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SKA3 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 221150 spindle and kinetochore associated complex subunit 3 chr13 - 21750241 - 21755741 21750741 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the SKA3 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints FOXB1_forkhead_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 21749905 21749922 6.0E-06 TATACACATATTTTTTTA 18 POU4F2_POU_full_monomeric_16_1 SELEX + 21745770 21745785 4.0E-06 GTTAATAATTAATCTT 16 FOXO4_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 21749906 21749919 6.0E-06 AAAAATATGTGTAT 14 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21750085 21750097 2.0E-06 GTAAACCTAAACA 13 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 21750452 21750462 1.0E-05 GCCACGCCCCT 11 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 21755076 21755089 1.0E-06 AATGATTATTCATG 14 POU2F1_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 21755076 21755089 0.0E+00 CATGAATAATCATT 14 DLX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 8.0E-06 AATAATTAAT 10 IRF7_IRF_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 21748977 21748990 3.0E-06 GCTAAAACGAAAAA 14 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 21750452 21750462 7.0E-06 GCCACGCCCCT 11 SOX2_HMG_full_dimeric_17_1 SELEX - 21749074 21749090 8.0E-06 CATCAATTTCATTAGTC 17 FOXG1_forkhead_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 21754976 21754992 2.0E-06 AAAAAAAAAAAAAAACA 17 MEF2D_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 21749897 21749908 6.0E-06 TATATAAATAAA 12 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21749897 21749908 0.0E+00 TATATAAATAAA 12 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21754974 21754985 6.0E-06 AAAAAAAACAAT 12 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 21745774 21745781 4.0E-06 ATAATTAA 8 TEF_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 21750224 21750235 7.0E-06 TATAACGTAATA 12 TEF_bZIP_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 21750224 21750235 5.0E-06 TATTACGTTATA 12 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX + 21745769 21745781 8.0E-06 AGTTAATAATTAA 13 FOXL1_forkhead_full_dimeric_13_1 SELEX - 21749898 21749910 1.0E-06 TGTATATAAATAA 13 ZNF435_C2H2_full_dimeric_18_1 SELEX + 21755109 21755126 1.0E-05 CCTGTTATCCCAGCACTT 18 HNF1B_MA0153.1 JASPAR + 21745771 21745782 0.0E+00 TTAATAATTAAT 12 FOXC1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 21749898 21749908 1.0E-06 TATATAAATAA 11 FOXC1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 21749912 21749922 8.0E-06 TAAAAAAATAT 11 POU1F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 21748152 21748165 5.0E-06 GAAATGCAAATCAA 14 POU1F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 21749027 21749040 1.0E-06 GAAATGCAAATTAA 14 POU1F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 21749054 21749067 9.0E-06 GAAATGCAAATTTC 14 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21749049 21749061 1.0E-05 CAAATTTCATTAG 13 MEF2A_MADS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 21749897 21749908 2.0E-06 TATATAAATAAA 12 ISL2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 21750203 21750210 1.0E-05 GCACTTAA 8 POU2F2_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 21749029 21749039 3.0E-06 AAATGCAAATT 11 POU2F2_POU_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 21749056 21749066 3.0E-06 AAATGCAAATT 11 POU3F4_POU_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 21748154 21748162 7.0E-06 AATGCAAAT 9 POU3F4_POU_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 21749030 21749038 7.0E-06 AATGCAAAT 9 POU3F4_POU_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 21749057 21749065 7.0E-06 AATGCAAAT 9 NKX3-2_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 21750203 21750211 7.0E-06 AGCACTTAA 9 Sox1_HMG_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21749076 21749088 4.0E-06 TCAATTTCATTAG 13 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 21755072 21755085 1.0E-05 TAAAAATGATTATT 14 FOXD2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 21755072 21755085 1.0E-05 AATAATCATTTTTA 14 Pax4_MA0068.1 JASPAR - 21754961 21754990 4.0E-06 AAAAAAAAAAAAACAATGTGTCTTCACCAT 30 E2F7_E2F_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 