Search TFs or Genes

Construction and Validation

Optimal Promoter Size

Download

Citation and Contact

MRPL22 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 29093 mitochondrial ribosomal protein L22 chr5 + 154315632 - 154321132 154320632 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the MRPL22 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 4.0E-06 TTAATTAA 8 CTCF_MA0139.1 JASPAR + 154325434 154325452 2.0E-06 TGGCCAGGAGAGGGCACAT 19 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 154325400 154325417 5.0E-06 TCAATTAAAACAAAATGA 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 4.0E-06 TTAATTAA 8 Creb3l2_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 154316917 154316928 9.0E-06 AGTCACGTGGCA 12 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 154320477 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTA 12 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 154320473 154320486 1.0E-06 TTATTAATTAATTC 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 154320473 154320486 0.0E+00 GAATTAATTAATAA 14 EMX2_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 154320477 154320490 3.0E-06 GAATGAATTAATTA 14 POU3F2_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 154320477 154320489 1.0E-06 AATGAATTAATTA 13 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 POU3F4_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 154320477 154320487 2.0E-06 TGAATTAATTA 11 ZNF435_C2H2_full_dimeric_18_1 SELEX + 154320883 154320900 9.0E-06 GTTGGTAACTGAGCGCCT 18 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 5.0E-06 ATTAATTAAT 10 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 5.0E-06 ATTAATTAAT 10 TBP_MA0108.2 JASPAR + 154317259 154317273 8.0E-06 ATATAAATGGCCGAG 15 HINFP1_C2H2_full_monomeric_12_1 SELEX + 154317670 154317681 1.0E-06 CAGCGTCCGCGG 12 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 154320476 154320488 6.0E-06 ATGAATTAATTAA 13 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 4.0E-06 ATTAATTAAT 10 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 4.0E-06 ATTAATTAAT 10 OTX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 154318011 154318025 4.0E-06 TCTAATCCTCTAATT 15 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 1.0E-06 ATTAATTAAT 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 1.0E-06 ATTAATTAAT 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 154320472 154320487 3.0E-06 TTTATTAATTAATTCA 16 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 154320473 154320488 6.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 154320477 154320486 9.0E-06 TAATTAATTC 10 PAX3_PAX_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 154320477 154320486 6.0E-06 GAATTAATTA 10 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 154320471 154320485 2.0E-06 AATTAATTAATAAAG 15 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 1.0E-05 ATTAATTAAT 10 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 1.0E-05 ATTAATTAAT 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 0.0E+00 ATTAATTAAT 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 0.0E+00 ATTAATTAAT 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 Otx1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 154318011 154318025 1.0E-05 TCTAATCCTCTAATT 15 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 7.0E-06 ATTAATTAAT 10 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 7.0E-06 ATTAATTAAT 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 5.0E-06 ATTAATTAAT 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 5.0E-06 ATTAATTAAT 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 154320474 154320486 0.0E+00 GAATTAATTAATA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 154320477 154320489 1.0E-06 TAATTAATTCATT 13 YY2_C2H2_full_monomeric_11_1 SELEX - 154320668 154320678 4.0E-06 GCCGCCATCTT 11 Gata1_MA0035.2 JASPAR + 154320333 154320343 7.0E-06 TCTGATAAGAA 11 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 6.0E-06 ATTAATTAAT 10 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 6.0E-06 ATTAATTAAT 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 