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NPHP3 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 27031 nephronophthisis 3 (adolescent) chr3 - 132440803 - 132446303 132441303 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the NPHP3 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 9.0E-06 CTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 9.0E-06 CTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 DLX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 6.0E-06 ACTAATTAAC 10 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 132441808 132441818 6.0E-06 GCCACTCCCCC 11 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 0.0E+00 ACTAATTAAC 10 HINFP1_C2H2_full_dimeric_20_1 SELEX + 132441189 132441208 2.0E-06 GCGGTCCCCATGGCGTCCGT 20 HINFP1_C2H2_full_dimeric_20_1 SELEX - 132441189 132441208 1.0E-06 ACGGACGCCATGGGGACCGC 20 FOXC1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 132445562 132445572 1.0E-05 ATAGTAAATAT 11 SOX7_HMG_full_dimeric_17_2 SELEX + 132445566 132445582 9.0E-06 TAAATATTTCAGTCTTT 17 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 9.0E-06 CTAATTAA 8 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 1.0E-06 ACTAATTAAC 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 7.0E-06 ACTAATTAAC 10 GBX2_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 1.0E-06 ACTAATTAAC 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 132442057 132442072 8.0E-06 CTGAAAAATTTATGGA 16 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX + 132445288 132445303 1.0E-06 TTTAGGAACTAATTAA 16 POU6F2_POU_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 132445288 132445303 1.0E-06 TTAATTAGTTCCTAAA 16 MEF2A_MA0052.1 JASPAR + 132445283 132445292 6.0E-06 CTAATTTTAG 10 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 0.0E+00 ACTAATTAAC 10 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 2.0E-06 ACTAATTAAC 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 1.0E-06 ACTAATTAAC 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 1.0E-06 ACTAATTAAC 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 9.0E-06 CTAATTAA 8 EMX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 1.0E-06 ACTAATTAAC 10 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 Gfi_MA0038.1 JASPAR - 132445331 132445340 2.0E-06 TAAATCACAG 10 MEOX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 5.0E-06 ACTAATTAAC 10 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 132441780 132441796 5.0E-06 CTAGCCCCGCCCTTCTT 17 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 0.0E+00 ACTAATTAAC 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 5.0E-06 ACTAATTAAC 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 9.0E-06 CTAATTAA 8 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 132441719 132441729 1.0E-05 GCCCCGCCCAC 11 EN1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 1.0E-06 ACTAATTAAC 10 GBX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 2.0E-06 ACTAATTAAC 10 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 132445295 132445304 1.0E-06 GTTAATTAGT 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 3.0E-06 ACTAATTAAC 10 LHX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 0.0E+00 ACTAATTAAC 10 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 132445296 132445310 4.0E-06 CTAATTAACAATAGG 15 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 132445296 132445310 6.0E-06 CCTATTGTTAATTAG 15 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 132445375 132445386 1.0E-06 AATTATTTTTTT 12 MGA_TBX_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 132445329 132445346 4.0E-06 AGCTGTGATTTAACATTT 18 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 1.0E-06 ACTAATTAAC 10 LHX9_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 2.0E-06 ACTAATTAAC 10 SPDEF_ETS_full_putative-multimer_16_1 SELEX - 132442026 132442041 3.0E-06 CCAGAAAGGAGTTTCC 16 MEOX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 0.0E+00 ACTAATTAAC 10 HLF_MA0043.1 JASPAR - 132445509 132445520 8.0E-06 TGTTTCATAATA 12 LBX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 1.0E-06 ACTAATTAAC 10 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 2.0E-06 ACTAATTAAC 10 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 5.0E-06 CTAATTAA 8 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 132445507 132445518 5.0E-06 ATTATTATGAAA 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 132445507 132445518 8.0E-06 TTTCATAATAAT 12 EMX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 5.0E-06 ACTAATTAAC 10 EMX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 