832 48882848 3.0E-06 AGGAGTTAATTAACGGT 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC - 48882831 48882847 8.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC + 48882832 48882848 2.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_ATF3_Q6_01_M01863 TRANSFAC - 48882713 48882723 8.0E-06 ATTACATCATG 11 V_RFX4_03_M02789 TRANSFAC + 48889023 48889037 4.0E-06 TACCATGGCAACTAA 15 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC - 48882831 48882847 5.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC + 48882832 48882848 2.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 48882831 48882847 3.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 48882832 48882848 2.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 48882831 48882847 1.0E-05 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 48882832 48882848 1.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_VAX2_01_M01327 TRANSFAC + 48882831 48882846 4.0E-06 GACCGTTAATTAACTC 16 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 48882834 48882843 8.0E-06 CGTTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 48882836 48882845 1.0E-06 AGTTAATTAA 10 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC - 48882831 48882847 8.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC + 48882832 48882848 1.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC - 48882831 48882847 8.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC + 48882832 48882848 1.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC - 48882831 48882847 6.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC + 48882832 48882848 2.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 48882831 48882847 2.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 48882832 48882848 3.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC - 48882831 48882847 2.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 48882832 48882848 1.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC + 48882831 48882847 5.0E-06 GACCGTTAATTAACTCC 17 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC - 48882832 48882848 8.0E-06 AGGAGTTAATTAACGGT 17 V_SOX13_03_M02797 TRANSFAC - 48885520 48885535 6.0E-06 GAAAGAATAATTTAAA 16 V_ETV7_01_M02071 TRANSFAC - 48885176 48885185 1.0E-05 CCCGGAAACG 10 V_HOXA6_01_M01392 TRANSFAC + 48882833 48882848 7.0E-06 CCGTTAATTAACTCCT 16 V_HOXA6_01_M01392 TRANSFAC - 48885454 48885469 5.0E-06 CCGTTCATTACCTAAT 16 V_E4BP4_01_M00045 TRANSFAC + 48882713 48882724 6.0E-06 CATGATGTAATG 12 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC + 48882831 48882847 3.0E-06 GACCGTTAATTAACTCC 17 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC - 48882832 48882848 1.0E-06 AGGAGTTAATTAACGGT 17 V_HOXA3_02_M01337 TRANSFAC - 48882835 48882848 2.0E-06 AGGAGTTAATTAAC 14 V_SP4_03_M02810 TRANSFAC + 48885376 48885392 6.0E-06 TGACCCGCCCCCTCGGG 17 V_SP1_Q6_M00196 TRANSFAC - 48884749 48884761 5.0E-06 TGTGGGCGGGGCC 13 V_HOXA1_01_M01487 TRANSFAC - 48882833 48882848 6.0E-06 AGGAGTTAATTAACGG 16 V_MYBL1_03_M02780 TRANSFAC + 48882826 48882842 1.0E-05 GCAATGACCGTTAATTA 17 V_PMX2A_01_M01444 TRANSFAC - 48882833 48882848 7.0E-06 AGGAGTTAATTAACGG 16 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC - 48882831 48882847 7.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC + 48882832 48882848 6.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_SOX18_03_M02801 TRANSFAC + 48885521 48885536 9.0E-06 TTAAATTATTCTTTCA 16 V_RAX_01_M01389 TRANSFAC + 48882832 48882848 0.0E+00 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC + 48882831 48882847 7.0E-06 GACCGTTAATTAACTCC 17 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC - 48882832 48882848 2.0E-06 AGGAGTTAATTAACGGT 17 V_IK2_01_M00087 TRANSFAC - 48882698 48882709 7.0E-06 TTTTGGGAAATC 12 V_MUSCLE_INI_B_M00321 TRANSFAC - 48884855 48884875 9.0E-06 CCGCCACCCCACGCCAGAGCC 21 V_MUSCLE_INI_B_M00321 TRANSFAC - 48884860 48884880 5.0E-06 GCCCGCCGCCACCCCACGCCA 21 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC + 48882831 48882847 1.0E-06 GACCGTTAATTAACTCC 17 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC - 48882832 48882848 1.0E-06 AGGAGTTAATTAACGGT 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC - 48882831 48882847 1.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC + 48882832 48882848 6.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_PMX2B_01_M01356 TRANSFAC + 48882831 48882847 4.0E-06 GACCGTTAATTAACTCC 17 V_PMX2B_01_M01356 TRANSFAC - 48882832 48882848 0.0E+00 AGGAGTTAATTAACGGT 17 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 48882836 48882845 1.0E-05 AGTTAATTAA 10 V_EMX2_01_M01461 TRANSFAC + 48882832 48882848 3.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC + 48882831 48882847 3.0E-06 GACCGTTAATTAACTCC 17 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC - 48882832 48882848 1.0E-06 AGGAGTTAATTAACGGT 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC + 48882832 48882848 7.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC - 48882831 48882847 3.0E-06 GGAGTTAATTAACGGTC 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 48882832 48882848 1.0E-06 ACCGTTAATTAACTCCT 17 V_VBP_01_M00228 TRANSFAC - 48882714 48882723 4.0E-06 ATTACATCAT 10 V_SP4_Q5_M01273 TRANSFAC + 48884750 48884760 9.0E-06 GCCCCGCCCAC 11 V_EN2_01_M01455 TRANSFAC - 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