Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

MID1 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 4281 midline 1 (Opitz/BBB syndrome) chrX - 10851309 - 10856809 10851809 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the MID1 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 4.0E-06 TTAATTAA 8 FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 10849985 10850002 6.0E-06 TATGTACATATCAACTCA 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 10852071 10852088 2.0E-06 GCAATTTAATTAAAATCA 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 4.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 10852075 10852084 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 10852075 10852084 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 SPIC_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX - 10851674 10851687 9.0E-06 AAAATGGGGAAGCT 14 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 10850471 10850482 5.0E-06 TTGCATTTTTTA 12 FOXF2_MA0030.1 JASPAR - 10846902 10846915 4.0E-06 GTCAAGTAAACAAT 14 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 2.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 10852071 10852083 4.0E-06 TTAATTAAATTGC 13 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 10850470 10850482 5.0E-06 CTTGCATTTTTTA 13 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 10850472 10850482 9.0E-06 TGCATTTTTTA 11 SRY_HMG_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 10853057 10853072 1.0E-05 TACAATTTCTCTTCTT 16 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 10852077 10852088 3.0E-06 TAATTAAAATCA 12 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 10852077 10852088 7.0E-06 TGATTTTAATTA 12 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 10852075 10852084 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 10852075 10852084 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 3.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 10852071 10852083 4.0E-06 TTAATTAAATTGC 13 GATA5_GATA_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10853069 10853076 7.0E-06 AGATAAGA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 SOX8_HMG_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 10850091 10850104 6.0E-06 AGAATATACAGTTA 14 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 SOX15_HMG_full_dimeric_15_3 SELEX + 10850466 10850480 4.0E-06 ATGACTTGCATTTTT 15 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 2.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 GATA4_GATA_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10853069 10853076 7.0E-06 AGATAAGA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 10851674 10851687 3.0E-06 AAAATGGGGAAGCT 14 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 10852082 10852095 8.0E-06 AAAATCATCTTTAT 14 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 10852075 10852084 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 10852075 10852084 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 10852072 10852082 2.0E-06 CAATTTAATTA 11 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 10852072 10852082 1.0E-05 TAATTAAATTG 11 Sox17_HMG_DBD_dimeric_15_2 SELEX + 10850466 10850480 4.0E-06 ATGACTTGCATTTTT 15 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 3.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 10852071 10852083 4.0E-06 TTAATTAAATTGC 13 SOX2_HMG_full_dimeric_15_1 SELEX - 10852127 10852141 3.0E-06 TTGACTCACAGTCAC 15 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 HNF4A_nuclearreceptor_full_dimeric_16_1 SELEX + 10853150 10853165 9.0E-06 TGGTCCAAAGTCTCAT 16 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 2.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 10852071 10852083 6.0E-06 TTAATTAAATTGC 13 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 10852072 10852082 2.0E-06 CAATTTAATTA 11 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 3.