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CFI Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 3426 complement factor I chr4 - 110722835 - 110728335 110723335 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the CFI promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints CTCF_MA0139.1 JASPAR - 110725498 110725516 2.0E-06 TCCCCACAAGATGGCACAA 19 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 110725459 110725476 7.0E-06 TCACTTAGTGGCAAATTA 18 DLX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 110725315 110725324 1.0E-05 CTTAATTATC 10 RARB_nuclearreceptor_full_dimeric_16_1 SELEX - 110723250 110723265 4.0E-06 AGAGTTCAAAAGTACA 16 NFIA_NFI_full_dimeric_15_1 SELEX + 110723274 110723288 9.0E-06 TTGGCTGAAATCCAG 15 ZNF713_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 110723458 110723474 8.0E-06 AAAAAAAAAACCAAAAA 17 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 110725547 110725560 9.0E-06 TCATTAACAAATGC 14 LHX6_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX - 110725445 110725460 6.0E-06 TAATTACATCTGATTC 16 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 110723190 110723202 7.0E-06 AAAATTAAATTTC 13 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110725316 110725323 4.0E-06 ATAATTAA 8 IRF8_IRF_full_dimeric_14_1 SELEX + 110723298 110723311 5.0E-06 CCGTAACTGAAACC 14 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 110723400 110723411 1.0E-06 TAATTGCAATGA 12 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 110723400 110723411 1.0E-06 TCATTGCAATTA 12 PDX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110725454 110725461 5.0E-06 GTAATTAA 8 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 110723190 110723202 9.0E-06 AAAATTAAATTTC 13 RARA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_18_2 SELEX - 110723247 110723264 1.0E-06 GAGTTCAAAAGTACAAAG 18 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 110723213 110723242 1.0E-06 AAAAATGTTTCAAAAGAACAAACCTCCTAA 30 Pax4_MA0068.1 JASPAR - 110723444 110723473 3.0E-06 AAAAAAAAACCAAAAAATTGCTTCCAATAT 30 Dlx2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110725454 110725461 5.0E-06 GTAATTAA 8 HMX3_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 110723397 110723407 5.0E-06 TGCAATTAACA 11 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 110723190 110723202 7.0E-06 AAAATTAAATTTC 13 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 110725455 110725464 3.0E-06 TAATTAATTT 10 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 110725455 110725464 2.0E-06 AAATTAATTA 10 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 110723193 110723207 2.0E-06 ATTTAATTTTTAACC 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 110723193 110723207 1.0E-06 GGTTAAAAATTAAAT 15 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110725453 110725462 7.0E-06 TGTAATTAAT 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 110723194 110723203 9.0E-06 AAAAATTAAA 10 FOXO4_forkhead_DBD_putatively-multimeric_12_1 SELEX - 110725507 110725518 6.0E-06 TGTCCCCACAAG 12 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 110723190 110723202 1.0E-05 GAAATTTAATTTT 13 MEOX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110725453 110725462 3.0E-06 TGTAATTAAT 10 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 110723191 110723201 6.0E-06 AAATTTAATTT 11 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 110723190 110723202 5.0E-06 AAAATTAAATTTC 13 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110725316 110725323 9.0E-06 ATAATTAA 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 110725316 110725323 9.0E-06 TTAATTAT 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 110725454 110725461 9.0E-06 TTAATTAC 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 110723189 110723201 3.0E-06 AAATTAAATTTCA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 110723191 110723203 7.0E-06 AAATTTAATTTTT 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 110723192 110723204 4.0E-06 AATTTAATTTTTA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 110725455 110725467 1.0E-06 TAATTAATTTGCC 13 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 110725316 110725323 9.0E-06 ATAATTAA 8 SOX7_HMG_full_dimeric_17_1 SELEX + 110723451 110723467 7.0E-06 AAGCAATTTTTTGGTTT 17 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 110725459 110725476 7.0E-06 TCACTTAGTGGCAAATTA 18 VENTX_homeodomain_DBD_dimeric_21_1 SELEX - 110723314 110723334 6.0E-06 CTTTAATGGGAAGGCCATTTT 21 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 