Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

PPARG Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS Motifs 5468 peroxisome proliferator-activated receptor gamma chr3 + 12324348 - 12330935 12330435 PPARG_MA0066.1 V_PPARG_03_M00528 V_PPARG_02_M00515 V_PPARG_01_M00512 PPARG_RXRA_MA0065.2 V_PPAR_DR1_Q2_M00763 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the PPARG promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 4.0E-06 TTAATTAA 8 Sox1_HMG_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 12331225 12331238 9.0E-06 TGAATGTCCATGCC 14 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 4.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 12328826 12328837 5.0E-06 AATCATTAAAAA 12 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 12328944 12328953 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 12328944 12328953 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 12328946 12328962 7.0E-06 TAATTAAATTTTCTTTT 17 NR4A2_nuclearreceptor_full_monomeric_11_1 SELEX + 12328961 12328971 6.0E-06 TTAAAATGTCA 11 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 12328945 12328957 1.0E-06 TTAATTAAATTTT 13 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAA 13 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 12328939 12328951 7.0E-06 TATGCTTTAATTA 13 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 TBP_MA0108.2 JASPAR - 12330529 12330543 4.0E-06 ATATAAAAGCCGCAG 15 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12328944 12328953 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 12328944 12328953 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 12328945 12328957 1.0E-06 TTAATTAAATTTT 13 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAA 13 Tp73_p53l_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 12324552 12324569 5.0E-06 CACAAGTGGGAACATGTC 18 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 Sox17_HMG_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 12328884 12328898 8.0E-06 CACACTTTCAGAGTT 15 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328807 12328819 9.0E-06 TTAAACTCATTAA 13 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 1.0E-06 AAAATTTAATTAA 13 IRF7_IRF_DBD_trimeric_17_1 SELEX - 12328947 12328963 9.0E-06 TAAAAGAAAATTTAATT 17 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 12328818 12328831 7.0E-06 TAAAAACATTTCTT 14 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12328944 12328953 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 12328944 12328953 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 RARG_nuclearreceptor_full_dimeric_18_1 SELEX + 12330544 12330561 6.0E-06 AAGGTCAGTGGTAGGTAA 18 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 12328827 12328836 6.0E-06 ATCATTAAAA 10 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 12328808 12328818 7.0E-06 TAAACTCATTA 11 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 12328946 12328956 5.0E-06 TAATTAAATTT 11 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 12328946 12328956 1.0E-06 AAATTTAATTA 11 ESRRG_nuclearreceptor_full_dimeric_18_1 SELEX + 12330544 12330561 7.0E-06 AAGGTCAGTGGTAGGTAA 18 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 12328945 12328957 1.0E-06 TTAATTAAATTTT 13 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAA 13 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 12328827 12328841 1.0E-06 TTTTAATGATTAAAA 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 12328827 12328841 1.0E-06 TTTTAATCATTAAAA 15 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 12328945 12328957 2.0E-06 TTAATTAAATTTT 13 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAA 13 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 12328946 12328956 3.0E-06 TAATTAAATTT 11 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 12328946 12328956 1.0E-06 AAATTTAATTA 11 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 12328945 12328957 1.0E-06 TTAATTAAATTTT 13 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAA 13 HOXC11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 12328827 12328837 5.0E-06 AATCATTAAAA 11 SOX18_HMG_full_dimeric_15_1 SELEX - 12328884 12328898 9.0E-06 CACACTTTCAGAGTT 15 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 12328944 12328953 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 12328944 12328953 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 12328943 12328955 3.0E-06 AATTTAATTAAAG 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 12328946 12328958 1.0E-06 TAATTAAATTTTC 13 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12328944 12328953 2.