Search TFs
or Genes
Construction
and Validation
Optimal
Promoter Size
Download Citation and
Contact

ZNF677


EntrezDescriptionChrom.StrandPromoter
(Start - Stop)
TSS
342926 zinc finger protein 677 chr19 -53757611 - 53763111 53758111

Transcription Factor Binding Sites

 
Download all TFBS in the ZNF677 promoter
 
MotifSourceStrandStartStop PValueMatch
Sequence
Overlap w/
Footprints
Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 4.0E-06 TTAATTAA 8
Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 4.0E-06 TTAATTAA 8
GABPA_MA0062.2 JASPAR - 53758113 53758123 7.0E-06 CCGGAAGCGGA 11
MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 53758615 53758632 0.0E+00 TTAATTAAATACAAATTT 18
LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 4.0E-06 TTAATTAA 8
LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 4.0E-06 TTAATTAA 8
ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 53758624 53758633 6.0E-06 TTTAATTAAG 10
ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 53758624 53758633 4.0E-06 CTTAATTAAA 10
BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 53758615 53758631 0.0E+00 TAATTAAATACAAATTT 17
YY2_C2H2_full_dimeric_12_1 SELEX - 53758241 53758252 6.0E-06 CCATCCCGCCAT 12
YY2_C2H2_full_dimeric_12_1 SELEX - 53758262 53758273 6.0E-06 CCATCCCGCCAT 12
Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 53758624 53758633 4.0E-06 TTTAATTAAG 10
Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 53758624 53758633 3.0E-06 CTTAATTAAA 10
NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 53758620 53758632 6.0E-06 TGTATTTAATTAA 13
HOMEZ_HOMEZ_DBD_monomer-or-dimer_12_1 SELEX + 53757886 53757897 5.0E-06 AGAACGATTTTA 12
SRF_MA0083.1 JASPAR - 53758441 53758452 8.0E-06 TCCAATATAAGG 12
LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
OTX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53757895 53757902 1.0E-05 TTAATCCG 8
SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 53758267 53758283 2.0E-06 TAGGCCCCGCCCATCCC 17
MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 53758624 53758633 3.0E-06 TTTAATTAAG 10
MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 53758624 53758633 2.0E-06 CTTAATTAAA 10
Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 53758624 53758633 4.0E-06 CTTAATTAAA 10
Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 53758615 53758632 0.0E+00 TTAATTAAATACAAATTT 18
Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 53758620 53758632 7.0E-06 TGTATTTAATTAA 13
GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 53758624 53758633 4.0E-06 CTTAATTAAA 10
RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 53758614 53758631 9.0E-06 AAAATTTGTATTTAATTA 18
MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 53758615 53758632 0.0E+00 TTAATTAAATACAAATTT 18
RORA_2_MA0072.1 JASPAR - 53757847 53757860 1.0E-05 TTGCTTTAGGTCAG 14
Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 4.0E-06 TTAATTAA 8
Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 4.0E-06 TTAATTAA 8
Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 53758625 53758632 9.0E-06 TTAATTAA 8
V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 53758618 53758634 7.0E-06 GCTTAATTAAATACAAA 17
V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 53758619 53758635 4.0E-06 TTGTATTTAATTAAGCG 17
V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 53758615 53758631 2.0E-06 TAATTAAATACAAATTT 17
V_APOLYA_B_M00310 TRANSFAC - 53758615 53758629 3.0E-06 ATTAAATACAAATTT 15
V_SOX40_04_M02908 TRANSFAC + 53757888 53757903 9.0E-06 AACGATTTTAATCCGA 16
V_GABP_B_M00341 TRANSFAC - 53758113 53758124 8.0E-06 CCCGGAAGCGGA 12
V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 53758621 53758637 7.0E-06 GTATTTAATTAAGCGAA 17
V_HNF3_Q6_01_M01012 TRANSFAC - 53758410 53758427 8.0E-06 CTAATTTTTTACTTAGCT 18
V_GKLF_02_M01588 TRANSFAC - 53758269 53758280 3.0E-06 GCCCCGCCCATC 12
V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 53758620 53758636 1.0E-05 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 53758620 53758636 3.0E-06 TGTATTTAATTAAGCGA 17
V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 53758620 53758636 5.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 53758623 53758632 0.0E+00 ATTTAATTAA 10
V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC - 53758620 53758635 9.0E-06 CGCTTAATTAAATACA 16
V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC + 53758622 53758637 7.0E-06 TATTTAATTAAGCGAA 16
V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC + 53758621 53758637 7.0E-06 GTATTTAATTAAGCGAA 17
