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SEMA6B Entrez Description Chrom. Strand Promoter (Start - Stop) TSS 10501 sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B chr19 - 4559271 - 4564771 4559771 Transcription Factor Binding Sites   Download all TFBS in the SEMA6B promoter   Motif Source Strand Start Stop PValue Match Sequence Overlap w/ Footprints POU4F2_POU_full_monomeric_16_1 SELEX + 4558612 4558627 3.0E-06 GATAATAATTAATAAA 16 CTCF_MA0139.1 JASPAR + 4557809 4557827 1.0E-06 CAGCCACCAGAGGGCGGGC 19 HOXD12_homeodomain_DBD_monomeric_9_1 SELEX + 4558620 4558628 9.0E-06 TTAATAAAA 9 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558619 4558631 2.0E-06 ATTAATAAAAACA 13 Hoxc10_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 4558620 4558629 5.0E-06 TTAATAAAAA 10 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556137 4556147 2.0E-06 ACCACGCCCAC 11 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556155 4556165 6.0E-06 GCCACGCCCAT 11 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556502 4556512 1.0E-06 GCCACGCCCAC 11 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556796 4556806 7.0E-06 GCCACACCCCC 11 SP3_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556875 4556885 1.0E-06 GCCACGCCCAC 11 Hoxd9_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 4558666 4558675 4.0E-06 ATAATTAAAT 10 DLX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 8.0E-06 AATAATTAAT 10 IRF7_IRF_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 4562160 4562173 3.0E-06 CCCAAACTGAAATT 14 ALX3_homeodomain_full_monomeric_10_1 SELEX + 4558667 4558676 8.0E-06 TTTAATTATC 10 SPIC_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX + 4559755 4559768 1.0E-06 AAAAACAGGAAGAC 14 SPIC_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX - 4562368 4562381 1.0E-06 AAAAAGGGGAAGGA 14 SPIC_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX - 4563843 4563856 4.0E-06 AAAAAAGGGAAGGA 14 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 4.0E-06 CTGATTTAATTAT 13 Arx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4558663 4558675 1.0E-06 ATAATTAAATCAG 13 FOXC2_forkhead_DBD_monomeric_12_1 SELEX + 4558622 4558633 7.0E-06 AATAAAAACAAT 12 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 4558616 4558623 4.0E-06 ATAATTAA 8 Dlx1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 4558668 4558675 4.0E-06 ATAATTAA 8 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 4556135 4556148 1.0E-06 GACCACGCCCACAT 14 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 4556153 4556166 2.0E-06 GGCCACGCCCATCA 14 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 4556500 4556513 1.0E-06 GGCCACGCCCACCC 14 KLF14_C2H2_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 4556873 4556886 1.0E-06 GGCCACGCCCACCC 14 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 3.0E-06 CTGATTTAATTAT 13 Alx1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4558663 4558675 3.0E-06 ATAATTAAATCAG 13 Pknox2_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 4562351 4562362 7.0E-06 TGACCTGTGTCA 12 Pknox2_MEIS_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 4563826 4563837 7.0E-06 TGACCTGTGTCA 12 ISX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 2.0E-06 CTGATTTAATTAT 13 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 4557598 4557611 8.0E-06 AGGATGCGGAAGTG 14 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 4559755 4559768 9.0E-06 AAAAACAGGAAGAC 14 SPIB_ETS_DBD_monomeric_14_1 SELEX - 4562368 4562381 2.0E-06 AAAAAGGGGAAGGA 14 Klf4_MA0039.2 JASPAR + 4556156 4556165 1.0E-05 TGGGCGTGGC 10 Klf4_MA0039.2 JASPAR + 4556503 4556512 1.0E-05 TGGGCGTGGC 10 Klf4_MA0039.2 JASPAR + 4556876 4556885 1.0E-05 TGGGCGTGGC 10 NFKB2_NFAT_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4559651 4559663 3.0E-06 AGGGGTATCCCCC 13 NFKB2_NFAT_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4559651 4559663 3.0E-06 GGGGGATACCCCT 13 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 0.0E+00 AATAATTAAT 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 4558615 4558624 5.0E-06 ATTAATTATT 10 HOXB5_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 4558667 4558676 5.0E-06 GATAATTAAA 