Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

HOOK1 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 51361 hook homolog 1 (Drosophila) chr1 + 60275532 - 60281032 60280532 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the HOOK1 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 60285434 60285451 5.0E-06 AACTTAAACATTAACTTT 18 MESP1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 60280077 60280086 5.0E-06 TACACCTGTG 10 Foxa2_MA0047.2 JASPAR - 60281800 60281811 8.0E-06 TGTTTACATTCC 12 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 60285136 60285145 5.0E-06 TTTAATTAAT 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 8.0E-06 ATTAATTAAA 10 ZNF713_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 60285506 60285522 8.0E-06 AAGAGAAACTCCAAGAA 17 FOXA1_MA0148.1 JASPAR - 60281801 60281811 4.0E-06 TGTTTACATTC 11 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 60285134 60285147 4.0E-06 GAATTAATTAAAAA 14 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 60281802 60281813 4.0E-06 AATGTAAACAGA 12 TBX5_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX - 60281683 60281702 1.0E-05 ATGGGTTAAGAACCACACCT 20 FOXO3_MA0157.1 JASPAR + 60281804 60281811 7.0E-06 TGTAAACA 8 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 60285138 60285148 2.0E-06 TGAATTAATTA 11 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 3.0E-06 ATTAATTAAA 10 HNF1B_MA0153.1 JASPAR - 60285423 60285434 1.0E-06 TTAATGTGTAAC 12 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 60285136 60285145 4.0E-06 TTTAATTAAT 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 6.0E-06 ATTAATTAAA 10 ZNF232_C2H2_full_monomeric_19_1 SELEX + 60285394 60285412 9.0E-06 TTGTAAAAAGTTAATGATG 19 RARA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_18_2 SELEX - 60280963 60280980 3.0E-06 GAGGTGAGAAGGGCAGGG 18 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 60285137 60285149 7.0E-06 GTGAATTAATTAA 13 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 1.0E-06 ATTAATTAAA 10 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 60285461 60285474 8.0E-06 GAAAAGTGGAAGTC 14 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 60285136 60285145 6.0E-06 TTTAATTAAT 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 1.0E-06 ATTAATTAAA 10 TEAD1_TEA_full_monomeric_10_1 SELEX - 60281798 60281807 1.0E-06 TACATTCCAT 10 Foxq1_MA0040.1 JASPAR + 60281764 60281774 9.0E-06 AGTTGTTTAGT 11 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 60285138 60285147 9.0E-06 TAATTAATTC 10 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 60285138 60285147 6.0E-06 GAATTAATTA 10 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 60285436 60285450 2.0E-06 AGTTAATGTTTAAGT 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 60285436 60285450 1.0E-06 ACTTAAACATTAACT 15 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 5.0E-06 ATTAATTAAA 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 2.0E-06 ATTAATTAAA 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 7.0E-06 ATTAATTAAA 10 SP1_MA0079.2 JASPAR - 60280509 60280518 9.0E-06 CCCCTCCTCC 10 FOXI1_MA0042.1 JASPAR + 60281764 60281775 7.0E-06 AGTTGTTTAGTT 12 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 9.0E-06 ATTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 60285136 60285145 3.0E-06 TTTAATTAAT 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 0.0E+00 ATTAATTAAA 10 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 60285135 60285147 1.0E-06 