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 10852071 10852083 5.0E-06 TTAATTAAATTGC 13 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 10852075 10852084 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 10852075 10852084 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 10852070 10852082 8.0E-06 TAATTAAATTGCA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 10852073 10852085 3.0E-06 AATTTAATTAAAA 13 SOX14_HMG_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 10850466 10850480 7.0E-06 ATGACTTGCATTTTT 15 SOX14_HMG_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 10852127 10852141 6.0E-06 TTGACTCACAGTCAC 15 Gata1_MA0035.2 JASPAR - 10853068 10853078 0.0E+00 AGAGATAAGAA 11 GATA3_GATA_full_monomeric_8_1 SELEX - 10853069 10853076 7.0E-06 AGATAAGA 8 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 10852075 10852084 2.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 10852075 10852084 2.0E-06 TTTAATTAAA 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 10852071 10852088 6.0E-06 GCAATTTAATTAAAATCA 18 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 10852072 10852082 2.0E-06 CAATTTAATTA 11 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 1.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 1.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 10852071 10852083 9.0E-06 TTAATTAAATTGC 13 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX + 10850471 10850482 5.0E-06 TTGCATTTTTTA 12 Hltf_MA0109.1 JASPAR + 10851925 10851934 6.0E-06 TTCCTTATAT 10 DUXA_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 10852071 10852083 6.0E-06 GCAATTTAATTAA 13 SRF_MADS_full_dimeric_16_1 SELEX - 10851924 10851939 2.0E-06 TACCTATATAAGGAAA 16 TEAD1_TEA_full_dimeric_17_1 SELEX - 10852061 10852077 8.0E-06 AAATTGCACAAATCCCT 17 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 10852072 10852082 1.0E-06 CAATTTAATTA 11 ZNF410_C2H2_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 10852153 10852169 7.0E-06 CACAGCCCATGATATAA 17 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 10852075 10852084 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 10852075 10852084 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 SPI1_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX - 10851674 10851687 2.0E-06 AAAATGGGGAAGCT 14 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 10852071 10852088 4.0E-06 GCAATTTAATTAAAATCA 18 Sox2_MA0143.1 JASPAR - 10852049 10852063 3.0E-06 CCTTTGTACTGCAAC 15 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 10852075 10852084 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 10852075 10852084 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 FOXB1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 10849985 10849995 6.0E-06 TATGTACATAT 11 Sox1_HMG_DBD_dimeric_15_2 SELEX + 10850466 10850480 4.0E-06 ATGACTTGCATTTTT 15 Sox1_HMG_DBD_dimeric_15_2 SELEX - 10852127 10852141 5.0E-06 TTGACTCACAGTCAC 15 HNF1A_MA0046.1 JASPAR + 10852143 10852156 9.0E-06 AGTTAGTATTTTAT 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 4.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 10852076 10852083 9.0E-06 TTAATTAA 8 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 10850088 10850101 1.0E-05 ATATACAGTTAATA 14 V_RUSH1A_02_M01107 TRANSFAC + 10851925 10851934 6.0E-06 TTCCTTATAT 10 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC + 10852073 10852089 1.0E-05 AATTTAATTAAAATCAT 17 V_KLF15_Q2_M01714 TRANSFAC - 10851843 10851856 8.0E-06 GAGAGGGGGAGTGA 14 V_SPI1_01_M01203 TRANSFAC - 10851671 10851687 3.0E-06 AAAATGGGGAAGCTGGT 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 10852070 10852086 1.0E-05 TGCAATTTAATTAAAAT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 10852073 10852089 8.0E-06 AATTTAATTAAAATCAT 17 V_TCF3_01_M01594 TRANSFAC - 10852051 10852063 7.0E-06 CCTTTGTACTGCA 13 V_POU3F3_01_M03090 TRANSFAC - 10853046 10853062 8.0E-06 ATTGTATGCAAAAGTTT 17 V_POU3F3_01_M03090 TRANSFAC + 10853047 10853063 9.0E-06 AACTTTTGCATACAATT 17 V_TCFE2A_04_M02927 TRANSFAC - 10850075 10850091 7.0E-06 AATAACAGATGGTTTAA 17 V_SRY_07_M02813 TRANSFAC + 10852075 10852090 7.0E-06 TTTAATTAAAATCATC 16 V_GATA2_02_M00348 TRANSFAC - 10853069 10853078 0.0E+00 AGAGATAAGA 10 TAL1_TCF3_MA0091.1 JASPAR + 10850077 10850088 