21749966 21749979 3.0E-06 TTTTCCCGCTAAAC 14 BARHL2_homeodomain_full_dimeric_16_1 SELEX - 21755068 21755083 7.0E-06 TAATCATTTTTAAAAA 16 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 0.0E+00 AATAATTAAT 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 21745773 21745782 5.0E-06 ATTAATTATT 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 21745767 21745782 4.0E-06 ATTAATTATTAACTGT 16 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 21745770 21745785 1.0E-06 GTTAATAATTAATCTT 16 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX - 21749049 21749064 8.0E-06 ATGCAAATTTCATTAG 16 Barhl1_homeodomain_DBD_dimeric_16_1 SELEX - 21755068 21755083 7.0E-06 TAATCATTTTTAAAAA 16 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 21749050 21749060 5.0E-06 AAATTTCATTA 11 POU3F3_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 21749028 21749040 2.0E-06 GAAATGCAAATTA 13 POU3F3_POU_DBD_monomeric_13_1 SELEX - 21749055 21749067 2.0E-06 GAAATGCAAATTT 13 TCF4_bHLH_full_dimeric_10_1 SELEX + 21755105 21755114 5.0E-06 CACACCTGTT 10 E2F8_E2F_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 21749967 21749978 7.0E-06 TTTCCCGCTAAA 12 MEF2A_MA0052.1 JASPAR + 21749898 21749907 1.0E-05 TTATTTATAT 10 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 6.0E-06 AATAATTAAT 10 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 21749049 21749061 9.0E-06 CAAATTTCATTAG 13 FOXJ3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 21750314 21750327 0.0E+00 ATAAACCATAAACA 14 FOXJ3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 21754976 21754989 4.0E-06 AAAAAAAAAAAACA 14 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 21745769 21745783 0.0E+00 AGTTAATAATTAATC 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 21745769 21745783 0.0E+00 GATTAATTATTAACT 15 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 2.0E-06 AATAATTAAT 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 9.0E-06 AATAATTAAT 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 4.0E-06 AATAATTAAT 10 OTX2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 21745831 21745838 7.0E-06 TTAATCCT 8 Pou2f2_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 21755076 21755089 3.0E-06 AATGATTATTCATG 14 Pou2f2_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 21755076 21755089 4.0E-06 CATGAATAATCATT 14 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 21755077 21755088 1.0E-06 ATGATTATTCAT 12 POU2F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 21755077 21755088 0.0E+00 ATGAATAATCAT 12 FOXB1_forkhead_DBD_putative-multimer_14_1 SELEX - 21755007 21755020 4.0E-06 GGGTGACACAGCGA 14 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21749049 21749061 7.0E-06 CAAATTTCATTAG 13 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX + 21750449 21750465 8.0E-06 CTCGCCACGCCCCTCCG 17 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 21745774 21745781 9.0E-06 ATAATTAA 8 NFATC1_NFAT_full_dimeric_20_1 SELEX - 21749052 21749071 9.0E-06 CAAGGAAATGCAAATTTCAT 20 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 21745774 21745781 9.0E-06 TTAATTAT 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 21745772 21745784 1.0E-06 AGATTAATTATTA 13 Lhx3_MA0135.1 JASPAR - 21749021 21749033 8.0E-06 AAATTAAATCTCA 13 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 21745774 21745781 9.0E-06 ATAATTAA 8 ESR1_nuclearreceptor_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 21749184 21749200 6.0E-06 GAGGTTGCAGTGACCCG 17 SOX7_HMG_full_dimeric_16_1 SELEX - 21748958 21748973 7.0E-06 AAAATTACCAAGTGTT 16 POU1F1_POU_DBD_monomeric_17_1 SELEX - 21755075 21755091 1.0E-06 AGCATGAATAATCATTT 17 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 21745770 21745782 0.0E+00 GTTAATAATTAAT 13 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 21745770 21745782 0.0E+00 ATTAATTATTAAC 13 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 21748153 21748164 5.0E-06 AAATGCAAATCA 12 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21749028 21749039 1.0E-06 AAATGCAAATTA 12 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21749055 21749066 1.0E-06 AAATGCAAATTT 12 Foxd3_MA0041.1 JASPAR + 21754973 21754984 3.0E-06 CATTGTTTTTTT 12 PITX1_homeodomain_full_monomeric_9_1 SELEX + 21745830 21745838 2.0E-06 TTTAATCCT 9 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21749049 