5.0E-06 ATTAATTAAT 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 5.0E-06 ATTAATTAAT 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 154325400 154325417 6.0E-06 TCAATTAAAACAAAATGA 18 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 154320472 154320484 5.0E-06 TTTATTAATTAAT 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 154320476 154320488 5.0E-06 ATGAATTAATTAA 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 154320476 154320488 4.0E-06 ATGAATTAATTAA 13 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 3.0E-06 ATTAATTAAT 10 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 3.0E-06 ATTAATTAAT 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 6.0E-06 ATTAATTAAT 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 6.0E-06 ATTAATTAAT 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 154320477 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTA 12 FEV_MA0156.1 JASPAR + 154320591 154320598 1.0E-05 CAGGAAAT 8 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 154320477 154320487 1.0E-05 TGAATTAATTA 11 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 4.0E-06 ATTAATTAAT 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 4.0E-06 ATTAATTAAT 10 IRF3_IRF_full_trimeric_21_1 SELEX + 154324480 154324500 9.0E-06 ACAAAAAGGAGAGGGATAGTG 21 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 154320473 154320486 2.0E-06 TTATTAATTAATTC 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 154320473 154320486 1.0E-06 GAATTAATTAATAA 14 EMX1_homeodomain_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 154320477 154320490 8.0E-06 GAATGAATTAATTA 14 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 154320471 154320485 2.0E-06 AATTAATTAATAAAG 15 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 154320472 154320483 6.0E-06 TTTATTAATTAA 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 154320472 154320483 3.0E-06 TTAATTAATAAA 12 NRF1_NRF_full_dimeric_12_1 SELEX + 154320608 154320619 2.0E-06 TGCGCATGCGTG 12 NRF1_NRF_full_dimeric_12_1 SELEX - 154320608 154320619 1.0E-06 CACGCATGCGCA 12 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 154325400 154325417 3.0E-06 TCAATTAAAACAAAATGA 18 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 4.0E-06 ATTAATTAAT 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 4.0E-06 ATTAATTAAT 10 Tcfap2a_TFAP_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 154318039 154318049 1.0E-05 CGCCCCAGGCT 11 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 154320471 154320484 6.0E-06 ATTAATTAATAAAG 14 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 154320472 154320485 3.0E-06 TTTATTAATTAATT 14 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 154320475 154320488 7.0E-06 ATGAATTAATTAAT 14 HNF1A_MA0046.1 JASPAR - 154320472 154320485 5.0E-06 AATTAATTAATAAA 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 4.0E-06 TTAATTAA 8 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 154320475 154320484 3.0E-06 ATTAATTAAT 10 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 154320475 154320484 3.0E-06 ATTAATTAAT 10 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 154320476 154320483 9.0E-06 TTAATTAA 8 V_STAT5A_Q6_M01890 TRANSFAC + 154320328 154320340 8.0E-06 TCATTTCTGATAA 13 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 154320469 154320485 0.0E+00 AATTAATTAATAAAGGC 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 154320470 154320486 0.0E+00 CCTTTATTAATTAATTC 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 154320473 154320489 0.0E+00 AATGAATTAATTAATAA 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC + 154320474 154320490 0.0E+00 TATTAATTAATTCATTC 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 154320477 154320493 3.0E-06 TGGGAATGAATTAATTA 17 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC - 154320473 154320488 2.