GAATTAATTAAAA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 60285138 60285150 1.0E-06 TAATTAATTCACT 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 60285398 60285410 7.0E-06 TCATTAACTTTTT 13 ZBTB49_C2H2_DBD_monomeric_17_1 SELEX + 60279931 60279947 6.0E-06 CTTGGCCTGGCGGGTCT 17 ZBTB49_C2H2_DBD_monomeric_17_1 SELEX + 60280252 60280268 1.0E-05 CTGCACCTGCCAGGTCA 17 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 60285477 60285487 9.0E-06 GAAAATAAACT 11 NR2F1_nuclearreceptor_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 60279947 60279962 8.0E-06 GAGGTCAGGAGTTCGA 16 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 60285136 60285145 9.0E-06 TTTAATTAAT 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 1.0E-06 ATTAATTAAA 10 TBX20_TBX_full_dimeric_16_1 SELEX + 60280747 60280762 8.0E-06 GAGTGTGAAGGTGTCC 16 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 60285437 60285449 5.0E-06 GTTAATGTTTAAG 13 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 60285437 60285449 4.0E-06 CTTAAACATTAAC 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 60285137 60285149 9.0E-06 GTGAATTAATTAA 13 TEAD3_TEA_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 60281799 60281806 1.0E-05 ACATTCCA 8 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 60285137 60285149 5.0E-06 GTGAATTAATTAA 13 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 8.0E-06 ATTAATTAAA 10 PRDM1_C2H2_full_monomeric-or-dimeric_15_1 SELEX - 60280284 60280298 2.0E-06 AGAGAGTGAGAGTGG 15 PRDM1_C2H2_full_monomeric-or-dimeric_15_1 SELEX + 60285461 60285475 9.0E-06 GAAAAGTGGAAGTCA 15 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 3.0E-06 ATTAATTAAA 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 60285138 60285149 9.0E-06 GTGAATTAATTA 12 LBX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 6.0E-06 ATTAATTAAA 10 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 60285138 60285148 1.0E-05 TGAATTAATTA 11 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 2.0E-06 ATTAATTAAA 10 TEAD4_TEA_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60281798 60281807 1.0E-06 TACATTCCAT 10 SPI1_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX + 60285461 60285474 6.0E-06 GAAAAGTGGAAGTC 14 Nr2f6_nuclearreceptor_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 60279948 60279962 2.0E-06 GAGGTCAGGAGTTCG 15 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 60285134 60285147 8.0E-06 GAATTAATTAAAAA 14 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 60285436 60285450 4.0E-06 AGTTAATGTTTAAGT 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 60285436 60285450 1.0E-06 ACTTAAACATTAACT 15 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 60285136 60285145 1.0E-06 ATTAATTAAA 10 RARG_nuclearreceptor_full_dimeric_16_1 SELEX - 60280965 60280980 5.0E-06 GAGGTGAGAAGGGCAG 16 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 60285477 60285489 6.0E-06 AGGAAAATAAACT 13 FOXB1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 60281802 60281812 8.0E-06 AATGTAAACAG 11 ZNF784_C2H2_full_monomeric_10_1 SELEX + 60280426 60280435 2.0E-06 GTACCTACCG 10 V_TAXCREB_01_M00114 TRANSFAC + 60280616 60280630 1.0E-05 AGGGGGTGACGCCGG 15 V_HNF3B_01_M00131 TRANSFAC + 60285437 60285451 9.0E-06 GTTAATGTTTAAGTT 15 V_KLF15_Q2_M01714 TRANSFAC + 60280510 60280523 4.0E-06 GAGGAGGGGAGGGG 14 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 60285130 60285146 9.0E-06 AATTAATTAAAAAGCTT 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 60285131 60285147 3.0E-06 AGCTTTTTAATTAATTC 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 60285134 60285150 0.0E+00 AGTGAATTAATTAAAAA 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 60285135 60285151 0.0E+00 TTTTAATTAATTCACTC 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC - 60285134 60285149 8.