Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

AQP7 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 364 aquaporin 7 chr9 - 33402017 - 33407517 33402517 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the AQP7 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints NFE2_bZIP_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 33399321 33399331 8.0E-06 GGTGACTCATG 11 NFE2_bZIP_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 33399321 33399331 6.0E-06 CATGAGTCACC 11 NKX2-8_homeodomain_full_monomeric_9_1 SELEX + 33402603 33402611 3.0E-06 CCACTTGAA 9 CTCF_MA0139.1 JASPAR + 33403526 33403544 3.0E-06 TGTCCTGTAGAGGGTGCCA 19 FOXJ2_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 33406603 33406610 5.0E-06 ATAAACAA 8 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 33399208 33399217 4.0E-06 ATAATTAAAT 10 NFIA_NFI_full_dimeric_15_1 SELEX - 33405885 33405899 1.0E-05 GTGGCAGTGAGCCAA 15 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 33399209 33399218 8.0E-06 TTTAATTATC 10 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 33399211 33399224 1.0E-06 TAATTATCTAATCA 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 33399211 33399224 0.0E+00 TGATTAGATAATTA 14 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 33399205 33399217 7.0E-06 ATAATTAAATGAG 13 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 33399210 33399217 4.0E-06 ATAATTAA 8 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 33399293 33399305 4.0E-06 ATTCAACAAACAT 13 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 33406602 33406614 2.0E-06 TATAAACAAGCAA 13 NFIX_NFI_full_dimeric_15_2 SELEX + 33405885 33405899 9.0E-06 TTGGCTCACTGCCAC 15 GATA5_GATA_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 33401894 33401901 7.0E-06 AGATAAGA 8 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 33399205 33399217 4.0E-06 CTCATTTAATTAT 13 GATA4_GATA_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 33401894 33401901 7.0E-06 AGATAAGA 8 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 33399297 33399310 8.0E-06 AACAAACATTGGTT 14 RORA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_19_1 SELEX - 33399269 33399287 6.0E-06 AATGTTGGTTAGCAGGTTG 19 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 33399209 33399218 5.0E-06 GATAATTAAA 10 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX - 33399209 33399218 8.0E-06 GATAATTAAA 10 RUNX2_RUNX_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 33406542 33406550 8.0E-06 AAACCACAA 9 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 33399210 33399225 1.0E-06 TTAATTATCTAATCAA 16 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 33399210 33399225 0.0E+00 TTGATTAGATAATTAA 16 Foxc1_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 33406603 33406613 7.0E-06 ATAAACAAGCA 11 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 33399209 33399218 7.0E-06 GATAATTAAA 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 33399209 33399218 2.0E-06 GATAATTAAA 10 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 33399210 33399217 9.0E-06 ATAATTAA 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 33399210 33399217 9.0E-06 TTAATTAT 8 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 33399210 33399217 9.0E-06 ATAATTAA 8 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 33399294 33399304 9.0E-06 TTCAACAAACA 11 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 33406603 33406613 1.0E-05 ATAAACAAGCA 11 Gata1_MA0035.2 JASPAR - 33401893 33401903 7.0E-06 GGAGATAAGAG 11 GATA3_GATA_full_monomeric_8_1 SELEX - 33401894 33401901 7.0E-06 AGATAAGA 8 ZNF143_C2H2_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 33403424 33403439 7.0E-06 TACCCACCGTCCACCA 16 