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC - 154325407 154325422 6.0E-06 AACACTCAATTAAAAC 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 154320470 154320486 0.0E+00 GAATTAATTAATAAAGG 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 154320473 154320489 0.0E+00 TTATTAATTAATTCATT 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 154320474 154320490 1.0E-06 GAATGAATTAATTAATA 17 V_ZFP187_03_M02830 TRANSFAC - 154320477 154320490 7.0E-06 GAATGAATTAATTA 14 V_USF_Q6_M00187 TRANSFAC - 154316918 154316927 2.0E-06 GTCACGTGGC 10 V_TCF3_01_M01594 TRANSFAC + 154325458 154325470 7.0E-06 CTTTTGATTTGAT 13 V_EVI1_05_M00082 TRANSFAC + 154320335 154320345 5.0E-06 TGATAAGAAAA 11 V_GATA1_Q6_M02004 TRANSFAC + 154320330 154320344 1.0E-06 ATTTCTGATAAGAAA 15 V_SMAD3_Q6_01_M01888 TRANSFAC - 154319114 154319126 1.0E-06 AGCCAGACAGACT 13 V_SATB1_Q3_M01723 TRANSFAC - 154320465 154320480 1.0E-06 ATTAATAAAGGCCGAA 16 V_EBOX_Q6_01_M01034 TRANSFAC + 154316919 154316928 4.0E-06 CCACGTGACT 10 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC - 154325405 154325421 9.0E-06 ACACTCAATTAAAACAA 17 V_LBX2_01_M01401 TRANSFAC + 154325406 154325422 8.0E-06 TGTTTTAATTGAGTGTT 17 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 154317767 154317776 7.0E-06 GGGGCGGGGT 10 V_MEF2_02_M00231 TRANSFAC - 154325477 154325498 9.0E-06 TGGGGTTCTTAATTTAGAAGCA 22 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC + 154320471 154320486 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTC 16 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 154320473 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAA 16 V_ISL2_01_M01328 TRANSFAC - 154325407 154325422 2.0E-06 AACACTCAATTAAAAC 16 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_POU1F1_Q6_M00744 TRANSFAC - 154320479 154320488 2.0E-06 ATGAATTAAT 10 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC - 154320471 154320487 4.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_YY1_Q6_M00793 TRANSFAC - 154320667 154320675 7.0E-06 GCCATCTTT 9 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_GATA_C_M00203 TRANSFAC + 154320335 154320345 5.0E-06 TGATAAGAAAA 11 V_HOXA2_01_M01402 TRANSFAC - 154320471 154320486 8.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 154320471 154320487 1.0E-06 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 154320472 154320488 3.0E-06 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 154320472 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 154320475 154320491 6.0E-06 ATTAATTAATTCATTCC 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 154320476 154320492 8.0E-06 GGGAATGAATTAATTAA 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 154320475 154320491 1.0E-05 GGAATGAATTAATTAAT 17 V_SP1_02_M01303 TRANSFAC + 154317767 154317777 3.0E-06 GGGGCGGGGTG 11 V_VAX2_01_M01327 TRANSFAC + 154320471 154320486 1.0E-06 CTTTATTAATTAATTC 16 V_VAX2_01_M01327 TRANSFAC - 154320473 154320488 1.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 V_COUPTF_Q6_M01036 TRANSFAC - 154317479 154317501 4.0E-06 CTTACTGCCCTTTGTACGCTCCC 23 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 154320472 154320481 5.0E-06 AATTAATAAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 154320474 154320483 5.0E-06 TATTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 154320476 154320485 0.0E+00 AATTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 154320478 154320487 7.0E-06 AATTAATTCA 10 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC - 154325405 154325420 9.0E-06 CACTCAATTAAAACAA 16 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC - 154320471 154320487 2.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_PSX1_01_M01435 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_EVX1_01_M01475 TRANSFAC - 154320471 154320487 3.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_CMYC_02_M01154 TRANSFAC + 154320454 154320465 9.0E-06 GCCCACGTGCTT 12 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC - 154320471 154320487 1.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_K2B_01_M01348 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_ALX4_02_M01417 TRANSFAC + 154320472 154320488 2.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC - 154320471 154320486 2.