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LMO1 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 4004 LIM domain only 1 (rhombotin 1) chr11 - 8284925 - 8295182 8285425 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the LMO1 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 4.0E-06 TTAATTAA 8 POU4F2_POU_full_monomeric_16_1 SELEX - 8290427 8290442 0.0E+00 TTGAATAATTGATTCA 16 LBX2_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290373 8290385 3.0E-06 ATTGATTTAATTA 13 CTCF_MA0139.1 JASPAR - 8285525 8285543 1.0E-06 AAGCCTCCAGGTGGCGCTG 19 EVX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 8285013 8285022 1.0E-05 GGTAATTAGA 10 EVX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 8290504 8290513 4.0E-06 GGTAATTAGT 10 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 4.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 8285013 8285022 1.0E-05 TCTAATTACC 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 8290371 8290380 1.0E-06 TTTAATTAAC 10 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 8290431 8290442 4.0E-06 TTGAATAATTGA 12 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 8290478 8290491 5.0E-06 AAATAAGCTAATGG 14 EVX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290504 8290513 9.0E-06 ACTAATTACC 10 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290372 8290384 0.0E+00 TTAATTAAATCAA 13 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 1.0E-06 TTGATTTAATTAA 13 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 8295069 8295080 7.0E-06 TACATCAACAAA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX + 8290425 8290437 1.0E-05 TTTGAATCAATTA 13 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 8290431 8290443 6.0E-06 ATTGAATAATTGA 13 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 8290373 8290387 5.0E-06 GAATTGATTTAATTA 15 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 8290478 8290492 1.0E-06 TAAATAAGCTAATGG 15 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 8290497 8290511 8.0E-06 CAAGGACACTAATTA 15 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 8290441 8290453 5.0E-06 AATACACAAACAT 13 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 8295071 8295083 5.0E-06 CATCAACAAATAA 13 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 8290431 8290441 9.0E-06 TGAATAATTGA 11 SRY_HMG_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 8280751 8280766 5.0E-06 AACAACATAAATTGGT 16 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 8290371 8290380 5.0E-06 TTTAATTAAC 10 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 8290504 8290513 7.0E-06 ACTAATTACC 10 HNF1B_MA0153.1 JASPAR + 8280523 8280534 1.0E-05 TCAGTAGTTAAT 12 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 8285044 8285055 9.0E-06 AGATTGCACTCA 12 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8285013 8285022 1.0E-05 TCTAATTACC 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 8290371 8290380 2.0E-06 TTTAATTAAC 10 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290372 8290384 1.0E-06 TTAATTAAATCAA 13 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 1.0E-06 TTGATTTAATTAA 13 SOX7_HMG_full_dimeric_17_2 SELEX + 8285357 8285373 5.0E-06 CTAAAATTATATTCAAA 17 Tcfap2a_TFAP_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290159 8290171 9.0E-06 AGCCCCGCGGGCA 13 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 0.0E+00 TTGATTTAATTAA 13 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290371 8290380 4.0E-06 GTTAATTAAA 10 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 8290371 8290380 7.0E-06 TTTAATTAAC 10 TBX1_TBX_DBD_dimeric_19_1 SELEX - 8295008 8295026 9.0E-06 TGGTGTTAAAATAAACCCT 19 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290371 8290380 6.0E-06 GTTAATTAAA 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 8290427 8290442 0.0E+00 TTGAATAATTGATTCA 16 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 8290373 8290383 9.0E-06 TAATTAAATCA 11 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 8290373 8290383 6.0E-06 TGATTTAATTA 11 MYBL2_MYB_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 8280622 8280632 4.0E-06 ATAGCCGTTAA 11 ONECUT1_CUT_full_monomeric_14_1 SELEX + 8290375 8290388 7.0E-06 ATTAAATCAATTCA 14 Foxc1_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 