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IGJ Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 3512 immunoglobulin J polypeptide, linker protein for immunoglobulin alpha and mu polypeptides chr4 - 71531848 - 71537348 71532348 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the IGJ promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 4.0E-06 TTAATTAA 8 FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 71536923 71536940 7.0E-06 GTAATAAATATTAACCTG 18 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 71536925 71536937 9.0E-06 ATAAATATTAACC 13 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 71536154 71536163 6.0E-06 ATAATTAAAA 10 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX - 71536931 71536940 5.0E-06 GTAATAAATA 10 EVX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71533731 71533740 1.0E-05 GGTAATTAGG 10 FOXJ2_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71536211 71536218 5.0E-06 ATAAACAA 8 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 71536154 71536171 1.0E-05 ATAATTAAAAAGTAACTT 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 71536982 71536999 2.0E-06 GTACTTACATAACACTTA 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 4.0E-06 TTAATTAA 8 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71536154 71536163 3.0E-06 ATAATTAAAA 10 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 71536931 71536940 9.0E-06 GTAATAAATA 10 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 71536153 71536162 6.0E-06 TATAATTAAA 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 71536153 71536162 2.0E-06 TTTAATTATA 10 EN2_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 71533731 71533740 1.0E-05 CCTAATTACC 10 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 71536982 71536998 2.0E-06 TACTTACATAACACTTA 17 SOX21_HMG_DBD_dimeric_13_2 SELEX - 71532394 71532406 7.0E-06 TAAATGTGAGTCA 13 MEF2D_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 71536151 71536162 4.0E-06 TCTATAATTAAA 12 SRY_HMG_DBD_dimeric_13_2 SELEX + 71532394 71532406 6.0E-06 TGACTCACATTTA 13 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 71533732 71533749 7.0E-06 GTAATTAGGAGTACTTCA 18 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 71536854 71536871 4.0E-06 GAAATTAAGAGAGATTAA 18 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71536154 71536161 4.0E-06 ATAATTAA 8 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 71533540 71533554 9.0E-06 AAATGACATTAATTA 15 TEF_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 71536986 71536997 5.0E-06 ACTTACATAACA 12 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 SOX9_HMG_full_dimeric_17_3 SELEX - 71532392 71532408 7.0E-06 CTTAAATGTGAGTCATA 17 SRY_HMG_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 71532338 71532353 9.0E-06 AACAATCACAACTGTG 16 HLF_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX - 71536986 71536997 3.0E-06 ACTTACATAACA 12 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71536153 71536162 6.0E-06 TATAATTAAA 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 71536153 71536162 4.0E-06 TTTAATTATA 10 NFIL3_MA0025.1 JASPAR + 71536988 71536998 5.0E-06 TTATGTAAGTA 11 SOX7_HMG_full_dimeric_17_2 SELEX - 71532392 71532408 5.0E-06 CTTAAATGTGAGTCATA 17 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 MEF2A_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 71536151 71536162 3.0E-06 TCTATAATTAAA 12 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 DBP_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX + 71536986 71536997 9.0E-06 TGTTATGTAAGT 12 DBP_bZIP_full_dimeric_12_1 SELEX - 71536986 71536997 7.0E-06 ACTTACATAACA 12 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 71533534 71533546 6.0E-06 TTCACTTAATTAA 13 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 71536925 71536938 0.0E+00 GGTTAATATTTATT 14 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 71536925 71536938 1.0E-06 AATAAATATTAACC 14 Pax4_MA0068.1 JASPAR - 71536985 71537014 3.0E-06 AATAATAAGTAACTAGTACTTACATAACAC 30 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 71533538 71533547 3.0E-06 ATTAATTAAG 10 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 71537021 