NKX2-3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 33402602 33402611 9.0E-06 GCCACTTGAA 10 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 33399206 33399216 4.0E-06 TCATTTAATTA 11 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 33399205 33399217 6.0E-06 CTCATTTAATTAT 13 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 33406575 33406586 9.0E-06 TTATGCAAAGGA 12 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 33399205 33399217 3.0E-06 CTCATTTAATTAT 13 EN1_homeodomain_full_dimeric_14_1 SELEX - 33399211 33399224 0.0E+00 TGATTAGATAATTA 14 JDP2_bZIP_full_dimeric_9_1 SELEX - 33399322 33399330 1.0E-05 ATGAGTCAC 9 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 33399206 33399216 8.0E-06 TCATTTAATTA 11 GBX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 33399211 33399224 8.0E-06 TGATTAGATAATTA 14 RUNX1_MA0002.2 JASPAR + 33406540 33406550 8.0E-06 ACTTGTGGTTT 11 Foxj3_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 33406603 33406610 5.0E-06 ATAAACAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 33399211 33399224 1.0E-06 TAATTATCTAATCA 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 33399211 33399224 0.0E+00 TGATTAGATAATTA 14 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 33399208 33399218 6.0E-06 GATAATTAAAT 11 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 33399209 33399218 3.0E-06 GATAATTAAA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 33399292 33399304 2.0E-06 AATTCAACAAACA 13 DLX5_homeodomain_FL_monomeric_8_1 SELEX - 33399210 33399217 8.0E-06 ATAATTAA 8 V_STAT3_01_M00225 TRANSFAC - 33405900 33405920 9.0E-06 ACTCGAATCCGGGAAGTGGAG 21 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 33399207 33399223 9.0E-06 GATTAGATAATTAAATG 17 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC + 33406598 33406613 4.0E-06 ATGGTATAAACAAGCA 16 V_AML_Q6_M00769 TRANSFAC + 33406538 33406552 1.0E-05 ACACTTGTGGTTTTT 15 V_EVI1_05_M00082 TRANSFAC - 33399214 33399224 5.0E-06 TGATTAGATAA 11 V_DUXL_01_M01390 TRANSFAC + 33399214 33399230 3.0E-06 TTATCTAATCAACCAGC 17 V_BACH2_01_M00490 TRANSFAC - 33399321 33399331 2.0E-06 CATGAGTCACC 11 V_GATA2_02_M00348 TRANSFAC - 33401894 33401903 5.0E-06 GGAGATAAGA 10 V_CEBP_Q3_M00770 TRANSFAC - 33406578 33406589 8.0E-06 GAGTTATGCAAA 12 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 33403614 33403629 6.0E-06 TTTTCTGCAGATCTTT 16 V_AML3_Q6_M01856 TRANSFAC - 33406542 33406549 1.0E-05 AACCACAA 8 V_ZTA_Q2_M00711 TRANSFAC - 33405834 33405846 3.0E-06 AAACTCTGGCTCA 13 V_CEBP_C_M00201 TRANSFAC + 33404833 33404850 3.0E-06 GGAGTGAGGCAAGGGCCA 18 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 33399206 33399222 5.0E-06 ATTAGATAATTAAATGA 17 V_FOXO3A_Q1_M01137 TRANSFAC + 33406602 33406613 4.0E-06 TATAAACAAGCA 12 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC + 33399206 33399222 9.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 33399206 33399222 5.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_GABPA_04_M02858 TRANSFAC - 33404859 33404874 4.0E-06 CCTTCTTCCCCAGAAT 16 V_P50RELAP65_Q5_01_M01224 TRANSFAC - 33403444 33403455 7.0E-06 GGAAGTTCCCAG 12 V_HOXA2_01_M01402 TRANSFAC + 33399207 33399222 9.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_OCT_C_M00210 TRANSFAC + 33406574 33406586 2.0E-06 ATCCTTTGCATAA 13 V_DLX2_01_M01468 TRANSFAC + 33399207 33399222 3.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 33399205 33399221 8.0E-06 CTCATTTAATTATCTAA 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 33399205 33399221 7.0E-06 TTAGATAATTAAATGAG 17 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 33399208 33399217 1.0E-06 ATTTAATTAT 10 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC + 33399206 33399222 6.