V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 53758620 53758636 6.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 53758621 53758637 4.0E-06 GTATTTAATTAAGCGAA 17
V_GC_01_M00255 TRANSFAC + 53758269 53758282 7.0E-06 GATGGGCGGGGCCT 14
V_POU3F2_01_M00463 TRANSFAC - 53758611 53758624 8.0E-06 ATACAAATTTTAAT 14
V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 53758620 53758635 3.0E-06 TGTATTTAATTAAGCG 16
V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 53758620 53758636 2.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_XFD3_01_M00269 TRANSFAC + 53758413 53758426 1.0E-05 TAAGTAAAAAATTA 14
V_SP1_Q6_M00196 TRANSFAC + 53758269 53758281 8.0E-06 GATGGGCGGGGCC 13
V_IRF3_Q3_M01279 TRANSFAC - 53757854 53757866 8.0E-06 ACCTTTTTGCTTT 13
V_HNF1_Q6_01_M01011 TRANSFAC - 53758613 53758633 7.0E-06 CTTAATTAAATACAAATTTTA 21
V_GADP_01_M01258 TRANSFAC + 53758115 53758126 8.0E-06 CGCTTCCGGGTC 12
V_OCT1_04_M00138 TRANSFAC - 53758610 53758632 5.0E-06 TTAATTAAATACAAATTTTAATC 23
V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 53758622 53758637 9.0E-06 TTCGCTTAATTAAATA 16
V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC + 53758620 53758636 3.0E-06 TGTATTTAATTAAGCGA 17
V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 53758618 53758634 4.0E-06 GCTTAATTAAATACAAA 17
V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 53758619 53758635 5.0E-06 TTGTATTTAATTAAGCG 17
V_OTP_01_M01323 TRANSFAC + 53758620 53758636 1.0E-05 TGTATTTAATTAAGCGA 17
V_KLF7_03_M02773 TRANSFAC - 53758268 53758283 9.0E-06 TAGGCCCCGCCCATCC 16
V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 53758615 53758631 5.0E-06 TAATTAAATACAAATTT 17
V_HB24_01_M01399 TRANSFAC - 53758620 53758634 0.0E+00 GCTTAATTAAATACA 15
V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC - 53758620 53758636 2.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC + 53758621 53758637 4.0E-06 GTATTTAATTAAGCGAA 17
V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC - 53758620 53758636 6.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC + 53758621 53758637 6.0E-06 GTATTTAATTAAGCGAA 17
V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC + 53758623 53758632 1.0E-06 ATTTAATTAA 10
V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 53758620 53758636 4.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_IRF7_01_M00453 TRANSFAC - 53758364 53758381 8.0E-06 AGGGAATCCAAAAGTGAA 18
V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC + 53758621 53758637 3.0E-06 GTATTTAATTAAGCGAA 17
V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 53758618 53758634 3.0E-06 GCTTAATTAAATACAAA 17
V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 53758619 53758635 9.0E-06 TTGTATTTAATTAAGCG 17
V_NKX61_02_M01469 TRANSFAC + 53758620 53758635 7.0E-06 TGTATTTAATTAAGCG 16
V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 53758620 53758636 3.0E-06 TGTATTTAATTAAGCGA 17
V_RBPJK_01_M01112 TRANSFAC + 53758029 53758039 2.0E-06 AGCGTGGGAAC 11
V_SRF_01_M00152 TRANSFAC - 53758437 53758454 7.0E-06 ATTCCAATATAAGGGGCC 18
V_OCT1_06_M00162 TRANSFAC - 53758620 53758633 1.0E-06 CTTAATTAAATACA 14
V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC + 53758620 53758636 8.0E-06 TGTATTTAATTAAGCGA 17
V_HOMEZ_01_M01429 TRANSFAC - 53757882 53757898 4.0E-06 TTAAAATCGTTCTGAAG 17
V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC - 53758620 53758636 6.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_PAX4_02_M00377 TRANSFAC + 53758418 53758428 9.0E-06 AAAAAATTAGA 11
V_SOX15_04_M02903 TRANSFAC - 53758619 53758633 1.0E-05 CTTAATTAAATACAA 15
V_PAX1_B_M00326 TRANSFAC - 53757915 53757932 9.0E-06 CCGAGAGGGTCTAGAGAT 18
V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 53758620 53758636 3.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 53758620 53758635 1.0E-05 TGTATTTAATTAAGCG 16
V_SP1_Q4_01_M00932 TRANSFAC + 53758269 53758281 5.0E-06 GATGGGCGGGGCC 13
V_HOXD10_01_M01375 TRANSFAC - 53758619 53758635 7.0E-06 CGCTTAATTAAATACAA 17
V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC - 53758620 53758636 6.0E-06 TCGCTTAATTAAATACA 17
V_ARID5A_04_M02840 TRANSFAC - 53758614 53758630 9.0E-06 AATTAAATACAAATTTT 17
V_PAX6_01_M00097 TRANSFAC + 53758360 53758380 8.0E-06 ATTCTTCACTTTTGGATTCCC 21
V_T3RALPHA_Q6_M01724 TRANSFAC - 53757847 53757857 6.0E-06 CTTTAGGTCAG 11
Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns.
Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.
A Django site.   Powered by PostgreSQL