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DFNB31 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 25861 deafness, autosomal recessive 31 chr9 - 117264995 - 117272736 117265495 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the DFNB31 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints CTCF_MA0139.1 JASPAR + 117266710 117266728 6.0E-06 CTGCCTGTAGGGGGTGGTG 19 HOXD12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 117263825 117263833 1.0E-06 GTAATAAAA 9 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117270689 117270701 6.0E-06 GTTAAAATCAACA 13 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX - 117263824 117263833 0.0E+00 GTAATAAAAA 10 MESP1_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 117265487 117265496 5.0E-06 AACACCTGCG 10 Foxa2_MA0047.2 JASPAR - 117264693 117264704 3.0E-06 TGTTTACTCTTG 12 EVX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 2.0E-06 AGTAATTAGC 10 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 117263815 117263832 8.0E-06 TTAATTTAATTTTTATTA 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 117263816 117263833 0.0E+00 GTAATAAAAATTAAATTA 18 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 117263824 117263833 1.0E-06 GTAATAAAAA 10 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 117270250 117270259 3.0E-06 ACAATTAAAA 10 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 117263816 117263832 9.0E-06 TAATTTAATTTTTATTA 17 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 117270242 117270258 6.0E-06 CAATTAAAAGTGGCTTT 17 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 117270253 117270269 4.0E-06 GCGTTAATGAACAATTA 17 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 117267796 117267806 1.0E-05 GCCCCGCCCCC 11 POU3F3_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 117270363 117270374 6.0E-06 AAGAATAAATTG 12 FOXA1_MA0148.1 JASPAR - 117264694 117264704 1.0E-06 TGTTTACTCTT 11 EVX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 2.0E-06 AGTAATTAGC 10 FOXF2_MA0030.1 JASPAR + 117264693 117264706 1.0E-06 CAAGAGTAAACAAA 14 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 117263815 117263827 1.0E-06 TTAATTTAATTTT 13 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117263815 117263827 0.0E+00 AAAATTAAATTAA 13 FOXG1_forkhead_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 117264688 117264704 3.0E-06 AGCAGCAAGAGTAAACA 17 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 117264695 117264706 1.0E-06 AGAGTAAACAAA 12 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 117263810 117263827 3.0E-06 TTAATTTAATTTAATTTT 18 PDX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 117263810 117263827 1.0E-06 AAAATTAAATTAAATTAA 18 IRX2_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 117268194 117268205 8.0E-06 TGACATGACAAA 12 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 117267795 117267808 9.0E-06 GGCCCCGCCCCCTC 14 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 117264697 117264709 0.0E+00 AGTAAACAAACAA 13 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX - 117268104 117268116 6.0E-06 ATCAAACAAACAA 13 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 117263815 117263827 1.0E-06 TTAATTTAATTTT 13 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117263815 117263827 0.0E+00 AAAATTAAATTAA 13 FOXO1_forkhead_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 117264698 117264705 7.0E-06 GTAAACAA 8 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 117263815 117263827 1.0E-06 TTAATTTAATTTT 13 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 117270189 117270202 4.0E-06 GAATAATATTTTCC 14 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 117261419 117261448 4.0E-06 AATAAATAACCACAAGTGCACTTGCCCCAT 30 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 6.0E-06 AGTAATTAGC 10 ZIC4_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX + 117268232 117268246 9.0E-06 GGCCACCTACTGTGT 15 TEAD1_TEA_full_monomeric_10_1 SELEX - 117270307 117270316 9.0E-06 AACATTCCTA 10 Tcfcp2l1_MA0145.1 JASPAR + 117270273 117270286 8.0E-06 CCAGCTCTGGCCAG 14 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 117263824 117263833 7.0E-06 GTAATAAAAA 10 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 117263816 117263826 2.0E-06 TAATTTAATTT 11 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 117263816 117263826 2.0E-06 AAATTAAATTA 11 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX - 117263825 117263834 1.0E-06 TGTAATAAAA 10 HMX3_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 117270250 117270260 0.0E+00 AACAATTAAAA 11 FOXD3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 