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 12328944 12328953 2.0E-06 TTTAATTAAA 10 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 12328828 12328840 1.0E-06 TTTAATGATTAAA 13 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 12328828 12328840 1.0E-06 TTTAATCATTAAA 13 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 12328946 12328956 1.0E-05 TAATTAAATTT 11 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 12328946 12328956 1.0E-06 AAATTTAATTA 11 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 12328945 12328957 5.0E-06 TTAATTAAATTTT 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 12328945 12328957 4.0E-06 TTAATTAAATTTT 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAA 13 DUXA_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 12328945 12328957 4.0E-06 AAAATTTAATTAA 13 Tp53_p53l_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 12328838 12328854 9.0E-06 ACAAGTCACTGACTTTT 17 TEAD1_TEA_full_dimeric_17_1 SELEX - 12328788 12328804 3.0E-06 GAATTTCTTAAATTTCT 17 HOXC10_homeodomain_DBD_monomeric_10_3 SELEX - 12328827 12328836 8.0E-06 ATCATTAAAA 10 RORA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 12330542 12330561 5.0E-06 ATAAGGTCAGTGGTAGGTAA 20 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 12328946 12328956 4.0E-06 TAATTAAATTT 11 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 12328946 12328956 0.0E+00 AAATTTAATTA 11 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12328944 12328953 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 12328944 12328953 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 12328827 12328841 1.0E-06 TTTTAATGATTAAAA 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 12328827 12328841 1.0E-06 TTTTAATCATTAAAA 15 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 12328944 12328953 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 12328944 12328953 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 TP63_p53l_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 12324552 12324569 0.0E+00 CACAAGTGGGAACATGTC 18 TP63_p53l_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 12324552 12324569 4.0E-06 GACATGTTCCCACTTGTG 18 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 4.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 12328945 12328952 9.0E-06 TTAATTAA 8 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 12328945 12328964 1.0E-06 TTAATTAAATTTTCTTTTAA 20 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 12328939 12328955 9.0E-06 TATGCTTTAATTAAATT 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC - 12328942 12328957 6.0E-06 AAAATTTAATTAAAGC 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 12328826 12328842 7.0E-06 TTTTTAATGATTAAAAG 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 12328826 12328842 2.0E-06 CTTTTAATCATTAAAAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 12328939 12328955 4.0E-06 AATTTAATTAAAGCATA 17 V_TCF3_01_M01594 TRANSFAC + 12324661 12324673 5.0E-06 TTTTTGAAATTTT 13 V_DMRT3_01_M01148 TRANSFAC + 12324583 12324597 7.0E-06 AAGTAGATACATTTG 15 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC + 12328947 12328961 0.0E+00 AATTAAATTTTCTTT 15 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 12328946 12328961 0.0E+00 TAATTAAATTTTCTTT 16 V_HP1SITEFACTOR_Q6_M00725 TRANSFAC + 12328831 12328842 6.0E-06 AATGATTAAAAG 12 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 12328940 12328956 3.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC + 12328941 12328957 4.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_MAFB_03_M02879 TRANSFAC - 12324658 12324672 4.0E-06 AAATTTCAAAAATCA 15 V_MAFB_03_M02879 TRANSFAC - 12330723 12330737 8.0E-06 GCACTGCAAAAAAAA 15 V_PROP1_01_M01294 TRANSFAC + 12328946 12328956 0.0E+00 TAATTAAATTT 11 V_FOXJ1_04_M02854 TRANSFAC + 12324529 12324543 5.0E-06 ATTTCATAACTAGAC 15 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 12328942 12328957 3.0E-06 AAAATTTAATTAAAGC 16 V_POU1F1_Q6_M00744 TRANSFAC + 12328832 12328841 8.0E-06 ATGATTAAAA 10 V_POU3F2_02_M00464 TRANSFAC + 12328802 12328811 9.0E-06 TTCTGTTAAT 10 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC - 12328802 12328818 8.0E-06 TAAACTCATTAACAGAA 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC - 12328940 12328956 8.