8290442 8290452 6.0E-06 ATACACAAACA 11 Foxc1_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 8295072 8295082 6.0E-06 ATCAACAAATA 11 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290504 8290513 2.0E-06 ACTAATTACC 10 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 8290372 8290384 1.0E-06 TTAATTAAATCAA 13 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 2.0E-06 TTGATTTAATTAA 13 HOXA5_MA0158.1 JASPAR + 8290503 8290510 7.0E-06 CACTAATT 8 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 8290428 8290437 4.0E-06 GAATCAATTA 10 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 8290428 8290437 8.0E-06 TAATTGATTC 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290504 8290513 5.0E-06 ACTAATTACC 10 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 Ascl2_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 8290249 8290258 6.0E-06 AGCAGCTGCC 10 ONECUT2_CUT_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 8290375 8290388 8.0E-06 ATTAAATCAATTCA 14 FOXI1_MA0042.1 JASPAR - 8290444 8290455 7.0E-06 TTATGTTTGTGT 12 NFIX_NFI_full_monomeric_9_2 SELEX + 8280577 8280585 8.0E-06 AATGCCAAT 9 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290372 8290384 2.0E-06 TTAATTAAATCAA 13 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 1.0E-06 TTGATTTAATTAA 13 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 8290373 8290383 1.0E-06 TGATTTAATTA 11 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290372 8290384 0.0E+00 TTAATTAAATCAA 13 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 1.0E-06 TTGATTTAATTAA 13 ATF4_bZIP_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8280583 8280595 4.0E-06 AGGTGATGCAATT 13 Atf4_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 8280583 8280596 3.0E-06 AAGGTGATGCAATT 14 CTCF_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX + 8285526 8285542 4.0E-06 AGCGCCACCTGGAGGCT 17 MGA_TBX_DBD_dimeric_18_2 SELEX - 8295008 8295025 7.0E-06 GGTGTTAAAATAAACCCT 18 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 8290371 8290380 2.0E-06 GTTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 8290371 8290380 1.0E-06 TTTAATTAAC 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 8290370 8290382 5.0E-06 GATTTAATTAACA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 8290373 8290385 8.0E-06 TAATTAAATCAAT 13 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 8290442 8290452 8.0E-06 ATACACAAACA 11 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 8295072 8295082 8.0E-06 ATCAACAAATA 11 SOX7_HMG_full_dimeric_16_1 SELEX + 8280751 8280766 8.0E-06 ACCAATTTATGTTGTT 16 SOX7_HMG_full_dimeric_16_1 SELEX - 8280751 8280766 2.0E-06 AACAACATAAATTGGT 16 GBX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290504 8290513 4.0E-06 ACTAATTACC 10 TFAP2A_TFAP_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290159 8290171 5.0E-06 AGCCCCGCGGGCA 13 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290371 8290380 6.0E-06 GTTAATTAAA 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290371 8290380 6.0E-06 GTTAATTAAA 10 POU1F1_POU_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 8290429 8290445 0.0E+00 GTATTGAATAATTGATT 17 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 8290373 8290383 1.0E-06 TGATTTAATTA 11 TBX15_TBX_DBD_dimeric_19_1 SELEX + 8295008 8295026 5.0E-06 AGGGTTTATTTTAACACCA 19 TBX15_TBX_DBD_dimeric_19_1 SELEX - 8295008 8295026 5.0E-06 TGGTGTTAAAATAAACCCT 19 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290372 8290384 9.0E-06 TTAATTAAATCAA 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 0.0E+00 TTGATTTAATTAA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290372 8290384 6.0E-06 TTAATTAAATCAA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 0.0E+00 TTGATTTAATTAA 13 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 8290431 8290442 3.0E-06 TTGAATAATTGA 12 FEV_MA0156.1 JASPAR - 8285461 8285468 1.0E-05 CAGGAAAT 8 TFAP2B_TFAP_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290159 8290171 9.0E-06 AGCCCCGCGGGCA 13 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 8290372 8290388 6.0E-06 TTAATTAAATCAATTCA 17 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 8290372 8290388 5.0E-06 TGAATTGATTTAATTAA 17 JDP2_bZIP_full_dimeric_9_1 SELEX + 