Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

DIRAS2 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 54769 DIRAS family, GTP-binding RAS-like 2 chr9 - 93404608 - 93410108 93405108 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the DIRAS2 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 93405470 93405482 4.0E-06 ATAATTTAATGAA 13 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 93405470 93405482 9.0E-06 ATAATTTAATGAA 13 E2F2_E2F_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 93405383 93405398 5.0E-06 TAAATGGCGCCTGTTC 16 E2F2_E2F_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 93405383 93405398 5.0E-06 GAACAGGCGCCATTTA 16 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 93405470 93405482 5.0E-06 ATAATTTAATGAA 13 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 93405470 93405482 9.0E-06 ATAATTTAATGAA 13 NR2E1_nuclearreceptor_full_dimeric_14_1 SELEX - 93405471 93405484 1.0E-05 AATTCATTAAATTA 14 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 93405470 93405482 9.0E-06 ATAATTTAATGAA 13 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 93405470 93405482 8.0E-06 ATAATTTAATGAA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 93405469 93405481 5.0E-06 TCATTAAATTATC 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 93405470 93405482 6.0E-06 ATAATTTAATGAA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 93405470 93405482 6.0E-06 ATAATTTAATGAA 13 E2F1_E2F_DBD_monomeric_14_2 SELEX - 93405384 93405397 2.0E-06 AACAGGCGCCATTT 14 E2F2_E2F_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 93405382 93405399 6.0E-06 CGAACAGGCGCCATTTAA 18 V_STAT5A_Q6_M01890 TRANSFAC + 93405461 93405473 8.0E-06 AATTTTCTGATAA 13 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 93405469 93405485 3.0E-06 GATAATTTAATGAATTA 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 93405472 93405488 1.0E-06 TTTTAATTCATTAAATT 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 93405473 93405489 1.0E-06 ATTTAATGAATTAAAAT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 93405464 93405480 4.0E-06 CATTAAATTATCAGAAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 93405472 93405488 7.0E-06 AATTTAATGAATTAAAA 17 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC + 93405456 93405470 0.0E+00 ACTGGAATTTTCTGA 15 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 93405472 93405487 1.0E-06 TTTAATTCATTAAATT 16 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 93405471 93405487 5.0E-06 TTTAATTCATTAAATTA 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 93405470 93405486 8.0E-06 ATAATTTAATGAATTAA 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC + 93405471 93405487 8.0E-06 TAATTTAATGAATTAAA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 93405470 93405486 5.0E-06 ATAATTTAATGAATTAA 17 V_STAT4_Q4_M01666 TRANSFAC + 93405465 93405478 8.0E-06 TTCTGATAATTTAA 14 V_TAL1_GATA1_01_M02243 TRANSFAC + 93405457 93405474 7.0E-06 CTGGAATTTTCTGATAAT 18 V_POU3F2_01_M00463 TRANSFAC - 93405470 93405483 3.0E-06 ATTCATTAAATTAT 14 V_IPF1_Q4_M00436 TRANSFAC + 93405472 93405483 1.0E-05 AATTTAATGAAT 12 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 93405470 93405485 1.0E-06 ATAATTTAATGAATTA 16 V_NKX61_01_M00424 TRANSFAC + 93405472 93405484 5.0E-06 AATTTAATGAATT 13 V_HOXB9_01_M01426 TRANSFAC - 93405470 93405485 7.0E-06 TAATTCATTAAATTAT 16 V_OCT1_04_M00138 TRANSFAC + 93405474 93405496 1.0E-06 TTTAATGAATTAAAATAATTCCA 23 V_OCT1_04_M00138 TRANSFAC - 93405475 93405497 1.0E-06 ATGGAATTATTTTAATTCATTAA 23 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 93405470 93405485 1.0E-06 ATAATTTAATGAATTA 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 93405472 93405487 2.0E-06 TTTAATTCATTAAATT 16 Tal1_Gata1_MA0140.1 JASPAR + 93405457 93405474 7.0E-06 CTGGAATTTTCTGATAAT 18 V_HBP1_03_M02762 TRANSFAC + 93405471 93405486 5.0E-06 TAATTTAATGAATTAA 16 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 93405472 93405488 2.0E-06 TTTTAATTCATTAAATT 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 93405473 93405489 3.0E-06 ATTTAATGAATTAAAAT 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC + 93405468 93405484 5.0E-06 TGATAATTTAATGAATT 17 V_STAT4_Q5_M02117 TRANSFAC - 93405464 93405473 6.0E-06 TTATCAGAAA 10 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC + 93405475 93405491 6.0E-06 TTAATGAATTAAAATAA 17 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC + 93405470 93405486 4.0E-06 ATAATTTAATGAATTAA 17 V_PAX8_B_M00328 TRANSFAC + 93405468 93405485 9.0E-06 TGATAATTTAATGAATTA 18 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 93405471 93405487 7.0E-06 TAATTTAATGAATTAAA 17 V_GATA4_Q3_M00632 TRANSFAC - 93405324 93405335 7.0E-06 AGATTGAAGAGA 12 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 93405469 93405485 9.0E-06 GATAATTTAATGAATTA 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 93405472 93405488 1.0E-06 TTTTAATTCATTAAATT 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 93405473 93405489 1.0E-06 ATTTAATGAATTAAAAT 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 93405470 93405486 3.0E-06 ATAATTTAATGAATTAA 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 93405471 93405487 8.0E-06 TTTAATTCATTAAATTA 17 V_BBX_03_M02739 TRANSFAC + 93405471 93405485 0.0E+00 TAATTTAATGAATTA 15 V_BBX_03_M02739 TRANSFAC - 93405471 93405485 0.0E+00 TAATTCATTAAATTA 15 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC - 93405469 93405485 7.0E-06 TAATTCATTAAATTATC 17 V_HOXB3_01_M01330 TRANSFAC + 93405471 93405487 2.0E-06 TAATTTAATGAATTAAA 17 V_SOX1_03_M02802 TRANSFAC - 93405473 93405488 0.0E+00 TTTTAATTCATTAAAT 16 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC + 93405471 93405487 7.0E-06 TAATTTAATGAATTAAA 17 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC - 93405472 93405487 4.0E-06 TTTAATTCATTAAATT 16 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 93405470 93405486 1.0E-06 TTAATTCATTAAATTAT 17 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 93405470 93405485 5.0E-06 ATAATTTAATGAATTA 16 V_SOX5_07_M02909 TRANSFAC - 93405464 93405480 9.0E-06 CATTAAATTATCAGAAA 17 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC + 93405471 93405487 7.0E-06 TAATTTAATGAATTAAA 17 V_HOX13_02_M01452 TRANSFAC + 93405472 93405487 7.0E-06 AATTTAATGAATTAAA 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.