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC + 12328941 12328957 1.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 12328940 12328956 4.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 12328941 12328957 5.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 12328941 12328957 4.0E-06 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 12328941 12328957 2.0E-06 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 12324668 12324684 5.0E-06 GATCTTAATTTAAAATT 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 12328940 12328956 1.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 12328941 12328957 1.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_PRX2_Q2_M02115 TRANSFAC + 12324672 12324680 2.0E-06 TTAAATTAA 9 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 12328943 12328952 3.0E-06 CTTTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 12328945 12328954 0.0E+00 ATTTAATTAA 10 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC - 12328823 12328838 9.0E-06 TAATCATTAAAAACAT 16 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC + 12328942 12328957 8.0E-06 GCTTTAATTAAATTTT 16 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC - 12330739 12330754 5.0E-06 CTTCTTATAAAACAAG 16 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC - 12328940 12328956 1.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC + 12328941 12328957 2.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_EVX1_01_M01475 TRANSFAC - 12328802 12328818 4.0E-06 TAAACTCATTAACAGAA 17 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC + 12328941 12328957 1.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_TCFAP2E_04_M02926 TRANSFAC - 12330723 12330736 2.0E-06 CACTGCAAAAAAAA 14 V_HOXC13_01_M01317 TRANSFAC - 12330740 12330755 9.0E-06 TCTTCTTATAAAACAA 16 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC - 12328940 12328956 6.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_CEBPB_01_M00109 TRANSFAC - 12324527 12324540 4.0E-06 TAGTTATGAAATTT 14 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 12328940 12328956 3.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 12328941 12328957 0.0E+00 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC - 12328940 12328956 2.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 12328941 12328957 7.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_STAT4_Q4_M01666 TRANSFAC - 12330740 12330753 5.0E-06 TTCTTATAAAACAA 14 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC + 12328940 12328956 4.0E-06 ATGCTTTAATTAAATTT 17 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC - 12328941 12328957 5.0E-06 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_EN1_02_M01365 TRANSFAC - 12328942 12328957 1.0E-05 AAAATTTAATTAAAGC 16 V_PR_Q2_M00960 TRANSFAC + 12328975 12328984 0.0E+00 GAAAGAACAT 10 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 12328824 12328839 3.0E-06 TGTTTTTAATGATTAA 16 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 12324668 12324684 4.0E-06 GATCTTAATTTAAAATT 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 12328940 12328956 2.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 12328941 12328957 0.0E+00 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC + 12328940 12328956 1.0E-06 ATGCTTTAATTAAATTT 17 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC - 12328941 12328957 4.0E-06 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_HNF1_Q6_M00790 TRANSFAC - 12328825 12328842 1.0E-05 CTTTTAATCATTAAAAAC 18 V_HNF1_Q6_M00790 TRANSFAC + 12328826 12328843 0.0E+00 TTTTTAATGATTAAAAGT 18 V_TATA_01_M00252 TRANSFAC - 12330529 12330543 4.0E-06 ATATAAAAGCCGCAG 15 V_NKX61_01_M00424 TRANSFAC + 12328826 12328838 8.0E-06 TTTTTAATGATTA 13 V_HIC1_03_M01073 TRANSFAC + 12329527 12329544 3.0E-06 TACGGGTGCCCGCGGCGC 18 V_CEBPD_Q6_M00621 TRANSFAC + 12324528 12324539 0.0E+00 AATTTCATAACT 12 V_OLF1_01_M00261 TRANSFAC - 12330368 12330389 9.0E-06 TTAGGCTCCCAGGAGGAGTGGT 22 V_ZF5_B_M00333 TRANSFAC + 12330167 12330179 2.0E-06 GAGGGGCGCGCTT 13 V_IRF_Q6_M00772 TRANSFAC - 12328913 12328927 7.0E-06 TTGGTTTTCTCTTCT 15 V_LHX2_01_M01325 TRANSFAC - 12328802 12328818 8.0E-06 TAAACTCATTAACAGAA 17 V_LHX2_01_M01325 TRANSFAC - 12328940 12328956 8.