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CNIH4 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 29097 cornichon homolog 4 (Drosophila) chr1 + 224539594 - 224545094 224544594 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the CNIH4 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints HOXD12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 224545624 224545632 9.0E-06 GTAATTAAA 9 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 224545624 224545633 5.0E-06 GTAATTAAAT 10 Sox1_HMG_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 224544435 224544448 5.0E-06 TGAACTACAATTCC 14 Sox1_HMG_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 224544435 224544448 6.0E-06 GGAATTGTAGTTCA 14 MYF6_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 224545340 224545349 3.0E-06 AACAACTGTC 10 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545624 224545633 2.0E-06 GTAATTAAAT 10 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 224545621 224545634 7.0E-06 TAAGTAATTAAATA 14 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 224544361 224544373 1.0E-05 GAAATGGAATTAA 13 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 224545624 224545636 6.0E-06 GTAATTAAATATA 13 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 224545624 224545641 8.0E-06 GTAATTAAATATAAGAAA 18 PDX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 224545624 224545631 5.0E-06 GTAATTAA 8 STAT1_MA0137.2 JASPAR + 224545672 224545686 2.0E-06 CCTTTCTTGGAAATC 15 STAT1_MA0137.2 JASPAR - 224545672 224545686 3.0E-06 GATTTCCAAGAAAGG 15 RARA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_18_2 SELEX - 224544424 224544441 3.0E-06 TAGTTCATTAGTACAAGT 18 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 224545619 224545631 6.0E-06 TTTAAGTAATTAA 13 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 224545624 224545636 6.0E-06 TATATTTAATTAC 13 SCRT2_C2H2_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 224544350 224544362 7.0E-06 AATCAACAAGTAT 13 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 2.0E-06 AGTAATTAAA 10 OTX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 224544378 224544392 6.0E-06 AATAATCGGATTTAT 15 OTX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 224544378 224544392 1.0E-06 ATAAATCCGATTATT 15 OTX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 224545700 224545714 2.0E-06 TTTAATCCGATCAGA 15 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 2.0E-06 AGTAATTAAA 10 Dlx2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 224545624 224545631 5.0E-06 GTAATTAA 8 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 224545623 224545632 4.0E-06 AGTAATTAAA 10 HOXC12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 224545624 224545632 7.0E-06 GTAATTAAA 9 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 5.0E-06 AGTAATTAAA 10 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 224545624 224545636 7.0E-06 TATATTTAATTAC 13 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 1.0E-06 AGTAATTAAA 10 HOXC11_homeodomain_full_monomeric_11_2 SELEX + 224545623 224545633 8.0E-06 AGTAATTAAAT 11 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 224545624 224545636 9.0E-06 TATATTTAATTAC 13 MEOX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 0.0E+00 AGTAATTAAA 10 BARHL2_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 224545504 224545513 9.0E-06 AATAAATGGT 10 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 224545624 224545636 9.0E-06 GTAATTAAATATA 13 Otx1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 224544378 224544392 0.0E+00 ATAAATCCGATTATT 15 Otx1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 224545700 224545714 2.0E-06 TTTAATCCGATCAGA 15 BCL6B_C2H2_DBD_monomeric_17_1 SELEX + 224545671 224545687 5.0E-06 TCCTTTCTTGGAAATCA 17 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 224545624 224545631 9.0E-06 TTAATTAC 8 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 8.0E-06 AGTAATTAAA 10 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 224544355 224544367 6.0E-06 GAATTAATCAACA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 224545625 224545637 2.0E-06 TAATTAAATATAA 13 SCRT1_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 224544348 224544362 2.0E-06 AATCAACAAGTATTT 15 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 2.0E-06 AGTAATTAAA 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 224544347 224544364 5.0E-06 TTAATCAACAAGTATTTA 18 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 224545625 224545635 8.0E-06 ATATTTAATTA 11 TBX15_TBX_DBD_dimeric_19_1 SELEX + 224545328 224545346 8.0E-06 AGGAGTTGTTTTAACAACT 19 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 224545624 224545636 4.0E-06 TATATTTAATTAC 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 224545624 224545636 4.0E-06 TATATTTAATTAC 13 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 