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LRRN3 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 54674 leucine rich repeat neuronal 3 chr7 + 110726061 - 110731561 110731061 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the LRRN3 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 9.0E-06 CTAATTAA 8 NFE2_bZIP_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 110726778 110726788 7.0E-06 AGTGACTCATT 11 NFE2_bZIP_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 110726778 110726788 9.0E-06 AATGAGTCACT 11 CTCF_MA0139.1 JASPAR + 110730056 110730074 8.0E-06 ACTCCACTAGAGGGTAGTC 19 HOXD12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 110726877 110726885 4.0E-06 GCAATAAAA 9 HOXD12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 110730287 110730295 9.0E-06 TTAATAAAA 9 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 110730011 110730023 6.0E-06 GAAAAAAAAAACA 13 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 110726877 110726886 1.0E-06 GCAATAAAAA 10 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 110730287 110730296 5.0E-06 TTAATAAAAA 10 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 110729980 110729997 0.0E+00 GCACTTAAGGAGCAATTA 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 110733057 110733074 5.0E-06 ACAATAACCAGCCACTTA 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 9.0E-06 CTAATTAA 8 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110726877 110726886 0.0E+00 GCAATAAAAA 10 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 110726785 110726798 7.0E-06 CATTCATATGTATT 14 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 110726785 110726798 6.0E-06 AATACATATGAATG 14 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 110730193 110730206 7.0E-06 CATGCATTTTTAAA 14 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 110730837 110730850 4.0E-06 CCTAAATATTAAAA 14 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 110729981 110729997 2.0E-06 CACTTAAGGAGCAATTA 17 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 110730194 110730205 6.0E-06 ATGCATTTTTAA 12 SOX2_HMG_full_dimeric_17_1 SELEX - 110731176 110731192 9.0E-06 TCACACTGACATGGTGC 17 NHLH1_MA0048.1 JASPAR + 110731080 110731091 1.0E-05 GAGCAGCTGCGA 12 NHLH1_MA0048.1 JASPAR - 110731080 110731091 3.0E-06 TCGCAGCTGCTC 12 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 110730009 110730020 5.0E-06 AAAAAAAACAAA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 110730193 110730205 7.0E-06 CATGCATTTTTAA 13 NR2E1_nuclearreceptor_full_monomeric_9_1 SELEX + 110733136 110733144 7.0E-06 AGAAGTCAA 9 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 110730024 110730041 8.0E-06 CTTATTAGATTTACTTAG 18 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 110730167 110730181 5.0E-06 CTAGTATACTAATTA 15 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 110732379 110732393 1.0E-05 TATTTAAGAAAATTG 15 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 ZNF435_C2H2_full_dimeric_18_1 SELEX - 110731142 110731159 4.0E-06 ATTAATAACTGAACACCC 18 HOXD13_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 110731774 110731784 9.0E-06 GCTAGTAAAAT 11 TBX19_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 110733086 110733105 3.0E-06 TTTCCCATAAATGTGTCAAA 20 TBX19_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX - 110733086 110733105 1.0E-06 TTTGACACATTTATGGGAAA 20 ZNF232_C2H2_full_monomeric_19_1 SELEX - 110731013 110731031 1.0E-05 AGGATACAAATAAATGAAA 19 POU1F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 110730169 110730182 9.0E-06 AGTATACTAATTAA 14 POU1F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 110732081 110732094 9.0E-06 TGGATGCAAATTAA 14 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 ISL2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110729980 110729987 1.0E-05 GCACTTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 NKX3-2_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 110729979 110729987 7.0E-06 AGCACTTAA 9 Sox1_HMG_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 110733145 110733157 7.0E-06 TTAATTCCAGTGA 13 Pax4_MA0068.1 JASPAR - 110729988 110730017 1.0E-05 AAAAACAAAACCTTCACATCTAATTGCTCC 30 Pax4_MA0068.1 JASPAR - 110729992 110730021 5.0E-06 AAAAAAAAACAAAACCTTCACATCTAATTG 30 Pax4_MA0068.1 JASPAR - 110729994 110730023 7.0E-06 GAAAAAAAAAACAAAACCTTCACATCTAAT 30 