117270189 117270202 4.0E-06 GAATAATATTTTCC 14 HOXC12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 117263825 117263833 1.0E-06 GTAATAAAA 9 Foxc1_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 117264698 117264708 0.0E+00 GTAAACAAACA 11 E2F8_E2F_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 117268080 117268091 2.0E-06 TTTCCCCCCGAA 12 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 5.0E-06 AGTAATTAGC 10 HOXD13_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 117263824 117263833 2.0E-06 GTAATAAAAA 10 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 117263815 117263827 1.0E-06 TTAATTTAATTTT 13 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 117263815 117263827 0.0E+00 AAAATTAAATTAA 13 Lhx8_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 117263810 117263827 6.0E-06 AAAATTAAATTAAATTAA 18 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 7.0E-06 AGTAATTAGC 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 117263819 117263828 9.0E-06 AAAAATTAAA 10 HOXC11_homeodomain_full_monomeric_11_2 SELEX - 117263824 117263834 1.0E-06 TGTAATAAAAA 11 HOXC11_homeodomain_full_monomeric_11_2 SELEX - 117270250 117270260 1.0E-05 AACAATTAAAA 11 EMX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 3.0E-06 AGTAATTAGC 10 SP1_MA0079.2 JASPAR + 117267797 117267806 7.0E-06 CCCCGCCCCC 10 Ascl2_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX - 117266768 117266777 9.0E-06 ACCAGCTGCT 10 FOXI1_MA0042.1 JASPAR - 117264700 117264711 1.0E-06 GCTTGTTTGTTT 12 FOXI1_MA0042.1 JASPAR + 117268102 117268113 1.0E-06 TTTTGTTTGTTT 12 HNF4A_nuclearreceptor_full_dimeric_16_1 SELEX + 117264035 117264050 4.0E-06 AAGTCTGAAGTCCAGT 16 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 117263815 117263827 1.0E-06 TTAATTTAATTTT 13 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117263815 117263827 0.0E+00 AAAATTAAATTAA 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 117270189 117270202 9.0E-06 GAATAATATTTTCC 14 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 117263816 117263826 1.0E-06 TAATTTAATTT 11 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 117263816 117263826 3.0E-06 AAATTAAATTA 11 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 117263815 117263827 1.0E-06 TTAATTTAATTTT 13 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117263815 117263827 0.0E+00 AAAATTAAATTAA 13 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX + 117267793 117267809 8.0E-06 CGGGCCCCGCCCCCTCG 17 BCL6B_C2H2_DBD_monomeric_17_1 SELEX + 117268044 117268060 5.0E-06 CGCTTTGGAGTAATTAG 17 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 117263812 117263824 5.0E-06 AATTTAATTTAAT 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 117263814 117263826 6.0E-06 AAATTAAATTAAA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 117263816 117263828 8.0E-06 TAATTTAATTTTT 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 117263817 117263829 4.0E-06 AATTTAATTTTTA 13 FOXC2_forkhead_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 117264698 117264708 0.0E+00 GTAAACAAACA 11 SOX7_HMG_full_dimeric_16_1 SELEX - 117270245 117270260 4.0E-06 AACAATTAAAAGTGGC 16 SOX7_HMG_full_dimeric_16_1 SELEX + 117270363 117270378 9.0E-06 AAGAATAAATTGTGTT 16 GBX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 6.0E-06 AGTAATTAGC 10 HOXA13_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 117263824 117263833 3.0E-06 GTAATAAAAA 10 ZSCAN4_C2H2_full_monomeric_15_1 SELEX + 117263859 117263873 1.0E-05 CACACACACTGAATC 15 RFX4_RFX_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 117267878 117267892 6.0E-06 CGTCTCCAGGCAACG 15 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 117263816 117263833 0.0E+00 GTAATAAAAATTAAATTA 18 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 117263816 117263826 1.0E-06 TAATTTAATTT 11 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 117263816 117263826 9.0E-06 AAATTAAATTA 11 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 117263815 117263827 0.0E+00 TTAATTTAATTTT 13 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117263815 117263827 2.0E-06 AAAATTAAATTAA 13 Foxd3_MA0041.1 JASPAR - 117264700 117264711 5.0E-06 GCTTGTTTGTTT 12 Foxd3_MA0041.1 JASPAR + 117268102 117268113 1.0E-06 TTTTGTTTGTTT 12 Foxd3_MA0041.1 JASPAR + 117268106 117268117 3.0E-06 GTTTGTTTGATT 12 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 117263815 117263827 0.0E+00 TTAATTTAATTTT 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117263815 117263827 5.0E-06 AAAATTAAATTAA 13 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 6.0E-06 