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC + 154320473 154320488 0.0E+00 TTATTAATTAATTCAT 16 V_PAX6_02_M01391 TRANSFAC + 154320477 154320492 5.0E-06 TAATTAATTCATTCCC 16 V_CDX_Q5_M00991 TRANSFAC - 154320472 154320489 1.0E-06 AATGAATTAATTAATAAA 18 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_PAX7_01_M01339 TRANSFAC - 154325405 154325421 4.0E-06 ACACTCAATTAAAACAA 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_CART1_03_M01453 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_VSX1_01_M01335 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_NKX62_Q2_M00489 TRANSFAC + 154320473 154320484 9.0E-06 TTATTAATTAAT 12 V_NKX62_Q2_M00489 TRANSFAC - 154320475 154320486 2.0E-06 GAATTAATTAAT 12 V_STAT4_Q4_M01666 TRANSFAC + 154320332 154320345 2.0E-06 TTCTGATAAGAAAA 14 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_LHX61_01_M01314 TRANSFAC - 154320472 154320488 1.0E-06 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_FOXA2_02_M02853 TRANSFAC - 154318052 154318066 8.0E-06 CCAAATAATAAACTG 15 V_HOXA6_01_M01392 TRANSFAC - 154320471 154320486 3.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_HOXA6_01_M01392 TRANSFAC + 154320473 154320488 9.0E-06 TTATTAATTAATTCAT 16 V_EN1_02_M01365 TRANSFAC + 154320471 154320486 7.0E-06 CTTTATTAATTAATTC 16 V_EN1_02_M01365 TRANSFAC - 154320473 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAA 16 V_POU3F2_01_M00463 TRANSFAC + 154320475 154320488 0.0E+00 ATTAATTAATTCAT 14 V_POU3F2_01_M00463 TRANSFAC - 154320475 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAAT 14 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 154320471 154320486 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTC 16 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC - 154320473 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAA 16 V_DBX2_01_M01360 TRANSFAC + 154320475 154320490 7.0E-06 ATTAATTAATTCATTC 16 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 154320468 154320484 7.0E-06 GGCCTTTATTAATTAAT 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_LMX1_01_M01409 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_ZFP105_03_M02827 TRANSFAC - 154325399 154325413 3.0E-06 TTAAAACAAAATGAA 15 V_HOXB13_01_M01467 TRANSFAC - 154325405 154325420 9.0E-06 CACTCAATTAAAACAA 16 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_ARX_01_M01423 TRANSFAC - 154320472 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_TEF_Q6_M00672 TRANSFAC + 154320784 154320795 2.0E-06 ATGGATACATAA 12 V_TATA_01_M00252 TRANSFAC + 154317259 154317273 8.0E-06 ATATAAATGGCCGAG 15 V_NKX61_01_M00424 TRANSFAC + 154320473 154320485 3.0E-06 TTATTAATTAATT 13 V_HOXA3_02_M01337 TRANSFAC - 154320475 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAAT 14 V_ZBP89_Q4_M01816 TRANSFAC - 154317657 154317666 4.0E-06 CCCTCCCCCA 10 V_HOXB9_01_M01426 TRANSFAC + 154317253 154317268 6.0E-06 GGAGCCATATAAATGG 16 V_ARID3A_02_M02839 TRANSFAC - 154325462 154325476 2.0E-06 CAGAATATCAAATCA 15 V_HOXA1_01_M01487 TRANSFAC + 154320471 154320486 3.0E-06 CTTTATTAATTAATTC 16 V_HOXA1_01_M01487 TRANSFAC - 154320473 154320488 5.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 V_IK1_01_M00086 TRANSFAC - 154316890 154316902 5.0E-06 ACTTGGGAATTCT 13 V_EVI1_01_M00078 TRANSFAC + 154321079 154321094 3.0E-06 GGACAAGGTTAGACTA 16 V_PMX2A_01_M01444 TRANSFAC + 154320471 154320486 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTC 16 V_PMX2A_01_M01444 TRANSFAC - 154320473 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAA 16 V_LHX2_01_M01325 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_LHX2_01_M01325 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC - 154320471 154320487 1.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_PAX4_05_M01385 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_GSH2_01_M01326 TRANSFAC - 154320471 154320486 4.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_GSH2_01_M01326 TRANSFAC + 154320473 154320488 1.0E-06 TTATTAATTAATTCAT 16 V_MEF2_03_M00232 TRANSFAC - 154325477 154325498 8.0E-06 TGGGGTTCTTAATTTAGAAGCA 22 V_NKX52_01_M01315 TRANSFAC - 154325405 154325421 3.0E-06 ACACTCAATTAAAACAA 17 V_YY1_Q6_02_M01035 TRANSFAC - 154320668 154320678 7.0E-06 GCCGCCATCTT 11 V_REX1_03_M01744 TRANSFAC + 154320668 154320679 1.0E-06 AAGATGGCGGCG 12 V_RAX_01_M01389 TRANSFAC - 154320471 154320487 3.