10 POU4F3_POU_DBD_monomeric_16_1 SELEX + 4558612 4558627 1.0E-06 GATAATAATTAATAAA 16 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 4558664 4558674 6.0E-06 TGATTTAATTA 11 PROP1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX - 4558664 4558674 9.0E-06 TAATTAAATCA 11 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX + 4558619 4558628 7.0E-06 ATTAATAAAA 10 HOXD11_homeodomain_DBD_monomeric_10_2 SELEX - 4558667 4558676 8.0E-06 GATAATTAAA 10 Hoxa2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 6.0E-06 AATAATTAAT 10 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 3.0E-06 CTGATTTAATTAT 13 ALX3_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 4558663 4558675 3.0E-06 ATAATTAAATCAG 13 FOXJ3_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX + 4558616 4558629 2.0E-06 ATAATTAATAAAAA 14 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 4558611 4558625 4.0E-06 GGATAATAATTAATA 15 HNF1A_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 4558611 4558625 1.0E-06 TATTAATTATTATCC 15 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 2.0E-06 AATAATTAAT 10 HOXB2_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 4558667 4558676 7.0E-06 GATAATTAAA 10 RAX_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 9.0E-06 AATAATTAAT 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 4.0E-06 AATAATTAAT 10 HOXD8_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 4558667 4558676 2.0E-06 GATAATTAAA 10 HSF4_HSF_DBD_trimeric_13_1 SELEX - 4562145 4562157 1.0E-05 GTCGAGAAAGTTC 13 ONECUT2_CUT_DBD_monomeric_14_1 SELEX + 4558623 4558636 8.0E-06 ATAAAAACAATAAT 14 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 2.0E-06 CTGATTTAATTAT 13 DRGX_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4558663 4558675 3.0E-06 ATAATTAAATCAG 13 PHOX2B_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 4558664 4558674 1.0E-06 TGATTTAATTA 11 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 3.0E-06 CTGATTTAATTAT 13 Alx4_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4558663 4558675 1.0E-06 ATAATTAAATCAG 13 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 4556134 4556150 1.0E-06 ATGACCACGCCCACATC 17 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 4556152 4556168 1.0E-06 CTGGCCACGCCCATCAC 17 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 4556499 4556515 0.0E+00 CAGGCCACGCCCACCCC 17 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 4556706 4556722 6.0E-06 ATAACCACGCCCCAAAT 17 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 4556848 4556864 4.0E-06 CTGGCCACGCCCCAACC 17 SP4_C2H2_full_monomeric_17_1 SELEX - 4556872 4556888 0.0E+00 CAGGCCACGCCCACCCC 17 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 4558616 4558623 9.0E-06 ATAATTAA 8 DLX6_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 4558668 4558675 9.0E-06 ATAATTAA 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 4558616 4558623 9.0E-06 TTAATTAT 8 VAX1_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 4558668 4558675 9.0E-06 TTAATTAT 8 Lhx3_MA0135.1 JASPAR + 4558665 4558677 5.0E-06 GATTTAATTATCA 13 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX + 4558616 4558623 9.0E-06 ATAATTAA 8 DLX3_homeodomain_DBD_monomeric_8_1 SELEX - 4558668 4558675 9.0E-06 ATAATTAA 8 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556137 4556147 0.0E+00 ACCACGCCCAC 11 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556502 4556512 4.0E-06 GCCACGCCCAC 11 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556796 4556806 8.0E-06 GCCACACCCCC 11 SP1_C2H2_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4556875 4556885 4.0E-06 GCCACGCCCAC 11 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX + 4558612 4558624 1.0E-06 GATAATAATTAAT 13 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_13_1 SELEX - 4558612 4558624 9.0E-06 ATTAATTATTATC 13 PRRX1_homeodomain_full_dimeric_11_1 SELEX + 4558664 4558674 1.0E-06 TGATTTAATTA 11 CART1_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 1.0E-06 CTGATTTAATTAT 13 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX + 4558613 4558627 4.0E-06 ATAATAATTAATAAA 15 HESX1_homeodomain_DBD_dimeric_15_1 SELEX - 4558613 4558627 3.0E-06 TTTATTAATTATTAT 