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 60285131 60285147 1.0E-06 GAATTAATTAAAAAGCT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 60285134 60285150 7.0E-06 TTTTTAATTAATTCACT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 60285135 60285151 3.0E-06 GAGTGAATTAATTAAAA 17 V_FOXO3_02_M02270 TRANSFAC + 60281804 60281811 7.0E-06 TGTAAACA 8 V_AREB6_03_M00414 TRANSFAC - 60280076 60280087 7.0E-06 CTACACCTGTGG 12 V_NRSF_Q4_M01028 TRANSFAC + 60281736 60281754 8.0E-06 GTGCTGTTGATGATGCTCA 19 V_RHOX11_01_M01347 TRANSFAC + 60281821 60281837 9.0E-06 AGGAGGCTGTAATCGGT 17 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC + 60285477 60285491 6.0E-06 AGTTTATTTTCCTTT 15 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 60285132 60285148 1.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC - 60280402 60280411 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 60285134 60285149 6.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_NFAT3_Q3_M01734 TRANSFAC + 60285480 60285489 3.0E-06 TTATTTTCCT 10 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 60285132 60285148 2.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 60285133 60285149 9.0E-06 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_PLAG1_02_M01973 TRANSFAC - 60280563 60280578 6.0E-06 TCCCCTTCCTGGGCCC 16 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC + 60285133 60285149 1.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_YY1_Q6_M00793 TRANSFAC + 60279926 60279934 7.0E-06 GCCATCTTG 9 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 60285132 60285148 1.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 60285133 60285149 1.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_P53_DECAMER_Q2_M00761 TRANSFAC - 60280310 60280319 7.0E-06 AGACAAGCCT 10 V_FOXJ1_03_M02750 TRANSFAC + 60281802 60281817 8.0E-06 AATGTAAACAGACGGG 16 V_SP1_03_M02281 TRANSFAC - 60280509 60280518 9.0E-06 CCCCTCCTCC 10 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 60285132 60285148 1.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 60285133 60285149 1.0E-06 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC + 60285133 60285149 8.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 60285132 60285148 1.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 60285133 60285149 0.0E+00 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 60285133 60285149 0.0E+00 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_SP1_02_M01303 TRANSFAC - 60280396 60280406 8.0E-06 GGGGCGGGGGC 11 V_VAX2_01_M01327 TRANSFAC - 60285134 60285149 5.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 60285137 60285146 0.0E+00 AATTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 60285139 60285148 7.0E-06 AATTAATTCA 10 V_GM497_04_M02864 TRANSFAC - 60281784 60281799 6.0E-06 ATCTGCACACACTCCC 16 V_NFY_Q6_01_M00775 TRANSFAC - 60280325 60280337 9.0E-06 CTCTGGCCAATCA 13 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC - 60285132 60285148 9.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC + 60285133 60285149 6.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC + 60285133 60285149 1.