132445295 132445304 9.0E-06 GTTAATTAGT 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 7.0E-06 ACTAATTAAC 10 FOXB1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 132445562 132445572 6.0E-06 ATAGTAAATAT 11 TP63_p53l_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 132445482 132445499 3.0E-06 CACAAGTAATAACATGAC 18 TP63_p53l_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 132445482 132445499 4.0E-06 GTCATGTTATTACTTGTG 18 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 132442057 132442070 3.0E-06 CTGAAAAATTTATG 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 132445296 132445303 9.0E-06 CTAATTAA 8 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 132445295 132445304 2.0E-06 ACTAATTAAC 10 LHX6_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 132445295 132445304 4.0E-06 GTTAATTAGT 10 Zfx_MA0146.1 JASPAR - 132441117 132441130 3.0E-06 GGCGGCGAGGCCTG 14 Zfx_MA0146.1 JASPAR - 132441960 132441973 8.0E-06 GGGACCCAGGCCTG 14 V_HNF3B_01_M00131 TRANSFAC - 132445562 132445576 1.0E-06 TGAAATATTTACTAT 15 V_KLF15_Q2_M01714 TRANSFAC + 132441804 132441817 2.0E-06 GATGGGGGGAGTGG 14 V_MSX3_01_M01341 TRANSFAC + 132445291 132445306 1.0E-06 AGGAACTAATTAACAA 16 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 132445293 132445309 1.0E-06 GAACTAATTAACAATAG 17 V_FOXP3_Q4_M00992 TRANSFAC - 132445483 132445499 4.0E-06 GTCATGTTATTACTTGT 17 V_ZFP187_03_M02830 TRANSFAC + 132445392 132445405 4.0E-06 GTATGTATTAAAAA 14 V_CDX2_Q5_01_M01659 TRANSFAC - 132442062 132442072 6.0E-06 TCCATAAATTT 11 V_XFD1_01_M00267 TRANSFAC + 132445562 132445575 3.0E-06 ATAGTAAATATTTC 14 V_SOX14_05_M02902 TRANSFAC + 132439122 132439136 1.0E-06 CTGACACAATGAATG 15 V_SRY_07_M02813 TRANSFAC + 132445503 132445518 6.0E-06 GGAAATTATTATGAAA 16 V_FOXA2_04_M02749 TRANSFAC + 132445560 132445576 2.0E-06 AAATAGTAAATATTTCA 17 V_ZFX_01_M01593 TRANSFAC + 132441114 132441129 1.0E-05 TCGCAGGCCTCGCCGC 16 V_RORA1_01_M00156 TRANSFAC - 132445277 132445289 6.0E-06 AAATTAGGGTCAT 13 V_FOXD3_01_M00130 TRANSFAC - 132445375 132445386 0.0E+00 AATTATTTTTTT 12 V_HP1SITEFACTOR_Q6_M00725 TRANSFAC - 132445501 132445512 5.0E-06 AATAATTTCCAG 12 V_HOXA3_01_M00395 TRANSFAC + 132445282 132445290 7.0E-06 CCTAATTTT 9 V_SOX5_01_M00042 TRANSFAC + 132445300 132445309 2.0E-06 TTAACAATAG 10 V_FOXJ1_04_M02854 TRANSFAC + 132445485 132445499 5.0E-06 AAGTAATAACATGAC 15 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 132441292 132441301 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 132441437 132441446 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 132441496 132441505 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 132441514 132441523 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 132441519 132441528 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 132441600 132441609 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 132441658 132441667 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 132441707 132441716 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_SRY_02_M00160 TRANSFAC + 132445299 132445310 1.0E-06 ATTAACAATAGG 12 V_CEBP_C_M00201 TRANSFAC + 132445507 132445524 8.0E-06 ATTATTATGAAACAGACA 18 V_NFAT3_Q3_M01734 TRANSFAC - 132445372 132445381 6.0E-06 TTTTTTTCCT 10 V_GBX2_01_M01382 TRANSFAC + 132445292 132445308 5.0E-06 GGAACTAATTAACAATA 17 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 132445292 132445308 1.0E-06 TATTGTTAATTAGTTCC 17 V_SOX11_04_M02899 TRANSFAC + 132445504 132445517 1.0E-06 GAAATTATTATGAA 14 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC - 132445291 132445307 3.0E-06 ATTGTTAATTAGTTCCT 17 V_HOXD1_01_M01448 TRANSFAC + 132445292 132445308 4.0E-06 GGAACTAATTAACAATA 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC - 132445291 132445307 4.0E-06 ATTGTTAATTAGTTCCT 17 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC + 132445292 132445308 1.0E-06 GGAACTAATTAACAATA 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 132445292 132445308 1.0E-06 GGAACTAATTAACAATA 17 V_GKLF_02_M01588 TRANSFAC - 132441782 132441793 5.0E-06 GCCCCGCCCTTC 12 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC + 132445292 132445308 5.0E-06 GGAACTAATTAACAATA 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 132445291 132445307 3.0E-06 AGGAACTAATTAACAAT 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 132445292 132445308 4.0E-06 TATTGTTAATTAGTTCC 17 V_NERF_Q2_M00531 TRANSFAC + 132441794 132441811 2.0E-06 TAGCAGGAAGGATGGGGG 18 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 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