0.0E+00 AAACCATCTGTT 12 V_FOXA2_04_M02749 TRANSFAC - 10846899 10846915 3.0E-06 GTCAAGTAAACAATTCA 17 V_PROP1_01_M01294 TRANSFAC - 10852072 10852082 2.0E-06 TAATTAAATTG 11 V_OCTAMER_01_M01324 TRANSFAC - 10853046 10853062 8.0E-06 ATTGTATGCAAAAGTTT 17 V_OCTAMER_01_M01324 TRANSFAC + 10853047 10853063 9.0E-06 AACTTTTGCATACAATT 17 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC + 10852071 10852086 8.0E-06 GCAATTTAATTAAAAT 16 V_OCT1_01_M00135 TRANSFAC - 10853045 10853063 5.0E-06 AATTGTATGCAAAAGTTTT 19 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 10852072 10852088 2.0E-06 TGATTTTAATTAAATTG 17 V_POU2F3_01_M01476 TRANSFAC - 10853046 10853061 7.0E-06 TTGTATGCAAAAGTTT 16 V_CEBP_Q2_M00190 TRANSFAC - 10852064 10852077 2.0E-06 AAATTGCACAAATC 14 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC + 10852072 10852088 7.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 10852072 10852088 1.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_HNF3_Q6_01_M01012 TRANSFAC + 10851544 10851561 7.0E-06 CATTGTATTTGTTCAGGA 18 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 10852071 10852087 1.0E-06 GCAATTTAATTAAAATC 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 10852072 10852088 1.0E-06 TGATTTTAATTAAATTG 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC + 10852072 10852088 1.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 10852071 10852087 3.0E-06 GCAATTTAATTAAAATC 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 10852072 10852088 8.0E-06 TGATTTTAATTAAATTG 17 V_NERF_Q2_M00531 TRANSFAC + 10851554 10851571 2.0E-06 GTTCAGGAAGGAGCTGTG 18 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 10852071 10852087 1.0E-06 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 10852072 10852088 0.0E+00 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_HTF_01_M00538 TRANSFAC - 10850476 10850499 3.0E-06 GAAAATGACCACGTTTTTAAAAAA 24 V_PU1_Q4_M01172 TRANSFAC + 10851668 10851686 7.0E-06 CTCACCAGCTTCCCCATTT 19 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 10852074 10852083 0.0E+00 ATTTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 10852076 10852085 9.0E-06 TTTTAATTAA 10 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC - 10852071 10852086 4.0E-06 ATTTTAATTAAATTGC 16 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC + 10852073 10852088 3.0E-06 AATTTAATTAAAATCA 16 V_NFY_Q6_01_M00775 TRANSFAC - 10853146 10853158 5.0E-06 TTTGGACCAATCA 13 V_SOX21_03_M02803 TRANSFAC - 10852075 10852090 8.0E-06 GATGATTTTAATTAAA 16 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC - 10852071 10852087 8.0E-06 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC + 10852072 10852088 5.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC + 10852072 10852088 3.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 10852071 10852087 1.0E-06 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 10852072 10852088 1.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 10852072 10852088 7.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_TAL1_GATA1_01_M02243 TRANSFAC + 10853127 10853144 3.0E-06 TTGGCTTACAGAGATAAA 18 V_BCL6_02_M01185 TRANSFAC + 10849200 10849213 1.0E-05 AACCTTCCAGGGAT 14 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC - 10850471 10850487 1.0E-05 GTTTTTAAAAAATGCAA 17 V_POU3F2_01_M00463 TRANSFAC + 10850471 10850484 9.0E-06 TTGCATTTTTTAAA 14 V_FREAC3_01_M00291 TRANSFAC - 10846900 10846915 7.0E-06 GTCAAGTAAACAATTC 16 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 10852071 10852087 0.0E+00 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 10852072 10852088 0.0E+00 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_HOXB13_01_M01467 TRANSFAC + 10852073 10852088 3.0E-06 AATTTAATTAAAATCA 16 V_CART1_01_M00416 TRANSFAC + 10852074 10852091 2.0E-06 ATTTAATTAAAATCATCT 18 V_NFAT_Q6_M00302 TRANSFAC + 10850001 10850012 5.0E-06 CACAGGAAAAAC 12 V_NKX26_01_M01322 TRANSFAC + 10849279 10849294 6.0E-06 CAACCCACTCATCATT 16 V_NKX61_01_M00424 TRANSFAC - 10852074 10852086 2.0E-06 ATTTTAATTAAAT 13 V_CEBPB_02_M00117 TRANSFAC - 10852064 10852077 7.0E-06 AAATTGCACAAATC 