71537034 1.0E-06 GTCGTCATCATTAT 14 BARHL2_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX - 71533540 71533555 5.0E-06 AAAATGACATTAATTA 16 BARHL2_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX + 71536855 71536870 4.0E-06 TAATCTCTCTTAATTT 16 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 71533538 71533547 2.0E-06 ATTAATTAAG 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71536153 71536162 5.0E-06 TATAATTAAA 10 Barhl1_homeodomain_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 71533540 71533555 7.0E-06 AAAATGACATTAATTA 16 Barhl1_homeodomain_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 71536855 71536870 3.0E-06 TAATCTCTCTTAATTT 16 REL_MA0101.1 JASPAR + 71533608 71533617 6.0E-06 TGGAATTTCC 10 FOXD3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 71536925 71536938 0.0E+00 GGTTAATATTTATT 14 FOXD3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 71536925 71536938 5.0E-06 AATAAATATTAACC 14 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 71533724 71533739 1.0E-06 TTTAAGAGGTAATTAG 16 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 71533724 71533739 2.0E-06 CTAATTACCTCTTAAA 16 Sox17_HMG_DBD_dimeric_15_2 SELEX + 71532393 71532407 5.0E-06 ATGACTCACATTTAA 15 Sox17_HMG_DBD_dimeric_15_2 SELEX - 71532393 71532407 5.0E-06 TTAAATGTGAGTCAT 15 SOX2_HMG_full_dimeric_15_1 SELEX + 71532393 71532407 9.0E-06 ATGACTCACATTTAA 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 71536156 71536170 1.0E-06 AATTAAAAAGTAACT 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 71536925 71536939 5.0E-06 TAATAAATATTAACC 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 71537001 71537015 4.0E-06 TAATAATAAGTAACT 15 RELA_MA0107.1 JASPAR + 71533608 71533617 3.0E-06 TGGAATTTCC 10 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71536153 71536162 5.0E-06 TATAATTAAA 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 71536925 71536938 0.0E+00 GGTTAATATTTATT 14 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 71536925 71536938 1.0E-06 AATAAATATTAACC 14 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71536154 71536161 9.0E-06 ATAATTAA 8 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 71533538 71533547 9.0E-06 ATTAATTAAG 10 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71536154 71536161 9.0E-06 TTAATTAT 8 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 71533538 71533547 5.0E-06 ATTAATTAAG 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 71536153 71536162 6.0E-06 TATAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 71536153 71536162 1.0E-05 TTTAATTATA 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71536154 71536161 9.0E-06 ATAATTAA 8 SOX7_HMG_full_dimeric_16_1 SELEX - 71532338 71532353 4.0E-06 CACAGTTGTGATTGTT 16 NFIL3_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 71536986 71536997 2.0E-06 ACTTACATAACA 12 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71536153 71536162 5.0E-06 TATAATTAAA 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 71536982 71536999 4.0E-06 GTACTTACATAACACTTA 18 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 71536157 71536169 8.0E-06 GTTACTTTTTAAT 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 71533534 71533546 7.0E-06 TTCACTTAATTAA 13 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 71533725 71533739 3.0E-06 TTAAGAGGTAATTAG 15 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 71536999 71537013 4.0E-06 ATAATAAGTAACTAG 15 LHX9_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 71533726 71533738 3.0E-06 TAATTACCTCTTA 13 LHX9_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 71536993 71537005 5.0E-06 TAAGTACTAGTTA 13 LHX9_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 71537000 71537012 3.0E-06 TAGTTACTTATTA 13 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 71533538 71533547 8.0E-06 ATTAATTAAG 10 PRDM1_C2H2_full_monomeric-or-dimeric_15_1 SELEX - 71536166 71536180 2.0E-06 GGAAAGGAAAAGTTA 15 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 71536925 71536938 1.0E-06 GGTTAATATTTATT 14 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 71536925 71536938 1.0E-06 AATAAATATTAACC 14 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71536153 