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_FOXP3_01_M01599 TRANSFAC + 33406603 33406610 5.0E-06 ATAAACAA 8 V_CEBPB_01_M00109 TRANSFAC - 33399283 33399296 0.0E+00 GAATTAAGAAATGT 14 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 33399206 33399222 4.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_BARBIE_01_M00238 TRANSFAC - 33403605 33403619 1.0E-06 AGAAAAAGCTGGAAG 15 V_BACH1_01_M00495 TRANSFAC - 33399319 33399333 4.0E-06 GGCATGAGTCACCAT 15 V_HOXA6_01_M01392 TRANSFAC + 33399207 33399222 2.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_POU3F2_01_M00463 TRANSFAC + 33399204 33399217 1.0E-05 ACTCATTTAATTAT 14 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 33399205 33399220 5.0E-06 CTCATTTAATTATCTA 16 V_CEBPE_Q6_M01868 TRANSFAC + 33399281 33399294 2.0E-06 CAACATTTCTTAAT 14 V_FKLF_Q5_M01837 TRANSFAC - 33403596 33403605 2.0E-06 GGGGTGGGAG 10 V_HNF3G_Q4_M02015 TRANSFAC - 33399297 33399304 7.0E-06 TGTTTGTT 8 V_RUNX1_01_M02257 TRANSFAC + 33406540 33406550 8.0E-06 ACTTGTGGTTT 11 V_STAF_01_M00262 TRANSFAC - 33403420 33403441 0.0E+00 CTTACCCACCGTCCACCACGCC 22 V_IRF2_01_M00063 TRANSFAC - 33405842 33405854 1.0E-05 CAACAGCGAAACT 13 V_AML2_01_M01759 TRANSFAC - 33406542 33406549 1.0E-05 AACCACAA 8 V_CEBPD_Q6_M00621 TRANSFAC + 33399284 33399295 2.0E-06 CATTTCTTAATT 12 V_HOXA1_01_M01487 TRANSFAC - 33399207 33399222 5.0E-06 ATTAGATAATTAAATG 16 V_CDX2_01_M01449 TRANSFAC - 33399206 33399221 8.0E-06 TTAGATAATTAAATGA 16 V_MAZ_Q6_01_M02023 TRANSFAC + 33403469 33403482 4.0E-06 ATGGGTGGGAAGGG 14 V_HNF3_Q6_M00791 TRANSFAC + 33399294 33399306 6.0E-06 TTCAACAAACATT 13 V_OCT1_05_M00161 TRANSFAC + 33406574 33406587 2.0E-06 ATCCTTTGCATAAC 14 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC + 33399206 33399222 7.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_GSH2_01_M01326 TRANSFAC - 33399205 33399220 1.0E-05 TAGATAATTAAATGAG 16 V_GSH2_01_M01326 TRANSFAC + 33399207 33399222 4.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_NKX25_Q5_M01043 TRANSFAC + 33402601 33402610 3.0E-06 TGCCACTTGA 10 V_JUNDM2_04_M02876 TRANSFAC - 33399319 33399334 3.0E-06 AGGCATGAGTCACCAT 16 V_DUXBL_01_M02968 TRANSFAC + 33399214 33399230 3.0E-06 TTATCTAATCAACCAGC 17 V_CDX1_01_M01373 TRANSFAC - 33399206 33399221 1.0E-06 TTAGATAATTAAATGA 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 33399205 33399220 8.0E-06 CTCATTTAATTATCTA 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 33399207 33399222 1.0E-06 ATTAGATAATTAAATG 16 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 33399207 33399223 9.0E-06 GATTAGATAATTAAATG 17 V_PEBP_Q6_M00984 TRANSFAC - 33406538 33406552 9.0E-06 AAAAACCACAAGTGT 15 V_GATA1_09_M02254 TRANSFAC - 33401893 33401903 7.0E-06 GGAGATAAGAG 11 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 33399204 33399220 8.0E-06 TAGATAATTAAATGAGT 17 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC + 33399204 33399218 7.0E-06 ACTCATTTAATTATC 15 V_AP1_01_M00517 TRANSFAC - 33399320 33399332 3.0E-06 GCATGAGTCACCA 13 V_CTCF_02_M01259 TRANSFAC + 33403523 33403542 9.0E-06 AACTGTCCTGTAGAGGGTGC 20 V_ATF1_04_M02842 TRANSFAC + 33404873 33404886 1.0E-06 GGATGACGAAGAAG 14 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC + 33399208 33399217 2.0E-06 ATTTAATTAT 10 V_CTCF_01_M01200 TRANSFAC + 33403525 33403544 8.0E-06 CTGTCCTGTAGAGGGTGCCA 20 V_OCT1_B_M00342 TRANSFAC - 33406576 33406585 9.0E-06 TATGCAAAGG 10 V_OCT_Q6_M00795 TRANSFAC + 33406575 33406585 8.0E-06 TCCTTTGCATA 11 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 33399206 33399222 9.