2.0E-06 AGTAATTAAA 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 0.0E+00 AGTAATTAAA 10 CUX2_CUT_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 224545441 224545458 5.0E-06 TTAAATTTTTCTATCGAT 18 CUX2_CUT_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 224545441 224545458 4.0E-06 ATCGATAGAAAAATTTAA 18 Hltf_MA0109.1 JASPAR - 224546157 224546166 6.0E-06 TTCCTTATAT 10 VAX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 224545624 224545631 5.0E-06 TTAATTAC 8 MEOX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 5.0E-06 AGTAATTAAA 10 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 224545625 224545635 6.0E-06 ATATTTAATTA 11 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 4.0E-06 AGTAATTAAA 10 FOXO6_forkhead_DBD_putatively-multimeric_14_1 SELEX + 224545181 224545194 6.0E-06 GTTCCCCACGCAAC 14 IRF3_IRF_full_trimeric_21_1 SELEX - 224545660 224545680 9.0E-06 CAAGAAAGGAAGCTGAAATGC 21 ZNF524_C2H2_full_monomeric_14_1 SELEX - 224544939 224544952 1.0E-05 CTCGGACCCGAGTG 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 224545621 224545634 9.0E-06 TAAGTAATTAAATA 14 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 224544347 224544364 5.0E-06 TTAATCAACAAGTATTTA 18 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 224545623 224545633 2.0E-06 AGTAATTAAAT 11 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 224545623 224545632 0.0E+00 AGTAATTAAA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 224545622 224545634 7.0E-06 AAGTAATTAAATA 13 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 224545623 224545633 2.0E-06 AGTAATTAAAT 11 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 224545624 224545631 9.0E-06 TTAATTAC 8 V_RUSH1A_02_M01107 TRANSFAC - 224546157 224546166 6.0E-06 TTCCTTATAT 10 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC + 224545621 224545637 3.0E-06 TAAGTAATTAAATATAA 17 V_CEBPG_Q6_M00622 TRANSFAC - 224545307 224545319 6.0E-06 CTCACTACAAAAC 13 V_OBOX6_01_M01445 TRANSFAC + 224544379 224544393 3.0E-06 ATAATCGGATTTATG 15 V_OBOX6_01_M01445 TRANSFAC + 224545701 224545715 5.0E-06 CTGATCGGATTAAAC 15 V_SPI1_01_M01203 TRANSFAC + 224546156 224546172 5.0E-06 GATATAAGGAACTAGAG 17 V_STAT5A_Q6_M01890 TRANSFAC + 224545671 224545683 5.0E-06 TCCTTTCTTGGAA 13 V_STAT5A_Q6_M01890 TRANSFAC - 224545675 224545687 2.0E-06 TGATTTCCAAGAA 13 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 224544354 224544370 8.0E-06 ATGGAATTAATCAACAA 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 224545617 224545633 7.0E-06 ATTTAATTACTTAAACC 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 224545618 224545634 2.0E-06 GTTTAAGTAATTAAATA 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 224545621 224545637 2.0E-06 TTATATTTAATTACTTA 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 224545622 224545638 7.0E-06 AAGTAATTAAATATAAG 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC + 224545619 224545634 2.0E-06 TTTAAGTAATTAAATA 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 224544351 224544367 6.0E-06 GAATTAATCAACAAGTA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 224545618 224545634 3.0E-06 TATTTAATTACTTAAAC 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 224545621 224545637 0.0E+00 TAAGTAATTAAATATAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 224545625 224545641 1.0E-06 TAATTAAATATAAGAAA 17 V_ZFP187_03_M02830 TRANSFAC + 224544424 224544437 9.0E-06 ACTTGTACTAATGA 14 V_TCF3_01_M01594 TRANSFAC + 224544412 224544424 6.0E-06 TCTTTGATATGGA 13 V_TBX15_01_M01263 TRANSFAC + 224545328 224545346 9.0E-06 AGGAGTTGTTTTAACAACT 19 V_TBX15_01_M01263 TRANSFAC - 224545328 224545346 9.0E-06 AGTTGTTAAAACAACTCCT 19 TAL1_TCF3_MA0091.1 JASPAR + 224546796 224546807 7.0E-06 AGACCATCTGGA 12 V_FOXA2_04_M02749 TRANSFAC + 224545619 224545635 7.0E-06 TTTAAGTAATTAAATAT 17 V_BCL6B_03_M02740 TRANSFAC + 224545672 224545687 4.0E-06 CCTTTCTTGGAAATCA 16 V_DLX3_01_M01400 TRANSFAC - 224545620 224545636 7.0E-06 TATATTTAATTACTTAA 17 V_FOXD3_01_M00130 TRANSFAC - 224545626 224545637 9.0E-06 TTATATTTAATT 12 V_NKX29_01_M01352 TRANSFAC - 224545617 224545633 3.0E-06 ATTTAATTACTTAAACC 17 V_NKX29_01_M01352 TRANSFAC + 224545618 224545634 2.0E-06 GTTTAAGTAATTAAATA 17 V_BCL6_01_M01183 TRANSFAC + 224545439 224545454 7.0E-06 TTTTAAATTTTTCTAT 16 V_STAT_Q6_M00777 TRANSFAC + 224545670 224545682 5.0E-06 TTCCTTTCTTGGA 13 V_PROP1_01_M01294 TRANSFAC + 224544362 224544372 6.0E-06 TAATTCCATTT 11 V_PROP1_01_M01294 TRANSFAC + 224545625 224545635 4.0E-06 TAATTAAATAT 11 V_OTX_Q1_M01117 TRANSFAC + 224544359 224544366 5.0E-06 GATTAATT 8 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 224545619 224545635 9.0E-06 TTTAAGTAATTAAATAT 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC + 224544427 224544443 7.0E-06 TGTACTAATGAACTACA 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC - 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