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CLK2 Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 1196 CDC-like kinase 2 chr1 - 155242781 - 155248281 155243281 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the CLK2 promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 4.0E-06 TTAATTAA 8 Uncx_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 4.0E-06 TTAATTAA 8 FOXO4_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 155247550 155247563 5.0E-06 GAGAACTTGTTGAC 14 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 155247113 155247123 1.0E-05 GCCACGCCCCT 11 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 155242109 155242126 0.0E+00 TTAATTAAAAACCACTTA 18 MSX2_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 155248016 155248033 8.0E-06 ATACTTAGAATATAATTT 18 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 4.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1A_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 4.0E-06 TTAATTAA 8 Myc_MA0147.1 JASPAR - 155243360 155243369 7.0E-06 AGCACGTGGT 10 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 ISX_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 155242118 155242127 5.0E-06 TTTAATTAAT 10 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 8.0E-06 ATTAATTAAA 10 BARX1_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX - 155242109 155242125 0.0E+00 TAATTAAAAACCACTTA 17 KLF16_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 155247113 155247123 7.0E-06 GCCACGCCCCT 11 LHX2_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 155242477 155242491 6.0E-06 TAGTTATCCTAATCA 15 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 155247112 155247125 1.0E-06 AGCCACGCCCCTCT 14 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 Shox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 ZNF75A_C2H2_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 155243015 155243026 2.0E-06 GCTTGTCCCACA 12 ESX1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 3.0E-06 ATTAATTAAA 10 MAX_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 155243360 155243369 1.0E-06 ACCACGTGCT 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 155242118 155242127 4.0E-06 TTTAATTAAT 10 Alx1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 6.0E-06 ATTAATTAAA 10 ERG_ETS_full_dimeric_14_1 SELEX + 155243024 155243037 7.0E-06 ACAGGAAGTCCGTG 14 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 NKX6-2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX2_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 KLF13_C2H2_full_monomeric_18_1 SELEX + 155247111 155247128 0.0E+00 AAGCCACGCCCCTCTCGG 18 GMEB2_SAND_DBD_dimer-of-dimers_14_1 SELEX - 155243362 155243375 5.0E-06 TACGTGAGCACGTG 14 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 LMX1B_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 155243662 155243691 1.0E-05 GAAAATAACCATTTCTTAAAACACTTCACC 30 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 155244178 155244207 0.0E+00 AAAAAAAAAAAAAAAAGCGCGCATCACCAC 30 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 155244180 155244209 5.0E-06 AAAAAAAAAAAAAAGCGCGCATCACCACGC 30 Pax4_MA0068.1 JASPAR + 155244181 155244210 4.0E-06 AAAAAAAAAAAAAGCGCGCATCACCACGCC 30 HOXA1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 1.0E-06 ATTAATTAAA 10 ZNF238_C2H2_full_monomeric_13_1 SELEX + 155242078 155242090 4.0E-06 ATTACAGATGTGA 13 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 155242118 155242127 6.0E-06 TTTAATTAAT 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 1.0E-06 ATTAATTAAA 10 Egr1_C2H2_mouse-DBD_mutant_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 155243092 155243107 1.0E-05 CTCCACCCCCCCAACC 16 RFX2_RFX_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 