21749061 8.0E-06 CAAATTTCATTAG 13 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 3.0E-06 AATAATTAAT 10 PRDM1_C2H2_full_monomeric-or-dimeric_15_1 SELEX - 21750239 21750253 6.0E-06 AGATAATGAAAGTAG 15 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 3.0E-06 AATAATTAAT 10 POU3F1_POU_DBD_monomeric_12_2 SELEX - 21745771 21745782 1.0E-05 ATTAATTATTAA 12 MAX_MA0058.1 JASPAR + 21750004 21750013 4.0E-06 GACCACGTGA 10 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 21755077 21755088 2.0E-06 ATGATTATTCAT 12 POU5F1P1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21755077 21755088 1.0E-06 ATGAATAATCAT 12 Pou5f1_MA0142.1 JASPAR + 21754926 21754940 6.0E-06 CATTCACATTTTAAT 15 POU2F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21749029 21749040 9.0E-06 GAAATGCAAATT 12 POU2F1_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21749056 21749067 9.0E-06 GAAATGCAAATT 12 FOXI1_forkhead_full_dimeric_17_1 SELEX - 21749897 21749913 1.0E-05 ATGTGTATATAAATAAA 17 Meis2_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 21755104 21755115 8.0E-06 TAACAGGTGTGA 12 IRF3_IRF_full_trimeric_21_1 SELEX + 21748150 21748170 7.0E-06 GAGAAATGCAAATCAAAACCA 21 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 21745769 21745783 0.0E+00 AGTTAATAATTAATC 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 21745769 21745783 0.0E+00 GATTAATTATTAACT 15 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 21745774 21745785 9.0E-06 AAGATTAATTAT 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 21755077 21755088 1.0E-06 ATGATTATTCAT 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 21755077 21755088 0.0E+00 ATGAATAATCAT 12 NRF1_NRF_full_dimeric_12_1 SELEX - 21750722 21750733 5.0E-06 TGCGCCTGCGCA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 21748153 21748164 5.0E-06 AAATGCAAATCA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21749028 21749039 1.0E-06 AAATGCAAATTA 12 POU3F2_POU_DBD_monomeric_12_1 SELEX - 21749055 21749066 2.0E-06 AAATGCAAATTT 12 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 21745773 21745782 4.0E-06 AATAATTAAT 10 SNAI2_C2H2_DBD_monomeric_9_1 SELEX - 21755106 21755114 3.0E-06 AACAGGTGT 9 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21749895 21749907 6.0E-06 ATATAAATAAAGC 13 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21754976 21754988 4.0E-06 AAAAAAAAAAACA 13 FOXO6_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 21749906 21749919 6.0E-06 ATACACATATTTTT 14 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21749947 21749959 5.0E-06 GCCAACACAAACA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21750085 21750097 6.0E-06 GTAAACCTAAACA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21754976 21754988 1.0E-06 AAAAAAAAAAACA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21754978 21754990 6.0E-06 AAAAAAAAAAAAA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21754979 21754991 6.0E-06 AAAAAAAAAAAAA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21754980 21754992 6.0E-06 AAAAAAAAAAAAA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21754981 21754993 6.0E-06 AAAAAAAAAAAAA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21754982 21754994 6.0E-06 AAAAAAAAAAAAA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 21754983 21754995 6.0E-06 AAAAAAAAAAAAA 13 FOXB1_forkhead_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 21749898 21749908 1.0E-06 TATATAAATAA 11 TBX1_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 21750033 21750052 5.0E-06 ATGTGTAAAGTATTGTGTAA 20 TBX1_TBX_DBD_dimeric_20_1 SELEX - 21755104 21755123 3.0E-06 TGCTGGGATAACAGGTGTGA 20 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 21745769 21745782 2.0E-06 ATTAATTATTAACT 14 POU4F1_POU_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 21745770 21745783 1.0E-06 GTTAATAATTAATC 14 HNF1A_MA0046.1 JASPAR + 21745769 21745782 0.0E+00 AGTTAATAATTAAT 14 HNF1A_MA0046.1 JASPAR - 21745770 21745783 0.0E+00 GATTAATTATTAAC 14 DLX5_homeodomain_FL_monomeric_8_1 SELEX + 21745774 21745781 8.0E-06 ATAATTAA 8 TEAD1_MA0090.1 JASPAR + 21749097 21749108 5.0E-06 CACATTCCTGAT 12 FOXO1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 21749906 21749919 5.0E-06 ATACACATATTTTT 14 FOXO1_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 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