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CXCL9 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 4283 chemokine (C-X-C motif) ligand 9 chr4 - 76928141 - 76933641 76928641 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the CXCL9 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints HOXD12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 76928416 76928424 9.0E-06 GTCATAAAA 9 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 76923685 76923702 0.0E+00 TCAATTAAAAAATTATTA 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 76923686 76923703 8.0E-06 TTAATAATTTTTTAATTG 18 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 76928414 76928425 6.0E-06 AGTCATAAAAGC 12 RARB_nuclearreceptor_full_dimeric_16_1 SELEX - 76928373 76928388 8.0E-06 AAAGTTCATAACTTCG 16 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 76933359 76933368 8.0E-06 TTTAATTATC 10 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 76923686 76923702 0.0E+00 CAATTAAAAAATTATTA 17 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 76923693 76923704 9.0E-06 TTTAATAATTTT 12 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 76923686 76923699 0.0E+00 CAATTAAAAAATTA 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 76923686 76923699 2.0E-06 TAATTTTTTAATTG 14 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 76933360 76933367 4.0E-06 ATAATTAA 8 RARA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_18_2 SELEX - 76928370 76928387 9.0E-06 AAGTTCATAACTTCGATC 18 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 76923692 76923721 2.0E-06 AAAAATTATTAAAACCTAGTTCCACAGTAT 30 ZNF238_C2H2_full_monomeric_13_1 SELEX - 76924464 76924476 4.0E-06 TACACAGATGTTC 13 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 76933359 76933368 5.0E-06 GATAATTAAA 10 CUX1_CUT_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 76923684 76923701 3.0E-06 ATCAATTAAAAAATTATT 18 CUX1_CUT_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 76933046 76933063 2.0E-06 ATAAATGCAACGATCAAT 18 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX - 76928416 76928425 2.0E-06 AGTCATAAAA 10 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX - 76933359 76933368 8.0E-06 GATAATTAAA 10 HOXC12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 76928416 76928424 9.0E-06 GTCATAAAA 9 FOXJ3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 76933165 76933178 9.0E-06 ATCAACAGTTACCA 14 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 76923691 76923705 5.0E-06 AAAAAATTATTAAAA 15 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 76933359 76933368 7.0E-06 GATAATTAAA 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 76933359 76933368 2.0E-06 GATAATTAAA 10 HOXC11_homeodomain_full_monomeric_11_2 SELEX - 76928415 76928425 4.0E-06 AGTCATAAAAG 11 Ascl2_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 76924433 76924442 5.0E-06 AACAGCTGCC 10 Ascl2_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 76933498 76933507 5.0E-06 AACAGCTGCC 10 SOX14_HMG_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 76933038 76933050 8.0E-06 AAAATCCCATTGA 13 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 76933360 76933367 9.0E-06 ATAATTAA 8 HOXC11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 76928415 76928425 7.0E-06 AGTCATAAAAG 11 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 76933360 76933367 9.0E-06 TTAATTAT 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 76933357 76933369 5.0E-06 TGTTTAATTATCC 13 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 76933360 76933367 9.0E-06 ATAATTAA 8 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 76923685 76923702 0.0E+00 TCAATTAAAAAATTATTA 18 SMAD3_MAD_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 76933063 76933072 9.0E-06 TGTCTAGCCA 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 76933250 76933261 5.0E-06 AAATGCTAATGT 12 Stat3_MA0144.1 JASPAR - 76924427 76924436 1.0E-05 TGCCTGGAAG 10 CUX2_CUT_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 76923684 76923701 4.0E-06 ATCAATTAAAAAATTATT 18 Pou5f1_MA0142.1 JASPAR + 76932977 76932991 7.0E-06 ACTTGTCATGCAAAG 15 HOXC10_homeodomain_DBD_monomeric_10_3 SELEX - 76928415 76928424 8.0E-06 GTCATAAAAG 10 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_9_2 SELEX - 76928416 76928424 7.0E-06 GTCATAAAA 9 IRF3_IRF_full_trimeric_21_1 SELEX - 76933170 76933190 6.0E-06 CCAAAAAGGAATTGGTAACTG 21 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 76923686 76923699 1.0E-06 CAATTAAAAAATTA 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 76923686 76923699 2.0E-06 TAATTTTTTAATTG 14 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 76923691 76923705 8.0E-06 AAAAAATTATTAAAA 15 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 76923693 76923704 8.0E-06 AAAATTATTAAA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 76933250 76933261 5.0E-06 AAATGCTAATGT 12 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 76923685 76923702 0.0E+00 TCAATTAAAAAATTATTA 18 