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC - 12328940 12328956 1.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_GSH2_01_M01326 TRANSFAC - 12328940 12328955 4.0E-06 AATTTAATTAAAGCAT 16 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC - 12328824 12328844 7.0E-06 GACTTTTAATCATTAAAAACA 21 V_MEF2_03_M00232 TRANSFAC + 12328936 12328957 6.0E-06 AAATATGCTTTAATTAAATTTT 22 V_OCT1_04_M00138 TRANSFAC + 12324655 12324677 5.0E-06 TTATGATTTTTGAAATTTTAAAT 23 V_OCT1_04_M00138 TRANSFAC - 12328819 12328841 6.0E-06 TTTTAATCATTAAAAACATTTCT 23 V_RAX_01_M01389 TRANSFAC - 12328940 12328956 6.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 12328802 12328817 8.0E-06 TTCTGTTAATGAGTTT 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 12328826 12328841 4.0E-06 TTTTAATCATTAAAAA 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 12328940 12328955 1.0E-06 ATGCTTTAATTAAATT 16 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC - 12328941 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 12328939 12328955 6.0E-06 TATGCTTTAATTAAATT 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 12328942 12328958 2.0E-06 GAAAATTTAATTAAAGC 17 V_ERR1_Q3_M01841 TRANSFAC - 12328960 12328974 8.0E-06 CAGTGACATTTTAAA 15 V_PNR_01_M01650 TRANSFAC - 12324658 12324671 1.0E-06 AATTTCAAAAATCA 14 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC + 12324670 12324686 6.0E-06 TTTTAAATTAAGATCTT 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 12328823 12328839 1.0E-06 TTAATCATTAAAAACAT 17 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC + 12328943 12328957 8.0E-06 CTTTAATTAAATTTT 15 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC - 12328944 12328958 5.0E-06 GAAAATTTAATTAAA 15 V_STAT4_Q5_M02117 TRANSFAC - 12328955 12328964 2.0E-06 TTAAAAGAAA 10 V_STAT4_Q5_M02117 TRANSFAC - 12331247 12331256 8.0E-06 TTAAGAGAAA 10 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC - 12324668 12324684 3.0E-06 GATCTTAATTTAAAATT 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC - 12328940 12328956 2.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC + 12328941 12328957 0.0E+00 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC - 12328940 12328956 2.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC + 12328941 12328957 2.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_PMX2B_01_M01356 TRANSFAC - 12328941 12328957 1.0E-05 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_TBP_06_M02814 TRANSFAC - 12324667 12324682 2.0E-06 TCTTAATTTAAAATTT 16 V_HIC1_02_M01072 TRANSFAC - 12329401 12329415 6.0E-06 CCCGCCTGCCCGCGG 15 V_HIC1_02_M01072 TRANSFAC + 12329527 12329541 3.0E-06 TACGGGTGCCCGCGG 15 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 12328945 12328954 1.0E-06 ATTTAATTAA 10 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 12328941 12328957 4.0E-06 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC + 12328940 12328956 1.0E-06 ATGCTTTAATTAAATTT 17 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC - 12328941 12328957 4.0E-06 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_ISGF4G_04_M02875 TRANSFAC - 12328818 12328831 2.0E-06 TAAAAACATTTCTT 14 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 12324668 12324684 9.0E-06 GATCTTAATTTAAAATT 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 12328940 12328956 1.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC + 12328941 12328957 1.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_HOXD9_Q2_M01834 TRANSFAC + 12324540 12324549 4.0E-06 AGACATAAAA 10 V_HOXD9_Q2_M01834 TRANSFAC - 12328828 12328837 5.0E-06 AATCATTAAA 10 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC - 12328940 12328956 8.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 12328941 12328957 7.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_GR_Q6_02_M01836 TRANSFAC - 12328976 12328988 3.0E-06 CAAGATGTTCTTT 13 V_EN2_01_M01455 TRANSFAC - 12328940 12328956 9.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC - 12328940 12328956 9.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC + 12328941 12328957 3.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC - 12328940 12328956 4.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC + 12328941 12328957 2.