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC + 60285134 60285149 0.0E+00 TTTTTAATTAATTCAC 16 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC - 60285132 60285148 1.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC + 60285133 60285149 1.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 60285133 60285149 1.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 60285133 60285149 4.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_NKX62_Q2_M00489 TRANSFAC - 60285136 60285147 8.0E-06 GAATTAATTAAA 12 V_LXRB_RXRA_Q5_M02021 TRANSFAC - 60279949 60279963 2.0E-06 TGAGGTCAGGAGTTC 15 V_WT1_Q6_01_M02036 TRANSFAC + 60280395 60280404 4.0E-06 CGCCCCCGCC 10 V_WT1_Q6_01_M02036 TRANSFAC - 60280599 60280608 4.0E-06 CGCCCCCGCC 10 V_NFY_C_M00209 TRANSFAC + 60280323 60280336 2.0E-06 GTTGATTGGCCAGA 14 V_RPC155_01_M01798 TRANSFAC - 60279943 60279958 0.0E+00 TCAGGAGTTCGAGACC 16 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC + 60285132 60285148 1.0E-05 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_COMP1_01_M00057 TRANSFAC + 60280320 60280343 8.0E-06 CACGTTGATTGGCCAGAGCCCACG 24 V_HELIOSA_02_M01004 TRANSFAC - 60285482 60285492 1.0E-06 AAAAGGAAAAT 11 V_EN1_02_M01365 TRANSFAC - 60285134 60285149 1.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 60285132 60285147 2.0E-06 GCTTTTTAATTAATTC 16 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC - 60285134 60285149 1.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 60285133 60285149 0.0E+00 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_ZFP105_03_M02827 TRANSFAC - 60285131 60285145 5.0E-06 ATTAATTAAAAAGCT 15 V_FKLF_Q5_M01837 TRANSFAC - 60280234 60280243 2.0E-06 GGGGTGGGAG 10 V_FKLF_Q5_M01837 TRANSFAC + 60280520 60280529 2.0E-06 GGGGTGGGAG 10 V_SREBP1_01_M00220 TRANSFAC - 60279960 60279970 8.0E-06 GATCACCTGAG 11 V_E4BP4_01_M00045 TRANSFAC + 60285406 60285417 8.0E-06 AATGATGTAACT 12 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC + 60285132 60285148 2.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC - 60285133 60285149 5.0E-06 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_HNF1_Q6_M00790 TRANSFAC + 60285435 60285452 4.0E-06 AAGTTAATGTTTAAGTTG 18 V_NFAT_Q6_M00302 TRANSFAC - 60285481 60285492 3.0E-06 AAAAGGAAAATA 12 V_NKX61_01_M00424 TRANSFAC + 60285134 60285146 0.0E+00 TTTTTAATTAATT 13 V_NKX61_01_M00424 TRANSFAC - 60285425 60285437 4.0E-06 CTTTTAATGTGTA 13 V_HOXA3_02_M01337 TRANSFAC - 60285136 60285149 7.0E-06 GTGAATTAATTAAA 14 V_IRF2_01_M00063 TRANSFAC + 60285461 60285473 2.0E-06 GAAAAGTGGAAGT 13 V_KROX_Q6_M00982 TRANSFAC + 60280393 60280406 0.0E+00 CCCGCCCCCGCCCC 14 V_KROX_Q6_M00982 TRANSFAC - 60280574 60280587 4.0E-06 TTCGCCCCCTCCCC 14 V_KROX_Q6_M00982 TRANSFAC - 60280597 60280610 0.0E+00 CCCGCCCCCGCCTC 14 V_KROX_Q6_M00982 TRANSFAC - 60281023 60281036 7.0E-06 CGCGCCCACACACC 14 V_RSRFC4_Q2_M00407 TRANSFAC - 60279897 60279913 8.0E-06 CTACTAAAAATACAAAG 17 V_SP1_Q6_M00196 TRANSFAC - 60280401 60280413 7.0E-06 GCGGGGCGGGGCG 13 V_HNF1B_04_M02266 TRANSFAC - 60285423 60285434 1.0E-06 TTAATGTGTAAC 12 V_CDX2_01_M01449 TRANSFAC + 60280261 60280276 8.0E-06 CCAGGTCATAAACCTC 16 V_HNF3A_01_M01261 TRANSFAC + 60281803 60281812 3.0E-06 ATGTAAACAG 10 V_MAZ_Q6_01_M02023 TRANSFAC + 60280506 60280519 2.0E-06 GTGGGAGGAGGGGA 14 V_MAZ_Q6_01_M02023 TRANSFAC + 60280509 60280522 0.0E+00 GGAGGAGGGGAGGG 14 V_MAZ_Q6_01_M02023 TRANSFAC + 60280514 60280527 4.0E-06 AGGGGAGGGGTGGG 14 V_EGR1_Q6_M01873 TRANSFAC - 60280394 60280403 4.0E-06 GCGGGGGCGG 10 V_EGR1_Q6_M01873 TRANSFAC + 60280600 60280609 4.0E-06 GCGGGGGCGG 10 V_PMX2A_01_M01444 TRANSFAC - 60285134 60285149 3.