15 LHX9_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4558614 4558626 5.0E-06 TTATTAATTATTA 13 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 4556134 4556148 0.0E+00 GACCACGCCCACATC 15 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 4556152 4556166 1.0E-06 GGCCACGCCCATCAC 15 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 4556499 4556513 3.0E-06 GGCCACGCCCACCCC 15 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 4556706 4556720 5.0E-06 AACCACGCCCCAAAT 15 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 4556793 4556807 9.0E-06 GGCCACACCCCCAAA 15 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 4556848 4556862 5.0E-06 GGCCACGCCCCAACC 15 Klf12_C2H2_DBD_monomeric_15_1 SELEX - 4556872 4556886 3.0E-06 GGCCACGCCCACCCC 15 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 0.0E+00 CTGATTTAATTAT 13 Uncx_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4558663 4558675 9.0E-06 ATAATTAAATCAG 13 Hoxd3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 3.0E-06 AATAATTAAT 10 HOXB3_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 3.0E-06 AATAATTAAT 10 TGIF2LX_MEIS_full_dimeric_12_1 SELEX + 4562351 4562362 6.0E-06 TGACCTGTGTCA 12 TGIF2LX_MEIS_full_dimeric_12_1 SELEX + 4563826 4563837 6.0E-06 TGACCTGTGTCA 12 DUXA_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558663 4558675 4.0E-06 CTGATTTAATTAT 13 DUXA_homeodomain_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4558663 4558675 9.0E-06 ATAATTAAATCAG 13 PHOX2A_homeodomain_DBD_dimeric_11_1 SELEX + 4558664 4558674 1.0E-06 TGATTTAATTA 11 CPEB1_RRM_full_monomeric_8_1 SELEX + 4558622 4558629 4.0E-06 AATAAAAA 8 SPI1_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX + 4559755 4559768 7.0E-06 AAAAACAGGAAGAC 14 SPI1_ETS_full_monomeric_14_1 SELEX - 4562368 4562381 1.0E-06 AAAAAGGGGAAGGA 14 ETV6_ETS_full_dimeric_15_1 SELEX - 4557598 4557612 5.0E-06 GAGGATGCGGAAGTG 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX + 4558611 4558625 4.0E-06 GGATAATAATTAATA 15 HNF1B_homeodomain_full_dimeric_15_1 SELEX - 4558611 4558625 2.0E-06 TATTAATTATTATCC 15 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX + 4558616 4558627 1.0E-06 ATAATTAATAAA 12 POU3F3_POU_DBD_dimeric_12_1 SELEX - 4558616 4558627 6.0E-06 TTTATTAATTAT 12 ELF5_MA0136.1 JASPAR + 4559880 4559888 5.0E-06 AATTTCCTT 9 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX + 4558619 4558629 5.0E-06 ATTAATAAAAA 11 Hoxa11_homeodomain_DBD_monomeric_11_1 SELEX - 4558666 4558676 6.0E-06 GATAATTAAAT 11 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX + 4558615 4558624 4.0E-06 AATAATTAAT 10 MNX1_homeodomain_DBD_monomeric_10_1 SELEX - 4558667 4558676 3.0E-06 GATAATTAAA 10 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX + 4558619 4558631 2.0E-06 ATTAATAAAAACA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 4562377 4562389 6.0E-06 AAAAAAAAAAAAA 13 Foxj3_forkhead_DBD_dimeric_13_1 SELEX - 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4562377 4562390 8.0E-06 GAAAAAAAAAAAAA 14 FOXJ2_forkhead_DBD_dimeric_14_1 SELEX - 4563851 4563864 8.0E-06 GAAAAAAAAAAAAA 14 V_HOXA9_01_M01351 TRANSFAC + 4558617 4558633 9.0E-06 TAATTAATAAAAACAAT 17 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 4558613 4558632 0.0E+00 TTGTTTTTATTAATTATTAT 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 4558616 4558635 2.0E-06 TTATTGTTTTTATTAATTAT 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC - 4558625 4558644 6.0E-06 TTATTGCCATTATTGTTTTT 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 4562377 4562396 0.0E+00 TTTTTTTTTTTTTCTTGTTT 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 4563851 4563870 0.0E+00 TTTTTTTTTTTTTCTTTTTT 20 V_FOXP1_01_M00987 TRANSFAC + 4563852 4563871 1.0E-06 TTTTTTTTTTTTCTTTTTTT 20 V_ER_Q6_02_M00959 TRANSFAC - 4562347 4562357 2.0E-06 CAGGTCACAGT 11 V_ER_Q6_02_M00959 TRANSFAC - 4563822 4563832 2.0E-06 CAGGTCACAGT 11 V_KLF15_Q2_M01714 TRANSFAC + 4556847 4556860 4.0E-06 GGGTTGGGGCGTGG 14 V_KLF15_Q2_M01714 TRANSFAC - 4559895 4559908 7.0E-06 GAGCAGGGGAGGAG 14 V_SPI1_01_M01203 TRANSFAC - 4562365 4562381 3.0E-06 AAAAAGGGGAAGGAAAC 17 V_TST1_02_M01316 TRANSFAC - 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