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_RAX_01_M01389 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC + 154320471 154320486 1.0E-06 CTTTATTAATTAATTC 16 V_OCT1_08_M01354 TRANSFAC - 154320473 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAA 16 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_UNCX4.1_01_M01458 TRANSFAC - 154320472 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_HBP1_03_M02762 TRANSFAC - 154320476 154320491 6.0E-06 GGAATGAATTAATTAA 16 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 154320469 154320485 0.0E+00 AATTAATTAATAAAGGC 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 154320470 154320486 0.0E+00 CCTTTATTAATTAATTC 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC - 154320473 154320489 0.0E+00 AATGAATTAATTAATAA 17 V_PIT1_01_M01465 TRANSFAC + 154320474 154320490 0.0E+00 TATTAATTAATTCATTC 17 V_USF_01_M00121 TRANSFAC + 154316916 154316929 6.0E-06 GTGCCACGTGACTT 14 V_USF_01_M00121 TRANSFAC - 154316916 154316929 6.0E-06 AAGTCACGTGGCAC 14 V_GRE_C_M00205 TRANSFAC + 154325466 154325481 9.0E-06 TTGATATTCTGTGCTT 16 V_CRX_02_M01436 TRANSFAC + 154318012 154318027 1.0E-05 ATTAGAGGATTAGACT 16 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_OTP_01_M01323 TRANSFAC - 154320472 154320488 1.0E-06 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_GATA1_09_M02254 TRANSFAC + 154320333 154320343 7.0E-06 TCTGATAAGAA 11 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 154320470 154320486 0.0E+00 GAATTAATTAATAAAGG 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC + 154320473 154320489 0.0E+00 TTATTAATTAATTCATT 17 V_NCX_02_M01420 TRANSFAC - 154320474 154320490 0.0E+00 GAATGAATTAATTAATA 17 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC + 154320470 154320484 1.0E-06 CCTTTATTAATTAAT 15 V_HB24_01_M01399 TRANSFAC - 154320475 154320489 9.0E-06 AATGAATTAATTAAT 15 V_STAT4_Q5_M02117 TRANSFAC - 154320331 154320340 6.0E-06 TTATCAGAAA 10 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC - 154320471 154320487 1.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_ARID3A_04_M02735 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_PROP1_02_M01320 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_PMX2B_01_M01356 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_PMX2B_01_M01356 TRANSFAC - 154320472 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_SP1_01_M00008 TRANSFAC + 154317767 154317776 3.0E-06 GGGGCGGGGT 10 V_TBP_06_M02814 TRANSFAC + 154320470 154320485 4.0E-06 CCTTTATTAATTAATT 16 V_CTCF_02_M01259 TRANSFAC + 154325431 154325450 0.0E+00 AATTGGCCAGGAGAGGGCAC 20 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 154320472 154320481 3.0E-06 AATTAATAAA 10 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC + 154320474 154320483 1.0E-06 TATTAATTAA 10 V_LHX3b_01_M01971 TRANSFAC - 154320476 154320485 0.0E+00 AATTAATTAA 10 V_SOX11_03_M02795 TRANSFAC + 154324468 154324484 8.0E-06 TCAGGAACAATGACAAA 17 V_EMX2_01_M01461 TRANSFAC - 154320471 154320487 3.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_EMX2_01_M01461 TRANSFAC + 154320472 154320488 6.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_CTCF_01_M01200 TRANSFAC + 154325433 154325452 1.0E-06 TTGGCCAGGAGAGGGCACAT 20 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC + 154320471 154320487 1.0E-06 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_NKX63_01_M01470 TRANSFAC - 154320472 154320488 2.0E-06 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_ARX_02_M02945 TRANSFAC - 154320472 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_LIM1_01_M01418 TRANSFAC + 154320472 154320488 1.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_HOXB4_01_M01424 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_EN2_01_M01455 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_EN2_01_M01455 TRANSFAC + 154320472 154320488 2.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_HOXB7_01_M01396 TRANSFAC - 154320471 154320486 1.