110723194 110723206 4.0E-06 TTTAATTTTTAAC 13 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 110723194 110723206 1.0E-06 GTTAAAAATTAAA 13 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 110723191 110723201 7.0E-06 AAATTTAATTT 11 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 110723190 110723202 6.0E-06 GAAATTTAATTTT 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 110723190 110723202 5.0E-06 GAAATTTAATTTT 13 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110725453 110725462 8.0E-06 TGTAATTAAT 10 IRF9_IRF_full_trimeric_15_1 SELEX + 110723297 110723311 2.0E-06 ACCGTAACTGAAACC 15 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110725453 110725462 9.0E-06 TGTAATTAAT 10 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 110723325 110723333 8.0E-06 CCCATTAAA 9 NFIB_NFI_full_dimeric_15_1 SELEX + 110723274 110723288 8.0E-06 TTGGCTGAAATCCAG 15 VAX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 110725454 110725461 5.0E-06 TTAATTAC 8 Rhox11_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 110725269 110725277 4.0E-06 TGCTGTAAA 9 LHX6_homeodomain_full_dimeric_12_1 SELEX + 110723400 110723411 1.0E-06 TAATTGCAATGA 12 LHX6_homeodomain_full_dimeric_12_1 SELEX - 110723400 110723411 2.0E-06 TCATTGCAATTA 12 IRF4_IRF_full_dimeric_15_1 SELEX + 110723298 110723312 1.0E-06 CCGTAACTGAAACCA 15 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 110723191 110723201 4.0E-06 AAATTTAATTT 11 GBX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 110725459 110725472 3.0E-06 TTAGTGGCAAATTA 14 IRF5_IRF_full_dimeric_14_1 SELEX + 110723298 110723311 4.0E-06 CCGTAACTGAAACC 14 IRF5_IRF_full_dimeric_14_1 SELEX + 110723304 110723317 3.0E-06 CTGAAACCAAAAAA 14 FOXO6_forkhead_DBD_putatively-multimeric_14_1 SELEX - 110725505 110725518 5.0E-06 TGTCCCCACAAGAT 14 IRF3_IRF_full_trimeric_21_1 SELEX + 110723298 110723318 5.0E-06 CCGTAACTGAAACCAAAAAAT 21 Nr2f6_nuclearreceptor_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 110723250 110723264 9.0E-06 GAGTTCAAAAGTACA 15 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 110725547 110725560 8.0E-06 TCATTAACAAATGC 14 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 110723193 110723207 2.0E-06 ATTTAATTTTTAACC 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 110723193 110723207 1.0E-06 GGTTAAAAATTAAAT 15 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 110725454 110725471 9.0E-06 GTAATTAATTTGCCACTA 18 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 110725453 110725462 7.0E-06 TGTAATTAAT 10 RARA_nuclearreceptor_full_dimeric_15_1 SELEX - 110723250 110723264 1.0E-06 GAGTTCAAAAGTACA 15 HNF1A_MA0046.1 JASPAR - 110723194 110723207 0.0E+00 GGTTAAAAATTAAA 14 PAX7_PAX_full_dimeric_10_1 SELEX + 110725455 110725464 4.0E-06 TAATTAATTT 10 PAX7_PAX_full_dimeric_10_1 SELEX - 110725455 110725464 2.0E-06 AAATTAATTA 10 DLX5_homeodomain_FL_monomeric_8_1 SELEX + 110725316 110725323 8.0E-06 ATAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 110725454 110725461 9.0E-06 TTAATTAC 8 V_DMRT4_01_M01149 TRANSFAC + 110723216 110723228 9.0E-06 AATGTTTCAAAAG 13 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 110723455 110723474 6.0E-06 AATTTTTTGGTTTTTTTTTT 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 110723456 110723475 6.0E-06 ATTTTTTGGTTTTTTTTTTG 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 110723457 110723476 1.0E-06 TTTTTTGGTTTTTTTTTTGT 20 V_CDP_03_M01342 TRANSFAC - 110725312 110725328 1.0E-05 AGTGCTTAATTATCTAG 17 V_MEIS1BHOXA9_02_M00421 TRANSFAC - 110725517 110725530 8.0E-06 TGACACTAATACTG 14 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 110725451 110725467 1.0E-06 GGCAAATTAATTACATC 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 110725452 110725468 4.0E-06 ATGTAATTAATTTGCCA 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC + 110725449 110725464 3.0E-06 CAGATGTAATTAATTT 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 110723189 110723205 8.0E-06 TTAAAAATTAAATTTCA 17 V_TCF3_01_M01594 TRANSFAC + 110723185 110723197 4.0E-06 CTTTTGAAATTTA 13 V_TCF3_01_M01594 TRANSFAC + 110723246 110723258 9.0E-06 GCTTTGTACTTTT 13 V_CHOP_01_M00249 TRANSFAC - 110725230 110725242 1.0E-06 TCATGCAATCCCC 13 V_DMRT3_01_M01148 TRANSFAC - 110723214 110723228 1.0E-06 CTTTTGAAACATTTT 15 V_NF1_Q6_01_M00806 TRANSFAC - 110723272 110723288 5.0E-06 CTGGATTTCAGCCAAAT 17 V_DLX3_01_M01400 TRANSFAC - 110725450 110725466 7.0E-06 GCAAATTAATTACATCT 17 V_HMGIY_Q3_M01010 TRANSFAC + 110723460 110723474 8.0E-06 TTTGGTTTTTTTTTT 15 V_NKX29_01_M01352 