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_STAT5A_02_M00460 TRANSFAC + 60285506 60285529 4.0E-06 TTCTTGGAGTTTCTCTTCCCTGTA 24 V_CDX2_Q5_M00729 TRANSFAC - 60280264 60280277 4.0E-06 AGAGGTTTATGACC 14 V_LHX2_01_M01325 TRANSFAC - 60285132 60285148 3.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC - 60285132 60285148 2.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC + 60285133 60285149 6.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC - 60285129 60285149 8.0E-06 GTGAATTAATTAAAAAGCTTA 21 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC + 60285433 60285453 1.0E-06 AAAAGTTAATGTTTAAGTTGG 21 V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC - 60285433 60285453 1.0E-06 CCAACTTAAACATTAACTTTT 21 V_HOXD11_01_M01434 TRANSFAC + 60280261 60280277 5.0E-06 CCAGGTCATAAACCTCT 17 V_TATA_C_M00216 TRANSFAC - 60285488 60285497 3.0E-06 TCTTTAAAAG 10 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 60285132 60285147 7.0E-06 GCTTTTTAATTAATTC 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 60285134 60285149 0.0E+00 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 60285399 60285414 7.0E-06 AAAAGTTAATGATGTA 16 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC + 60285132 60285148 2.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC - 60285133 60285149 0.0E+00 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 60285130 60285146 5.0E-06 AATTAATTAAAAAGCTT 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 60285131 60285147 3.0E-06 AGCTTTTTAATTAATTC 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 60285134 60285150 0.0E+00 AGTGAATTAATTAAAAA 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 60285135 60285151 0.0E+00 TTTTAATTAATTCACTC 17 V_MEF2_04_M00233 TRANSFAC - 60279896 60279917 1.0E-05 TTCTCTACTAAAAATACAAAGA 22 V_SPIB_01_M01204 TRANSFAC + 60285461 60285477 3.0E-06 GAAAAGTGGAAGTCACA 17 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC + 60285132 60285148 3.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC - 60285133 60285149 1.0E-06 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_XFD2_01_M00268 TRANSFAC + 60281802 60281815 4.0E-06 AATGTAAACAGACG 14 V_PNR_01_M01650 TRANSFAC + 60285427 60285440 7.0E-06 CACATTAAAAGTTA 14 V_HFH1_01_M00129 TRANSFAC + 60281764 60281775 4.0E-06 AGTTGTTTAGTT 12 V_HFH1_01_M00129 TRANSFAC + 60285474 60285485 4.0E-06 CACAGTTTATTT 12 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 60285131 60285147 0.0E+00 GAATTAATTAAAAAGCT 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC + 60285134 60285150 7.0E-06 TTTTTAATTAATTCACT 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 60285135 60285151 1.0E-06 GAGTGAATTAATTAAAA 17 V_GATA5_04_M02860 TRANSFAC + 60281658 60281674 4.0E-06 TACTTAGATATCAGTGC 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC - 60285132 60285148 1.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC + 60285133 60285149 0.0E+00 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC + 60285133 60285149 1.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_PMX2B_01_M01356 TRANSFAC + 60285132 60285148 9.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_PMX2B_01_M01356 TRANSFAC - 60285133 60285149 0.0E+00 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_SP3_Q3_M00665 TRANSFAC - 60280072 60280085 3.0E-06 ACACCTGTGGAGGG 14 V_LMO2COM_01_M00277 TRANSFAC + 60280076 60280087 4.0E-06 CCACAGGTGTAG 12 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 60285137 60285146 0.0E+00 AATTAATTAA 10 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC + 60285132 60285148 1.