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_HOXB7_01_M01396 TRANSFAC + 154320473 154320488 0.0E+00 TTATTAATTAATTCAT 16 V_YY1_03_M02044 TRANSFAC - 154320667 154320678 3.0E-06 GCCGCCATCTTT 12 V_FXR_IR1_Q6_M00767 TRANSFAC - 154320321 154320333 6.0E-06 AAATGACTAACCT 13 V_HOXA7_02_M01336 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_S8_01_M00099 TRANSFAC - 154320473 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAA 16 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_SHOX2_01_M01415 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_AP3_Q6_M00690 TRANSFAC + 154325481 154325488 5.0E-06 TCTAAATT 8 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 154320469 154320485 0.0E+00 AATTAATTAATAAAGGC 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 154320470 154320486 0.0E+00 CCTTTATTAATTAATTC 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 154320473 154320489 0.0E+00 AATGAATTAATTAATAA 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC + 154320474 154320490 0.0E+00 TATTAATTAATTCATTC 17 V_BRN4_01_M01473 TRANSFAC - 154320477 154320493 6.0E-06 TGGGAATGAATTAATTA 17 V_HOXB8_01_M01451 TRANSFAC - 154320472 154320487 2.0E-06 TGAATTAATTAATAAA 16 V_HNF1_01_M00132 TRANSFAC - 154320471 154320485 7.0E-06 AATTAATTAATAAAG 15 V_GATA1_04_M00128 TRANSFAC + 154320332 154320344 3.0E-06 TTCTGATAAGAAA 13 V_BARHL1_01_M01332 TRANSFAC - 154320473 154320488 2.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 V_BARHL1_01_M01332 TRANSFAC - 154325407 154325422 7.0E-06 AACACTCAATTAAAAC 16 V_FOXL1_02_M02857 TRANSFAC - 154325380 154325395 8.0E-06 ACCTTAAAACAGAAAA 16 V_FOXL1_02_M02857 TRANSFAC - 154325401 154325416 0.0E+00 CAATTAAAACAAAATG 16 V_FOXL1_02_M02857 TRANSFAC - 154325457 154325472 5.0E-06 ATATCAAATCAAAAGT 16 V_ZSCAN4_04_M02942 TRANSFAC + 154318001 154318016 4.0E-06 AAAGGCACAAAATTAG 16 V_ZSCAN4_04_M02942 TRANSFAC - 154325468 154325483 5.0E-06 AGAAGCACAGAATATC 16 V_MAX_04_M02881 TRANSFAC + 154316916 154316929 0.0E+00 GTGCCACGTGACTT 14 V_NKX61_02_M01469 TRANSFAC + 154320471 154320486 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTC 16 V_DMRT7_01_M01151 TRANSFAC + 154325395 154325408 3.0E-06 TTGCTTCATTTTGT 14 V_ZFP206_01_M01742 TRANSFAC + 154320608 154320618 2.0E-06 TGCGCATGCGT 11 V_MSX1_02_M01412 TRANSFAC + 154320471 154320486 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTC 16 V_MSX1_02_M01412 TRANSFAC - 154320473 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAA 16 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_LMX1B_01_M01363 TRANSFAC - 154320472 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_NRF1_Q6_M00652 TRANSFAC - 154320608 154320617 2.0E-06 CGCATGCGCA 10 V_BARX2_01_M01431 TRANSFAC - 154320471 154320486 1.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_BARX2_01_M01431 TRANSFAC + 154320473 154320488 1.0E-06 TTATTAATTAATTCAT 16 V_STAT6_02_M00500 TRANSFAC - 154320592 154320599 1.0E-05 GATTTCCT 8 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_ALX4_03_M02944 TRANSFAC + 154320472 154320488 2.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_MEF3_B_M00319 TRANSFAC - 154320791 154320803 3.0E-06 TCCTCAGGTTATG 13 V_HOXC5_01_M01454 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_HOXC5_01_M01454 TRANSFAC + 154320472 154320488 2.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_ESX1_01_M01474 TRANSFAC - 154320472 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_VAX1_01_M01397 TRANSFAC - 154320471 154320486 1.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_VAX1_01_M01397 TRANSFAC + 154320473 154320488 3.0E-06 TTATTAATTAATTCAT 16 V_SOX18_04_M02905 TRANSFAC - 154320476 154320491 2.0E-06 GGAATGAATTAATTAA 16 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC - 154320470 154320486 0.0E+00 GAATTAATTAATAAAGG 17 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC + 154320473 154320489 0.0E+00 TTATTAATTAATTCATT 17 V_HOXD8_01_M01432 TRANSFAC - 154320474 154320490 5.0E-06 GAATGAATTAATTAATA 17 V_HOXB3_01_M01330 TRANSFAC - 154320471 154320487 1.