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_PTF1BETA_Q6_M00657 TRANSFAC - 33406541 33406554 4.0E-06 GGAAAAACCACAAG 14 V_S8_01_M00099 TRANSFAC + 33399205 33399220 8.0E-06 CTCATTTAATTATCTA 16 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 33399204 33399220 1.0E-05 ACTCATTTAATTATCTA 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 33399207 33399223 7.0E-06 GATTAGATAATTAAATG 17 V_SIRT6_01_M01797 TRANSFAC - 33401894 33401901 7.0E-06 AGATAAGA 8 V_OCT1_Q6_M00195 TRANSFAC - 33406574 33406588 1.0E-05 AGTTATGCAAAGGAT 15 V_GATA3_02_M00350 TRANSFAC - 33401894 33401903 5.0E-06 GGAGATAAGA 10 V_CPHX_01_M01478 TRANSFAC + 33399213 33399226 1.0E-05 ATTATCTAATCAAC 14 V_FOX_Q2_M00809 TRANSFAC - 33399295 33399307 5.0E-06 CAATGTTTGTTGA 13 V_BBX_03_M02739 TRANSFAC + 33399202 33399216 6.0E-06 TAACTCATTTAATTA 15 V_BBX_03_M02739 TRANSFAC - 33399202 33399216 5.0E-06 TAATTAAATGAGTTA 15 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC - 33399206 33399222 3.0E-06 ATTAGATAATTAAATGA 17 V_VAX1_01_M01397 TRANSFAC + 33399207 33399222 7.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_FOXJ2_01_M00422 TRANSFAC + 33399292 33399309 2.0E-06 AATTCAACAAACATTGGT 18 V_NFE2_Q6_M02104 TRANSFAC - 33399316 33399331 7.0E-06 CATGAGTCACCATGCC 16 V_COREBINDINGFACTOR_Q6_M00722 TRANSFAC + 33406543 33406550 1.0E-05 TGTGGTTT 8 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC - 33399204 33399220 4.0E-06 TAGATAATTAAATGAGT 17 V_HOXB3_01_M01330 TRANSFAC + 33399206 33399222 1.0E-05 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_FOXO1_01_M00473 TRANSFAC + 33406602 33406611 5.0E-06 TATAAACAAG 10 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC - 33399205 33399221 4.0E-06 TTAGATAATTAAATGAG 17 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC + 33399206 33399222 3.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_MOX1_01_M01443 TRANSFAC - 33399205 33399220 4.0E-06 TAGATAATTAAATGAG 16 V_MOX1_01_M01443 TRANSFAC + 33399207 33399222 2.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_BSX_01_M01442 TRANSFAC - 33399205 33399220 8.0E-06 TAGATAATTAAATGAG 16 V_BSX_01_M01442 TRANSFAC + 33399207 33399222 1.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_PIT1_Q6_M00802 TRANSFAC + 33399285 33399302 1.0E-06 ATTTCTTAATTCAACAAA 18 V_CTF1_01_M01196 TRANSFAC - 33405885 33405898 0.0E+00 TGGCAGTGAGCCAA 14 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC - 33399207 33399222 4.0E-06 ATTAGATAATTAAATG 16 V_FOXO4_01_M00472 TRANSFAC + 33406603 33406613 1.0E-06 ATAAACAAGCA 11 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 33399205 33399221 5.0E-06 TTAGATAATTAAATGAG 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC + 33399206 33399222 5.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 V_CEBP_Q2_01_M00912 TRANSFAC + 33406578 33406589 9.0E-06 TTTGCATAACTC 12 V_HOXA10_01_M01464 TRANSFAC - 33399205 33399220 2.0E-06 TAGATAATTAAATGAG 16 V_P300_01_M00033 TRANSFAC + 33404829 33404842 4.0E-06 ACAGGGAGTGAGGC 14 V_DLX1_01_M01439 TRANSFAC - 33399209 33399222 7.0E-06 ATTAGATAATTAAA 14 V_HOXD10_01_M01375 TRANSFAC - 33399204 33399220 5.0E-06 TAGATAATTAAATGAGT 17 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC - 33399205 33399221 4.0E-06 TTAGATAATTAAATGAG 17 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC + 33399206 33399222 3.0E-06 TCATTTAATTATCTAAT 17 TLX1_NFIC_MA0119.1 JASPAR - 33405885 33405898 0.0E+00 TGGCAGTGAGCCAA 14 V_EVI1_03_M00080 TRANSFAC - 33399214 33399224 1.0E-06 TGATTAGATAA 11 V_HOXB5_01_M01319 TRANSFAC + 33399207 33399222 1.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_HOX13_02_M01452 TRANSFAC + 33399207 33399222 7.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16 V_HOXC9_01_M01416 TRANSFAC - 33399206 33399221 5.0E-06 TTAGATAATTAAATGA 16 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC - 33399207 33399222 7.0E-06 ATTAGATAATTAAATG 16 V_IPF1_06_M01438 TRANSFAC + 33399207 33399222 5.0E-06 CATTTAATTATCTAAT 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.