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 76933359 76933368 3.0E-06 GATAATTAAA 10 CDX2_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 76928416 76928424 6.0E-06 GTCATAAAA 9 CDX1_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 76928416 76928424 6.0E-06 GTCATAAAA 9 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 76923687 76923700 9.0E-06 ATAATTTTTTAATT 14 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 76928415 76928425 9.0E-06 AGTCATAAAAG 11 DLX5_homeodomain_FL_monomeric_8_1 SELEX - 76933360 76933367 8.0E-06 ATAATTAA 8 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 76933165 76933178 4.0E-06 ATCAACAGTTACCA 14 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC + 76923682 76923698 2.0E-06 ACATCAATTAAAAAATT 17 V_HNF3B_01_M00131 TRANSFAC + 76933352 76933366 6.0E-06 TGTTCTGTTTAATTA 15 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 76923686 76923702 3.0E-06 TAATAATTTTTTAATTG 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC + 76923680 76923695 4.0E-06 CAACATCAATTAAAAA 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 76923682 76923698 6.0E-06 ACATCAATTAAAAAATT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 76923683 76923699 4.0E-06 TAATTTTTTAATTGATG 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 76923686 76923702 2.0E-06 CAATTAAAAAATTATTA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 76923686 76923702 0.0E+00 TAATAATTTTTTAATTG 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 76923687 76923703 5.0E-06 TTAATAATTTTTTAATT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 76923690 76923706 0.0E+00 TAAAAAATTATTAAAAC 17 V_FOXP3_Q4_M00992 TRANSFAC + 76928412 76928428 6.0E-06 AAGCTTTTATGACTGAC 17 V_BCL6_Q3_01_M02085 TRANSFAC - 76933540 76933549 3.0E-06 CTTTCAAGAA 10 V_CDX2_Q5_01_M01659 TRANSFAC - 76933056 76933066 1.0E-05 GCCATAAATGC 11 V_APOLYA_B_M00310 TRANSFAC - 76933526 76933540 8.0E-06 AATAAACCCCTTTCT 15 V_AR_02_M00953 TRANSFAC + 76933337 76933363 2.0E-06 GTTGTGGAATCGAGGTGTTCTGTTTAA 27 V_GCM_Q2_M00634 TRANSFAC + 76924938 76924949 6.0E-06 CATACCCACATA 12 V_SOX14_05_M02902 TRANSFAC + 76923645 76923659 6.0E-06 CTGAGACAATGGTCT 15 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC - 76933191 76933205 6.0E-06 AGTTAAAATTCTTGT 15 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC - 76933215 76933229 0.0E+00 ACTGGAATTTTTCAA 15 V_POU5F1_02_M02245 TRANSFAC + 76932977 76932991 7.0E-06 ACTTGTCATGCAAAG 15 V_HOXA13_02_M01297 TRANSFAC - 76933533 76933541 3.0E-06 AAATAAACC 9 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC - 76932895 76932904 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC + 76923680 76923695 1.0E-06 CAACATCAATTAAAAA 16 V_IRF_Q6_01_M00972 TRANSFAC + 76933085 76933095 6.0E-06 GAAACAGAAAC 11 V_HNF4ALPHA_Q6_M00638 TRANSFAC + 76928380 76928392 1.0E-06 ATGAACTTTGGAT 13 V_RP58_01_M00532 TRANSFAC + 76924463 76924474 6.0E-06 TGAACATCTGTG 12 V_OCT1_01_M00135 TRANSFAC + 76933246 76933264 5.0E-06 ATCCAAATGCTAATGTAAC 19 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 76923681 76923697 7.0E-06 ATTTTTTAATTGATGTT 17 V_POU2F3_01_M01476 TRANSFAC + 76933248 76933263 1.0E-05 CCAAATGCTAATGTAA 16 V_P50P50_Q3_M01223 TRANSFAC - 76933479 76933491 6.0E-06 AGGGGAAATCCAC 13 V_SOX11_04_M02899 TRANSFAC + 76923693 76923706 3.0E-06 AAAATTATTAAAAC 14 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 76923681 76923697 5.0E-06 AACATCAATTAAAAAAT 17 V_P50RELAP65_Q5_01_M01224 TRANSFAC + 76933481 76933492 3.0E-06 GGATTTCCCCTC 12 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC + 76923681 76923697 7.0E-06 AACATCAATTAAAAAAT 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 76923681 76923697 1.0E-06 AACATCAATTAAAAAAT 17 V_AREB6_04_M00415 TRANSFAC - 76923737 76923745 8.0E-06 CTGTTTCTT 9 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC + 76923682 76923697 7.0E-06 ACATCAATTAAAAAAT 16 V_AP4_Q6_01_M00927 TRANSFAC - 76924434 76924442 1.0E-05 AACAGCTGC 9 V_AP4_Q6_01_M00927 TRANSFAC - 76933499 76933507 1.0E-05 AACAGCTGC 9 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC + 76923689 76923704 3.0E-06 TTAAAAAATTATTAAA 16 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC - 76923689 76923704 2.0E-06 TTTAATAATTTTTTAA 16 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC - 76923688 76923703 3.0E-06 TTAATAATTTTTTAAT 16 V_CDX_Q5_M00991 TRANSFAC + 76923687 76923704 0.0E+00 AATTAAAAAATTATTAAA 18 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 76923681 76923697 3.0E-06 AACATCAATTAAAAAAT 17 V_AR_03_M00956 TRANSFAC + 76933337 76933363 4.0E-06 GTTGTGGAATCGAGGTGTTCTGTTTAA 27 V_CETS1P54_02_M00074 TRANSFAC - 76933201 76933213 1.0E-06 GCACAGGAAGTTA 13 V_TAL1_GATA1_01_M02243 TRANSFAC - 76928465 76928482 6.0E-06 CTTGATTAGCCAGATAAA 18 V_BARBIE_01_M00238 TRANSFAC - 76928457 76928471 2.0E-06 AGATAAAGGTGAATG 15 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC + 76923683 76923699 4.0E-06 CATCAATTAAAAAATTA 17 V_FOXA2_02_M02853 TRANSFAC - 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