AGTAATTAGC 10 Stat3_MA0144.1 JASPAR + 117270315 117270324 4.0E-06 TTCCTGGAAA 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 6.0E-06 AGTAATTAGC 10 FEV_MA0156.1 JASPAR + 117267846 117267853 1.0E-05 CAGGAAAT 8 POU6F2_POU_full_monomeric_10_1 SELEX - 117268052 117268061 3.0E-06 GCTAATTACT 10 SPDEF_ETS_full_putative-multimer_16_1 SELEX - 117264669 117264684 4.0E-06 AGAGTAAAACCTAAAC 16 SPDEF_ETS_full_putative-multimer_16_1 SELEX + 117270355 117270370 9.0E-06 GAAGGAAGAAGAATAA 16 TBX21_TBX_full_dimeric_19_1 SELEX + 117264742 117264760 1.0E-06 TAACAGCACCATGGTGTTA 19 TBX21_TBX_full_dimeric_19_1 SELEX - 117264742 117264760 5.0E-06 TAACACCATGGTGCTGTTA 19 SOX21_HMG_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 117270245 117270260 4.0E-06 AACAATTAAAAGTGGC 16 Rhox11_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 117264741 117264749 2.0E-06 TGCTGTTAA 9 HOXC13_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 117263824 117263833 3.0E-06 GTAATAAAAA 10 HMX2_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 117270250 117270260 0.0E+00 AACAATTAAAA 11 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 117263816 117263826 0.0E+00 TAATTTAATTT 11 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX - 117263816 117263826 3.0E-06 AAATTAAATTA 11 CPEB1_RRM_full_monomeric_8_1 SELEX - 117263824 117263831 4.0E-06 AATAAAAA 8 FOXB1_forkhead_full_monomeric_9_1 SELEX + 117264697 117264705 7.0E-06 AGTAAACAA 9 TP53_MA0106.1 JASPAR + 117267639 117267658 4.0E-06 CGGGGCATGTCCGGGGCAGC 20 REST_MA0138.2 JASPAR + 117266930 117266950 6.0E-06 CTCAGCAGCGCGGTCAGCGCT 21 IRF3_IRF_full_trimeric_21_1 SELEX - 117268143 117268163 5.0E-06 TAAGGAAGAAAACCGAGACTG 21 FOXO3_forkhead_full_monomeric_8_1 SELEX + 117264698 117264705 7.0E-06 GTAAACAA 8 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 117263819 117263830 8.0E-06 ATAAAAATTAAA 12 EMX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 117268052 117268061 3.0E-06 AGTAATTAGC 10 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 117263815 117263832 6.0E-06 TTAATTTAATTTTTATTA 18 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 117263816 117263833 0.0E+00 GTAATAAAAATTAAATTA 18 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 117263824 117263834 2.0E-06 TGTAATAAAAA 11 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 117264696 117264708 0.0E+00 GAGTAAACAAACA 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117268101 117268113 1.0E-06 AAACAAACAAAAA 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 117268105 117268117 2.0E-06 AATCAAACAAACA 13 CDX2_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 117263825 117263833 1.0E-06 GTAATAAAA 9 CDX1_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 117263825 117263833 1.0E-06 GTAATAAAA 9 HOXA10_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 117263824 117263834 0.0E+00 TGTAATAAAAA 11 Irx3_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 117268194 117268205 1.0E-06 TGACATGACAAA 12 TCF3_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 117265487 117265496 7.0E-06 AACACCTGCG 10 ZIC1_C2H2_full_monomeric_14_1 SELEX + 117268232 117268245 8.0E-06 GGCCACCTACTGTG 14 HMX1_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 117270250 117270260 0.0E+00 AACAATTAAAA 11 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 117268098 117268111 9.0E-06 ACAAACAAAAAACT 14 IRX5_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 117268194 117268205 9.0E-06 TGACATGACAAA 12 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC - 117263809 117263825 4.0E-06 AATTAAATTAAATTAAA 17 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC - 117263814 117263830 8.0E-06 ATAAAAATTAAATTAAA 17 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC - 117263820 117263836 2.0E-06 TGTGTAATAAAAATTAA 17 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 117268100 117268119 1.0E-06 TTTTTTGTTTGTTTGATTTT 20 V_CEBPG_Q6_M00622 TRANSFAC - 117270072 117270084 1.0E-06 CTTATTTCTGAAT 13 V_HNF3B_01_M00131 TRANSFAC - 117264699 117264713 5.0E-06 TAGCTTGTTTGTTTA 15 V_STAT5A_Q6_M01890 TRANSFAC - 117270315 117270327 8.0E-06 AAGTTTCCAGGAA 13 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 117263809 117263825 6.0E-06 AATTAAATTAAATTAAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 117263810 117263826 7.0E-06 AAATTAAATTAAATTAA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 117263816 117263832 5.0E-06 TAATTTAATTTTTATTA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 117263817 117263833 7.0E-06 AATTTAATTTTTATTAC 17 V_FREAC7_01_M00293 TRANSFAC - 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