155247104 155247118 4.0E-06 CTTTGCTAAGCCACG 15 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 5.0E-06 ATTAATTAAA 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 2.0E-06 ATTAATTAAA 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 7.0E-06 ATTAATTAAA 10 MNT_bHLH_DBD_dimeric_10_1 SELEX + 155243360 155243369 2.0E-06 ACCACGTGCT 10 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 SHOX_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 Pou2f2_POU_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 155246845 155246858 5.0E-06 CAAGAATATGCCTA 14 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 PRRX1_homeodomain_full_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 SP1_MA0079.2 JASPAR - 155248147 155248156 7.0E-06 CCCCGCCCCC 10 RFX3_RFX_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 155247104 155247118 3.0E-06 CTTTGCTAAGCCACG 15 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX + 155247061 155247077 1.0E-06 TAGGCCACGCCCTCTCC 17 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX + 155247110 155247126 0.0E+00 TAAGCCACGCCCCTCTC 17 NOTO_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 9.0E-06 ATTAATTAAA 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 155242118 155242127 3.0E-06 TTTAATTAAT 10 MIXL1_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 0.0E+00 ATTAATTAAA 10 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 Vsx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 MZF1_5-13_MA0057.1 JASPAR - 155242841 155242850 8.0E-06 TGAGGGGGAA 10 HESX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 155242118 155242127 9.0E-06 TTTAATTAAT 10 GSX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 1.0E-06 ATTAATTAAA 10 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 155242109 155242126 0.0E+00 TTAATTAAAAACCACTTA 18 Msx3_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 155248016 155248033 9.0E-06 ATACTTAGAATATAATTT 18 VENTX_homeodomain_DBD_dimeric_21_1 SELEX - 155242108 155242128 2.0E-06 TATTAATTAAAAACCACTTAC 21 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX + 155247063 155247077 2.0E-06 GGCCACGCCCTCTCC 15 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX + 155247112 155247126 7.0E-06 AGCCACGCCCCTCTC 15 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 8.0E-06 ATTAATTAAA 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 3.0E-06 ATTAATTAAA 10 MEOX2_homeodomain_DBD_dimeric_17_1 SELEX + 155242476 155242492 6.0E-06 ATAGTTATCCTAATCAG 17 ZNF282_C2H2_DBD_monomeric_17_1 SELEX + 155242913 155242929 7.0E-06 CTTGCCCCCAACCCAAG 17 RORA_nuclearreceptor_DBD_dimeric_20_1 SELEX + 155247048 155247067 7.0E-06 GAAAGGCCAACGCTAGGCCA 20 LBX2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 6.0E-06 ATTAATTAAA 10 SRY_HMG_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 155242165 155242177 7.0E-06 CCAATTCCATTAA 13 GSX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 2.0E-06 ATTAATTAAA 10 REST_MA0138.2 JASPAR - 155248176 155248196 0.0E+00 TTCAGCACTAGGGACAGCGAC 21 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 RAXL1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 155242109 155242126 0.0E+00 TTAATTAAAAACCACTTA 18 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX + 155248015 155248032 9.0E-06 GAAATTATATTCTAAGTA 18 MSX1_homeodomain_DBD_dimeric_18_1 SELEX - 155248016 155248033 7.0E-06 ATACTTAGAATATAATTT 18 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 155242118 155242127 1.0E-06 ATTAATTAAA 10 FOXC1_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 155244215 155244227 8.0E-06 AAAAAAAAAAATA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 155244215 155244227 4.0E-06 AAAAAAAAAAATA 13 Irx3_homeodomain_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 155244223 155244234 3.0E-06 CTACAAGAAAAA 12 HNF1A_MA0046.1 JASPAR + 155242114 155242127 5.0E-06 GGTTTTTAATTAAT 14 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 4.0E-06 TTAATTAA 8 Lhx4_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 4.