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HMGB1 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 3146 high mobility group box 1 chr13 - 31039581 - 31045081 31040081 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the HMGB1 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 4.0E-06 TTAATTAA 8 HSF2_HSF_DBD_trimeric_13_1 SELEX + 31040809 31040821 6.0E-06 GTCTAGAACTTTT 13 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 31035913 31035930 7.0E-06 CTCATTGAGGTGCAATTA 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 4.0E-06 TTAATTAA 8 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31040493 31040502 5.0E-06 GCCATTAAAA 10 VSX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31038266 31038273 5.0E-06 CTAATTAT 8 Myc_MA0147.1 JASPAR - 31038687 31038696 4.0E-06 CGCACGTGGC 10 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 31039629 31039638 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 31039629 31039638 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 SPIC_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX - 31041349 31041362 1.0E-06 AAAAAAGGGAAGTC 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 31039623 31039636 8.0E-06 TAATTAAAAAAATT 14 MEF2D_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 31041201 31041212 1.0E-05 TCTATTAATACC 12 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 31039622 31039636 5.0E-06 TAATTAAAAAAATTT 15 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 31041323 31041336 2.0E-06 GACCACGCCCCTAT 14 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX - 31040817 31040829 5.0E-06 TTTAAATAAAAAG 13 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 31040822 31040830 9.0E-06 TATTTAAAT 9 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 31040823 31040831 9.0E-06 TATTTAAAT 9 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31039629 31039638 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31039629 31039638 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 FOXO1_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31038493 31038500 7.0E-06 GTAAACAA 8 GATA5_GATA_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31040475 31040482 7.0E-06 AGATAAGA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 EGR1_C2H2_full_monomeric_14_1 SELEX + 31039153 31039166 8.0E-06 GCCGCCCCCGCACG 14 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 31039625 31039637 7.0E-06 TTTTTTTAATTAA 13 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 31039630 31039642 7.0E-06 TTTTTTTAATTAA 13 KLF13_C2H2_full_monomeric_18_1 SELEX + 31041322 31041339 1.0E-06 AGACCACGCCCCTATTCA 18 GATA4_GATA_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31040475 31040482 7.0E-06 AGATAAGA 8 HOMEZ_HOMEZ_DBD_monomer-or-dimer_12_1 SELEX + 31038141 31038152 0.0E+00 TAAACGATTTTA 12 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 Barhl1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31038139 31038148 7.0E-06 CTTAAACGAT 10 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 31041349 31041362 2.0E-06 AAAAAAGGGAAGTC 14 BARHL2_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX + 31038141 31038156 7.0E-06 TAAACGATTTTAAAAT 16 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31039629 31039638 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31039629 31039638 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 MEF2B_MADS_full_dimeric_12_1 SELEX - 31041201 31041212 8.0E-06 TCTATTAATACC 12 Barhl1_homeodomain_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 31038141 31038156 7.0E-06 TAAACGATTTTAAAAT 16 Foxq1_MA0040.1 JASPAR - 31038234 31038244 8.0E-06 CCTTGTTTATT 11 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXC11_homeodomain_full_monomeric_11_2 SELEX - 31040493 31040503 8.0E-06 GGCCATTAAAA 11 XBP1_bZIP_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 31040185 31040198 1.0E-06 GGGGACACGTCATC 14 OTX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31036043 31036050 7.0E-06 TTAATCCT 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 SP1_MA0079.2 JASPAR + 31038542 31038551 3.0E-06 CCCCTCCCCC 10 SP1_MA0079.2 JASPAR - 31039021 31039030 3.0E-06 CCCCTCCCCC 10 SP1_MA0079.2 JASPAR + 31039069 