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 60285133 60285149 2.0E-06 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_SRF_03_M01304 TRANSFAC - 60285486 60285498 1.0E-05 ATCTTTAAAAGGA 13 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC + 60285132 60285148 2.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC - 60285133 60285149 5.0E-06 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC + 60285133 60285149 3.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_HOXD9_Q2_M01834 TRANSFAC + 60285426 60285435 3.0E-06 ACACATTAAA 10 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC - 60285132 60285148 2.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 60285133 60285149 0.0E+00 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_VBP_01_M00228 TRANSFAC - 60285407 60285416 2.0E-06 GTTACATCAT 10 V_SP4_Q5_M01273 TRANSFAC + 60280397 60280407 7.0E-06 CCCCCGCCCCG 11 V_SP4_Q5_M01273 TRANSFAC + 60280402 60280412 2.0E-06 GCCCCGCCCCG 11 V_FREAC2_01_M00290 TRANSFAC + 60281800 60281815 7.0E-06 GGAATGTAAACAGACG 16 V_HOXB7_01_M01396 TRANSFAC + 60285134 60285149 7.0E-06 TTTTTAATTAATTCAC 16 V_YY1_03_M02044 TRANSFAC + 60279923 60279934 7.0E-06 TTCGCCATCTTG 12 V_FXR_IR1_Q6_M00767 TRANSFAC - 60280263 60280275 1.0E-06 AGGTTTATGACCT 13 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC + 60285133 60285149 1.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_CAAT_01_M00254 TRANSFAC - 60280325 60280336 2.0E-06 TCTGGCCAATCA 12 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC - 60285132 60285148 3.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC + 60285133 60285149 0.0E+00 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_MTF1_06_M02882 TRANSFAC - 60285133 60285146 1.0E-05 AATTAATTAAAAAG 14 V_POU6F1_02_M01462 TRANSFAC + 60285400 60285416 7.0E-06 AAAGTTAATGATGTAAC 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 60285130 60285146 8.0E-06 AATTAATTAAAAAGCTT 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 60285131 60285147 3.0E-06 AGCTTTTTAATTAATTC 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 60285134 60285150 0.0E+00 AGTGAATTAATTAAAAA 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 60285135 60285151 0.0E+00 TTTTAATTAATTCACTC 17 V_IPF1_05_M01255 TRANSFAC + 60285426 60285437 1.0E-06 ACACATTAAAAG 12 V_IPF1_05_M01255 TRANSFAC - 60285435 60285446 5.0E-06 AAACATTAACTT 12 V_FOXL1_04_M02753 TRANSFAC + 60281800 60281816 6.0E-06 GGAATGTAAACAGACGG 17 V_PLAG1_01_M01778 TRANSFAC + 60280562 60280577 2.0E-06 GGGGCCCAGGAAGGGG 16 V_PXR_Q2_M00964 TRANSFAC - 60281690 60281701 9.0E-06 TGGGTTAAGAAC 12 V_NKX61_02_M01469 TRANSFAC + 60285132 60285147 1.0E-06 GCTTTTTAATTAATTC 16 V_TCF7_04_M02921 TRANSFAC - 60285390 60285404 4.0E-06 ACTTTTTACAAAATT 15 V_ZFP206_01_M01742 TRANSFAC + 60280203 60280213 9.0E-06 CGCGCACGCGC 11 V_MSX1_02_M01412 TRANSFAC + 60285132 60285147 2.0E-06 GCTTTTTAATTAATTC 16 V_MSX1_02_M01412 TRANSFAC - 60285134 60285149 6.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_BDP1_01_M01796 TRANSFAC + 60279943 60279954 2.0E-06 GGTCTCGAACTC 12 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 60285132 60285148 0.0E+00 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 60285133 60285149 0.0E+00 GTGAATTAATTAAAAAG 17 V_FPM315_01_M01587 TRANSFAC + 60280506 60280517 4.0E-06 GTGGGAGGAGGG 12 V_FOXA2_03_M02260 TRANSFAC - 60281800 60281811 8.0E-06 TGTTTACATTCC 12 V_IRF6_04_M02874 TRANSFAC - 60280987 60281001 5.0E-06 CATTCTCTCGGTCAA 15 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC + 60285133 60285149 1.