8295060 8295068 1.0E-05 ATGAGTCAC 9 DUXA_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8290372 8290384 4.0E-06 TTAATTAAATCAA 13 DUXA_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 8290372 8290384 1.0E-06 TTGATTTAATTAA 13 SPDEF_ETS_full_putative-multimer_16_1 SELEX + 8294967 8294982 8.0E-06 TGAAAAAAAAGTATCA 16 SOX21_HMG_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 8280751 8280766 4.0E-06 ACCAATTTATGTTGTT 16 MEOX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 8290504 8290513 2.0E-06 ACTAATTACC 10 MYBL1_MYB_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 8280622 8280632 7.0E-06 ATAGCCGTTAA 11 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 8290373 8290383 1.0E-06 TGATTTAATTA 11 ETV6_ETS_full_dimeric_15_1 SELEX + 8280925 8280939 6.0E-06 CAGGAAGGGGAAGCG 15 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 8290478 8290491 5.0E-06 AAATAAGCTAATGG 14 EMX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 8290504 8290513 9.0E-06 GGTAATTAGT 10 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 8290371 8290381 9.0E-06 GTTAATTAAAT 11 Sox2_MA0143.1 JASPAR - 8294993 8295007 9.0E-06 CCTTTGTCATGGTGT 15 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 8290371 8290380 3.0E-06 GTTAATTAAA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 8295070 8295082 4.0E-06 ACATCAACAAATA 13 NFE2L2_MA0150.1 JASPAR + 8295032 8295042 2.0E-06 ATGATTCAGCA 11 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 8290429 8290442 0.0E+00 TTGAATAATTGATT 14 RREB1_MA0073.1 JASPAR - 8280856 8280875 2.0E-06 CAACCCCACACACACACCCG 20 RREB1_MA0073.1 JASPAR - 8280860 8280879 4.0E-06 CCCCCAACCCCACACACACA 20 RREB1_MA0073.1 JASPAR - 8280864 8280883 6.0E-06 CCGCCCCCCAACCCCACACA 20 Irx3_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 8294962 8294973 1.0E-06 TGACATGAAAAA 12 PAX7_PAX_full_dimeric_10_1 SELEX + 8290428 8290437 5.0E-06 GAATCAATTA 10 PAX7_PAX_full_dimeric_10_1 SELEX - 8290428 8290437 8.0E-06 TAATTGATTC 10 ONECUT3_CUT_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 8290375 8290388 6.0E-06 ATTAAATCAATTCA 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 4.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 8290372 8290379 9.0E-06 TTAATTAA 8 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 8290434 8290453 6.0E-06 ATGTTTGTGTATTGAATAAT 20 V_AP1_Q2_M00173 TRANSFAC - 8295059 8295069 4.0E-06 AGTGACTCATA 11 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 8290369 8290385 4.0E-06 ATTGATTTAATTAACAG 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 8290370 8290386 4.0E-06 TGTTAATTAAATCAATT 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC - 8290449 8290464 4.0E-06 CCCAAGCAATTATGTT 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 8290428 8290444 2.0E-06 GAATCAATTATTCAATA 17 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC + 8290441 8290456 1.0E-06 AATACACAAACATAAT 16 V_GAF_Q6_M01209 TRANSFAC + 8290360 8290370 5.0E-06 CAGATTCCCCT 11 V_FOXP3_Q4_M00992 TRANSFAC - 8294964 8294980 1.0E-06 ATACTTTTTTTTCATGT 17 V_AML_Q6_M00769 TRANSFAC - 8295019 8295033 1.0E-05 ATGTTTGTGGTGTTA 15 V_FLI1_Q6_M01208 TRANSFAC + 8280955 8280965 3.0E-06 CAGGATGTGAT 11 V_TBX15_01_M01263 TRANSFAC + 8295008 8295026 9.0E-06 AGGGTTTATTTTAACACCA 19 V_TBX15_01_M01263 TRANSFAC - 8295008 8295026 9.0E-06 TGGTGTTAAAATAAACCCT 19 V_OSF2_Q6_M00731 TRANSFAC + 8295023 8295030 1.0E-05 ACCACAAA 8 V_DMRT3_01_M01148 TRANSFAC - 8294972 8294986 0.0E+00 CTTTTGATACTTTTT 15 V_ZFX_01_M01593 TRANSFAC + 8290261 8290276 5.0E-06 GGCCGGGCCGCAGCCG 16 V_SOX30_03_M02804 TRANSFAC - 8290428 8290443 2.0E-06 ATTGAATAATTGATTC 16 V_EVI1_04_M00081 TRANSFAC + 8294962 8294976 3.0E-06 TGACATGAAAAAAAA 15 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC - 8280632 8280647 9.0E-06 TGATTTGGATTGCTTT 16 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC - 8294969 8294984 3.0E-06 TTTGATACTTTTTTTT 16 V_MMEF2_Q6_M00405 TRANSFAC - 8295010 8295025 2.0E-06 GGTGTTAAAATAAACC 16 V_HOXA13_02_M01297 TRANSFAC - 8295010 8295018 3.0E-06 AAATAAACC 9 V_SATB1_Q3_M01723 TRANSFAC - 8290530 8290545 7.0E-06 AGAATTAATGAGAAAA 16 V_SATB1_Q3_M01723 TRANSFAC + 8295076 8295091 9.0E-06 ACAAATAAAGGAACAA 16 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 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