31039078 3.0E-06 CCCCTCCCCC 10 Ascl2_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 31040280 31040289 2.0E-06 AGCAGCTGCT 10 Ascl2_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 31040280 31040289 2.0E-06 AGCAGCTGCT 10 Creb3l2_bZIP_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 31040187 31040199 2.0E-06 GGACACGTCATCA 13 BARHL2_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 31038139 31038148 9.0E-06 CTTAAACGAT 10 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX + 31041321 31041337 1.0E-06 CAGACCACGCCCCTATT 17 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 31039629 31039638 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 31039629 31039638 0.0E+00 TTTAATTAAA 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 31041324 31041334 1.0E-05 ACCACGCCCCT 11 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 31040818 31040828 3.0E-06 TTAAATAAAAA 11 Gata1_MA0035.2 JASPAR + 31040473 31040483 8.0E-06 TGAGATAAGAG 11 GATA3_GATA_full_monomeric_8_1 SELEX + 31040475 31040482 7.0E-06 AGATAAGA 8 Mycn_MA0104.2 JASPAR - 31038687 31038696 5.0E-06 CGCACGTGGC 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31039629 31039638 2.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31039629 31039638 2.0E-06 TTTAATTAAA 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 31035913 31035930 2.0E-06 CTCATTGAGGTGCAATTA 18 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 31038284 31038295 7.0E-06 GATTTTTTTTTT 12 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX + 31041323 31041337 0.0E+00 GACCACGCCCCTATT 15 PITX1_homeodomain_full_monomeric_9_1 SELEX + 31036042 31036050 9.0E-06 CTTAATCCT 9 EN1_homeodomain_full_dimeric_14_1 SELEX + 31038129 31038142 8.0E-06 TAACTGGTCACTTA 14 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 31039621 31039637 7.0E-06 TTAATTAAAAAAATTTT 17 CREB3L1_bZIP_full_dimeric_14_1 SELEX + 31040186 31040199 8.0E-06 GGGACACGTCATCA 14 Myf_MA0055.1 JASPAR + 31040276 31040287 3.0E-06 AGGCAGCAGCTG 12 POU2F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 31040820 31040831 1.0E-05 TTTATTTAAATA 12 CPEB1_RRM_full_monomeric_8_1 SELEX - 31040818 31040825 4.0E-06 AATAAAAA 8 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31039629 31039638 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31039629 31039638 6.0E-06 TTTAATTAAA 10 GBX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 31038129 31038142 3.0E-06 TAACTGGTCACTTA 14 GBX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 31038129 31038142 2.0E-06 TAAGTGACCAGTTA 14 SPI1_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX - 31041349 31041362 2.0E-06 AAAAAAGGGAAGTC 14 RUNX1_MA0002.2 JASPAR + 31041169 31041179 2.0E-06 GGCTGTGGTTT 11 FOXB1_forkhead_full_monomeric_9_1 SELEX + 31038492 31038500 7.0E-06 AGTAAACAA 9 FOXO3_forkhead_full_monomeric_8_1 SELEX + 31038493 31038500 7.0E-06 GTAAACAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 31035913 31035930 3.0E-06 CTCATTGAGGTGCAATTA 18 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 31040493 31040503 6.0E-06 GGCCATTAAAA 11 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 31039629 31039638 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 31039629 31039638 3.0E-06 TTTAATTAAA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 31040818 31040830 1.0E-06 ATTTAAATAAAAA 13 NHLH1_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 31040280 31040289 7.0E-06 AGCAGCTGCT 10 NHLH1_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX - 31040280 31040289 7.0E-06 AGCAGCTGCT 10 TBX1_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 31038922 31038941 6.0E-06 GTGTATGAGAGAGTGTGTGA 20 HNF1A_MA0046.1 JASPAR + 31037924 31037937 1.0E-05 GGTTATTTAACACA 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 4.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 31039630 31039637 9.0E-06 TTAATTAA 8 V_DMRT4_01_M01149 TRANSFAC + 31038307 31038319 7.0E-06 AAAGTTTCAAAAA 13 V_DMRT4_01_M01149 TRANSFAC - 31041011 31041023 8.0E-06 ATTGTAACAGTAA 13 V_MINI20_B_M00324 TRANSFAC + 31035906 31035926 4.0E-06 GTTATGCCTCATTGAGGTGCA 21 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC - 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