71536162 9.0E-06 TATAATTAAA 10 FEV_MA0156.1 JASPAR - 71533612 71533619 1.0E-05 CAGGAAAT 8 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 71533539 71533555 2.0E-06 TTAATTAATGTCATTTT 17 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 71533539 71533555 1.0E-06 AAAATGACATTAATTAA 17 JDP2_bZIP_full_dimeric_9_1 SELEX + 71532393 71532401 7.0E-06 ATGACTCAC 9 TBX21_TBX_full_dimeric_19_1 SELEX + 71536972 71536990 5.0E-06 TGGCACACAATAAGTGTTA 19 SOX18_HMG_full_dimeric_15_3 SELEX - 71532393 71532407 9.0E-06 TTAAATGTGAGTCAT 15 SOX18_HMG_full_dimeric_15_3 SELEX - 71533542 71533556 7.0E-06 AAAAATGACATTAAT 15 HLF_MA0043.1 JASPAR + 71533653 71533664 7.0E-06 GGTTACACAACA 12 Sox3_HMG_DBD_dimeric_17_3 SELEX - 71532392 71532408 1.0E-05 CTTAAATGTGAGTCATA 17 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71533538 71533547 8.0E-06 CTTAATTAAT 10 SPI1_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX - 71532291 71532304 1.0E-05 AGAAAGCAGAAGCA 14 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 Foxj3_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71536211 71536218 5.0E-06 ATAAACAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 71533536 71533549 9.0E-06 CACTTAATTAATGT 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 71533536 71533549 1.0E-05 ACATTAATTAAGTG 14 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 71536156 71536170 1.0E-06 AATTAAAAAGTAACT 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 71536925 71536939 6.0E-06 TAATAAATATTAACC 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 71537001 71537015 6.0E-06 TAATAATAAGTAACT 15 Sox3_HMG_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 71533541 71533557 9.0E-06 AATTAATGTCATTTTTT 17 Sox3_HMG_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 71533541 71533557 6.0E-06 AAAAAATGACATTAATT 17 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 71536154 71536171 5.0E-06 ATAATTAAAAAGTAACTT 18 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 71536982 71536999 5.0E-06 GTACTTACATAACACTTA 18 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 71536153 71536162 3.0E-06 TATAATTAAA 10 Sox1_HMG_DBD_dimeric_15_2 SELEX + 71532393 71532407 7.0E-06 ATGACTCACATTTAA 15 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 71536153 71536163 9.0E-06 TATAATTAAAA 11 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 71536931 71536941 5.0E-06 TGTAATAAATA 11 Irx3_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 71533515 71533526 8.0E-06 TTACACAAAATA 12 HNF1A_MA0046.1 JASPAR - 71536157 71536170 2.0E-06 AGTTACTTTTTAAT 14 HNF1A_MA0046.1 JASPAR + 71536925 71536938 0.0E+00 GGTTAATATTTATT 14 HNF1A_MA0046.1 JASPAR + 71537001 71537014 3.0E-06 AGTTACTTATTATT 14 DLX5_homeodomain_FL_monomeric_8_1 SELEX + 71536154 71536161 8.0E-06 ATAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 4.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 71533539 71533546 9.0E-06 TTAATTAA 8 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 71532335 71532348 4.0E-06 AAAAACAATCACAA 14 IRX5_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 71536984 71536995 7.0E-06 TTACATAACACT 12 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC - 71536927 71536943 3.0E-06 GATGTAATAAATATTAA 17 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 71533540 71533559 6.0E-06 TAATTAATGTCATTTTTTTT 20 V_NFKAPPAB65_01_M00052 TRANSFAC + 71533608 71533617 1.0E-06 TGGAATTTCC 10 V_AP1_Q2_M00173 TRANSFAC + 71536220 71536230 3.0E-06 AATGACTAAGT 11 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 71533536 71533552 1.0E-06 ATGACATTAATTAAGTG 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 71533537 71533553 5.0E-06 ACTTAATTAATGTCATT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 71533529 71533545 6.0E-06 TAATTAAGTGAAAAAAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 71536151 71536167 7.0E-06 TCTATAATTAAAAAGTA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 71536927 71536943 1.0E-05 TTAATATTTATTACATC 17 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC + 71536206 71536221 4.0E-06 AGATCATAAACAAGAA 16 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC - 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