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_MTF1_06_M02882 TRANSFAC - 12324659 12324672 2.0E-06 AAATTTCAAAAATC 14 V_POU6F1_02_M01462 TRANSFAC + 12328803 12328819 6.0E-06 TCTGTTAATGAGTTTAA 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 12328939 12328955 6.0E-06 TATGCTTTAATTAAATT 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 12328942 12328958 3.0E-06 GAAAATTTAATTAAAGC 17 V_IPF1_05_M01255 TRANSFAC + 12324572 12324583 7.0E-06 AGTCATTCAAAA 12 V_IPF1_05_M01255 TRANSFAC - 12328826 12328837 0.0E+00 AATCATTAAAAA 12 V_FOXL1_02_M02857 TRANSFAC - 12328952 12328967 7.0E-06 ATTTTAAAAGAAAATT 16 V_DELTAEF1_01_M00073 TRANSFAC - 12330629 12330639 8.0E-06 ACTCACCTAAG 11 V_SMAD3_03_M02794 TRANSFAC + 12324533 12324549 1.0E-06 CATAACTAGACATAAAA 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 12324668 12324684 3.0E-06 AATTTTAAATTAAGATC 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 12324669 12324685 7.0E-06 AGATCTTAATTTAAAAT 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 12328940 12328956 1.0E-06 ATGCTTTAATTAAATTT 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 12328941 12328957 0.0E+00 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_STAT1STAT1_Q3_M01212 TRANSFAC - 12328954 12328966 4.0E-06 TTTTAAAAGAAAA 13 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC + 12328941 12328957 1.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_PLZF_02_M01075 TRANSFAC - 12330731 12330759 6.0E-06 GGATTCTTCTTATAAAACAAGAGCACTGC 29 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC + 12328940 12328956 2.0E-06 ATGCTTTAATTAAATTT 17 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC - 12328941 12328957 4.0E-06 AAAATTTAATTAAAGCA 17 V_SRF_06_M02916 TRANSFAC - 12328950 12328966 6.0E-06 TTTTAAAAGAAAATTTA 17 V_SRF_06_M02916 TRANSFAC - 12328951 12328967 5.0E-06 ATTTTAAAAGAAAATTT 17 V_POU6F1_03_M01479 TRANSFAC + 12328803 12328819 2.0E-06 TCTGTTAATGAGTTTAA 17 V_VAX1_01_M01397 TRANSFAC - 12328940 12328955 6.0E-06 AATTTAATTAAAGCAT 16 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC - 12328823 12328839 5.0E-06 TTAATCATTAAAAACAT 17 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC - 12328939 12328955 9.0E-06 AATTTAATTAAAGCATA 17 V_HOXB3_01_M01330 TRANSFAC - 12328802 12328818 2.0E-06 TAAACTCATTAACAGAA 17 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC - 12328940 12328956 8.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC + 12328941 12328957 7.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_LHX9_01_M01367 TRANSFAC + 12328941 12328957 5.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_BSX_01_M01442 TRANSFAC - 12328940 12328955 1.0E-05 AATTTAATTAAAGCAT 16 V_SOX15_04_M02903 TRANSFAC - 12328944 12328958 6.0E-06 GAAAATTTAATTAAA 15 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC + 12328940 12328955 1.0E-06 ATGCTTTAATTAAATT 16 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC - 12328942 12328957 9.0E-06 AAAATTTAATTAAAGC 16 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 12328940 12328956 1.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC + 12328941 12328957 0.0E+00 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_CEBP_Q2_01_M00912 TRANSFAC + 12324529 12324540 4.0E-06 ATTTCATAACTA 12 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 12328824 12328839 2.0E-06 TGTTTTTAATGATTAA 16 V_HOXA10_01_M01464 TRANSFAC + 12328942 12328957 5.0E-06 GCTTTAATTAAATTTT 16 V_EHF_07_M02849 TRANSFAC + 12324525 12324540 8.0E-06 TAAAATTTCATAACTA 16 V_GFI1_Q6_01_M02010 TRANSFAC - 12330421 12330430 3.0E-06 CTGAGATTTC 10 V_HOXD10_01_M01375 TRANSFAC + 12328942 12328958 4.0E-06 GCTTTAATTAAATTTTC 17 V_SOX5_04_M02910 TRANSFAC - 12324670 12324684 3.0E-06 GATCTTAATTTAAAA 15 V_LTF_Q6_M01692 TRANSFAC - 12330351 12330359 6.0E-06 GGCACTTGC 9 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC - 12328940 12328956 8.0E-06 AAATTTAATTAAAGCAT 17 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC + 12328941 12328957 7.0E-06 TGCTTTAATTAAATTTT 17 V_HOXB5_01_M01319 TRANSFAC - 12328940 12328955 4.0E-06 AATTTAATTAAAGCAT 16 V_HOX13_02_M01452 TRANSFAC - 12328940 12328955 6.0E-06 AATTTAATTAAAGCAT 16 V_OCT4_01_M01125 TRANSFAC + 12324662 12324676 4.0E-06 TTTTGAAATTTTAAA 15 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC + 12328940 12328955 5.0E-06 ATGCTTTAATTAAATT 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.