14 V_HNF3_Q6_M00791 TRANSFAC - 10851547 10851559 3.0E-06 CTGAACAAATACA 13 V_HNF3ALPHA_Q6_M00724 TRANSFAC + 10851549 10851559 5.0E-06 TATTTGTTCAG 11 V_IRF_Q6_M00772 TRANSFAC + 10853057 10853071 6.0E-06 TACAATTTCTCTTCT 15 V_SFPI1_04_M02896 TRANSFAC - 10851923 10851936 5.0E-06 CTATATAAGGAAAC 14 V_NFE4_Q5_M02105 TRANSFAC + 10851848 10851859 1.0E-06 CCCCCTCTCCAG 12 V_OCT1_04_M00138 TRANSFAC - 10852072 10852094 1.0E-05 TAAAGATGATTTTAATTAAATTG 23 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 10852071 10852086 5.0E-06 GCAATTTAATTAAAAT 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 10852073 10852088 2.0E-06 TGATTTTAATTAAATT 16 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC + 10852071 10852087 5.0E-06 GCAATTTAATTAAAATC 17 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC - 10852072 10852088 7.0E-06 TGATTTTAATTAAATTG 17 Tal1_Gata1_MA0140.1 JASPAR + 10853127 10853144 3.0E-06 TTGGCTTACAGAGATAAA 18 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 10852070 10852086 9.0E-06 TGCAATTTAATTAAAAT 17 V_TAL1BETAE47_01_M00065 TRANSFAC - 10850076 10850091 1.0E-06 AATAACAGATGGTTTA 16 V_SOX12_04_M02900 TRANSFAC + 10853190 10853205 1.0E-06 CCCCAGATAAAGAATT 16 V_SPIB_01_M01204 TRANSFAC - 10851671 10851687 1.0E-06 AAAATGGGGAAGCTGGT 17 V_ERBETA_Q5_M01875 TRANSFAC - 10851906 10851920 6.0E-06 GTTAGGCTGACCTGA 15 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC - 10852072 10852088 4.0E-06 TGATTTTAATTAAATTG 17 V_GATA1_09_M02254 TRANSFAC - 10853068 10853078 0.0E+00 AGAGATAAGAA 11 V_OCAB_Q6_M02113 TRANSFAC - 10850468 10850478 6.0E-06 AAATGCAAGTC 11 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC + 10852073 10852089 1.0E-06 AATTTAATTAAAATCAT 17 V_SRF_Q5_02_M01007 TRANSFAC + 10851922 10851940 3.0E-06 GGTTTCCTTATATAGGTAA 19 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC - 10852071 10852087 0.0E+00 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC + 10852072 10852088 0.0E+00 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC - 10852071 10852087 2.0E-06 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC + 10852072 10852088 1.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_TBP_06_M02814 TRANSFAC - 10852146 10852161 8.0E-06 ATGATATAAAATACTA 16 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC + 10852074 10852083 1.0E-06 ATTTAATTAA 10 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 10852076 10852085 5.0E-06 TTTTAATTAA 10 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC + 10852071 10852087 3.0E-06 GCAATTTAATTAAAATC 17 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 10852072 10852088 1.0E-06 TGATTTTAATTAAATTG 17 V_SRF_03_M01304 TRANSFAC - 10851926 10851938 5.0E-06 ACCTATATAAGGA 13 V_AP1_Q2_01_M00924 TRANSFAC - 10852129 10852140 5.0E-06 TGACTCACAGTC 12 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 10852071 10852087 2.0E-06 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC + 10852072 10852088 0.0E+00 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 10852072 10852088 3.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_TAL1BETAITF2_01_M00070 TRANSFAC - 10850076 10850091 1.0E-06 AATAACAGATGGTTTA 16 V_PTF1BETA_Q6_M00657 TRANSFAC - 10850488 10850501 4.0E-06 GAGAAAATGACCAC 14 V_FREAC2_01_M00290 TRANSFAC - 10846900 10846915 7.0E-06 GTCAAGTAAACAATTC 16 V_DLX7_01_M01486 TRANSFAC + 10852071 10852087 3.0E-06 GCAATTTAATTAAAATC 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC - 10852071 10852087 2.0E-06 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC + 10852072 10852088 0.0E+00 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC - 10852071 10852087 6.0E-06 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_HIF1_Q3_M00797 TRANSFAC + 10850014 10850027 6.0E-06 GCAGACGTGCTGGC 14 V_TAL1_01_M01591 TRANSFAC + 10853066 10853078 4.0E-06 TCTTCTTATCTCT 13 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 10852070 10852086 7.0E-06 TGCAATTTAATTAAAAT 17 V_CEBPA_01_M00116 TRANSFAC - 10852064 10852077 8.0E-06 AAATTGCACAAATC 14 V_OCT2_01_M01368 TRANSFAC - 10853046 10853061 1.0E-05 TTGTATGCAAAAGTTT 16 V_HNF1_01_M00132 TRANSFAC + 10852143 10852157 9.0E-06 AGTTAGTATTTTATA 15 V_TAL1ALPHAE47_01_M00066 TRANSFAC - 10850076 10850091 2.0E-06 AATAACAGATGGTTTA 16 V_SIRT6_01_M01797 TRANSFAC - 10853069 10853076 7.0E-06 AGATAAGA 8 V_OCT1_Q6_M00195 TRANSFAC - 10850466 10850480 5.0E-06 AAAAATGCAAGTCAT 15 V_FOXL1_04_M02753 TRANSFAC - 10846899 10846915 7.0E-06 GTCAAGTAAACAATTCA 17 V_GATA3_02_M00350 TRANSFAC - 10853069 10853078 1.0E-06 AGAGATAAGA 10 V_TCF7_04_M02921 TRANSFAC + 10850475 10850489 1.0E-05 ATTTTTTAAAAACGT 15 V_MSX1_02_M01412 TRANSFAC - 10852073 10852088 4.0E-06 TGATTTTAATTAAATT 16 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 10852071 10852087 0.0E+00 GCAATTTAATTAAAATC 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 10852072 10852088 0.0E+00 TGATTTTAATTAAATTG 17 V_SRF_01_M00152 TRANSFAC - 10851923 10851940 5.0E-06 TTACCTATATAAGGAAAC 18 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC - 10852071 10852087 8.0E-06 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC + 10852072 10852088 5.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_CEBPB_Q6_M01896 TRANSFAC + 10852067 10852076 4.0E-06 TTGTGCAATT 10 V_HOXC5_01_M01454 TRANSFAC + 10852072 10852088 5.0E-06 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_IRF1_Q6_01_M01881 TRANSFAC + 10853059 10853072 5.0E-06 CAATTTCTCTTCTT 14 V_SRF_02_M01257 TRANSFAC - 10851921 10851938 3.0E-06 ACCTATATAAGGAAACCT 18 V_SOX2_01_M02246 TRANSFAC - 10852049 10852063 3.0E-06 CCTTTGTACTGCAAC 15 V_GATA2_03_M00349 TRANSFAC - 10853069 10853078 0.0E+00 AGAGATAAGA 10 V_FOXJ2_01_M00422 TRANSFAC - 10846899 10846916 7.0E-06 CGTCAAGTAAACAATTCA 18 V_FOXJ2_01_M00422 TRANSFAC + 10851931 10851948 5.0E-06 ATATAGGTAAACATGAAT 18 V_FOXO1_04_M01969 TRANSFAC + 10852076 10852095 7.0E-06 TTAATTAAAATCATCTTTAT 20 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC + 10852073 10852089 8.0E-06 AATTTAATTAAAATCAT 17 V_SOX2_Q6_M01272 TRANSFAC - 10852052 10852067 3.0E-06 AATCCCTTTGTACTGC 16 V_SOX15_04_M02903 TRANSFAC + 10852070 10852084 1.0E-05 TGCAATTTAATTAAA 15 V_SOX15_04_M02903 TRANSFAC - 10852070 10852084 1.0E-06 TTTAATTAAATTGCA 15 V_CTF1_01_M01196 TRANSFAC - 10850032 10850045 1.0E-06 TGGCCCCAAGCCAA 14 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC - 10852073 10852088 8.0E-06 TGATTTTAATTAAATT 16 V_FREAC4_01_M00292 TRANSFAC - 10846900 10846915 8.0E-06 GTCAAGTAAACAATTC 16 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 10852071 10852087 0.0E+00 GATTTTAATTAAATTGC 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC + 10852072 10852088 0.0E+00 CAATTTAATTAAAATCA 17 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC - 10852073 10852088 7.0E-06 TGATTTTAATTAAATT 16 V_HOXA10_01_M01464 TRANSFAC + 10852068 10852083 7.0E-06 TGTGCAATTTAATTAA 16 V_HOXA10_01_M01464 TRANSFAC + 10852073 10852088 2.0E-06 AATTTAATTAAAATCA 16 V_MAFK_04_M02880 TRANSFAC - 10850469 10850483 2.0E-06 TTAAAAAATGCAAGT 15 V_GATA6_04_M02757 TRANSFAC - 10853065 10853081 3.0E-06 TGCAGAGATAAGAAGAG 17 V_HOXD10_01_M01375 TRANSFAC - 10852070 10852086 3.0E-06 ATTTTAATTAAATTGCA 17 V_HOXD10_01_M01375 TRANSFAC + 10852073 10852089 1.0E-06 AATTTAATTAAAATCAT 17 V_HNF1A_01_M02162 TRANSFAC + 10852143 10852156 9.0E-06 AGTTAGTATTTTAT 14 V_SOX5_04_M02910 TRANSFAC + 10849285 10849299 3.0E-06 ACTCATCATTTACCA 15 V_LTF_Q6_M01692 TRANSFAC - 10851768 10851776 6.0E-06 GGCACTTGC 9 TLX1_NFIC_MA0119.1 JASPAR - 10850032 10850045 1.0E-06 TGGCCCCAAGCCAA 14 V_SMAD1_01_M01590 TRANSFAC - 10850396 10850407 5.0E-06 AAGGACAAAAGC 12 V_SOX9_Q4_M01284 TRANSFAC + 10852055 10852065 8.0E-06 GTACAAAGGGA 11 V_PPARA_01_M00242 TRANSFAC - 10850460 10850479 9.0E-06 AAAATGCAAGTCATAGTCCA 20 V_SOX14_03_M02798 TRANSFAC + 10852075 10852090 7.0E-06 TTTAATTAAAATCATC 16 V_CEBPA_Q6_M01866 TRANSFAC + 10852064 10852076 3.0E-06 GATTTGTGCAATT 13 V_GATA1_06_M00347 TRANSFAC - 10853069 10853078 3.0E-06 AGAGATAAGA 10 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC + 10852071 10852086 7.0E-06 GCAATTTAATTAAAAT 16 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC - 10852073 10852088 9.0E-06 TGATTTTAATTAAATT 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.