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 9.0E-06 CTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 4.0E-06 ACTAATTAAG 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 5.0E-06 ACTAATTAAG 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 110730194 110730209 9.0E-06 ATGCATTTTTAAAACT 16 IRF1_MA0050.1 JASPAR - 110730006 110730017 5.0E-06 AAAAACAAAACC 12 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 110726876 110726885 2.0E-06 AGCAATAAAA 10 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 110730286 110730295 7.0E-06 ATTAATAAAA 10 POU3F3_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 110730169 110730181 6.0E-06 AGTATACTAATTA 13 POU3F3_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 110732081 110732093 9.0E-06 TGGATGCAAATTA 13 HOXC12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 110726877 110726885 3.0E-06 GCAATAAAA 9 Foxq1_MA0040.1 JASPAR + 110732389 110732399 8.0E-06 AATTGTTTGTT 11 HOXD13_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110726877 110726886 2.0E-06 GCAATAAAAA 10 FIGLA_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 110730828 110730837 4.0E-06 AACACCTGGT 10 FOXJ3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 110730283 110730296 1.0E-06 GTAATTAATAAAAA 14 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 1.0E-05 ACTAATTAAG 10 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730282 110730291 1.0E-05 GGTAATTAAT 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110733140 110733149 6.0E-06 GTCAATTAAT 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 9.0E-06 CTAATTAA 8 HOXC11_homeodomain_full_monomeric_11_2 SELEX + 110726876 110726886 0.0E+00 AGCAATAAAAA 11 OTX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730128 110730135 7.0E-06 TTAATCCT 8 EMX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 110730282 110730291 8.0E-06 ATTAATTACC 10 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 110730194 110730205 9.0E-06 TTAAAAATGCAT 12 FOXI1_MA0042.1 JASPAR + 110731017 110731028 6.0E-06 ATTTATTTGTAT 12 SOX14_HMG_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 110733145 110733157 1.0E-05 TTAATTCCAGTGA 13 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 110730029 110730041 7.0E-06 TAAATCTAATAAG 13 MEOX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 7.0E-06 ACTAATTAAG 10 MEOX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730282 110730291 5.0E-06 GGTAATTAAT 10 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 3.0E-06 ACTAATTAAG 10 SOX9_HMG_full_dimeric_16_3 SELEX + 110726880 110726895 9.0E-06 ATAAAAATTCCGTCAT 16 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 9.0E-06 CTAATTAA 8 ZBTB49_C2H2_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 110726743 110726759 4.0E-06 TTGTGCTAGGAAGGTCT 17 HOXA13_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 110726877 110726886 2.0E-06 GCAATAAAAA 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 8.0E-06 ACTAATTAAG 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 110729980 110729997 0.0E+00 GCACTTAAGGAGCAATTA 18 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 110733057 110733074 9.0E-06 ACAATAACCAGCCACTTA 18 LHX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 1.0E-06 ACTAATTAAG 10 POU1F1_POU_DBD_monomeric_17_1 SELEX + 110730191 110730207 2.0E-06 AACATGCATTTTTAAAA 17 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 110730030 110730040 8.0E-06 AAATCTAATAA 11 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 110730029 110730041 4.0E-06 TAAATCTAATAAG 13 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 110729984 110729998 5.0E-06 TTAAGGAGCAATTAG 15 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 110730283 110730297 7.0E-06 GTAATTAATAAAAAT 15 Foxd3_MA0041.1 JASPAR + 110730008 110730019 1.0E-06 TTTTGTTTTTTT 12 Foxd3_MA0041.1 JASPAR + 110732389 110732400 1.0E-06 AATTGTTTGTTC 12 LHX9_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 110729985 110729997 1.0E-06 TAATTGCTCCTTA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 110730029 110730041 1.0E-05 TAAATCTAATAAG 13 EN1_homeodomain_full_dimeric_14_1 SELEX + 110733134 110733147 3.0E-06 TAAGAAGTCAATTA 14 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 3.0E-06 ACTAATTAAG 10 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730282 110730291 3.0E-06 GGTAATTAAT 10 LHX9_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 