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 Meox2_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 155242119 155242126 9.0E-06 TTAATTAA 8 V_ELF5_03_M02057 TRANSFAC + 155248124 155248133 8.0E-06 CCAGGAAAAA 10 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC - 155242113 155242129 1.0E-06 ATATTAATTAAAAACCA 17 V_DBX1_01_M01483 TRANSFAC + 155242116 155242132 2.0E-06 TTTTTAATTAATATCAG 17 V_ZFP410_04_M02936 TRANSFAC + 155242379 155242395 6.0E-06 CCCAACCTCCCCAAATT 17 V_NRSF_Q4_M01028 TRANSFAC + 155248177 155248195 1.0E-06 TCGCTGTCCCTAGTGCTGA 19 V_DMRT3_01_M01148 TRANSFAC + 155242407 155242421 3.0E-06 TATTTGATGCATTCT 15 V_EVI1_04_M00081 TRANSFAC - 155244215 155244229 1.0E-06 AGAAAAAAAAAAATA 15 V_STAT_Q6_M00777 TRANSFAC + 155244221 155244233 6.0E-06 TTTTTTTCTTGTA 13 V_SP1_Q6_01_M00931 TRANSFAC + 155248209 155248218 4.0E-06 GGGGCGGGGC 10 V_NFAT3_Q3_M01734 TRANSFAC - 155248126 155248135 4.0E-06 TATTTTTCCT 10 V_RP58_01_M00532 TRANSFAC - 155242080 155242091 7.0E-06 CTCACATCTGTA 12 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC + 155242114 155242130 1.0E-06 GGTTTTTAATTAATATC 17 V_HOXA4_01_M01370 TRANSFAC - 155242115 155242131 9.0E-06 TGATATTAATTAAAAAC 17 V_POU3F2_02_M00464 TRANSFAC + 155242480 155242489 1.0E-05 TTATCCTAAT 10 V_ARNT_01_M00236 TRANSFAC - 155243357 155243372 9.0E-06 GTGAGCACGTGGTGGC 16 V_PLAG1_02_M01973 TRANSFAC + 155243210 155243225 8.0E-06 CCCCCGCCCGGGGCCC 16 V_CART1_02_M01362 TRANSFAC - 155242114 155242130 5.0E-06 GATATTAATTAAAAACC 17 V_YY1_Q6_M00793 TRANSFAC + 155242954 155242962 7.0E-06 GCCATCTTT 9 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC - 155242114 155242130 1.0E-06 GATATTAATTAAAAACC 17 V_HOXC4_01_M01369 TRANSFAC + 155242115 155242131 6.0E-06 GTTTTTAATTAATATCA 17 V_GABPA_04_M02858 TRANSFAC + 155242836 155242851 1.0E-06 CCTCCTTCCCCCTCAT 16 V_SP1_03_M02281 TRANSFAC - 155248147 155248156 7.0E-06 CCCCGCCCCC 10 V_GKLF_02_M01588 TRANSFAC + 155244203 155244214 7.0E-06 ACCACGCCCAGC 12 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC + 155242114 155242130 1.0E-06 GGTTTTTAATTAATATC 17 V_NKX61_03_M01489 TRANSFAC - 155242115 155242131 4.0E-06 TGATATTAATTAAAAAC 17 V_HOXC6_01_M01406 TRANSFAC - 155242114 155242130 1.0E-06 GATATTAATTAAAAACC 17 V_PITX2_Q6_M02114 TRANSFAC - 155242074 155242083 1.0E-06 TGTAATCCCA 10 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC + 155242114 155242130 1.0E-06 GGTTTTTAATTAATATC 17 V_OCTAMER_02_M01477 TRANSFAC - 155242115 155242131 8.0E-06 TGATATTAATTAAAAAC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC - 155242114 155242130 0.0E+00 GATATTAATTAAAAACC 17 V_LHX3_01_M01471 TRANSFAC + 155242115 155242131 1.0E-06 GTTTTTAATTAATATCA 17 V_NKX24_01_M01350 TRANSFAC + 155243678 155243693 9.0E-06 TAAAACACTTCACCTA 16 V_SP1_02_M01303 TRANSFAC - 155243171 155243181 8.0E-06 GGGGCGGGGAC 11 V_SP1_02_M01303 TRANSFAC + 155248148 155248158 3.0E-06 GGGGCGGGGGG 11 V_VAX2_01_M01327 TRANSFAC - 155242116 155242131 6.0E-06 TGATATTAATTAAAAA 16 V_AIRE_02_M01000 TRANSFAC - 155242486 155242510 8.0E-06 GGCATTTATGTGGCTATGCTGATTA 25 V_PU1_Q4_M01172 TRANSFAC + 155246929 155246947 2.0E-06 CATTTCCACTTCTTCCATT 19 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC + 155242117 155242126 9.0E-06 TTTTAATTAA 10 V_LHX3A_01_M00510 TRANSFAC - 155242119 155242128 5.0E-06 TATTAATTAA 10 V_HOXD13_01_M01404 TRANSFAC - 155242114 155242129 7.0E-06 ATATTAATTAAAAACC 16 V_CMYC_02_M01154 TRANSFAC - 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