Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

LPA Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 4018 lipoprotein, Lp(a) chr6 - 161086907 - 161092407 161087407 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the LPA promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints CTCF_MA0139.1 JASPAR - 161089115 161089133 2.0E-06 CGGCCACTGGATGGCAGCA 19 NEUROD2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 161083559 161083568 3.0E-06 AACATATGTT 10 NEUROD2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 161083559 161083568 3.0E-06 AACATATGTT 10 FOXA1_MA0148.1 JASPAR - 161089042 161089052 8.0E-06 TGTTTGCCTTG 11 POU2F2_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 161083562 161083572 5.0E-06 ATATGTTAATC 11 BHLHE23_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 161083559 161083568 0.0E+00 AACATATGTT 10 BHLHE23_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 161083559 161083568 0.0E+00 AACATATGTT 10 BHLHE22_bHLH_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 161083558 161083569 0.0E+00 AAACATATGTTA 12 BHLHE22_bHLH_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 161083558 161083569 0.0E+00 TAACATATGTTT 12 OLIG1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 161083559 161083568 0.0E+00 AACATATGTT 10 OLIG1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 161083559 161083568 0.0E+00 AACATATGTT 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 161083562 161083573 1.0E-05 ATATGTTAATCC 12 Stat3_MA0144.1 JASPAR + 161089083 161089092 7.0E-06 TGCCAGGAAA 10 Atoh1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 161083559 161083568 0.0E+00 AACATATGTT 10 Atoh1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 161083559 161083568 0.0E+00 AACATATGTT 10 POU2F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 161083561 161083572 7.0E-06 CATATGTTAATC 12 NEUROG2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 161083559 161083568 1.0E-06 AACATATGTT 10 NEUROG2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 161083559 161083568 1.0E-06 AACATATGTT 10 BHLHA15_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 161083559 161083568 2.0E-06 AACATATGTT 10 BHLHA15_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 161083559 161083568 2.0E-06 AACATATGTT 10 OLIG2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 161083559 161083568 1.0E-06 AACATATGTT 10 OLIG2_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 161083559 161083568 1.0E-06 AACATATGTT 10 OLIG3_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 161083559 161083568 1.0E-06 AACATATGTT 10 OLIG3_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 161083559 161083568 1.0E-06 AACATATGTT 10 TAL1_TCF3_MA0091.1 JASPAR + 161083557 161083568 1.0E-06 AAAACATATGTT 12 TAL1_TCF3_MA0091.1 JASPAR - 161083559 161083570 5.0E-06 TTAACATATGTT 12 V_OCT1_01_M00135 TRANSFAC + 161083558 161083576 7.0E-06 AAACATATGTTAATCCTGT 19 V_POU3F2_02_M00464 TRANSFAC + 161083562 161083571 1.0E-06 ATATGTTAAT 10 V_SPDEF_03_M02811 TRANSFAC + 161089048 161089063 5.0E-06 AAACATCCTGATAATG 16 V_PPARG_03_M00528 TRANSFAC + 161089159 161089175 6.0E-06 AGGTAGGCCACAGGTGA 17 V_CTCF_02_M01259 TRANSFAC - 161089117 161089136 5.0E-06 TGTCGGCCACTGGATGGCAG 20 V_CTCF_01_M01200 TRANSFAC - 161089115 161089134 4.0E-06 TCGGCCACTGGATGGCAGCA 20

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.