4.0E-06 ACTAATTAAG 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 110730194 110730205 4.0E-06 ATGCATTTTTAA 12 JDP2_bZIP_full_dimeric_9_1 SELEX - 110726779 110726787 1.0E-05 ATGAGTCAC 9 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 110726786 110726797 8.0E-06 ATACATATGAAT 12 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 110730194 110730205 1.0E-05 TTAAAAATGCAT 12 Pou5f1_MA0142.1 JASPAR + 110731707 110731721 2.0E-06 AATTCACATGCAAAA 15 Tp53_p53l_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 110730104 110730120 8.0E-06 ACAGGTCAAAAGCAGGC 17 MEOX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 7.0E-06 ACTAATTAAG 10 TBX20_TBX_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 110732012 110732026 9.0E-06 AATAATGTGTGATCT 15 HOXC13_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110726877 110726886 2.0E-06 GCAATAAAAA 10 LBX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 6.0E-06 ACTAATTAAG 10 CPEB1_RRM_full_monomeric_8_1 SELEX + 110726879 110726886 4.0E-06 AATAAAAA 8 CPEB1_RRM_full_monomeric_8_1 SELEX + 110730289 110730296 4.0E-06 AATAAAAA 8 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 6.0E-06 ACTAATTAAG 10 GBX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 110729984 110729997 1.0E-05 TTAAGGAGCAATTA 14 GBX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 110733134 110733147 5.0E-06 TAAGAAGTCAATTA 14 GBX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 110733134 110733147 3.0E-06 TAATTGACTTCTTA 14 DMBX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 110730127 110730136 7.0E-06 GAGGATTAAT 10 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 5.0E-06 CTAATTAA 8 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 110726786 110726797 9.0E-06 ATTCATATGTAT 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 110726786 110726797 4.0E-06 ATACATATGAAT 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 110730286 110730297 6.0E-06 ATTAATAAAAAT 12 Sox3_HMG_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 110730285 110730301 9.0E-06 AATTAATAAAAATGTTT 17 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 110729980 110729997 0.0E+00 GCACTTAAGGAGCAATTA 18 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 110726876 110726886 1.0E-06 AGCAATAAAAA 11 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 110730286 110730296 5.0E-06 ATTAATAAAAA 11 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110730282 110730291 7.0E-06 GGTAATTAAT 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 110730007 110730019 7.0E-06 AAAAAAACAAAAC 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 110731016 110731028 8.0E-06 ATACAAATAAATG 13 NHLH1_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 110731081 110731090 5.0E-06 AGCAGCTGCG 10 NHLH1_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 110731081 110731090 4.0E-06 CGCAGCTGCT 10 CDX2_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 110726877 110726885 3.0E-06 GCAATAAAA 9 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 110730011 110730023 1.0E-06 GAAAAAAAAAACA 13 CDX1_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 110726877 110726885 3.0E-06 GCAATAAAA 9 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 110730194 110730207 4.0E-06 ATGCATTTTTAAAA 14 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 110726876 110726886 0.0E+00 AGCAATAAAAA 11 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 110730286 110730296 3.0E-06 ATTAATAAAAA 11 Irx3_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 110733122 110733133 4.0E-06 CAACATGTAATA 12 ONECUT3_CUT_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 110732163 110732176 7.0E-06 AGAAATTCAATAAC 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110730175 110730182 9.0E-06 CTAATTAA 8 HOXB13_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110726877 110726886 4.0E-06 GCAATAAAAA 10 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 110730174 110730183 7.0E-06 ACTAATTAAG 10 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 110730283 110730296 3.0E-06 GTAATTAATAAAAA 14 V_DMRT4_01_M01149 TRANSFAC + 110733095 110733107 8.0E-06 AATGTGTCAAAAA 13 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC + 110726874 110726890 5.0E-06 ACAGCAATAAAAATTCC 17 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 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