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_E47_01_M00002 TRANSFAC + 60281017 60281031 9.0E-06 CGGGCAGGTGTGTGG 15 V_T3RBETA_Q6_01_M02119 TRANSFAC - 60279955 60279971 1.0E-06 GGATCACCTGAGGTCAG 17 V_HOXC5_01_M01454 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_HOXC5_01_M01454 TRANSFAC + 60285133 60285149 5.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_HSF_Q6_M00641 TRANSFAC + 60285506 60285518 1.0E-05 TTCTTGGAGTTTC 13 V_SRF_02_M01257 TRANSFAC - 60285481 60285498 1.0E-05 ATCTTTAAAAGGAAAATA 18 V_LXRA_RXRA_Q3_M00647 TRANSFAC - 60279951 60279965 1.0E-06 CCTGAGGTCAGGAGT 15 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC + 60285132 60285148 1.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_POU6F1_03_M01479 TRANSFAC + 60285400 60285416 5.0E-06 AAAGTTAATGATGTAAC 17 V_SOX18_04_M02905 TRANSFAC - 60285137 60285152 1.0E-06 AGAGTGAATTAATTAA 16 V_HNF1A_Q5_M02013 TRANSFAC + 60285436 60285446 1.0E-06 AGTTAATGTTT 11 V_FOXO1_04_M01969 TRANSFAC - 60281708 60281727 2.0E-06 TCATCAAACACCATCTTTAC 20 V_HLF_01_M00260 TRANSFAC - 60285407 60285416 5.0E-06 GTTACATCAT 10 V_YY1_01_M00059 TRANSFAC - 60281706 60281722 9.0E-06 AAACACCATCTTTACTC 17 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC - 60285132 60285148 5.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC + 60285133 60285149 7.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_NKX12_01_M01427 TRANSFAC + 60285132 60285148 6.0E-06 GCTTTTTAATTAATTCA 17 V_LHX9_01_M01367 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_LHX9_01_M01367 TRANSFAC + 60285133 60285149 0.0E+00 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_HOXA7_03_M01394 TRANSFAC + 60285134 60285149 7.0E-06 TTTTTAATTAATTCAC 16 V_ARP1_01_M00155 TRANSFAC + 60279948 60279963 3.0E-06 CGAACTCCTGACCTCA 16 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 60285132 60285148 0.0E+00 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC + 60285133 60285149 0.0E+00 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 60285132 60285147 1.0E-06 GCTTTTTAATTAATTC 16 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC - 60285134 60285149 9.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 60285136 60285151 1.0E-05 TTTAATTAATTCACTC 16 V_OG2_02_M01441 TRANSFAC - 60285132 60285148 3.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_P300_01_M00033 TRANSFAC + 60281781 60281794 1.0E-06 TAGGGGAGTGTGTG 14 V_DLX1_01_M01439 TRANSFAC - 60285136 60285149 1.0E-06 GTGAATTAATTAAA 14 V_SOX5_04_M02910 TRANSFAC - 60285401 60285415 1.0E-06 TTACATCATTAACTT 15 V_BRF1_01_M01747 TRANSFAC - 60279942 60279954 5.0E-06 GAGTTCGAGACCC 13 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC - 60285132 60285148 5.0E-06 TGAATTAATTAAAAAGC 17 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC + 60285133 60285149 7.0E-06 CTTTTTAATTAATTCAC 17 V_RHOX11_06_M03100 TRANSFAC + 60281821 60281837 9.0E-06 AGGAGGCTGTAATCGGT 17 V_FOXK1_03_M02752 TRANSFAC + 60281800 60281816 2.0E-06 GGAATGTAAACAGACGG 17 V_FOXK1_03_M02752 TRANSFAC - 60285476 60285492 1.0E-05 AAAAGGAAAATAAACTG 17 V_T3RALPHA_Q6_M01724 TRANSFAC - 60279955 60279965 5.0E-06 CCTGAGGTCAG 11 V_HOXC9_01_M01416 TRANSFAC - 60285400 60285415 9.0E-06 TTACATCATTAACTTT 16 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC - 60285134 60285149 6.0E-06 GTGAATTAATTAAAAA 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.