TRANSFAC - 110725317 110725333 1.0E-06 TATAGAGTGCTTAATTA 17 V_NKX29_01_M01352 TRANSFAC + 110725318 110725334 9.0E-06 AATTAAGCACTCTATAA 17 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 110723187 110723202 1.0E-06 TTTGAAATTTAATTTT 16 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 110723457 110723472 0.0E+00 TTTTTTGGTTTTTTTT 16 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 110723458 110723473 0.0E+00 TTTTTGGTTTTTTTTT 16 V_HP1SITEFACTOR_Q6_M00725 TRANSFAC - 110723185 110723196 2.0E-06 AAATTTCAAAAG 12 V_ETS_B_M00340 TRANSFAC - 110723379 110723392 6.0E-06 GGGAGGAAATCAGT 14 V_PROP1_01_M01294 TRANSFAC + 110725455 110725465 7.0E-06 TAATTAATTTG 11 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC + 110725449 110725464 5.0E-06 CAGATGTAATTAATTT 16 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 110725312 110725328 3.0E-06 AGTGCTTAATTATCTAG 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC + 110725450 110725466 9.0E-06 AGATGTAATTAATTTGC 17 V_YY1_Q6_M00793 TRANSFAC + 110725502 110725510 7.0E-06 GCCATCTTG 9 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 110725312 110725328 2.0E-06 CTAGATAATTAAGCACT 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 110725449 110725465 4.0E-06 CAAATTAATTACATCTG 17 V_CUX1_03_M02958 TRANSFAC - 110725312 110725328 1.0E-05 AGTGCTTAATTATCTAG 17 V_HOXA2_01_M01402 TRANSFAC - 110725449 110725464 5.0E-06 AAATTAATTACATCTG 16 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 110725450 110725466 0.0E+00 GCAAATTAATTACATCT 17 V_DLX2_01_M01468 TRANSFAC - 110725449 110725464 3.0E-06 AAATTAATTACATCTG 16 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 110725449 110725465 1.0E-06 CAAATTAATTACATCTG 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 110725450 110725466 9.0E-06 GCAAATTAATTACATCT 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 110725449 110725465 1.0E-06 CAAATTAATTACATCTG 17 V_AFP1_Q6_M00616 TRANSFAC - 110725452 110725462 0.0E+00 ATTAATTACAT 11 V_AP4_Q6_02_M01860 TRANSFAC + 110725528 110725540 3.0E-06 TCAGCTGCTGTCA 13 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 110723193 110723202 7.0E-06 ATTTAATTTT 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 110725452 110725461 4.0E-06 ATGTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 110725454 110725463 2.0E-06 AATTAATTAC 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 110725456 110725465 5.0E-06 AATTAATTTG 10 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC - 110723438 110723453 6.0E-06 CTTCCAATATAATTTC 16 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC + 110725454 110725470 6.0E-06 GTAATTAATTTGCCACT 17 V_TCFAP2E_04_M02926 TRANSFAC - 110723464 110723477 1.0E-06 TACAAAAAAAAAAC 14 V_TCFAP2E_04_M02926 TRANSFAC - 110723466 110723479 7.0E-06 TGTACAAAAAAAAA 14 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC - 110725311 110725326 3.0E-06 TGCTTAATTATCTAGC 16 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC - 110725453 110725468 4.0E-06 TGGCAAATTAATTACA 16 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 110725312 110725328 3.0E-06 CTAGATAATTAAGCACT 17 V_NKX62_Q2_M00489 TRANSFAC - 110725453 110725464 5.0E-06 AAATTAATTACA 12 V_RHOX11_02_M01384 TRANSFAC + 110725446 110725462 8.0E-06 AATCAGATGTAATTAAT 17 V_AP1_Q6_M00174 TRANSFAC + 110723407 110723417 2.0E-06 AATGACTCAAT 11 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC - 110723190 110723206 1.0E-06 GTTAAAAATTAAATTTC 17 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC - 110723191 110723207 1.0E-06 GGTTAAAAATTAAATTT 17 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC - 110723462 110723478 1.0E-06 GTACAAAAAAAAAACCA 17 V_ELF4_04_M02850 TRANSFAC - 110723463 110723479 1.0E-06 TGTACAAAAAAAAAACC 17 V_TCF3_04_M02816 TRANSFAC - 110723181 110723197 2.0E-06 TAAATTTCAAAAGAATA 17 V_HOXA6_01_M01392 TRANSFAC - 110725449 110725464 1.0E-06 AAATTAATTACATCTG 16 V_EN1_02_M01365 TRANSFAC - 110725451 110725466 4.0E-06 GCAAATTAATTACATC 16 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 110723190 110723205 7.0E-06 GAAATTTAATTTTTAA 16 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 110725449 110725464 7.0E-06 CAGATGTAATTAATTT 16 V_CEBPE_Q6_M01868 TRANSFAC - 110723185 110723198 2.0E-06 TTAAATTTCAAAAG 14 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 110725449 110725465 4.0E-06 CAAATTAATTACATCTG 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 110725450 110725466 4.0E-06 AGATGTAATTAATTTGC 17 V_ZFP105_03_M02827 TRANSFAC - 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