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_SOX1_03_M02802 TRANSFAC + 154320474 154320489 5.0E-06 TATTAATTAATTCATT 16 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_ALX3_01_M01355 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_NKX12_01_M01427 TRANSFAC + 154320471 154320487 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTCA 17 V_NKX12_01_M01427 TRANSFAC - 154320472 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAATAAA 17 V_MOX1_01_M01443 TRANSFAC - 154320471 154320486 6.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_LHX9_01_M01367 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_LHX9_01_M01367 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_BSX_01_M01442 TRANSFAC - 154320471 154320486 6.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_BARHL2_01_M01446 TRANSFAC - 154320473 154320488 4.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 V_BARHL2_01_M01446 TRANSFAC - 154325407 154325422 4.0E-06 AACACTCAATTAAAAC 16 V_HOXA7_03_M01394 TRANSFAC - 154320471 154320486 1.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_HOXA7_03_M01394 TRANSFAC + 154320473 154320488 1.0E-06 TTATTAATTAATTCAT 16 V_S8_02_M01376 TRANSFAC - 154320471 154320487 1.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_S8_02_M01376 TRANSFAC + 154320472 154320488 4.0E-06 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC + 154320471 154320486 2.0E-06 CTTTATTAATTAATTC 16 V_HOXD3_01_M01338 TRANSFAC - 154320473 154320488 2.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 V_GATA5_03_M02756 TRANSFAC + 154320330 154320346 0.0E+00 ATTTCTGATAAGAAAAC 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_LHX5_01_M01353 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC - 154320469 154320484 3.0E-06 ATTAATTAATAAAGGC 16 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 154320471 154320486 0.0E+00 CTTTATTAATTAATTC 16 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC - 154320473 154320488 1.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 V_BRN3C_01_M01408 TRANSFAC + 154320475 154320490 2.0E-06 ATTAATTAATTCATTC 16 V_HMX3_02_M01413 TRANSFAC - 154320471 154320487 9.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_HMX3_02_M01413 TRANSFAC - 154325405 154325421 2.0E-06 ACACTCAATTAAAACAA 17 V_OG2_02_M01441 TRANSFAC - 154320471 154320487 1.0E-06 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_GATA6_04_M02757 TRANSFAC + 154320330 154320346 9.0E-06 ATTTCTGATAAGAAAAC 17 V_DLX1_01_M01439 TRANSFAC + 154320471 154320484 4.0E-06 CTTTATTAATTAAT 14 V_DLX1_01_M01439 TRANSFAC - 154320475 154320488 0.0E+00 ATGAATTAATTAAT 14 V_AP2ALPHA_03_M01047 TRANSFAC + 154318037 154318051 7.0E-06 ACCGCCCCAGGCTAC 15 V_AP2ALPHA_03_M01047 TRANSFAC - 154318037 154318051 7.0E-06 GTAGCCTGGGGCGGT 15 V_EHF_07_M02849 TRANSFAC + 154321047 154321062 3.0E-06 TGCGATTTCCGAACGT 16 V_HNF1A_01_M02162 TRANSFAC - 154320472 154320485 5.0E-06 AATTAATTAATAAA 14 V_SOX5_04_M02910 TRANSFAC - 154325480 154325494 1.0E-06 GTTCTTAATTTAGAA 15 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC - 154320471 154320487 0.0E+00 TGAATTAATTAATAAAG 17 V_ALX3_02_M02943 TRANSFAC + 154320472 154320488 0.0E+00 TTTATTAATTAATTCAT 17 V_FEV_01_M02269 TRANSFAC + 154320591 154320598 1.0E-05 CAGGAAAT 8 V_GLIS2_04_M02863 TRANSFAC - 154320470 154320483 3.0E-06 TTAATTAATAAAGG 14 V_GLIS2_04_M02863 TRANSFAC + 154320472 154320485 2.0E-06 TTTATTAATTAATT 14 V_HOXB5_01_M01319 TRANSFAC + 154320473 154320488 2.0E-06 TTATTAATTAATTCAT 16 V_SOX9_Q4_M01284 TRANSFAC + 154317485 154317495 9.0E-06 GTACAAAGGGC 11 V_HOX13_02_M01452 TRANSFAC - 154320471 154320486 3.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_HOX13_02_M01452 TRANSFAC + 154320473 154320488 9.0E-06 TTATTAATTAATTCAT 16 V_NANOG_02_M01247 TRANSFAC + 154324466 154324485 9.0E-06 TGTCAGGAACAATGACAAAA 20 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC + 154320471 154320486 3.0E-06 CTTTATTAATTAATTC 16 V_HOXC8_01_M01321 TRANSFAC - 154320473 154320488 2.0E-06 ATGAATTAATTAATAA 16 V_IPF1_06_M01438 TRANSFAC - 154320471 154320486 3.0E-06 GAATTAATTAATAAAG 16 V_IPF1_06_M01438 TRANSFAC + 154320473 154320488 1.0E-06 TTATTAATTAATTCAT 16

Need help? Please contact cplaisier(at)systemsbiology.org if you have any questions, comments or concerns. Developed at the Institute for Systems Biology in the Baliga Lab.